MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter bemidjiensis Bem chromosome

Total Repeats: 577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011146	ACCCT	2	10	11015	11024	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011146	AGTAA	2	10	16178	16187	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011146	CCCTG	2	10	22787	22796	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_011146	TTTGA	2	10	26119	26128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011146	GGGGA	2	10	30157	30166	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011146	CCCGC	2	10	51467	51476	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_011146	CAATG	2	10	63869	63878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011146	AGGGG	2	10	82421	82430	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011146	CTTTG	2	10	90270	90279	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011146	AGGGG	2	10	95699	95708	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011146	CCCCT	2	10	142240	142249	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_011146	CGCCC	2	10	169511	169520	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_011146	GCTCG	2	10	172765	172774	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011146	CAAAG	2	10	174730	174739	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011146	AAGAA	2	10	186696	186705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011146	CTTTT	2	10	186734	186743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011146	TCCCC	2	10	212083	212092	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_011146	CAAAC	2	10	220369	220378	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011146	AGGGG	2	10	234221	234230	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011146	CCTCA	2	10	263571	263580	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011146	TTTTG	2	10	274238	274247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011146	TTAGA	2	10	282636	282645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011146	TAAAA	2	10	285729	285738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011146	ATTTT	2	10	291010	291019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011146	GAAAA	2	10	297281	297290	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011146	ATGCC	2	10	305435	305444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011146	GGGGA	2	10	307885	307894	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011146	TTTGA	2	10	308096	308105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011146	TCCCC	2	10	309101	309110	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30	NC_011146	TCCTG	2	10	310327	310336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011146	CGGAC	2	10	310355	310364	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011146	CAGGG	2	10	310446	310455	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011146	TCCCC	2	10	310595	310604	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_011146	AGGGG	2	10	321806	321815	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011146	AGGGG	2	10	382446	382455	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011146	GCTTC	2	10	387219	387228	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011146	ATTTT	2	10	402569	402578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011146	GGTAA	2	10	408424	408433	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011146	CTTGC	2	10	408468	408477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011146	ACCTT	2	10	413712	413721	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011146	GGGGT	2	10	415710	415719	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011146	GAGGG	2	10	420412	420421	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011146	GGGGA	2	10	420491	420500	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011146	AGGGG	2	10	440615	440624	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011146	CTAAA	2	10	450729	450738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011146	AGGTG	2	10	458776	458785	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011146	TAATT	2	10	462270	462279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011146	CGCTC	2	10	463577	463586	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_011146	TGCTC	2	10	468918	468927	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011146	TGAAA	2	10	475925	475934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011146	AGGGG	2	10	484984	484993	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011146	TGGTG	2	10	485146	485155	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011146	TTTGC	2	10	489664	489673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011146	TTTCT	2	10	492663	492672	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011146	TTATT	2	10	498137	498146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011146	GAGGG	2	10	502149	502158	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011146	AGGGG	2	10	504095	504104	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011146	GGGGA	2	10	504220	504229	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011146	CGCGG	2	10	511405	511414	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011146	CCCCT	2	10	521440	521449	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
61	NC_011146	CCCCT	2	10	539061	539070	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_011146	AGGCA	2	10	560646	560655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011146	TAAAA	2	10	560708	560717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011146	AGATT	2	10	563314	563323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011146	TTTTA	2	10	572842	572851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011146	CTCCC	2	10	596478	596487	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
67	NC_011146	AGGGG	2	10	596571	596580	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011146	TTTTG	2	10	614258	614267	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011146	TTCGC	2	10	627667	627676	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011146	ATTCG	2	10	631541	631550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011146	CGTCC	2	10	639134	639143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_011146	CGTTT	2	10	644909	644918	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011146	ATTAG	2	10	652430	652439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011146	GGGGA	2	10	652451	652460	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011146	GGAGG	2	10	654499	654508	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011146	GCAAA	2	10	669600	669609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011146	CAAAA	2	10	674114	674123	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011146	CGCCC	2	10	677652	677661	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
