MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 4274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011134	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011134	AAG	2	6	218	223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011134	CTA	5	15	1696	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011134	ATT	2	6	3195	3200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011134	TCT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011134	GAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011134	TAA	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011134	GCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011134	ATA	2	6	11216	11221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011134	TGA	2	6	11256	11261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011134	GAA	2	6	11298	11303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011134	CAT	2	6	11308	11313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011134	ATT	2	6	14468	14473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011134	ATA	2	6	14486	14491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011134	AAT	2	6	14494	14499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011134	GTT	2	6	16459	16464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011134	GAC	2	6	18179	18184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011134	GGC	2	6	18304	18309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011134	TGA	2	6	18360	18365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011134	CGA	2	6	18549	18554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011134	GCA	2	6	18623	18628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011134	CGC	2	6	18670	18675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011134	TGT	2	6	18709	18714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011134	AGA	2	6	18718	18723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011134	CAT	2	6	18746	18751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011134	CAG	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011134	GGA	2	6	18982	18987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011134	GAA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011134	AAG	2	6	19292	19297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011134	GGT	2	6	19320	19325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011134	GTC	2	6	19334	19339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011134	CAT	2	6	19402	19407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011134	TAA	2	6	19437	19442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011134	GGA	2	6	19446	19451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011134	ATC	2	6	19470	19475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011134	CGC	2	6	19636	19641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011134	CAC	2	6	19681	19686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011134	GAT	2	6	19752	19757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011134	CCT	2	6	19808	19813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011134	AGG	2	6	19909	19914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011134	AAG	2	6	20048	20053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011134	GAA	2	6	20281	20286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011134	ACG	2	6	20298	20303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011134	GCG	2	6	20474	20479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011134	AGG	2	6	20491	20496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011134	GAC	2	6	20543	20548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011134	AGA	2	6	20557	20562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011134	TCG	2	6	20660	20665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011134	GGA	2	6	20673	20678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011134	AAG	2	6	20793	20798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011134	GGA	2	6	20989	20994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011134	ACC	2	6	21254	21259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011134	AGC	2	6	21334	21339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011134	ACA	2	6	21641	21646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011134	GAC	2	6	21708	21713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011134	GAT	2	6	22044	22049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011134	CGG	2	6	22135	22140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011134	TAC	2	6	22405	22410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011134	CCT	2	6	22493	22498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011134	GGT	2	6	22629	22634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011134	TCG	2	6	22744	22749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011134	CGT	2	6	22824	22829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011134	CTC	2	6	23002	23007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011134	GTG	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011134	AGT	2	6	23265	23270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011134	AGT	2	6	23290	23295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011134	ACC	2	6	23786	23791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011134	CGT	2	6	23823	23828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011134	CTC	2	6	24000	24005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011134	CGC	2	6	24171	24176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011134	TGG	2	6	24276	24281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011134	TCC	2	6	24363	24368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011134	TCG	2	6	24405	24410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011134	CGG	2	6	24526	24531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011134	TGT	2	6	24596	24601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011134	GGT	2	6	24671	24676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011134	GGT	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011134	CAT	2	6	24729	24734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011134	GTA	2	6	28564	28569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011134	CTT	2	6	28755	28760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011134	GTT	2	6	28770	28775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011134	ATT	2	6	28872	28877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011134	TGT	2	6	31917	31922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011134	GCT	2	6	31988	31993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011134	GCT	2	6	35854	35859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011134	ATT	2	6	35860	35865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011134	GCT	2	6	35876	35881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011134	AGG	2	6	37444	37449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011134	TAA	2	6	39043	39048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011134	AGC	2	6	39082	39087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011134	TGG	2	6	39096	39101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011134	AGA	2	6	39114	39119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011134	TGA	2	6	39126	39131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011134	TTA	2	6	40787	40792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011134	TGG	2	6	40871	40876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011134	GCT	2	6	41044	41049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011134	CCT	2	6	42264	42269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011134	GCC	2	6	42390	42395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011134	TAG	2	6	42421	42426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011134	TGG	2	6	42473	42478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011134	ATG	2	6	43908	43913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011134	TTA	2	6	43922	43927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011134	TGG	2	6	44043	44048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011134	CTG	2	6	44049	44054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011134	ATG	2	6	45976	45981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011134	TGT	2	6	45989	45994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011134	GAC	2	6	46030	46035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011134	CAT	2	6	46069	46074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011134	ATT	2	6	46166	46171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011134	GAA	2	6	46534	46539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011134	TGG	2	6	46556	46561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011134	GAG	2	6	46594	46599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011134	GTG	2	6	46636	46641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011134	CGT	2	6	46687	46692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011134	ATG	2	6	46753	46758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011134	GCT	2	6	46861	46866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011134	CCA	2	6	46918	46923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011134	GAG	2	6	46930	46935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011134	AGA	2	6	47101	47106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011134	ATC	2	6	47279	47284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011134	CCT	2	6	47521	47526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011134	TGA	2	6	47572	47577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011134	GAA	2	6	47642	47647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011134	GAA	2	6	47735	47740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011134	CTT	2	6	47829	47834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011134	TTA	2	6	47857	47862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011134	AAT	2	6	48884	48889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011134	AAT	2	6	48909	48914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011134	GCT	2	6	48970	48975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011134	TGG	2	6	49018	49023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011134	ATC	2	6	49042	49047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011134	TTA	2	6	51240	51245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011134	AGG	2	6	51301	51306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011134	TTG	2	6	51309	51314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011134	TCT	2	6	51324	51329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011134	TTG	2	6	51359	51364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011134	TGA	2	6	51367	51372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011134	CCG	2	6	51437	51442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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411	NC_011134	ACC	2	6	141690	141695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_011134	CAA	2	6	148437	148442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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