MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 plasmid unnamed

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011148	AAATA	2	10	631	640	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011148	TCTGA	2	10	1411	1420	20 %	40 %	20 %	20 %	197247347
3	NC_011148	TAGGG	2	10	2082	2091	20 %	20 %	60 %	0 %	197247342
4	NC_011148	GAAAA	2	10	2235	2244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011148	AGGGT	2	10	3407	3416	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011148	AGGGA	2	10	3922	3931	40 %	0 %	60 %	0 %	197247325
7	NC_011148	TGAAA	2	10	4018	4027	60 %	20 %	20 %	0 %	197247335
8	NC_011148	TAACA	2	10	4746	4755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011148	GCCTT	2	10	5762	5771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011148	TACAA	2	10	6390	6399	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011148	CCCGC	2	10	6541	6550	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_011148	AGCGC	2	10	6862	6871	20 %	0 %	40 %	40 %	197247331
13	NC_011148	GTAAC	2	10	8430	8439	40 %	20 %	20 %	20 %	197247340
14	NC_011148	CTTTT	2	10	13547	13556	0 %	80 %	0 %	20 %	197247321
15	NC_011148	ACCTG	2	10	16574	16583	20 %	20 %	20 %	40 %	197247349
16	NC_011148	TACTG	2	10	18445	18454	20 %	40 %	20 %	20 %	197247350
17	NC_011148	TTGAG	2	10	19422	19431	20 %	40 %	40 %	0 %	197247350
18	NC_011148	GCATT	2	10	21690	21699	20 %	40 %	20 %	20 %	197247317
19	NC_011148	GTCAG	2	10	23314	23323	20 %	20 %	40 %	20 %	197247333
20	NC_011148	AGGAA	2	10	24581	24590	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011148	ACTTA	2	10	25077	25086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011148	ATAAA	2	10	26485	26494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011148	AAAAG	2	10	26935	26944	80 %	0 %	20 %	0 %	197247346
24	NC_011148	TCCCC	2	10	27564	27573	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_011148	ACTAT	2	10	27651	27660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011148	ATTGT	2	10	30136	30145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011148	ACAAT	2	10	30146	30155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011148	AAAAT	2	10	30188	30197	80 %	20 %	0 %	0 %	197247348
29	NC_011148	TGCGG	2	10	32414	32423	0 %	20 %	60 %	20 %	197247328
30	NC_011148	CAAAA	2	10	33207	33216	80 %	0 %	0 %	20 %	197247302
31	NC_011148	GTAGA	2	10	34728	34737	40 %	20 %	40 %	0 %	197247307
32	NC_011148	GAAAA	2	10	34772	34781	80 %	0 %	20 %	0 %	197247307
33	NC_011148	TAAAT	2	10	34939	34948	60 %	40 %	0 %	0 %	197247307
34	NC_011148	GAAAT	2	10	34976	34985	60 %	20 %	20 %	0 %	197247307
35	NC_011148	ATCTT	2	10	35005	35014	20 %	60 %	0 %	20 %	197247307
36	NC_011148	GCAGG	2	10	37085	37094	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011148	TCGCT	2	10	37281	37290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011148	TGCGG	2	10	37312	37321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011148	TTACA	2	10	37494	37503	40 %	40 %	0 %	20 %	197247303

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.