79	NC_011146	AGCCG	2	10	679799	679808	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011146	AGATG	2	10	684409	684418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011146	TCCCC	2	10	686794	686803	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_011146	GTTCG	2	10	687171	687180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011146	ATTTG	2	10	687191	687200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011146	CCCCT	2	10	697049	697058	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
85	NC_011146	CTTGC	2	10	716181	716190	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011146	ACCGG	2	10	717256	717265	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011146	GTTAG	2	10	724456	724465	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011146	GGCAA	2	10	729498	729507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011146	AGGGG	2	10	769294	769303	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011146	AGGGG	2	10	772838	772847	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011146	CTTTT	2	10	779393	779402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011146	ATTCA	2	10	784153	784162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011146	TCCTT	2	10	792739	792748	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_011146	CTCTG	2	10	803775	803784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011146	GGCGG	2	10	804311	804320	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011146	GCAGG	2	10	804430	804439	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011146	GCGCG	2	10	804473	804482	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011146	AGGGG	2	10	841316	841325	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011146	TTTCA	2	10	841442	841451	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011146	TCTCC	2	10	849058	849067	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_011146	GCAAA	2	10	865614	865623	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011146	ACGGA	2	10	867669	867678	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011146	CGGGC	2	10	869566	869575	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011146	CTTGC	2	10	871161	871170	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011146	AACGA	2	10	888974	888983	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011146	TTTTC	2	10	890879	890888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_011146	TGCCG	2	10	895627	895636	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011146	AAACA	2	10	909267	909276	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011146	AGGGG	2	10	921411	921420	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011146	AGGGG	2	10	923487	923496	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011146	CTGTC	2	10	926359	926368	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_011146	CTTTT	2	10	926386	926395	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011146	AGGGG	2	10	926487	926496	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011146	TCTTT	2	10	935508	935517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011146	TTAAA	2	10	950494	950503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011146	TCGTG	2	10	951582	951591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011146	GAAAA	2	10	952859	952868	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011146	ACCGT	2	10	954295	954304	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011146	TCACC	2	10	957601	957610	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_011146	TGGAT	2	10	966386	966395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011146	ACTGG	2	10	970434	970443	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011146	CTTCT	2	10	980111	980120	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011146	TTCTT	2	10	987106	987115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011146	TTAGT	2	10	988616	988625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011146	AGGGG	2	10	1000811	1000820	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011146	CCGCT	2	10	1036813	1036822	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_011146	GTTTT	2	10	1038895	1038904	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011146	GTCCA	2	10	1040268	1040277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011146	TTCTC	2	10	1042726	1042735	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_011146	GGGGT	2	10	1047503	1047512	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011146	GGCAG	2	10	1049048	1049057	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011146	CTTTC	2	10	1074208	1074217	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011146	TTCGC	2	10	1079419	1079428	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011146	AGATG	2	10	1079673	1079682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011146	TTAAA	2	10	1123827	1123836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011146	TCGTG	2	10	1124915	1124924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011146	GAAAA	2	10	1126186	1126195	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011146	ACCGT	2	10	1127622	1127631	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011146	TTGCA	2	10	1129274	1129283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011146	TCCCC	2	10	1142164	1142173	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_011146	GGGGA	2	10	1142181	1142190	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011146	ATGTG	2	10	1147407	1147416	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011146	AATTA	2	10	1153785	1153794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011146	GCCGC	2	10	1161970	1161979	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_011146	CCGCC	2	10	1168559	1168568	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
146	NC_011146	CCGCA	2	10	1169575	1169584	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_011146	TTAAA	2	10	1175442	1175451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_011146	AGGGG	2	10	1988806	1988815	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_011146	TGGAA	2	10	2278265	2278274	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_011146	AGGGG	2	10	2293732	2293741	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_011146	TTTGA	2	10	2314533	2314542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_011146	TGGGG	2	10	3709228	3709237	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011146	GCATA	2	10	3711692	3711701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
464	NC_011146	TTTCG	2	10	3732374	3732383	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_011146	TTTAA	2	10	3907688	3907697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_011146	CCCGC	2	10	3928117	3928126	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
491	NC_011146	GAGTG	2	10	3930223	3930232	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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