MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 1241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	TGAAA	2	10	2979	2988	60 %	20 %	20 %	0 %	195977159
2	NC_011134	TGGTA	2	10	3845	3854	20 %	40 %	40 %	0 %	195977161
3	NC_011134	AGCAA	2	10	7255	7264	60 %	0 %	20 %	20 %	195977163
4	NC_011134	GCTTC	2	10	8861	8870	0 %	40 %	20 %	40 %	195977163
5	NC_011134	TTTTA	2	10	9987	9996	20 %	80 %	0 %	0 %	195977164
6	NC_011134	TGCTG	2	10	10295	10304	0 %	40 %	40 %	20 %	195977164
7	NC_011134	TTATC	2	10	12548	12557	20 %	60 %	0 %	20 %	195977167
8	NC_011134	TGACT	2	10	13616	13625	20 %	40 %	20 %	20 %	195977168
9	NC_011134	GATTA	2	10	14384	14393	40 %	40 %	20 %	0 %	195977169
10	NC_011134	GTATG	2	10	16095	16104	20 %	40 %	40 %	0 %	195977170
11	NC_011134	GATTT	2	10	16680	16689	20 %	60 %	20 %	0 %	195977171
12	NC_011134	GTATT	2	10	17377	17386	20 %	60 %	20 %	0 %	195977171
13	NC_011134	CTTTT	2	10	25738	25747	0 %	80 %	0 %	20 %	195977173
14	NC_011134	CTTGC	2	10	25947	25956	0 %	40 %	20 %	40 %	195977173
15	NC_011134	TTTTG	2	10	26164	26173	0 %	80 %	20 %	0 %	195977173
16	NC_011134	GCTTG	2	10	34397	34406	0 %	40 %	40 %	20 %	195977180
17	NC_011134	AGGCA	2	10	34630	34639	40 %	0 %	40 %	20 %	195977180
18	NC_011134	CAGCT	2	10	34759	34768	20 %	20 %	20 %	40 %	195977180
19	NC_011134	ATCTG	2	10	36144	36153	20 %	40 %	20 %	20 %	195977181
20	NC_011134	AAATG	2	10	36870	36879	60 %	20 %	20 %	0 %	195977181
21	NC_011134	ACAAG	2	10	39748	39757	60 %	0 %	20 %	20 %	195977184
22	NC_011134	AAGCA	2	10	39802	39811	60 %	0 %	20 %	20 %	195977184
23	NC_011134	GTGGA	2	10	41277	41286	20 %	20 %	60 %	0 %	195977185
24	NC_011134	AGCAG	2	10	45282	45291	40 %	0 %	40 %	20 %	195977188
25	NC_011134	TGACA	2	10	49659	49668	40 %	20 %	20 %	20 %	195977191
26	NC_011134	ATGGT	2	10	54167	54176	20 %	40 %	40 %	0 %	195977195
27	NC_011134	ATTCA	2	10	54851	54860	40 %	40 %	0 %	20 %	195977195
28	NC_011134	AACCA	2	10	57831	57840	60 %	0 %	0 %	40 %	195977198
29	NC_011134	TCTTT	2	10	60401	60410	0 %	80 %	0 %	20 %	195977199
30	NC_011134	AGGAT	2	10	61340	61349	40 %	20 %	40 %	0 %	195977200
31	NC_011134	TTTTG	2	10	62081	62090	0 %	80 %	20 %	0 %	195977200
32	NC_011134	GATTT	2	10	62309	62318	20 %	60 %	20 %	0 %	195977200
33	NC_011134	ATTTA	2	10	62710	62719	40 %	60 %	0 %	0 %	195977201
34	NC_011134	TGAAG	2	10	63427	63436	40 %	20 %	40 %	0 %	195977201
35	NC_011134	TCATA	2	10	63580	63589	40 %	40 %	0 %	20 %	195977201
36	NC_011134	GAATT	2	10	63893	63902	40 %	40 %	20 %	0 %	195977202
37	NC_011134	AATTT	2	10	64109	64118	40 %	60 %	0 %	0 %	195977202
38	NC_011134	TGCCA	2	10	65058	65067	20 %	20 %	20 %	40 %	195977203
39	NC_011134	AAGCT	2	10	68215	68224	40 %	20 %	20 %	20 %	195977206
40	NC_011134	GAAAA	2	10	72011	72020	80 %	0 %	20 %	0 %	195977212
41	NC_011134	TTTGG	2	10	72425	72434	0 %	60 %	40 %	0 %	195977213
42	NC_011134	TTCAC	2	10	72781	72790	20 %	40 %	0 %	40 %	195977214
43	NC_011134	TGAAA	2	10	73861	73870	60 %	20 %	20 %	0 %	195977216
44	NC_011134	AAATA	2	10	79174	79183	80 %	20 %	0 %	0 %	195977228
45	NC_011134	TTCCT	2	10	79278	79287	0 %	60 %	0 %	40 %	195977228
