MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 9914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011147	ATA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011147	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011147	ACA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011147	AAC	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011147	CGC	2	6	5970	5975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011147	TTG	2	6	7447	7452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011147	TGA	2	6	7467	7472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011147	ATG	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011147	CGG	2	6	7544	7549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011147	CGT	2	6	7638	7643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011147	ATC	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011147	AAT	2	6	8761	8766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011147	GGA	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011147	TAG	2	6	9373	9378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011147	TCC	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011147	GGA	2	6	9398	9403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011147	ATC	2	6	9993	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011147	ATA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011147	TAA	2	6	10090	10095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011147	TTA	2	6	11372	11377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011147	GTT	2	6	11401	11406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011147	TCG	2	6	11456	11461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011147	TGA	2	6	11487	11492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011147	GTG	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011147	TTA	2	6	11581	11586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011147	ATG	2	6	11602	11607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011147	TTC	2	6	14783	14788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011147	TTG	2	6	14868	14873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011147	CAG	2	6	14910	14915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011147	TGA	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011147	TAT	2	6	15003	15008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011147	ATG	2	6	16034	16039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011147	CCT	2	6	16055	16060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011147	ATT	2	6	16088	16093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011147	ATT	2	6	17645	17650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011147	GTT	2	6	17737	17742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011147	GTT	2	6	17761	17766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011147	ATC	2	6	17790	17795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011147	GAT	2	6	17802	17807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011147	ACT	2	6	17942	17947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011147	CAA	2	6	17973	17978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011147	GAT	2	6	17981	17986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011147	TTA	2	6	18070	18075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011147	TTG	2	6	18189	18194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011147	AGA	2	6	18223	18228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011147	CGG	2	6	18466	18471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011147	CCG	2	6	18501	18506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011147	GTG	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011147	AGA	2	6	18637	18642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011147	GCT	2	6	18658	18663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011147	GCT	2	6	18779	18784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011147	TGA	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011147	CTT	2	6	18817	18822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011147	CCA	2	6	18850	18855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011147	CTG	2	6	18914	18919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011147	CGC	2	6	19005	19010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011147	TAC	2	6	19042	19047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011147	CGC	2	6	19212	19217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011147	CGA	2	6	19420	19425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011147	GCG	2	6	19454	19459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011147	TTC	2	6	19510	19515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011147	TGA	2	6	19516	19521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011147	CGG	2	6	19701	19706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011147	GAA	2	6	19745	19750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011147	GAA	2	6	19778	19783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011147	GAT	2	6	19802	19807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011147	CAG	2	6	19812	19817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011147	TGG	2	6	19925	19930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011147	CGG	2	6	19966	19971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011147	CCA	2	6	20064	20069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011147	TTA	2	6	23199	23204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011147	TAA	2	6	24128	24133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011147	AAG	2	6	24155	24160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011147	ATT	2	6	24161	24166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011147	ACA	2	6	24228	24233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011147	GAT	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011147	TAA	2	6	24292	24297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011147	TAA	2	6	24299	24304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011147	ACG	2	6	24339	24344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011147	AAG	2	6	24386	24391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011147	GAA	2	6	24432	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011147	CAG	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011147	TGC	2	6	30058	30063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011147	GGC	2	6	30065	30070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011147	GCA	2	6	30256	30261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011147	GCG	2	6	30268	30273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011147	GGC	2	6	30483	30488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011147	GGT	2	6	32497	32502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011147	ATA	2	6	33167	33172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011147	CAT	2	6	33234	33239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011147	TAA	2	6	33288	33293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011147	GTG	2	6	33333	33338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011147	ATG	2	6	33360	33365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011147	ATA	3	9	34879	34887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011147	ATG	2	6	34967	34972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011147	TAG	2	6	35025	35030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011147	TTG	2	6	35073	35078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011147	AAT	2	6	35085	35090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011147	ATT	2	6	35264	35269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011147	TTG	2	6	35283	35288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011147	TTG	2	6	35321	35326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011147	TAA	2	6	35353	35358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011147	TCA	2	6	38784	38789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011147	TGT	2	6	39597	39602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011147	AAG	2	6	39606	39611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011147	TGT	2	6	39702	39707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011147	TTA	2	6	39708	39713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011147	TGT	2	6	39747	39752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011147	AAT	2	6	39798	39803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011147	AAT	2	6	40010	40015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011147	GAA	2	6	40040	40045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011147	TAT	2	6	40213	40218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011147	ATT	2	6	40260	40265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011147	GAT	2	6	40272	40277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011147	AGG	2	6	40348	40353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011147	TAT	2	6	40371	40376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011147	CAG	2	6	40521	40526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011147	GAT	2	6	40541	40546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011147	CGG	2	6	40633	40638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011147	GTG	2	6	40692	40697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011147	GCG	2	6	40753	40758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011147	GTG	2	6	40776	40781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011147	ATA	2	6	40792	40797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011147	TTC	2	6	40815	40820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011147	AGC	2	6	40912	40917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011147	GGC	2	6	41175	41180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011147	ATC	2	6	41196	41201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011147	ATG	2	6	41283	41288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011147	ACG	2	6	41317	41322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011147	GAT	2	6	41430	41435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011147	TGA	2	6	41584	41589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011147	AAT	2	6	41634	41639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011147	GTA	2	6	42922	42927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011147	TGA	2	6	44211	44216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011147	GTT	2	6	44220	44225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011147	ATC	2	6	46040	46045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011147	TCA	2	6	46110	46115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_011147	GAA	2	6	46166	46171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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