MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 plasmid unnamed

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011148	AT	3	6	1723	1728	50 %	50 %	0 %	0 %	197247347
2	NC_011148	AT	3	6	2337	2342	50 %	50 %	0 %	0 %	197247304
3	NC_011148	CT	3	6	2468	2473	0 %	50 %	0 %	50 %	197247304
4	NC_011148	AT	3	6	2622	2627	50 %	50 %	0 %	0 %	197247304
5	NC_011148	CA	3	6	4672	4677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011148	TC	3	6	4966	4971	0 %	50 %	0 %	50 %	197247329
7	NC_011148	AG	3	6	6142	6147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011148	CG	3	6	6960	6965	0 %	0 %	50 %	50 %	197247341
9	NC_011148	AT	3	6	8925	8930	50 %	50 %	0 %	0 %	197247340
10	NC_011148	TA	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	197247344
11	NC_011148	GC	3	6	10203	10208	0 %	0 %	50 %	50 %	197247344
12	NC_011148	TG	3	6	11544	11549	0 %	50 %	50 %	0 %	197247336
13	NC_011148	AT	3	6	11625	11630	50 %	50 %	0 %	0 %	197247336
14	NC_011148	CG	3	6	11749	11754	0 %	0 %	50 %	50 %	197247336
15	NC_011148	AT	3	6	12343	12348	50 %	50 %	0 %	0 %	197247336
16	NC_011148	TA	3	6	13117	13122	50 %	50 %	0 %	0 %	197247321
17	NC_011148	TA	3	6	13367	13372	50 %	50 %	0 %	0 %	197247321
18	NC_011148	AT	3	6	14140	14145	50 %	50 %	0 %	0 %	197247337
19	NC_011148	CA	3	6	14595	14600	50 %	0 %	0 %	50 %	197247337
20	NC_011148	AT	3	6	16604	16609	50 %	50 %	0 %	0 %	197247349
21	NC_011148	CT	3	6	16899	16904	0 %	50 %	0 %	50 %	197247332
22	NC_011148	GA	3	6	18213	18218	50 %	0 %	50 %	0 %	197247350
23	NC_011148	AG	3	6	19169	19174	50 %	0 %	50 %	0 %	197247350
24	NC_011148	CG	3	6	20276	20281	0 %	0 %	50 %	50 %	197247350
25	NC_011148	AG	3	6	20886	20891	50 %	0 %	50 %	0 %	197247309
26	NC_011148	AT	3	6	22082	22087	50 %	50 %	0 %	0 %	197247308
27	NC_011148	TA	3	6	23010	23015	50 %	50 %	0 %	0 %	197247333
28	NC_011148	GA	3	6	23609	23614	50 %	0 %	50 %	0 %	197247333
29	NC_011148	AC	3	6	25104	25109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011148	AT	3	6	25401	25406	50 %	50 %	0 %	0 %	197247312
31	NC_011148	AT	3	6	25530	25535	50 %	50 %	0 %	0 %	197247312
32	NC_011148	TA	3	6	25708	25713	50 %	50 %	0 %	0 %	197247312
33	NC_011148	AT	3	6	25877	25882	50 %	50 %	0 %	0 %	197247312
34	NC_011148	AT	3	6	27585	27590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011148	GC	3	6	28477	28482	0 %	0 %	50 %	50 %	197247300
36	NC_011148	CT	3	6	28641	28646	0 %	50 %	0 %	50 %	197247300
37	NC_011148	CG	3	6	28789	28794	0 %	0 %	50 %	50 %	197247300
38	NC_011148	TA	3	6	30393	30398	50 %	50 %	0 %	0 %	197247348
39	NC_011148	TA	3	6	31526	31531	50 %	50 %	0 %	0 %	197247345
40	NC_011148	TA	3	6	32966	32971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011148	AG	3	6	36023	36028	50 %	0 %	50 %	0 %	197247307
42	NC_011148	AG	3	6	36743	36748	50 %	0 %	50 %	0 %	197247307
43	NC_011148	TA	3	6	37619	37624	50 %	50 %	0 %	0 %	197247323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.