MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 5413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	TTTA	2	8	183	190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011134	AGCT	2	8	273	280	25 %	25 %	25 %	25 %	195977157
3	NC_011134	TGCT	2	8	1395	1402	0 %	50 %	25 %	25 %	195977157
4	NC_011134	TTCA	2	8	1772	1779	25 %	50 %	0 %	25 %	195977158
5	NC_011134	ATAA	2	8	2917	2924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011134	TGAG	2	8	2938	2945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011134	AATT	2	8	4126	4133	50 %	50 %	0 %	0 %	195977161
8	NC_011134	AATC	2	8	4147	4154	50 %	25 %	0 %	25 %	195977161
9	NC_011134	GTGC	2	8	4614	4621	0 %	25 %	50 %	25 %	195977161
10	NC_011134	AGGA	2	8	4777	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	195977161
11	NC_011134	CAAA	2	8	5043	5050	75 %	0 %	0 %	25 %	195977162
12	NC_011134	ATCA	2	8	5151	5158	50 %	25 %	0 %	25 %	195977162
13	NC_011134	ATTT	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	195977162
14	NC_011134	CAAT	2	8	5470	5477	50 %	25 %	0 %	25 %	195977162
15	NC_011134	CTTG	2	8	5776	5783	0 %	50 %	25 %	25 %	195977163
16	NC_011134	AATG	2	8	6413	6420	50 %	25 %	25 %	0 %	195977163
17	NC_011134	AGTT	2	8	6477	6484	25 %	50 %	25 %	0 %	195977163
18	NC_011134	TCAA	2	8	6702	6709	50 %	25 %	0 %	25 %	195977163
19	NC_011134	ACTG	2	8	7858	7865	25 %	25 %	25 %	25 %	195977163
20	NC_011134	TATT	2	8	8762	8769	25 %	75 %	0 %	0 %	195977163
21	NC_011134	TTGG	2	8	9553	9560	0 %	50 %	50 %	0 %	195977164
22	NC_011134	ACTG	2	8	10004	10011	25 %	25 %	25 %	25 %	195977164
23	NC_011134	GCTG	2	8	10069	10076	0 %	25 %	50 %	25 %	195977164
24	NC_011134	GCTT	2	8	10346	10353	0 %	50 %	25 %	25 %	195977164
25	NC_011134	TTGC	2	8	10391	10398	0 %	50 %	25 %	25 %	195977164
26	NC_011134	GATT	2	8	10603	10610	25 %	50 %	25 %	0 %	195977165
27	NC_011134	TTAT	2	8	11168	11175	25 %	75 %	0 %	0 %	195977166
28	NC_011134	AGGA	2	8	11330	11337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011134	GCTT	2	8	12350	12357	0 %	50 %	25 %	25 %	195977167
30	NC_011134	CTAT	2	8	12389	12396	25 %	50 %	0 %	25 %	195977167
31	NC_011134	CTAT	2	8	12865	12872	25 %	50 %	0 %	25 %	195977168
32	NC_011134	AGCT	2	8	13396	13403	25 %	25 %	25 %	25 %	195977168
33	NC_011134	CAGG	3	12	13685	13696	25 %	0 %	50 %	25 %	195977168
34	NC_011134	ATTA	2	8	14613	14620	50 %	50 %	0 %	0 %	195977170
35	NC_011134	TTGC	2	8	15181	15188	0 %	50 %	25 %	25 %	195977170
36	NC_011134	TGTT	2	8	15254	15261	0 %	75 %	25 %	0 %	195977170
37	NC_011134	GAGC	2	8	15313	15320	25 %	0 %	50 %	25 %	195977170
38	NC_011134	GATG	2	8	15426	15433	25 %	25 %	50 %	0 %	195977170
39	NC_011134	AACC	2	8	15471	15478	50 %	0 %	0 %	50 %	195977170
40	NC_011134	TGAT	2	8	16202	16209	25 %	50 %	25 %	0 %	195977170
41	NC_011134	ACTT	2	8	17065	17072	25 %	50 %	0 %	25 %	195977171
42	NC_011134	TTTA	2	8	17177	17184	25 %	75 %	0 %	0 %	195977171
43	NC_011134	AAGA	2	8	17989	17996	75 %	0 %	25 %	0 %	195977171
