MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 1613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	TGAAA	2	10	2979	2988	60 %	20 %	20 %	0 %	195977159
2	NC_011134	AAAGG	2	10	3255	3264	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011134	TGGTA	2	10	3845	3854	20 %	40 %	40 %	0 %	195977161
4	NC_011134	AGCAA	2	10	7255	7264	60 %	0 %	20 %	20 %	195977163
5	NC_011134	GCTTC	2	10	8861	8870	0 %	40 %	20 %	40 %	195977163
6	NC_011134	TTTTA	2	10	9987	9996	20 %	80 %	0 %	0 %	195977164
7	NC_011134	TGCTG	2	10	10295	10304	0 %	40 %	40 %	20 %	195977164
8	NC_011134	TTATC	2	10	12548	12557	20 %	60 %	0 %	20 %	195977167
9	NC_011134	TGACT	2	10	13616	13625	20 %	40 %	20 %	20 %	195977168
10	NC_011134	GATTA	2	10	14384	14393	40 %	40 %	20 %	0 %	195977169
11	NC_011134	GTATG	2	10	16095	16104	20 %	40 %	40 %	0 %	195977170
12	NC_011134	GATTT	2	10	16680	16689	20 %	60 %	20 %	0 %	195977171
13	NC_011134	GTATT	2	10	17377	17386	20 %	60 %	20 %	0 %	195977171
14	NC_011134	TCGTG	2	10	19343	19352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011134	CGGTT	2	10	19963	19972	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011134	GTTAA	2	10	20235	20244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011134	GGGAG	2	10	20754	20763	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011134	AGGGA	2	10	22962	22971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011134	TAAGT	2	10	23214	23223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011134	GCTTA	2	10	23327	23336	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011134	GCATA	2	10	23924	23933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011134	CTTTT	2	10	25738	25747	0 %	80 %	0 %	20 %	195977173
23	NC_011134	CTTGC	2	10	25947	25956	0 %	40 %	20 %	40 %	195977173
24	NC_011134	TTTTG	2	10	26164	26173	0 %	80 %	20 %	0 %	195977173
25	NC_011134	TTTAT	2	10	31101	31110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011134	GCTTG	2	10	34397	34406	0 %	40 %	40 %	20 %	195977180
27	NC_011134	AGGCA	2	10	34630	34639	40 %	0 %	40 %	20 %	195977180
28	NC_011134	CAGCT	2	10	34759	34768	20 %	20 %	20 %	40 %	195977180
29	NC_011134	ATCTG	2	10	36144	36153	20 %	40 %	20 %	20 %	195977181
30	NC_011134	AAATG	2	10	36870	36879	60 %	20 %	20 %	0 %	195977181
31	NC_011134	ACAAG	2	10	39748	39757	60 %	0 %	20 %	20 %	195977184
32	NC_011134	AAGCA	2	10	39802	39811	60 %	0 %	20 %	20 %	195977184
33	NC_011134	GTGGA	2	10	41277	41286	20 %	20 %	60 %	0 %	195977185
34	NC_011134	AGCAG	2	10	45282	45291	40 %	0 %	40 %	20 %	195977188
35	NC_011134	TAGCC	2	10	47670	47679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011134	TGACA	2	10	49659	49668	40 %	20 %	20 %	20 %	195977191
37	NC_011134	CTTGT	2	10	51443	51452	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011134	TTGGT	2	10	51661	51670	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011134	CTTTC	2	10	51825	51834	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011134	TTTTC	2	10	52211	52220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011134	ATCCA	2	10	52627	52636	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011134	TGGTA	2	10	52882	52891	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011134	ATGGT	2	10	54167	54176	20 %	40 %	40 %	0 %	195977195
44	NC_011134	ATTCA	2	10	54851	54860	40 %	40 %	0 %	20 %	195977195
45	NC_011134	AACCA	2	10	57831	57840	60 %	0 %	0 %	40 %	195977198
46	NC_011134	TGACT	2	10	59193	59202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011134	AAATG	2	10	59239	59248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011134	ACATA	2	10	59373	59382	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011134	GATAC	2	10	59497	59506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011134	TCTTT	2	10	60401	60410	0 %	80 %	0 %	20 %	195977199
51	NC_011134	AGGAT	2	10	61340	61349	40 %	20 %	40 %	0 %	195977200
52	NC_011134	TTTTG	2	10	62081	62090	0 %	80 %	20 %	0 %	195977200
