MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 9506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011149	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
3	NC_011149	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
4	NC_011149	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	197250740
5	NC_011149	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
6	NC_011149	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
7	NC_011149	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
8	NC_011149	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
9	NC_011149	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
10	NC_011149	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	197249934
11	NC_011149	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	197249934
12	NC_011149	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
13	NC_011149	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
14	NC_011149	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
15	NC_011149	TG	3	6	5147	5152	0 %	50 %	50 %	0 %	197249510
16	NC_011149	CG	3	6	5250	5255	0 %	0 %	50 %	50 %	197249510
17	NC_011149	CG	3	6	5469	5474	0 %	0 %	50 %	50 %	197249510
18	NC_011149	AG	3	6	5551	5556	50 %	0 %	50 %	0 %	197249510
19	NC_011149	CG	3	6	5970	5975	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
20	NC_011149	GC	3	6	6888	6893	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
21	NC_011149	CG	3	6	6990	6995	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
22	NC_011149	TC	3	6	7772	7777	0 %	50 %	0 %	50 %	197248384
23	NC_011149	CG	3	6	7859	7864	0 %	0 %	50 %	50 %	197248384
24	NC_011149	CG	3	6	7957	7962	0 %	0 %	50 %	50 %	197248384
25	NC_011149	CT	3	6	8450	8455	0 %	50 %	0 %	50 %	197248384
26	NC_011149	GC	3	6	8474	8479	0 %	0 %	50 %	50 %	197248384
27	NC_011149	TG	3	6	8900	8905	0 %	50 %	50 %	0 %	197251166
28	NC_011149	GC	3	6	9572	9577	0 %	0 %	50 %	50 %	197251907
29	NC_011149	CG	3	6	10532	10537	0 %	0 %	50 %	50 %	197250147
30	NC_011149	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	197247979
31	NC_011149	GC	3	6	13301	13306	0 %	0 %	50 %	50 %	197247979
32	NC_011149	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	197250919
33	NC_011149	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	197250919
34	NC_011149	AT	3	6	15373	15378	50 %	50 %	0 %	0 %	197251857
35	NC_011149	AT	3	6	15648	15653	50 %	50 %	0 %	0 %	197251857
36	NC_011149	AT	3	6	15901	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	197251857
37	NC_011149	GA	3	6	17065	17070	50 %	0 %	50 %	0 %	197251520
38	NC_011149	GC	3	6	18367	18372	0 %	0 %	50 %	50 %	197248226
39	NC_011149	CT	3	6	20342	20347	0 %	50 %	0 %	50 %	197248849
40	NC_011149	GC	3	6	20658	20663	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
41	NC_011149	GC	3	6	20778	20783	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
42	NC_011149	GC	3	6	21183	21188	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
43	NC_011149	GC	3	6	22041	22046	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
44	NC_011149	CT	3	6	22796	22801	0 %	50 %	0 %	50 %	197248849
45	NC_011149	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	197250746
46	NC_011149	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	197250746
47	NC_011149	AT	3	6	24058	24063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011149	CG	3	6	25066	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011149	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	449785010
50	NC_011149	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	449785010
51	NC_011149	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
52	NC_011149	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
53	NC_011149	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
54	NC_011149	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
55	NC_011149	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	197251618
56	NC_011149	GT	3	6	28493	28498	0 %	50 %	50 %	0 %	197250867
57	NC_011149	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	197250867
58	NC_011149	CT	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	197249913
59	NC_011149	CG	3	6	30433	30438	0 %	0 %	50 %	50 %	197249913
60	NC_011149	AT	3	6	30534	30539	50 %	50 %	0 %	0 %	449785011
61	NC_011149	GC	3	6	30765	30770	0 %	0 %	50 %	50 %	449785011
62	NC_011149	GC	3	6	31055	31060	0 %	0 %	50 %	50 %	449785011
63	NC_011149	GT	3	6	33043	33048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011149	CA	3	6	33221	33226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011149	TC	3	6	33487	33492	0 %	50 %	0 %	50 %	197249381
66	NC_011149	AT	3	6	33737	33742	50 %	50 %	0 %	0 %	197249381
67	NC_011149	TA	3	6	33940	33945	50 %	50 %	0 %	0 %	197249381
68	NC_011149	TA	3	6	34435	34440	50 %	50 %	0 %	0 %	197250600
69	NC_011149	AT	3	6	34694	34699	50 %	50 %	0 %	0 %	197250600
70	NC_011149	AT	3	6	35440	35445	50 %	50 %	0 %	0 %	197251278
71	NC_011149	TG	4	8	35655	35662	0 %	50 %	50 %	0 %	197251278
72	NC_011149	GC	3	6	36248	36253	0 %	0 %	50 %	50 %	197251278