44	NC_011134	GTGA	2	8	18676	18683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011134	TAAC	2	8	18759	18766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011134	AGCG	2	8	18847	18854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011134	TGGT	2	8	19512	19519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011134	AGCC	2	8	19729	19736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011134	GTAA	2	8	20321	20328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011134	GAAG	2	8	20403	20410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011134	ATTC	2	8	21341	21348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011134	CTAA	2	8	21696	21703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011134	CTGA	2	8	21969	21976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011134	TAGG	2	8	22351	22358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011134	TTGG	2	8	22534	22541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011134	AATC	2	8	22543	22550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011134	GCGT	2	8	24339	24346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011134	TGCT	2	8	26568	26575	0 %	50 %	25 %	25 %	195977174
59	NC_011134	GCAG	2	8	26965	26972	25 %	0 %	50 %	25 %	195977174
60	NC_011134	TGGT	2	8	27436	27443	0 %	50 %	50 %	0 %	195977174
61	NC_011134	ATTG	2	8	27535	27542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011134	TGAT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
63	NC_011134	TGAT	2	8	28262	28269	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
64	NC_011134	ATTG	2	8	28401	28408	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
65	NC_011134	TGAT	2	8	28442	28449	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
66	NC_011134	ATAG	2	8	28635	28642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011134	GAAT	2	8	29344	29351	50 %	25 %	25 %	0 %	195977176
68	NC_011134	ATTT	2	8	29478	29485	25 %	75 %	0 %	0 %	195977176
69	NC_011134	ATCA	2	8	29909	29916	50 %	25 %	0 %	25 %	195977177
70	NC_011134	GTTT	2	8	30116	30123	0 %	75 %	25 %	0 %	195977177
71	NC_011134	GCTT	2	8	30314	30321	0 %	50 %	25 %	25 %	195977177
72	NC_011134	TAAA	2	8	31119	31126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011134	AAAG	2	8	31173	31180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011134	TAAA	2	8	31428	31435	75 %	25 %	0 %	0 %	195977179
75	NC_011134	AAAT	2	8	31963	31970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011134	TCAA	2	8	32449	32456	50 %	25 %	0 %	25 %	195977180
77	NC_011134	ACCT	2	8	32844	32851	25 %	25 %	0 %	50 %	195977180
78	NC_011134	TGCT	2	8	32978	32985	0 %	50 %	25 %	25 %	195977180
79	NC_011134	TGGT	2	8	33352	33359	0 %	50 %	50 %	0 %	195977180
80	NC_011134	GCAG	2	8	34334	34341	25 %	0 %	50 %	25 %	195977180
81	NC_011134	CTTG	2	8	34367	34374	0 %	50 %	25 %	25 %	195977180
82	NC_011134	TGAT	2	8	34579	34586	25 %	50 %	25 %	0 %	195977180
83	NC_011134	ATTG	2	8	34844	34851	25 %	50 %	25 %	0 %	195977180
84	NC_011134	AACT	2	8	35039	35046	50 %	25 %	0 %	25 %	195977180
85	NC_011134	GGTG	2	8	35489	35496	0 %	25 %	75 %	0 %	195977180
86	NC_011134	TGGT	2	8	36575	36582	0 %	50 %	50 %	0 %	195977181
87	NC_011134	TGGT	2	8	36806	36813	0 %	50 %	50 %	0 %	195977181
88	NC_011134	CCAA	2	8	36918	36925	50 %	0 %	0 %	50 %	195977181
89	NC_011134	GTAT	2	8	37888	37895	25 %	50 %	25 %	0 %	195977182
90	NC_011134	TGAT	2	8	37954	37961	25 %	50 %	25 %	0 %	195977182
91	NC_011134	TTCA	2	8	38014	38021	25 %	50 %	0 %	25 %	195977182
92	NC_011134	ACCT	2	8	38215	38222	25 %	25 %	0 %	50 %	195977182
93	NC_011134	ATCA	2	8	38313	38320	50 %	25 %	0 %	25 %	195977182
94	NC_011134	TGCT	2	8	38362	38369	0 %	50 %	25 %	25 %	195977182
95	NC_011134	AAGC	2	8	38645	38652	50 %	0 %	25 %	25 %	195977183
96	NC_011134	AGTC	2	8	38843	38850	25 %	25 %	25 %	25 %	195977183
97	NC_011134	GACG	2	8	39355	39362	25 %	0 %	50 %	25 %	195977184
