MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	CTGACG	2	12	10151	10162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194733838
2	NC_011092	GCTGGA	2	12	11129	11140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194733781
3	NC_011092	GAAACC	2	12	11328	11339	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	194733781
4	NC_011092	TAAGCC	2	12	15006	15017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194733883
5	NC_011092	CTCAGG	2	12	19289	19300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194733834
6	NC_011092	TTGATA	2	12	20835	20846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194733826
7	NC_011092	GCTTCG	2	12	24515	24526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733828
8	NC_011092	CGGTGG	2	12	25691	25702	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194733830
9	NC_011092	CCCGAA	2	12	31020	31031	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194733848
10	NC_011092	TTACCT	2	12	39683	39694	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194733885
11	NC_011092	AGCGCG	2	12	40782	40793	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194733806
12	NC_011092	GGCAGG	2	12	40867	40878	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	194733806
13	NC_011092	ATACTC	2	12	44045	44056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733784
14	NC_011092	ATTTCT	2	12	53560	53571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194733777
15	NC_011092	TCCCAT	2	12	57088	57099	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194733791
16	NC_011092	TCTCGC	2	12	58758	58769	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194733865
17	NC_011092	ATCTGC	2	12	60204	60215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194733803
18	NC_011092	CGGGAT	2	12	63154	63165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194733851
19	NC_011092	GACCAG	2	12	71100	71111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733795
20	NC_011092	ATCCCG	2	12	78923	78934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194733853
21	NC_011092	ACTTAC	2	12	86205	86216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733833
22	NC_011092	ATTTTT	2	12	87241	87252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194733861
23	NC_011092	TTCCGT	2	12	91614	91625	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194733818
24	NC_011092	AGCCGC	2	12	94573	94584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194733870
25	NC_011092	CACCGC	2	12	95700	95711	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	194733829
26	NC_011092	GCGGGC	2	12	96461	96472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733887
27	NC_011092	CCGCTG	2	12	101542	101553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194733844
28	NC_011092	CTGGAT	2	12	105108	105119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194733778
29	NC_011092	CGTCCT	2	12	108044	108055	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194733871

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.