MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 plasmid unnamed

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011148	CCTG	2	8	170	177	0 %	25 %	25 %	50 %	197247316
2	NC_011148	GCTG	2	8	195	202	0 %	25 %	50 %	25 %	197247316
3	NC_011148	ACCT	2	8	551	558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011148	TAAG	3	12	682	693	50 %	25 %	25 %	0 %	197247310
5	NC_011148	AGTA	2	8	1378	1385	50 %	25 %	25 %	0 %	197247347
6	NC_011148	TAAT	2	8	1759	1766	50 %	50 %	0 %	0 %	197247347
7	NC_011148	TGAA	2	8	1909	1916	50 %	25 %	25 %	0 %	197247342
8	NC_011148	ATTG	2	8	2123	2130	25 %	50 %	25 %	0 %	197247342
9	NC_011148	AACT	2	8	2294	2301	50 %	25 %	0 %	25 %	197247304
10	NC_011148	CTCG	2	8	2588	2595	0 %	25 %	25 %	50 %	197247304
11	NC_011148	TGAT	2	8	2837	2844	25 %	50 %	25 %	0 %	197247319
12	NC_011148	GAAG	2	8	2851	2858	50 %	0 %	50 %	0 %	197247319
13	NC_011148	TATT	2	8	3130	3137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011148	CAGC	2	8	3911	3918	25 %	0 %	25 %	50 %	197247325
15	NC_011148	AACC	2	8	4193	4200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011148	AGTG	2	8	4214	4221	25 %	25 %	50 %	0 %	197247327
17	NC_011148	ATGA	2	8	4273	4280	50 %	25 %	25 %	0 %	197247327
18	NC_011148	TTTA	2	8	4378	4385	25 %	75 %	0 %	0 %	197247327
19	NC_011148	AAGG	2	8	4577	4584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011148	CTGG	2	8	4799	4806	0 %	25 %	50 %	25 %	197247329
21	NC_011148	ATTG	2	8	5389	5396	25 %	50 %	25 %	0 %	197247301
22	NC_011148	CTTT	2	8	5408	5415	0 %	75 %	0 %	25 %	197247301
23	NC_011148	CAAA	2	8	5471	5478	75 %	0 %	0 %	25 %	197247301
24	NC_011148	ATTT	2	8	5567	5574	25 %	75 %	0 %	0 %	197247301
25	NC_011148	AGCG	3	12	6154	6165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011148	TGCT	2	8	6325	6332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011148	TCTT	2	8	6368	6375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011148	CAGT	2	8	7223	7230	25 %	25 %	25 %	25 %	197247341
29	NC_011148	TTTC	2	8	7306	7313	0 %	75 %	0 %	25 %	197247339
30	NC_011148	AGAA	2	8	7660	7667	75 %	0 %	25 %	0 %	197247339
31	NC_011148	TGTC	2	8	7939	7946	0 %	50 %	25 %	25 %	197247340
32	NC_011148	AAGG	2	8	8462	8469	50 %	0 %	50 %	0 %	197247340
33	NC_011148	TTTC	2	8	8500	8507	0 %	75 %	0 %	25 %	197247340
34	NC_011148	CCAG	2	8	8633	8640	25 %	0 %	25 %	50 %	197247340
35	NC_011148	TAAA	2	8	9263	9270	75 %	25 %	0 %	0 %	197247340
36	NC_011148	CTTT	2	8	10318	10325	0 %	75 %	0 %	25 %	197247344
37	NC_011148	TCGT	2	8	11190	11197	0 %	50 %	25 %	25 %	197247336
38	NC_011148	AGTT	2	8	11233	11240	25 %	50 %	25 %	0 %	197247336
39	NC_011148	TTCT	2	8	11334	11341	0 %	75 %	0 %	25 %	197247336
40	NC_011148	GATA	2	8	11401	11408	50 %	25 %	25 %	0 %	197247336
41	NC_011148	ATTA	2	8	11579	11586	50 %	50 %	0 %	0 %	197247336
42	NC_011148	TTAT	2	8	11979	11986	25 %	75 %	0 %	0 %	197247336
43	NC_011148	CTTT	2	8	12561	12568	0 %	75 %	0 %	25 %	197247336
44	NC_011148	AAAG	2	8	12626	12633	75 %	0 %	25 %	0 %	197247336
45	NC_011148	CATT	2	8	12739	12746	25 %	50 %	0 %	25 %	197247336
46	NC_011148	TACC	2	8	13078	13085	25 %	25 %	0 %	50 %	197247321
47	NC_011148	ACCA	2	8	13439	13446	50 %	0 %	0 %	50 %	197247321
48	NC_011148	AGCA	2	8	13796	13803	50 %	0 %	25 %	25 %	197247321
49	NC_011148	ATTC	2	8	13981	13988	25 %	50 %	0 %	25 %	197247321
50	NC_011148	ATTT	2	8	14044	14051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011148	TCAT	2	8	15286	15293	25 %	50 %	0 %	25 %	197247337
52	NC_011148	CCAT	2	8	15702	15709	25 %	25 %	0 %	50 %	197247306
53	NC_011148	CTTT	2	8	16090	16097	0 %	75 %	0 %	25 %	197247349
54	NC_011148	ATCA	2	8	16513	16520	50 %	25 %	0 %	25 %	197247349
55	NC_011148	TAAG	2	8	16529	16536	50 %	25 %	25 %	0 %	197247349
56	NC_011148	CTTT	2	8	16789	16796	0 %	75 %	0 %	25 %	197247349
57	NC_011148	GTTG	2	8	16986	16993	0 %	50 %	50 %	0 %	197247332
