MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 plasmid unnamed

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011148	CGA	2	6	429	434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247305
2	NC_011148	GAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247305
3	NC_011148	CCT	2	6	503	508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197247305
4	NC_011148	TAT	2	6	661	666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247310
5	NC_011148	TAA	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247310
6	NC_011148	TTA	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247310
7	NC_011148	GAA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247310
8	NC_011148	CTA	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247343
9	NC_011148	GAT	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247343
10	NC_011148	ATG	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247343
11	NC_011148	ATA	2	6	1064	1069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247343
12	NC_011148	AGC	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247343
13	NC_011148	CAA	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247343
14	NC_011148	TGT	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247343
15	NC_011148	TCT	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247351
16	NC_011148	ACT	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247351
17	NC_011148	CAT	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247347
18	NC_011148	TGT	2	6	1460	1465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247347
19	NC_011148	AGA	2	6	1487	1492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247347
20	NC_011148	TTC	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247347
21	NC_011148	CAG	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247347
22	NC_011148	AAT	2	6	1732	1737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247347
23	NC_011148	CCT	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197247342
24	NC_011148	CTA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247342
25	NC_011148	AAT	2	6	2061	2066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247342
26	NC_011148	TAA	2	6	2394	2399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247304
27	NC_011148	CAA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247304
28	NC_011148	TAC	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247304
29	NC_011148	AAT	2	6	2449	2454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247304
30	NC_011148	CCA	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247304
31	NC_011148	CAA	2	6	2669	2674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247304
32	NC_011148	CAA	2	6	2686	2691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247304
33	NC_011148	TAA	2	6	2862	2867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247319
34	NC_011148	AGG	2	6	2935	2940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247319
35	NC_011148	CGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247319
36	NC_011148	AGC	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247338
37	NC_011148	TAT	2	6	3210	3215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247338
38	NC_011148	AAG	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247338
39	NC_011148	TGT	2	6	3261	3266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247338
40	NC_011148	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247338
41	NC_011148	ATG	2	6	3317	3322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247338
42	NC_011148	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247325
43	NC_011148	GCT	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247325
44	NC_011148	TAT	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247325
45	NC_011148	ACA	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247325
46	NC_011148	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247325
47	NC_011148	TTA	2	6	3984	3989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247335
48	NC_011148	AAG	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247335
49	NC_011148	GCC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247335
50	NC_011148	TTA	2	6	4331	4336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247327
51	NC_011148	TAA	2	6	4469	4474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247327
52	NC_011148	GGC	2	6	4489	4494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247327
53	NC_011148	TTA	2	6	4538	4543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247327
54	NC_011148	CTT	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247329
55	NC_011148	GGC	2	6	4903	4908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247329
56	NC_011148	ACA	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247329
57	NC_011148	TCA	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247301
58	NC_011148	CAT	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247301
59	NC_011148	ATC	2	6	5121	5126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247301
60	NC_011148	TAA	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247301
61	NC_011148	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247301
62	NC_011148	CAC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247301
63	NC_011148	ATA	2	6	5452	5457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247301
64	NC_011148	AGC	2	6	5495	5500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247301
65	NC_011148	TAA	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247301
66	NC_011148	AAT	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247301
67	NC_011148	GCA	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247301
68	NC_011148	CAG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247331
69	NC_011148	ATC	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247331
70	NC_011148	TAT	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247341
71	NC_011148	ATC	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247341
72	NC_011148	TCA	3	9	7277	7285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247339
73	NC_011148	CTG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247339
74	NC_011148	CTG	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247339
75	NC_011148	TAC	2	6	7417	7422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247339
76	NC_011148	ATC	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247339
77	NC_011148	TTC	2	6	7570	7575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247339
78	NC_011148	GGC	2	6	7805	7810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247340
79	NC_011148	AGA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247340
80	NC_011148	ACA	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247340
81	NC_011148	TAT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247340
82	NC_011148	AGC	2	6	8084	8089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247340
83	NC_011148	ATC	2	6	8187	8192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
84	NC_011148	TTG	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247340
85	NC_011148	TAA	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247340
86	NC_011148	ACC	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247340
87	NC_011148	CAT	2	6	8521	8526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
88	NC_011148	CAT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
89	NC_011148	ATC	3	9	8600	8608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
90	NC_011148	TTG	2	6	8653	8658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247340
91	NC_011148	CCA	2	6	8664	8669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247340
92	NC_011148	ATA	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247340
93	NC_011148	ATC	2	6	8720	8725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
94	NC_011148	ATC	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
95	NC_011148	GTT	2	6	8888	8893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247340
96	NC_011148	TAA	2	6	8896	8901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247340
97	NC_011148	CGC	2	6	8917	8922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247340
98	NC_011148	TCA	2	6	8961	8966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
99	NC_011148	AGC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247340
100	NC_011148	GGT	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247340
101	NC_011148	TCC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197247340
102	NC_011148	CAA	2	6	9154	9159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247340
