MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011147	CCTTC	2	10	8713	8722	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011147	GAAAA	2	10	10100	10109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011147	TCTTT	2	10	11362	11371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011147	TATTG	2	10	17609	17618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011147	GGCTG	2	10	18884	18893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011147	CCTGA	2	10	19946	19955	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011147	TTTTA	2	10	33244	33253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011147	ATCGT	2	10	34948	34957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011147	ATTTT	2	10	34992	35001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011147	ATTTT	2	10	35252	35261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011147	TGAAA	2	10	40154	40163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011147	TAAAA	2	10	44197	44206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011147	GAAGG	2	10	47370	47379	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011147	AGCGC	2	10	57240	57249	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011147	ACGCT	2	10	58782	58791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011147	TTAAT	2	10	75310	75319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011147	TAAAA	2	10	95552	95561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011147	GCGCT	2	10	97858	97867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011147	TGCAC	2	10	98624	98633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011147	TAATT	2	10	118271	118280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011147	ATTTT	2	10	118297	118306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011147	TAGTG	2	10	128349	128358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011147	GGTTT	2	10	135708	135717	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011147	CCCAA	2	10	139722	139731	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_011147	TTGTT	2	10	141069	141078	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011147	CGCGG	2	10	160206	160215	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011147	GCGCT	2	10	216666	216675	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011147	CGCGT	2	10	216718	216727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011147	ATATA	2	10	234867	234876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011147	CAACC	2	10	237220	237229	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_011147	GCACC	2	10	237639	237648	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011147	AAGTT	2	10	239691	239700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011147	TGCTC	2	10	250361	250370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011147	CGCTT	2	10	251551	251560	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011147	GTCTG	2	10	261297	261306	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011147	GCGCT	2	10	284150	284159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011147	TGTGT	2	10	290541	290550	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011147	AATGA	2	10	292252	292261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011147	GCTTC	2	10	295096	295105	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011147	AGCGC	2	10	298780	298789	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011147	CGCTG	2	10	306721	306730	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011147	ATAAA	2	10	314862	314871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011147	TTTGG	2	10	315163	315172	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011147	TGTAG	2	10	318028	318037	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011147	CGCTA	2	10	346780	346789	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011147	TGTGT	2	10	353023	353032	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011147	AAGCG	2	10	370430	370439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011147	ATTTA	2	10	381106	381115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011147	GGAAA	2	10	383266	383275	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011147	ATTTT	2	10	385922	385931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011147	AGCGC	2	10	395097	395106	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_011147	GCAGA	2	10	395398	395407	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011147	TTATT	2	10	395488	395497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011147	CTTTT	2	10	395615	395624	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011147	CGGGC	2	10	406356	406365	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011147	TTGCC	2	10	408468	408477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011147	CCGGC	2	10	410450	410459	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_011147	AATCA	2	10	413272	413281	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011147	CTGCA	2	10	413622	413631	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011147	TGACC	2	10	413782	413791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011147	TTGAG	2	10	415371	415380	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011147	GGTAA	2	10	417161	417170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011147	CCATG	2	10	424221	424230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011147	CCATT	2	10	440622	440631	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011147	AAAGT	2	10	468287	468296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011147	TATCG	2	10	487883	487892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011147	TTTCA	2	10	487934	487943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011147	CGCTT	2	10	489575	489584	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011147	CCGCG	2	10	491599	491608	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011147	GGATG	2	10	500120	500129	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011147	AGGTG	2	10	503231	503240	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011147	AGCGC	2	10	510987	510996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011147	GGCAG	2	10	513172	513181	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011147	GCATG	2	10	514210	514219	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011147	TACTG	2	10	517848	517857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011147	ATGAT	2	10	525578	525587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011147	AAATG	2	10	527105	527114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011147	TATGA	2	10	527479	527488	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011147	AAAAT	2	10	528858	528867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011147	CGACT	2	10	533630	533639	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011147	TATAA	2	10	537701	537710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011147	CATGA	2	10	538128	538137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011147	ATAAA	2	10	541256	541265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011147	ACCCG	2	10	551221	551230	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_011147	GAAAG	2	10	561602	561611	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011147	AGGGC	2	10	569263	569272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011147	CGCGC	2	10	582446	582455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_011147	ACAGG	2	10	583621	583630	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011147	GCAAA	2	10	596381	596390	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011147	ATTAA	2	10	641453	641462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011147	TGCTT	2	10	641510	641519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011147	GGCCT	2	10	649483	649492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_011147	GAGTA	2	10	650961	650970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011147	TGAGC	2	10	658882	658891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011147	ATTGT	2	10	665930	665939	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011147	GTGGC	2	10	697830	697839	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011147	TTAAA	2	10	698943	698952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011147	TTACC	2	10	699946	699955	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011147	AAAGT	2	10	704250	704259	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011147	CGGGG	2	10	704317	704326	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011147	TTTAT	2	10	708722	708731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011147	TCCGC	2	10	720464	720473	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_011147	GGCGT	2	10	738184	738193	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011147	GAGAG	2	10	751102	751111	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011147	CGTAG	2	10	759450	759459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011147	AAAGA	2	10	778676	778685	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011147	AGGTA	2	10	794780	794789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011147	CCAGA	2	10	797985	797994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011147	TTAAT	2	10	798680	798689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011147	TCTAT	2	10	805169	805178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011147	TTATT	2	10	806440	806449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011147	ATCAT	2	10	807488	807497	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011147	AGCGT	2	10	824035	824044	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011147	AATGC	2	10	835442	835451	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011147	GTGGA	2	10	835561	835570	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011147	GAACC	2	10	859417	859426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_011147	TATTT	2	10	877394	877403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011147	AGCGC	2	10	889258	889267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011147	CGGGT	2	10	898449	898458	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011147	TAAAA	2	10	898737	898746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011147	GCTTC	2	10	900652	900661	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011147	GAGAT	2	10	900906	900915	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011147	CGGTA	2	10	901093	901102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011147	ATAAA	2	10	902501	902510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011147	AAAGA	2	10	903530	903539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011147	ATTTA	2	10	923139	923148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011147	CAATT	2	10	949792	949801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011147	ATAAA	2	10	955718	955727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011147	TAAAG	2	10	965681	965690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011147	GACGC	2	10	977018	977027	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011147	TTATT	2	10	1002899	1002908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011147	TGTAG	2	10	1003610	1003619	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011147	ATATT	2	10	1004551	1004560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011147	AATAA	2	10	1004623	1004632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011147	AAGCG	2	10	1005693	1005702	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011147	TAAAA	2	10	1008822	1008831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011147	CCGTT	2	10	1009061	1009070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011147	GCCTT	2	10	1010298	1010307	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011147	CTTAT	2	10	1010367	1010376	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011147	AAAGT	2	10	1014896	1014905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011147	GGCGC	2	10	1019474	1019483	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011147	AGCTT	2	10	1024126	1024135	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011147	AATCA	2	10	1029361	1029370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011147	AAATT	2	10	1063163	1063172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011147	GACCA	2	10	1064259	1064268	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011147	GGAAA	2	10	1065748	1065757	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_011147	ACTTA	2	10	3553632	3553641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_011147	CCCAG	2	10	3630454	3630463	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

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