MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 plasmid unnamed

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011148	GCAAAA	2	12	1590	1601	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197247347
2	NC_011148	CGCAGC	2	12	2092	2103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197247342
3	NC_011148	AATGTA	2	12	2356	2367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197247304
4	NC_011148	GCATCA	2	12	5729	5740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011148	TTAATA	2	12	8142	8153	50 %	50 %	0 %	0 %	197247340
6	NC_011148	AAAGTC	2	12	11660	11671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197247336
7	NC_011148	TAAATT	2	12	12244	12255	50 %	50 %	0 %	0 %	197247336
8	NC_011148	CAAAAA	2	12	12295	12306	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	197247336
9	NC_011148	ATCTTT	2	12	13496	13507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197247321
10	NC_011148	TACCTG	2	12	18984	18995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197247350
11	NC_011148	GTAGAA	2	12	19190	19201	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197247350
12	NC_011148	ATTGAG	2	12	20204	20215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247350
13	NC_011148	ACCTTT	2	12	21006	21017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	197247309
14	NC_011148	TTGTTT	2	12	24003	24014	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197247333
15	NC_011148	ATGTTG	2	12	28746	28757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197247300
16	NC_011148	CTTGTA	2	12	32119	32130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197247345
17	NC_011148	GAACAT	2	12	34685	34696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197247307
18	NC_011148	CAGTAT	2	12	35306	35317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197247307
19	NC_011148	GATAAA	2	12	35675	35686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197247307

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.