103	NC_011148	ATA	2	6	9217	9222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247340
104	NC_011148	ATC	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
105	NC_011148	CAT	2	6	9301	9306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
106	NC_011148	GCC	2	6	9404	9409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247340
107	NC_011148	CAA	2	6	9632	9637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247340
108	NC_011148	TCA	2	6	9645	9650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247340
109	NC_011148	TAA	2	6	9667	9672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247340
110	NC_011148	GAT	3	9	9675	9683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247340
111	NC_011148	AAG	2	6	9805	9810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247340
112	NC_011148	AGG	2	6	9824	9829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247340
113	NC_011148	AAC	2	6	9863	9868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247340
114	NC_011148	GTT	2	6	9869	9874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247340
115	NC_011148	CCG	2	6	9912	9917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247340
116	NC_011148	AAT	2	6	9929	9934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247340
117	NC_011148	ATT	2	6	10022	10027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247344
118	NC_011148	TAT	2	6	10080	10085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247344
119	NC_011148	AAT	2	6	10261	10266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247344
120	NC_011148	TTG	2	6	10301	10306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247344
121	NC_011148	AGA	2	6	10333	10338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247344
122	NC_011148	ACA	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247344
123	NC_011148	CTT	2	6	10528	10533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247322
124	NC_011148	GCA	2	6	10667	10672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247322
125	NC_011148	AGC	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247322
126	NC_011148	CGC	2	6	10914	10919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247336
127	NC_011148	TCA	2	6	11016	11021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247336
128	NC_011148	CAA	2	6	11041	11046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247336
129	NC_011148	TTA	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247336
130	NC_011148	CCG	2	6	11214	11219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247336
131	NC_011148	AGG	2	6	11306	11311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247336
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254	NC_011148	CAT	2	6	20299	20304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247350
255	NC_011148	TCA	2	6	20316	20321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247320
256	NC_011148	ATG	2	6	20439	20444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247320
257	NC_011148	ACA	2	6	20473	20478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247320
258	NC_011148	TGA	2	6	20528	20533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247320
259	NC_011148	TCT	3	9	20628	20636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247320
260	NC_011148	CAT	3	9	20647	20655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247320
261	NC_011148	ATA	2	6	20664	20669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247320
262	NC_011148	GCC	2	6	20732	20737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247309
263	NC_011148	CCG	2	6	20866	20871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247309
264	NC_011148	CAC	2	6	20929	20934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247309
265	NC_011148	ACC	2	6	20939	20944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247309
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270	NC_011148	TTA	2	6	21265	21270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247317
271	NC_011148	TTC	2	6	21295	21300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247317
272	NC_011148	ATT	2	6	21324	21329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247317
273	NC_011148	TAG	2	6	21334	21339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247317
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275	NC_011148	TAA	2	6	21403	21408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247317
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278	NC_011148	ATA	2	6	21733	21738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247317
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280	NC_011148	ACT	2	6	22018	22023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247308
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284	NC_011148	TCT	2	6	22597	22602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247334
285	NC_011148	CTT	2	6	22727	22732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247334
286	NC_011148	AGG	2	6	22821	22826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247334
287	NC_011148	TGA	2	6	22836	22841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247334
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369	NC_011148	TAT	2	6	32039	32044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247345
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375	NC_011148	AAT	2	6	32306	32311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247328
376	NC_011148	GCC	2	6	32401	32406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247328
377	NC_011148	TAA	2	6	32520	32525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247328
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379	NC_011148	GCT	2	6	33139	33144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247302
380	NC_011148	ATG	2	6	33149	33154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247302
381	NC_011148	CTT	2	6	33190	33195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247302
382	NC_011148	GGC	3	9	33223	33231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247302
383	NC_011148	GTT	2	6	33232	33237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247302
384	NC_011148	AAT	2	6	33310	33315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247302
385	NC_011148	GAA	2	6	33370	33375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247302
386	NC_011148	TTA	2	6	33418	33423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247302
387	NC_011148	GGT	2	6	33461	33466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247307
388	NC_011148	GAT	2	6	33719	33724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247307
389	NC_011148	CTT	2	6	33842	33847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247307
390	NC_011148	GGC	2	6	33851	33856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247307
391	NC_011148	CAT	2	6	33884	33889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247307
392	NC_011148	ATG	2	6	33900	33905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247307
393	NC_011148	TGA	2	6	33970	33975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247307
394	NC_011148	AAT	2	6	34057	34062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247307
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396	NC_011148	TGA	2	6	34291	34296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247307
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399	NC_011148	GAC	2	6	34446	34451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247307
400	NC_011148	CAG	2	6	34609	34614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247307
401	NC_011148	AGT	2	6	34658	34663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247307
402	NC_011148	GCA	2	6	34678	34683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247307
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404	NC_011148	TAA	2	6	35038	35043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247307
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410	NC_011148	AGC	2	6	35779	35784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247307
411	NC_011148	GAA	2	6	35837	35842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247307
412	NC_011148	CAG	2	6	35849	35854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247307
413	NC_011148	GCG	2	6	35880	35885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247307
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433	NC_011148	TGA	2	6	37722	37727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.