53	NC_011134	GATTT	2	10	62309	62318	20 %	60 %	20 %	0 %	195977200
54	NC_011134	ATTTA	2	10	62710	62719	40 %	60 %	0 %	0 %	195977201
55	NC_011134	TGAAG	2	10	63427	63436	40 %	20 %	40 %	0 %	195977201
56	NC_011134	TCATA	2	10	63580	63589	40 %	40 %	0 %	20 %	195977201
57	NC_011134	GAATT	2	10	63893	63902	40 %	40 %	20 %	0 %	195977202
58	NC_011134	AATTT	2	10	64109	64118	40 %	60 %	0 %	0 %	195977202
59	NC_011134	AGTCA	2	10	64642	64651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011134	TTTAG	2	10	64707	64716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011134	TGCCA	2	10	65058	65067	20 %	20 %	20 %	40 %	195977203
62	NC_011134	AAGCT	2	10	68215	68224	40 %	20 %	20 %	20 %	195977206
63	NC_011134	GAAAA	2	10	72011	72020	80 %	0 %	20 %	0 %	195977212
64	NC_011134	TTTGG	2	10	72425	72434	0 %	60 %	40 %	0 %	195977213
65	NC_011134	TTCAC	2	10	72781	72790	20 %	40 %	0 %	40 %	195977214
66	NC_011134	TGAAA	2	10	73861	73870	60 %	20 %	20 %	0 %	195977216
67	NC_011134	AAGGA	2	10	74949	74958	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011134	AAATA	2	10	79174	79183	80 %	20 %	0 %	0 %	195977228
69	NC_011134	TTCCT	2	10	79278	79287	0 %	60 %	0 %	40 %	195977228
70	NC_011134	TCCAA	2	10	79855	79864	40 %	20 %	0 %	40 %	195977228
71	NC_011134	AGAAT	2	10	80425	80434	60 %	20 %	20 %	0 %	195977228
72	NC_011134	ACTAG	2	10	81266	81275	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011134	GTTTC	2	10	82510	82519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011134	TCGTG	2	10	89461	89470	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011134	CGGTT	2	10	90081	90090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011134	GTTAA	2	10	90353	90362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011134	GGGAG	2	10	90872	90881	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011134	AGGGA	2	10	93080	93089	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011134	TAAGT	2	10	93332	93341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011134	GCTTA	2	10	93445	93454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011134	AGTTT	2	10	94423	94432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011134	TCTTT	2	10	94567	94576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011134	CTTTC	2	10	95959	95968	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_011134	TGCTT	2	10	96623	96632	0 %	60 %	20 %	20 %	195977243
85	NC_011134	CGCTC	2	10	97687	97696	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_011134	CTTGA	2	10	97909	97918	20 %	40 %	20 %	20 %	195977245
87	NC_011134	ATTCA	2	10	98729	98738	40 %	40 %	0 %	20 %	195977245
88	NC_011134	TCTTT	2	10	99119	99128	0 %	80 %	0 %	20 %	195977245
89	NC_011134	TTCTT	2	10	100897	100906	0 %	80 %	0 %	20 %	195977247
90	NC_011134	CAACC	2	10	102964	102973	40 %	0 %	0 %	60 %	195977249
91	NC_011134	CTAAA	2	10	103723	103732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011134	GAAAA	2	10	105004	105013	80 %	0 %	20 %	0 %	195977250
93	NC_011134	GATAA	2	10	105137	105146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011134	GGTCT	2	10	105194	105203	0 %	40 %	40 %	20 %	195977251
95	NC_011134	AAGGA	2	10	106052	106061	60 %	0 %	40 %	0 %	195977251
96	NC_011134	TGTTT	2	10	110162	110171	0 %	80 %	20 %	0 %	195977256
97	NC_011134	TTCCT	2	10	116440	116449	0 %	60 %	0 %	40 %	195977259
98	NC_011134	GACTA	2	10	118146	118155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011134	ATTGA	2	10	123521	123530	40 %	40 %	20 %	0 %	195977262
100	NC_011134	TAAGG	2	10	125517	125526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011134	TTTGG	2	10	125582	125591	0 %	60 %	40 %	0 %	195977264
102	NC_011134	AACAC	2	10	126966	126975	60 %	0 %	0 %	40 %	195977264
103	NC_011134	ATCAA	2	10	130083	130092	60 %	20 %	0 %	20 %	195977267
104	NC_011134	CAAAG	2	10	131134	131143	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011134	GCTTT	2	10	132100	132109	0 %	60 %	20 %	20 %	195977272
