MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	TAAAAT	2	12	2798	2809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011126	GTGCCT	2	12	30149	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011126	TATAAA	2	12	53769	53780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011126	AATTTG	2	12	117303	117314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011126	GATAAA	2	12	148077	148088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011126	AAATAT	2	12	257310	257321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011126	TATATT	2	12	257987	257998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011126	ATTATA	2	12	393748	393759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011126	TTATTT	2	12	406467	406478	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011126	AATTGG	2	12	413670	413681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011126	AAAAGA	2	12	415365	415376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011126	ATGAAG	2	12	415658	415669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011126	ATTTAT	2	12	455398	455409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011126	GCAAAA	2	12	529338	529349	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011126	TAAATT	2	12	550702	550713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011126	CTATAA	2	12	592825	592836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011126	TTTATA	2	12	617335	617346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011126	AATTTT	2	12	782217	782228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011126	AGATTA	2	12	814406	814417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011126	AAAAAC	2	12	916398	916409	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011126	TTTATA	2	12	966780	966791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011126	AACACA	2	12	979066	979077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011126	ATTTAT	2	12	1015105	1015116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011126	ACAAAG	2	12	1038739	1038750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011126	AAAAAT	2	12	1041265	1041276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011126	ATTTTT	2	12	1076454	1076465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011126	GTTTTT	2	12	1077108	1077119	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011126	GATTTA	2	12	1088878	1088889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011126	TAAAAA	2	12	1100634	1100645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011126	AAAACT	2	12	1121805	1121816	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011126	TAAAAA	2	12	1125412	1125423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011126	CAAGCA	2	12	1129632	1129643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011126	AGAATA	2	12	1187173	1187184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011126	TATAAA	2	12	1234358	1234369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011126	TTATAT	2	12	1392878	1392889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011126	TACCAT	2	12	1458723	1458734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011126	GTTTAA	2	12	1458970	1458981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011126	ATTAAT	2	12	1461851	1461862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011126	TGTATA	2	12	1488811	1488822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.