MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 3497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	GATT	2	8	1594	1601	25 %	50 %	25 %	0 %	195952381
2	NC_011126	TACC	2	8	1806	1813	25 %	25 %	0 %	50 %	195952382
3	NC_011126	CTTT	2	8	1986	1993	0 %	75 %	0 %	25 %	195952382
4	NC_011126	TACC	2	8	2193	2200	25 %	25 %	0 %	50 %	195952382
5	NC_011126	AAAG	2	8	2330	2337	75 %	0 %	25 %	0 %	195952382
6	NC_011126	AGTA	2	8	2372	2379	50 %	25 %	25 %	0 %	195952382
7	NC_011126	GGTG	2	8	2854	2861	0 %	25 %	75 %	0 %	195952384
8	NC_011126	CAAA	2	8	3470	3477	75 %	0 %	0 %	25 %	195952384
9	NC_011126	ATGT	2	8	3635	3642	25 %	50 %	25 %	0 %	195952384
10	NC_011126	AAGA	2	8	4812	4819	75 %	0 %	25 %	0 %	195952385
11	NC_011126	AGAA	2	8	5821	5828	75 %	0 %	25 %	0 %	195952386
12	NC_011126	TAAT	2	8	6388	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	195952387
13	NC_011126	GTTT	2	8	6948	6955	0 %	75 %	25 %	0 %	195952387
14	NC_011126	ATCT	2	8	7152	7159	25 %	50 %	0 %	25 %	195952387
15	NC_011126	GGTG	2	8	7221	7228	0 %	25 %	75 %	0 %	195952387
16	NC_011126	AAGC	2	8	8250	8257	50 %	0 %	25 %	25 %	195952388
17	NC_011126	TTCT	2	8	8883	8890	0 %	75 %	0 %	25 %	195952389
18	NC_011126	TCCA	2	8	8923	8930	25 %	25 %	0 %	50 %	195952389
19	NC_011126	AAAC	2	8	9766	9773	75 %	0 %	0 %	25 %	195952390
20	NC_011126	TAAT	2	8	9829	9836	50 %	50 %	0 %	0 %	195952390
21	NC_011126	GTAT	2	8	9949	9956	25 %	50 %	25 %	0 %	195952390
22	NC_011126	ATTA	2	8	10630	10637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011126	ATGA	2	8	11051	11058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011126	AAGA	2	8	11215	11222	75 %	0 %	25 %	0 %	195952391
25	NC_011126	TTTG	2	8	11630	11637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011126	GTTT	2	8	11767	11774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011126	GGTT	2	8	12910	12917	0 %	50 %	50 %	0 %	195952393
28	NC_011126	GTAT	2	8	13049	13056	25 %	50 %	25 %	0 %	195952393
29	NC_011126	GGTA	2	8	13061	13068	25 %	25 %	50 %	0 %	195952393
30	NC_011126	GAAA	2	8	13370	13377	75 %	0 %	25 %	0 %	195952393
31	NC_011126	TAAA	2	8	13423	13430	75 %	25 %	0 %	0 %	195952393
32	NC_011126	GAAA	2	8	13655	13662	75 %	0 %	25 %	0 %	195952393
33	NC_011126	TTTG	2	8	14231	14238	0 %	75 %	25 %	0 %	195952393
34	NC_011126	CTAC	2	8	14462	14469	25 %	25 %	0 %	50 %	195952394
35	NC_011126	TAAA	2	8	14571	14578	75 %	25 %	0 %	0 %	195952394
36	NC_011126	TGTT	2	8	14582	14589	0 %	75 %	25 %	0 %	195952394
37	NC_011126	ACAA	2	8	14831	14838	75 %	0 %	0 %	25 %	195952394
38	NC_011126	AGTA	2	8	15292	15299	50 %	25 %	25 %	0 %	195952394
39	NC_011126	TCTT	2	8	15577	15584	0 %	75 %	0 %	25 %	195952395
40	NC_011126	TTTA	2	8	16377	16384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011126	ATTT	2	8	16411	16418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011126	GCTG	2	8	16798	16805	0 %	25 %	50 %	25 %	195952396
43	NC_011126	TTTA	2	8	18041	18048	25 %	75 %	0 %	0 %	195952397
44	NC_011126	TGTT	2	8	19337	19344	0 %	75 %	25 %	0 %	195952399
45	NC_011126	TAAA	2	8	19630	19637	75 %	25 %	0 %	0 %	195952399
46	NC_011126	AAAG	2	8	19678	19685	75 %	0 %	25 %	0 %	195952400