106	NC_011134	AGGTA	2	10	132494	132503	40 %	20 %	40 %	0 %	195977272
107	NC_011134	CTTGA	2	10	132806	132815	20 %	40 %	20 %	20 %	195977272
108	NC_011134	TTTCA	2	10	133467	133476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011134	TGATA	2	10	133486	133495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011134	AATCG	2	10	134339	134348	40 %	20 %	20 %	20 %	195977274
111	NC_011134	TGATT	2	10	134720	134729	20 %	60 %	20 %	0 %	195977275
112	NC_011134	TCACT	2	10	136609	136618	20 %	40 %	0 %	40 %	195977276
113	NC_011134	ATTAT	2	10	136814	136823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011134	GCTTG	2	10	137010	137019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011134	TTTAT	2	10	137894	137903	20 %	80 %	0 %	0 %	195977277
116	NC_011134	ATCAG	2	10	138172	138181	40 %	20 %	20 %	20 %	195977277
117	NC_011134	ACGAT	2	10	138587	138596	40 %	20 %	20 %	20 %	195977277
118	NC_011134	GCTTT	2	10	138771	138780	0 %	60 %	20 %	20 %	195977277
119	NC_011134	AAGGA	2	10	142337	142346	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011134	ACATC	2	10	146847	146856	40 %	20 %	0 %	40 %	195977283
121	NC_011134	TTTCC	2	10	149882	149891	0 %	60 %	0 %	40 %	195977284
122	NC_011134	CATGT	2	10	149901	149910	20 %	40 %	20 %	20 %	195977284
123	NC_011134	GATTC	2	10	151207	151216	20 %	40 %	20 %	20 %	195977286
124	NC_011134	GCTTG	2	10	152516	152525	0 %	40 %	40 %	20 %	195977287
125	NC_011134	TTAAG	2	10	153830	153839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011134	AAGTT	2	10	154741	154750	40 %	40 %	20 %	0 %	195977288
127	NC_011134	ATGCT	2	10	155699	155708	20 %	40 %	20 %	20 %	195977289
128	NC_011134	TCTTT	2	10	157116	157125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011134	TTGAA	2	10	158516	158525	40 %	40 %	20 %	0 %	195977293
130	NC_011134	TACAG	2	10	160531	160540	40 %	20 %	20 %	20 %	195977295
131	NC_011134	AAAGG	2	10	160632	160641	60 %	0 %	40 %	0 %	195977295
132	NC_011134	AAAAG	2	10	162772	162781	80 %	0 %	20 %	0 %	195977297
133	NC_011134	TTGCT	2	10	163187	163196	0 %	60 %	20 %	20 %	195977298
134	NC_011134	TGGAG	2	10	166063	166072	20 %	20 %	60 %	0 %	195977300
135	NC_011134	AAGAT	2	10	167490	167499	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011134	AAAAT	2	10	169483	169492	80 %	20 %	0 %	0 %	195977304
137	NC_011134	AAAGG	2	10	169974	169983	60 %	0 %	40 %	0 %	195977305
138	NC_011134	GCAGC	2	10	169984	169993	20 %	0 %	40 %	40 %	195977305
139	NC_011134	GAGCA	2	10	170557	170566	40 %	0 %	40 %	20 %	195977305
140	NC_011134	CAGCT	2	10	171126	171135	20 %	20 %	20 %	40 %	195977305
141	NC_011134	CAAGC	2	10	171244	171253	40 %	0 %	20 %	40 %	195977305
142	NC_011134	CAGCT	2	10	172818	172827	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_011134	GGTCA	2	10	173172	173181	20 %	20 %	40 %	20 %	195977307
144	NC_011134	TAATA	2	10	173868	173877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011134	GTGTT	2	10	175739	175748	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_011134	ATTAG	2	10	196396	196405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_011134	TTTTC	2	10	335553	335562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
270	NC_011134	GACTT	2	10	335662	335671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
271	NC_011134	TGAGA	2	10	335722	335731	40 %	20 %	40 %	0 %	195977462
272	NC_011134	TGCCT	2	10	337153	337162	0 %	40 %	20 %	40 %	195977464
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387	NC_011134	TGGCT	2	10	487193	487202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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402	NC_011134	TGCTT	2	10	499373	499382	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
403	NC_011134	AGAGC	2	10	500692	500701	40 %	0 %	40 %	20 %	195977620
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