MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 27973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011134	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011134	AAG	2	6	218	223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011134	ATG	2	6	321	326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977157
5	NC_011134	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977157
6	NC_011134	CAG	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977157
7	NC_011134	GAG	2	6	473	478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977157
8	NC_011134	ATT	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977157
9	NC_011134	CAG	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977157
10	NC_011134	TGA	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977157
11	NC_011134	TGC	2	6	622	627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977157
12	NC_011134	GGA	2	6	683	688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977157
13	NC_011134	TTA	2	6	786	791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977157
14	NC_011134	TGT	2	6	799	804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977157
15	NC_011134	TCC	2	6	861	866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977157
16	NC_011134	TGA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977157
17	NC_011134	AAC	3	9	950	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977157
18	NC_011134	ATC	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977157
19	NC_011134	AGC	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977157
20	NC_011134	GAA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977157
21	NC_011134	GGA	2	6	1472	1477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977157
22	NC_011134	CTA	5	15	1696	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011134	CAG	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977158
24	NC_011134	TTG	2	6	1940	1945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977158
25	NC_011134	GGT	2	6	2050	2055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977158
26	NC_011134	TGC	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977158
27	NC_011134	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977158
28	NC_011134	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977158
29	NC_011134	TGA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977158
30	NC_011134	GTG	2	6	2690	2695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977158
31	NC_011134	GAT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977158
32	NC_011134	GTC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977159
33	NC_011134	ATT	2	6	3195	3200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011134	ATG	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977160
35	NC_011134	AAG	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977160
36	NC_011134	TCT	2	6	3570	3575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977160
37	NC_011134	TTG	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977160
38	NC_011134	TCT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011134	CAG	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977161
40	NC_011134	GCT	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977161
41	NC_011134	TGA	3	9	4043	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
42	NC_011134	GAA	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977161
43	NC_011134	GAT	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
44	NC_011134	TTA	2	6	4323	4328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977161
45	NC_011134	TGA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
46	NC_011134	GCA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977161
47	NC_011134	AGA	3	9	4466	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977161
48	NC_011134	GAT	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
49	NC_011134	ATG	2	6	4717	4722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
50	NC_011134	GTC	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977161
51	NC_011134	GAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011134	TAA	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011134	GCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011134	TAG	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977162
55	NC_011134	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977162
56	NC_011134	TTG	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977162
57	NC_011134	AAT	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977162
58	NC_011134	ATG	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977162
59	NC_011134	ATT	2	6	5349	5354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977162
60	NC_011134	TTA	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977162
61	NC_011134	GAT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977162
62	NC_011134	TAT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977162
63	NC_011134	GCA	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977162
64	NC_011134	ATT	2	6	5581	5586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
65	NC_011134	AGC	3	9	5674	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
66	NC_011134	GTG	2	6	5723	5728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977163
67	NC_011134	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
68	NC_011134	CTG	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
69	NC_011134	CAG	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
70	NC_011134	AAG	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
71	NC_011134	TGA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
72	NC_011134	AAG	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
73	NC_011134	GGA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977163
74	NC_011134	AGC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
75	NC_011134	GGA	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977163
76	NC_011134	AAG	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
77	NC_011134	GAT	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
78	NC_011134	TTG	2	6	6521	6526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977163
79	NC_011134	GAT	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
80	NC_011134	ACA	2	6	6538	6543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977163
81	NC_011134	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
82	NC_011134	CTT	2	6	6616	6621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977163
83	NC_011134	TGA	2	6	6724	6729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
84	NC_011134	TCA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977163
85	NC_011134	CTG	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
86	NC_011134	ATT	2	6	6881	6886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
87	NC_011134	TGA	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
88	NC_011134	CGT	2	6	6971	6976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
89	NC_011134	TCG	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
90	NC_011134	CAG	2	6	7139	7144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
91	NC_011134	AGC	2	6	7170	7175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
92	NC_011134	CAG	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
93	NC_011134	TAA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977163
94	NC_011134	GAT	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
95	NC_011134	CGA	2	6	7405	7410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