47	NC_011126	CCAT	2	8	19738	19745	25 %	25 %	0 %	50 %	195952400
48	NC_011126	TATC	2	8	20066	20073	25 %	50 %	0 %	25 %	195952400
49	NC_011126	ATGT	2	8	20147	20154	25 %	50 %	25 %	0 %	195952400
50	NC_011126	TACT	2	8	20762	20769	25 %	50 %	0 %	25 %	195952400
51	NC_011126	GTCC	2	8	21136	21143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011126	TTCC	2	8	21305	21312	0 %	50 %	0 %	50 %	195952402
53	NC_011126	TTTA	2	8	21679	21686	25 %	75 %	0 %	0 %	195952402
54	NC_011126	GATT	2	8	21936	21943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011126	GGGC	2	8	22239	22246	0 %	0 %	75 %	25 %	195952403
56	NC_011126	GATA	2	8	22884	22891	50 %	25 %	25 %	0 %	195952403
57	NC_011126	TTTG	2	8	24051	24058	0 %	75 %	25 %	0 %	195952406
58	NC_011126	AAGA	2	8	24129	24136	75 %	0 %	25 %	0 %	195952406
59	NC_011126	TACC	2	8	24207	24214	25 %	25 %	0 %	50 %	195952406
60	NC_011126	AAGA	2	8	24830	24837	75 %	0 %	25 %	0 %	195952406
61	NC_011126	GTTT	2	8	25420	25427	0 %	75 %	25 %	0 %	195952407
62	NC_011126	TATC	2	8	25989	25996	25 %	50 %	0 %	25 %	195952407
63	NC_011126	TATC	2	8	26145	26152	25 %	50 %	0 %	25 %	195952407
64	NC_011126	CTTT	2	8	26542	26549	0 %	75 %	0 %	25 %	195952408
65	NC_011126	TACC	2	8	26639	26646	25 %	25 %	0 %	50 %	195952408
66	NC_011126	GTTT	2	8	27231	27238	0 %	75 %	25 %	0 %	195952409
67	NC_011126	CTTT	2	8	27332	27339	0 %	75 %	0 %	25 %	195952409
68	NC_011126	TATT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	195952409
69	NC_011126	ATCT	2	8	27633	27640	25 %	50 %	0 %	25 %	195952409
70	NC_011126	TGTA	2	8	28628	28635	25 %	50 %	25 %	0 %	195952410
71	NC_011126	TAAC	2	8	29012	29019	50 %	25 %	0 %	25 %	195952410
72	NC_011126	ATTT	2	8	29178	29185	25 %	75 %	0 %	0 %	195952410
73	NC_011126	GTTC	2	8	30001	30008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011126	ATCT	2	8	30170	30177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011126	CTTT	2	8	30212	30219	0 %	75 %	0 %	25 %	195952412
76	NC_011126	TGAA	2	8	30389	30396	50 %	25 %	25 %	0 %	195952412
77	NC_011126	AAAT	2	8	30400	30407	75 %	25 %	0 %	0 %	195952412
78	NC_011126	CATC	2	8	30654	30661	25 %	25 %	0 %	50 %	195952412
79	NC_011126	GTTT	2	8	32240	32247	0 %	75 %	25 %	0 %	195952413
80	NC_011126	GTTG	2	8	34689	34696	0 %	50 %	50 %	0 %	195952417
81	NC_011126	CTCC	2	8	35282	35289	0 %	25 %	0 %	75 %	195952418
82	NC_011126	ATCC	2	8	35633	35640	25 %	25 %	0 %	50 %	195952420
83	NC_011126	CTTT	2	8	35783	35790	0 %	75 %	0 %	25 %	195952420
84	NC_011126	CTTT	2	8	36400	36407	0 %	75 %	0 %	25 %	195952421
85	NC_011126	GGTA	2	8	36429	36436	25 %	25 %	50 %	0 %	195952421
86	NC_011126	ATTT	2	8	36600	36607	25 %	75 %	0 %	0 %	195952421
87	NC_011126	ATCT	2	8	37053	37060	25 %	50 %	0 %	25 %	195952421
88	NC_011126	TTTG	2	8	37073	37080	0 %	75 %	25 %	0 %	195952421
89	NC_011126	CCTT	2	8	38411	38418	0 %	50 %	0 %	50 %	195952423
90	NC_011126	AAAT	2	8	39139	39146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011126	TATC	2	8	40653	40660	25 %	50 %	0 %	25 %	195952426
92	NC_011126	ATAA	3	12	42456	42467	75 %	25 %	0 %	0 %	195952426
93	NC_011126	TACA	2	8	43957	43964	50 %	25 %	0 %	25 %	195952428
94	NC_011126	AACT	2	8	45402	45409	50 %	25 %	0 %	25 %	195952431