46	NC_011134	TCCAA	2	10	79855	79864	40 %	20 %	0 %	40 %	195977228
47	NC_011134	AGAAT	2	10	80425	80434	60 %	20 %	20 %	0 %	195977228
48	NC_011134	TGCTT	2	10	96623	96632	0 %	60 %	20 %	20 %	195977243
49	NC_011134	CTTGA	2	10	97909	97918	20 %	40 %	20 %	20 %	195977245
50	NC_011134	ATTCA	2	10	98729	98738	40 %	40 %	0 %	20 %	195977245
51	NC_011134	TCTTT	2	10	99119	99128	0 %	80 %	0 %	20 %	195977245
52	NC_011134	TTCTT	2	10	100897	100906	0 %	80 %	0 %	20 %	195977247
53	NC_011134	CAACC	2	10	102964	102973	40 %	0 %	0 %	60 %	195977249
54	NC_011134	GAAAA	2	10	105004	105013	80 %	0 %	20 %	0 %	195977250
55	NC_011134	GGTCT	2	10	105194	105203	0 %	40 %	40 %	20 %	195977251
56	NC_011134	AAGGA	2	10	106052	106061	60 %	0 %	40 %	0 %	195977251
57	NC_011134	TGTTT	2	10	110162	110171	0 %	80 %	20 %	0 %	195977256
58	NC_011134	TTCCT	2	10	116440	116449	0 %	60 %	0 %	40 %	195977259
59	NC_011134	ATTGA	2	10	123521	123530	40 %	40 %	20 %	0 %	195977262
60	NC_011134	TTTGG	2	10	125582	125591	0 %	60 %	40 %	0 %	195977264
61	NC_011134	AACAC	2	10	126966	126975	60 %	0 %	0 %	40 %	195977264
62	NC_011134	ATCAA	2	10	130083	130092	60 %	20 %	0 %	20 %	195977267
63	NC_011134	GCTTT	2	10	132100	132109	0 %	60 %	20 %	20 %	195977272
64	NC_011134	AGGTA	2	10	132494	132503	40 %	20 %	40 %	0 %	195977272
65	NC_011134	CTTGA	2	10	132806	132815	20 %	40 %	20 %	20 %	195977272
66	NC_011134	AATCG	2	10	134339	134348	40 %	20 %	20 %	20 %	195977274
67	NC_011134	TGATT	2	10	134720	134729	20 %	60 %	20 %	0 %	195977275
68	NC_011134	TCACT	2	10	136609	136618	20 %	40 %	0 %	40 %	195977276
69	NC_011134	TTTAT	2	10	137894	137903	20 %	80 %	0 %	0 %	195977277
70	NC_011134	ATCAG	2	10	138172	138181	40 %	20 %	20 %	20 %	195977277
71	NC_011134	ACGAT	2	10	138587	138596	40 %	20 %	20 %	20 %	195977277
72	NC_011134	GCTTT	2	10	138771	138780	0 %	60 %	20 %	20 %	195977277
73	NC_011134	ACATC	2	10	146847	146856	40 %	20 %	0 %	40 %	195977283
74	NC_011134	TTTCC	2	10	149882	149891	0 %	60 %	0 %	40 %	195977284
75	NC_011134	CATGT	2	10	149901	149910	20 %	40 %	20 %	20 %	195977284
76	NC_011134	GATTC	2	10	151207	151216	20 %	40 %	20 %	20 %	195977286
77	NC_011134	GCTTG	2	10	152516	152525	0 %	40 %	40 %	20 %	195977287
78	NC_011134	AAGTT	2	10	154741	154750	40 %	40 %	20 %	0 %	195977288
79	NC_011134	ATGCT	2	10	155699	155708	20 %	40 %	20 %	20 %	195977289
80	NC_011134	TTGAA	2	10	158516	158525	40 %	40 %	20 %	0 %	195977293
81	NC_011134	TACAG	2	10	160531	160540	40 %	20 %	20 %	20 %	195977295
82	NC_011134	AAAGG	2	10	160632	160641	60 %	0 %	40 %	0 %	195977295
83	NC_011134	AAAAG	2	10	162772	162781	80 %	0 %	20 %	0 %	195977297
84	NC_011134	TTGCT	2	10	163187	163196	0 %	60 %	20 %	20 %	195977298
85	NC_011134	TGGAG	2	10	166063	166072	20 %	20 %	60 %	0 %	195977300
86	NC_011134	AAAAT	2	10	169483	169492	80 %	20 %	0 %	0 %	195977304
87	NC_011134	AAAGG	2	10	169974	169983	60 %	0 %	40 %	0 %	195977305
88	NC_011134	GCAGC	2	10	169984	169993	20 %	0 %	40 %	40 %	195977305
89	NC_011134	GAGCA	2	10	170557	170566	40 %	0 %	40 %	20 %	195977305
90	NC_011134	CAGCT	2	10	171126	171135	20 %	20 %	20 %	40 %	195977305