98	NC_011134	TCAT	2	8	39383	39390	25 %	50 %	0 %	25 %	195977184
99	NC_011134	CAAA	2	8	40483	40490	75 %	0 %	0 %	25 %	195977184
100	NC_011134	GCAA	2	8	40521	40528	50 %	0 %	25 %	25 %	195977184
101	NC_011134	ATCA	2	8	40977	40984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011134	CACC	2	8	41225	41232	25 %	0 %	0 %	75 %	195977185
103	NC_011134	AGGC	2	8	42012	42019	25 %	0 %	50 %	25 %	195977185
104	NC_011134	ACTT	2	8	42113	42120	25 %	50 %	0 %	25 %	195977185
105	NC_011134	CTGA	2	8	42158	42165	25 %	25 %	25 %	25 %	195977185
106	NC_011134	ATTA	2	8	42256	42263	50 %	50 %	0 %	0 %	195977185
107	NC_011134	AAGA	2	8	42286	42293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011134	CTTT	2	8	42532	42539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011134	TTAT	2	8	42549	42556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011134	GGCT	2	8	42867	42874	0 %	25 %	50 %	25 %	195977186
111	NC_011134	TCCT	2	8	43502	43509	0 %	50 %	0 %	50 %	195977186
112	NC_011134	GCTT	2	8	43629	43636	0 %	50 %	25 %	25 %	195977186
113	NC_011134	AAAT	2	8	43870	43877	75 %	25 %	0 %	0 %	195977186
114	NC_011134	CAAT	2	8	44464	44471	50 %	25 %	0 %	25 %	195977187
115	NC_011134	TGAG	2	8	44708	44715	25 %	25 %	50 %	0 %	195977188
116	NC_011134	AGCT	2	8	45074	45081	25 %	25 %	25 %	25 %	195977188
117	NC_011134	CGAC	2	8	46628	46635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011134	CAAG	2	8	46665	46672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011134	TGCT	2	8	47022	47029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011134	ATTA	2	8	47887	47894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011134	GAAA	2	8	47911	47918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011134	GAAT	2	8	48463	48470	50 %	25 %	25 %	0 %	195977190
123	NC_011134	AGGG	2	8	49889	49896	25 %	0 %	75 %	0 %	195977191
124	NC_011134	TAGC	2	8	50138	50145	25 %	25 %	25 %	25 %	195977192
125	NC_011134	TTTG	2	8	50371	50378	0 %	75 %	25 %	0 %	195977193
126	NC_011134	CTGG	2	8	50471	50478	0 %	25 %	50 %	25 %	195977193
127	NC_011134	GAGG	2	8	50683	50690	25 %	0 %	75 %	0 %	195977193
128	NC_011134	AAGC	2	8	50941	50948	50 %	0 %	25 %	25 %	195977194
129	NC_011134	GAAT	2	8	51001	51008	50 %	25 %	25 %	0 %	195977194
130	NC_011134	AAAC	2	8	51383	51390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011134	ATTC	2	8	51589	51596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011134	TGGC	2	8	51938	51945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011134	ATTT	2	8	52135	52142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011134	CTGG	2	8	52188	52195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011134	ATTG	2	8	52300	52307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011134	GCTT	2	8	52335	52342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011134	AGCT	2	8	52811	52818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011134	GAGC	2	8	52969	52976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011134	ATTG	2	8	53302	53309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011134	TGCC	2	8	54092	54099	0 %	25 %	25 %	50 %	195977195
141	NC_011134	ACTT	2	8	54253	54260	25 %	50 %	0 %	25 %	195977195
142	NC_011134	GCTT	2	8	55932	55939	0 %	50 %	25 %	25 %	195977195
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144	NC_011134	ATCA	2	8	56063	56070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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