96	NC_011134	GCT	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
97	NC_011134	CAA	2	6	7569	7574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977163
98	NC_011134	CAG	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
99	NC_011134	ATT	3	9	7715	7723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
100	NC_011134	TGA	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
101	NC_011134	CCT	2	6	7934	7939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977163
102	NC_011134	AAT	2	6	7976	7981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977163
103	NC_011134	TAT	2	6	8002	8007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
104	NC_011134	GTG	2	6	8022	8027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977163
105	NC_011134	AAG	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
106	NC_011134	ATG	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
107	NC_011134	CAA	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977163
108	NC_011134	TAT	2	6	8206	8211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
109	NC_011134	GCT	2	6	8530	8535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
110	NC_011134	AGC	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
111	NC_011134	ATT	2	6	8889	8894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
112	NC_011134	AGA	2	6	8998	9003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
113	NC_011134	ATT	2	6	9110	9115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977164
114	NC_011134	AGC	2	6	9116	9121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977164
115	NC_011134	CAA	2	6	9177	9182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977164
116	NC_011134	TAT	2	6	9200	9205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977164
117	NC_011134	TGT	2	6	9300	9305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977164
118	NC_011134	TAT	2	6	9316	9321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977164
119	NC_011134	CAG	2	6	9372	9377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977164
120	NC_011134	TGC	3	9	9527	9535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977164
121	NC_011134	TGC	2	6	9584	9589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977164
122	NC_011134	TGC	2	6	9862	9867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977164
123	NC_011134	TTA	2	6	10018	10023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977164
124	NC_011134	TGA	2	6	10036	10041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977164
125	NC_011134	TGA	2	6	10093	10098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977164
126	NC_011134	TCA	2	6	10130	10135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977164
127	NC_011134	TTA	2	6	10194	10199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977164
128	NC_011134	CTA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977164
129	NC_011134	TTG	2	6	10240	10245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977164
130	NC_011134	CTG	2	6	10444	10449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977164
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133	NC_011134	GAA	2	6	10833	10838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977165
134	NC_011134	GAA	2	6	10876	10881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977166
135	NC_011134	ATG	2	6	10954	10959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977166
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142	NC_011134	TGA	2	6	11256	11261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011134	GAA	2	6	11298	11303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_011134	TCA	2	6	17773	17778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977171
255	NC_011134	TAT	2	6	17873	17878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977171
256	NC_011134	GAC	2	6	18179	18184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_011134	GGC	2	6	18304	18309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_011134	TGA	2	6	18360	18365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_011134	CGA	2	6	18549	18554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_011134	GCA	2	6	18623	18628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_011134	CGC	2	6	18670	18675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_011134	TGT	2	6	18709	18714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011134	AGA	2	6	18718	18723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_011134	CAT	2	6	18746	18751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_011134	CAG	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_011134	GGA	2	6	18982	18987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_011134	GAA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_011134	AAG	2	6	19292	19297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_011134	GTC	2	6	19334	19339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_011134	CAT	2	6	19402	19407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_011134	TAA	2	6	19437	19442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011134	GGA	2	6	19446	19451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_011134	ATC	2	6	19470	19475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_011134	CGC	2	6	19636	19641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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278	NC_011134	CCT	2	6	19808	19813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_011134	AAG	2	6	20048	20053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011134	GAA	2	6	20281	20286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011134	ACG	2	6	20298	20303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_011134	GCG	2	6	20474	20479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_011134	AGG	2	6	20491	20496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011134	GAC	2	6	20543	20548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_011134	AGA	2	6	20557	20562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011134	TCG	2	6	20660	20665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_011134	GGA	2	6	20673	20678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011134	AAG	2	6	20793	20798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011134	GGA	2	6	20989	20994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011134	ACC	2	6	21254	21259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_011134	AGC	2	6	21334	21339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_011134	ACA	2	6	21641	21646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_011134	GAC	2	6	21708	21713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_011134	GAT	2	6	22044	22049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011134	CGG	2	6	22135	22140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_011134	TAC	2	6	22405	22410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_011134	GGT	2	6	22629	22634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011134	TCG	2	6	22744	22749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_011134	AGT	2	6	23290	23295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_011134	ACC	2	6	23786	23791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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374	NC_011134	CTT	2	6	28755	28760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
375	NC_011134	GTT	2	6	28770	28775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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