91	NC_011134	CAAGC	2	10	171244	171253	40 %	0 %	20 %	40 %	195977305
92	NC_011134	GGTCA	2	10	173172	173181	20 %	20 %	40 %	20 %	195977307
93	NC_011134	ATTAT	2	10	175875	175884	40 %	60 %	0 %	0 %	195977310
94	NC_011134	CTTGT	2	10	176566	176575	0 %	60 %	20 %	20 %	195977310
95	NC_011134	GTATT	2	10	176717	176726	20 %	60 %	20 %	0 %	195977310
96	NC_011134	GCAAA	2	10	178510	178519	60 %	0 %	20 %	20 %	195977311
97	NC_011134	GCCTA	2	10	179693	179702	20 %	20 %	20 %	40 %	195977313
98	NC_011134	AAAGG	2	10	181591	181600	60 %	0 %	40 %	0 %	195977313
99	NC_011134	AAGAG	2	10	181635	181644	60 %	0 %	40 %	0 %	195977313
100	NC_011134	TTGGA	2	10	185926	185935	20 %	40 %	40 %	0 %	195977319
101	NC_011134	TTTGA	2	10	189057	189066	20 %	60 %	20 %	0 %	195977321
102	NC_011134	AAGGA	2	10	191376	191385	60 %	0 %	40 %	0 %	195977324
103	NC_011134	TTGGC	2	10	191631	191640	0 %	40 %	40 %	20 %	195977324
104	NC_011134	TGGAT	2	10	192449	192458	20 %	40 %	40 %	0 %	195977325
105	NC_011134	TGGCT	2	10	193101	193110	0 %	40 %	40 %	20 %	195977325
106	NC_011134	GATTG	2	10	197406	197415	20 %	40 %	40 %	0 %	195977329
107	NC_011134	AATTG	2	10	198600	198609	40 %	40 %	20 %	0 %	195977329
108	NC_011134	GCTTG	2	10	200010	200019	0 %	40 %	40 %	20 %	195977330
109	NC_011134	CAATC	2	10	205208	205217	40 %	20 %	0 %	40 %	195977333
110	NC_011134	AAGAT	2	10	207136	207145	60 %	20 %	20 %	0 %	195977334
111	NC_011134	GCTAG	2	10	215703	215712	20 %	20 %	40 %	20 %	195977342
112	NC_011134	TCTTT	2	10	216757	216766	0 %	80 %	0 %	20 %	195977343
113	NC_011134	AGATT	2	10	217365	217374	40 %	40 %	20 %	0 %	195977344
114	NC_011134	TATTT	2	10	217681	217690	20 %	80 %	0 %	0 %	195977344
115	NC_011134	AAGGG	2	10	218540	218549	40 %	0 %	60 %	0 %	195977346
116	NC_011134	ATCAA	2	10	220220	220229	60 %	20 %	0 %	20 %	195977347
117	NC_011134	ATTCA	2	10	221244	221253	40 %	40 %	0 %	20 %	195977348
118	NC_011134	CCAAG	2	10	221366	221375	40 %	0 %	20 %	40 %	195977348
119	NC_011134	TATCA	2	10	222550	222559	40 %	40 %	0 %	20 %	195977349
120	NC_011134	ACGTC	2	10	225867	225876	20 %	20 %	20 %	40 %	195977351
121	NC_011134	GCCTA	2	10	227312	227321	20 %	20 %	20 %	40 %	195977352
122	NC_011134	CTGTT	2	10	228149	228158	0 %	60 %	20 %	20 %	195977352
123	NC_011134	CAAGC	2	10	229274	229283	40 %	0 %	20 %	40 %	195977354
124	NC_011134	GCTTA	2	10	230937	230946	20 %	40 %	20 %	20 %	195977356
125	NC_011134	AACTT	2	10	233295	233304	40 %	40 %	0 %	20 %	195977358
126	NC_011134	ATGAT	2	10	234280	234289	40 %	40 %	20 %	0 %	195977358
127	NC_011134	TAAAT	2	10	234719	234728	60 %	40 %	0 %	0 %	195977359
128	NC_011134	CTTGG	2	10	239106	239115	0 %	40 %	40 %	20 %	195977363
129	NC_011134	CTTGG	2	10	239214	239223	0 %	40 %	40 %	20 %	195977363
130	NC_011134	TGAAT	2	10	239336	239345	40 %	40 %	20 %	0 %	195977363
131	NC_011134	AATCA	2	10	239755	239764	60 %	20 %	0 %	20 %	195977364
132	NC_011134	TTTTG	2	10	240488	240497	0 %	80 %	20 %	0 %	195977364
133	NC_011134	AAGAG	2	10	241076	241085	60 %	0 %	40 %	0 %	195977366
134	NC_011134	TGCTC	2	10	241230	241239	0 %	40 %	20 %	40 %	195977367
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