73	NC_011149	TA	3	6	37198	37203	50 %	50 %	0 %	0 %	197250571
74	NC_011149	AT	3	6	39514	39519	50 %	50 %	0 %	0 %	197248673
75	NC_011149	TG	3	6	39681	39686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011149	AT	3	6	39830	39835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011149	AT	3	6	39945	39950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011149	AT	4	8	40032	40039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011149	AT	3	6	40086	40091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011149	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	197249148
81	NC_011149	GT	3	6	41768	41773	0 %	50 %	50 %	0 %	197247602
82	NC_011149	TG	3	6	42798	42803	0 %	50 %	50 %	0 %	197247602
83	NC_011149	CG	3	6	43313	43318	0 %	0 %	50 %	50 %	197247498
84	NC_011149	AG	3	6	43498	43503	50 %	0 %	50 %	0 %	197247498
85	NC_011149	TA	3	6	43686	43691	50 %	50 %	0 %	0 %	197247498
86	NC_011149	CA	3	6	44999	45004	50 %	0 %	0 %	50 %	197248163
87	NC_011149	GC	3	6	45702	45707	0 %	0 %	50 %	50 %	197248163
88	NC_011149	TA	3	6	46107	46112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011149	GA	3	6	46174	46179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011149	TA	3	6	46806	46811	50 %	50 %	0 %	0 %	197251902
91	NC_011149	TG	3	6	47187	47192	0 %	50 %	50 %	0 %	197251902
92	NC_011149	GC	4	8	47326	47333	0 %	0 %	50 %	50 %	197251902
93	NC_011149	GA	3	6	47408	47413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011149	GA	3	6	48240	48245	50 %	0 %	50 %	0 %	197250162
95	NC_011149	CG	4	8	49307	49314	0 %	0 %	50 %	50 %	197248810
96	NC_011149	CG	3	6	49520	49525	0 %	0 %	50 %	50 %	197248810
97	NC_011149	TG	3	6	50138	50143	0 %	50 %	50 %	0 %	197248810
98	NC_011149	GC	3	6	51206	51211	0 %	0 %	50 %	50 %	197249256
99	NC_011149	GC	3	6	51506	51511	0 %	0 %	50 %	50 %	197249256
100	NC_011149	GC	3	6	52509	52514	0 %	0 %	50 %	50 %	197247824
101	NC_011149	GT	3	6	52916	52921	0 %	50 %	50 %	0 %	197248853
102	NC_011149	CG	3	6	54350	54355	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
103	NC_011149	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
104	NC_011149	CG	3	6	55097	55102	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
105	NC_011149	CG	3	6	55831	55836	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
106	NC_011149	CG	3	6	56086	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
107	NC_011149	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	197247967
108	NC_011149	GC	3	6	57881	57886	0 %	0 %	50 %	50 %	197251022
109	NC_011149	GC	4	8	58111	58118	0 %	0 %	50 %	50 %	197251022
110	NC_011149	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	197250636
111	NC_011149	TC	3	6	61124	61129	0 %	50 %	0 %	50 %	197248621
112	NC_011149	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	197249131
113	NC_011149	AT	3	6	63061	63066	50 %	50 %	0 %	0 %	197249131
114	NC_011149	GT	3	6	63387	63392	0 %	50 %	50 %	0 %	197249131
115	NC_011149	GC	3	6	64582	64587	0 %	0 %	50 %	50 %	197250360
116	NC_011149	GC	3	6	66220	66225	0 %	0 %	50 %	50 %	197250006
117	NC_011149	CG	3	6	66317	66322	0 %	0 %	50 %	50 %	197250006
118	NC_011149	GC	3	6	66723	66728	0 %	0 %	50 %	50 %	197249120
119	NC_011149	AT	3	6	68147	68152	50 %	50 %	0 %	0 %	197248761
120	NC_011149	GC	3	6	69026	69031	0 %	0 %	50 %	50 %	197247805
121	NC_011149	GC	3	6	69600	69605	0 %	0 %	50 %	50 %	197247805
122	NC_011149	AC	3	6	69652	69657	50 %	0 %	0 %	50 %	197247805
123	NC_011149	AG	3	6	69798	69803	50 %	0 %	50 %	0 %	197247457
124	NC_011149	CG	3	6	69877	69882	0 %	0 %	50 %	50 %	197247457
125	NC_011149	GC	3	6	69905	69910	0 %	0 %	50 %	50 %	197247457
126	NC_011149	CG	3	6	70534	70539	0 %	0 %	50 %	50 %	197251141
127	NC_011149	CG	3	6	70814	70819	0 %	0 %	50 %	50 %	197251141
128	NC_011149	TG	3	6	71455	71460	0 %	50 %	50 %	0 %	197249273
129	NC_011149	GC	3	6	71966	71971	0 %	0 %	50 %	50 %	197249273
130	NC_011149	CG	3	6	72201	72206	0 %	0 %	50 %	50 %	197249273
131	NC_011149	GC	3	6	72273	72278	0 %	0 %	50 %	50 %	197249273
132	NC_011149	GC	3	6	72450	72455	0 %	0 %	50 %	50 %	197247435
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134	NC_011149	GC	3	6	73457	73462	0 %	0 %	50 %	50 %	197247849
135	NC_011149	TC	3	6	73844	73849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011149	GC	3	6	73953	73958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011149	CG	3	6	74640	74645	0 %	0 %	50 %	50 %	197251291
138	NC_011149	AT	3	6	74888	74893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011149	CT	3	6	75983	75988	0 %	50 %	0 %	50 %	197249998
140	NC_011149	GC	3	6	77151	77156	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
141	NC_011149	CG	3	6	77287	77292	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
142	NC_011149	CG	3	6	77763	77768	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
143	NC_011149	TC	3	6	78196	78201	0 %	50 %	0 %	50 %	197250511
144	NC_011149	GC	5	10	78809	78818	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
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