58	NC_011148	CGTT	2	8	17481	17488	0 %	50 %	25 %	25 %	197247313
59	NC_011148	GCTT	2	8	17605	17612	0 %	50 %	25 %	25 %	197247313
60	NC_011148	CAGG	2	8	17970	17977	25 %	0 %	50 %	25 %	197247350
61	NC_011148	CCCT	2	8	18691	18698	0 %	25 %	0 %	75 %	197247350
62	NC_011148	TACC	2	8	19149	19156	25 %	25 %	0 %	50 %	197247350
63	NC_011148	TCAT	2	8	19784	19791	25 %	50 %	0 %	25 %	197247350
64	NC_011148	TGTT	2	8	20491	20498	0 %	75 %	25 %	0 %	197247320
65	NC_011148	AGCA	2	8	20516	20523	50 %	0 %	25 %	25 %	197247320
66	NC_011148	TTTA	2	8	21056	21063	25 %	75 %	0 %	0 %	197247317
67	NC_011148	TGCT	2	8	21360	21367	0 %	50 %	25 %	25 %	197247317
68	NC_011148	TTGT	2	8	21656	21663	0 %	75 %	25 %	0 %	197247317
69	NC_011148	TTTA	2	8	21921	21928	25 %	75 %	0 %	0 %	197247308
70	NC_011148	ATTA	2	8	22416	22423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011148	CATA	2	8	22614	22621	50 %	25 %	0 %	25 %	197247334
72	NC_011148	TTTC	2	8	23113	23120	0 %	75 %	0 %	25 %	197247333
73	NC_011148	CAAT	2	8	23422	23429	50 %	25 %	0 %	25 %	197247333
74	NC_011148	CATT	2	8	23555	23562	25 %	50 %	0 %	25 %	197247333
75	NC_011148	CATA	2	8	23792	23799	50 %	25 %	0 %	25 %	197247333
76	NC_011148	GCCA	2	8	23875	23882	25 %	0 %	25 %	50 %	197247333
77	NC_011148	CGTT	2	8	24676	24683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011148	ATAA	2	8	25351	25358	75 %	25 %	0 %	0 %	197247315
79	NC_011148	TTCC	2	8	25555	25562	0 %	50 %	0 %	50 %	197247312
80	NC_011148	CGTT	2	8	25727	25734	0 %	50 %	25 %	25 %	197247312
81	NC_011148	TTTA	2	8	26012	26019	25 %	75 %	0 %	0 %	197247312
82	NC_011148	TATG	2	8	26028	26035	25 %	50 %	25 %	0 %	197247312
83	NC_011148	CAGG	2	8	26386	26393	25 %	0 %	50 %	25 %	197247312
84	NC_011148	GCTG	2	8	26422	26429	0 %	25 %	50 %	25 %	197247312
85	NC_011148	ACGA	2	8	26867	26874	50 %	0 %	25 %	25 %	197247346
86	NC_011148	CATC	2	8	26921	26928	25 %	25 %	0 %	50 %	197247346
87	NC_011148	AAAC	2	8	27601	27608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011148	TAGT	2	8	27664	27671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011148	ATTT	2	8	28058	28065	25 %	75 %	0 %	0 %	197247311
90	NC_011148	GTTT	2	8	28105	28112	0 %	75 %	25 %	0 %	197247311
91	NC_011148	GTAT	2	8	28357	28364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011148	GCTT	2	8	28603	28610	0 %	50 %	25 %	25 %	197247300
93	NC_011148	TGCT	2	8	28944	28951	0 %	50 %	25 %	25 %	197247300
94	NC_011148	AATC	2	8	29244	29251	50 %	25 %	0 %	25 %	197247300
95	NC_011148	GTAA	2	8	29385	29392	50 %	25 %	25 %	0 %	197247300
96	NC_011148	CTTA	2	8	29602	29609	25 %	50 %	0 %	25 %	197247318
97	NC_011148	CTTT	2	8	30024	30031	0 %	75 %	0 %	25 %	197247318
98	NC_011148	TGAT	2	8	30586	30593	25 %	50 %	25 %	0 %	197247326
99	NC_011148	TTGA	2	8	31010	31017	25 %	50 %	25 %	0 %	197247324
100	NC_011148	TAAA	2	8	31449	31456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011148	AAAG	2	8	31695	31702	75 %	0 %	25 %	0 %	197247345
102	NC_011148	TAAC	2	8	32725	32732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011148	AAAT	2	8	34111	34118	75 %	25 %	0 %	0 %	197247307
104	NC_011148	AAAG	2	8	34345	34352	75 %	0 %	25 %	0 %	197247307
105	NC_011148	CAAA	2	8	34621	34628	75 %	0 %	0 %	25 %	197247307
106	NC_011148	AGAA	2	8	35242	35249	75 %	0 %	25 %	0 %	197247307
107	NC_011148	ATCA	2	8	35510	35517	50 %	25 %	0 %	25 %	197247307
108	NC_011148	AGAA	2	8	36046	36053	75 %	0 %	25 %	0 %	197247307
109	NC_011148	TTGC	2	8	36305	36312	0 %	50 %	25 %	25 %	197247307
110	NC_011148	GTTC	2	8	37272	37279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011148	CTAT	2	8	37351	37358	25 %	50 %	0 %	25 %	197247303
112	NC_011148	AACC	2	8	37929	37936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011148	CTTT	2	8	37969	37976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.