95	NC_011126	ACAA	2	8	46378	46385	75 %	0 %	0 %	25 %	195952432
96	NC_011126	CATC	2	8	47001	47008	25 %	25 %	0 %	50 %	195952433
97	NC_011126	TTTG	2	8	47290	47297	0 %	75 %	25 %	0 %	195952433
98	NC_011126	CTTT	2	8	47441	47448	0 %	75 %	0 %	25 %	195952433
99	NC_011126	TCCG	2	8	48532	48539	0 %	25 %	25 %	50 %	195952434
100	NC_011126	CATA	2	8	48696	48703	50 %	25 %	0 %	25 %	195952434
101	NC_011126	CTCC	2	8	49375	49382	0 %	25 %	0 %	75 %	195952434
102	NC_011126	AATA	2	8	49453	49460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011126	ATTA	2	8	49464	49471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011126	GGTG	2	8	49909	49916	0 %	25 %	75 %	0 %	195952435
105	NC_011126	CTTT	2	8	49979	49986	0 %	75 %	0 %	25 %	195952435
106	NC_011126	TATG	2	8	50047	50054	25 %	50 %	25 %	0 %	195952435
107	NC_011126	TCTG	2	8	50518	50525	0 %	50 %	25 %	25 %	195952435
108	NC_011126	AAAC	2	8	51280	51287	75 %	0 %	0 %	25 %	195952435
109	NC_011126	GCTC	2	8	52130	52137	0 %	25 %	25 %	50 %	195952436
110	NC_011126	AAAT	2	8	52308	52315	75 %	25 %	0 %	0 %	195952436
111	NC_011126	ACAA	2	8	52336	52343	75 %	0 %	0 %	25 %	195952436
112	NC_011126	CAAA	2	8	52742	52749	75 %	0 %	0 %	25 %	195952436
113	NC_011126	GATA	2	8	52949	52956	50 %	25 %	25 %	0 %	195952436
114	NC_011126	TTTC	2	8	53490	53497	0 %	75 %	0 %	25 %	195952437
115	NC_011126	CTGG	2	8	54399	54406	0 %	25 %	50 %	25 %	195952438
116	NC_011126	GTAA	2	8	54784	54791	50 %	25 %	25 %	0 %	195952439
117	NC_011126	ATCT	2	8	55825	55832	25 %	50 %	0 %	25 %	195952439
118	NC_011126	TCTT	2	8	56312	56319	0 %	75 %	0 %	25 %	195952439
119	NC_011126	TCTT	2	8	56703	56710	0 %	75 %	0 %	25 %	195952440
120	NC_011126	AAAG	2	8	56732	56739	75 %	0 %	25 %	0 %	195952440
121	NC_011126	GTAA	2	8	57118	57125	50 %	25 %	25 %	0 %	195952440
122	NC_011126	GCGT	2	8	57972	57979	0 %	25 %	50 %	25 %	195952441
123	NC_011126	TATC	2	8	59347	59354	25 %	50 %	0 %	25 %	195952442
124	NC_011126	TTTC	2	8	59666	59673	0 %	75 %	0 %	25 %	195952443
125	NC_011126	GTTT	2	8	60061	60068	0 %	75 %	25 %	0 %	195952443
126	NC_011126	AAAC	2	8	60357	60364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011126	TGGT	2	8	60466	60473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011126	GACG	2	8	60678	60685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011126	ATTA	2	8	60781	60788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011126	TAGA	2	8	60810	60817	50 %	25 %	25 %	0 %	195952444
131	NC_011126	GCAT	2	8	60939	60946	25 %	25 %	25 %	25 %	195952444
132	NC_011126	GATT	2	8	60988	60995	25 %	50 %	25 %	0 %	195952444
133	NC_011126	AAAT	2	8	61356	61363	75 %	25 %	0 %	0 %	195952445
134	NC_011126	ACAT	2	8	61693	61700	50 %	25 %	0 %	25 %	195952445
135	NC_011126	GATG	2	8	61774	61781	25 %	25 %	50 %	0 %	195952445
136	NC_011126	GATG	2	8	62557	62564	25 %	25 %	50 %	0 %	195952446
137	NC_011126	AGAT	2	8	62781	62788	50 %	25 %	25 %	0 %	195952446
138	NC_011126	GACA	2	8	63161	63168	50 %	0 %	25 %	25 %	195952447
139	NC_011126	ACAA	2	8	63735	63742	75 %	0 %	0 %	25 %	195952448
140	NC_011126	TCTT	2	8	64780	64787	0 %	75 %	0 %	25 %	195952450
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