MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	TTCA	2	8	430	437	25 %	50 %	0 %	25 %	194733785
2	NC_011092	GGCA	2	8	816	823	25 %	0 %	50 %	25 %	194733880
3	NC_011092	GGCC	2	8	2654	2661	0 %	0 %	50 %	50 %	194733889
4	NC_011092	ATTG	2	8	2871	2878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011092	CTAA	2	8	2890	2897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011092	CAGA	2	8	2975	2982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011092	ACCA	2	8	4054	4061	50 %	0 %	0 %	50 %	194733850
8	NC_011092	CGGC	2	8	4389	4396	0 %	0 %	50 %	50 %	194733850
9	NC_011092	TGAT	2	8	5368	5375	25 %	50 %	25 %	0 %	194733786
10	NC_011092	ACGT	2	8	5883	5890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011092	GTCT	2	8	6222	6229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011092	GTAT	2	8	6307	6314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011092	CTGG	2	8	6664	6671	0 %	25 %	50 %	25 %	194733894
14	NC_011092	TCGT	2	8	6725	6732	0 %	50 %	25 %	25 %	194733894
15	NC_011092	CAAA	2	8	6771	6778	75 %	0 %	0 %	25 %	194733894
16	NC_011092	CTGT	2	8	7746	7753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011092	TGAT	2	8	8004	8011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011092	GCGA	2	8	8375	8382	25 %	0 %	50 %	25 %	194733831
19	NC_011092	CGTT	2	8	10596	10603	0 %	50 %	25 %	25 %	194733838
20	NC_011092	GGCA	2	8	11279	11286	25 %	0 %	50 %	25 %	194733781
21	NC_011092	GGCG	2	8	12509	12516	0 %	0 %	75 %	25 %	194733891
22	NC_011092	CAGC	2	8	12826	12833	25 %	0 %	25 %	50 %	194733891
23	NC_011092	GAAA	2	8	13902	13909	75 %	0 %	25 %	0 %	194733836
24	NC_011092	ACTA	2	8	14140	14147	50 %	25 %	0 %	25 %	194733836
25	NC_011092	GCTG	2	8	14344	14351	0 %	25 %	50 %	25 %	194733816
26	NC_011092	CTTC	2	8	14729	14736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011092	GCCC	2	8	16026	16033	0 %	0 %	25 %	75 %	194733857
28	NC_011092	CAGC	2	8	16622	16629	25 %	0 %	25 %	50 %	194733790
29	NC_011092	CTAA	2	8	17642	17649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011092	AGTG	2	8	17796	17803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011092	TTTA	2	8	18212	18219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011092	CATC	2	8	18550	18557	25 %	25 %	0 %	50 %	194733834
33	NC_011092	TTAT	2	8	18703	18710	25 %	75 %	0 %	0 %	194733834
34	NC_011092	TGAC	2	8	18796	18803	25 %	25 %	25 %	25 %	194733834
35	NC_011092	TCAA	2	8	18879	18886	50 %	25 %	0 %	25 %	194733834
36	NC_011092	AAAC	2	8	19303	19310	75 %	0 %	0 %	25 %	194733834
37	NC_011092	CTTT	2	8	19541	19548	0 %	75 %	0 %	25 %	194733834
38	NC_011092	TGAA	2	8	20071	20078	50 %	25 %	25 %	0 %	194733834
39	NC_011092	TTTA	2	8	20177	20184	25 %	75 %	0 %	0 %	194733834
40	NC_011092	GAAA	2	8	21052	21059	75 %	0 %	25 %	0 %	194733826
41	NC_011092	AATA	2	8	21434	21441	75 %	25 %	0 %	0 %	194733826
42	NC_011092	ATTG	2	8	22231	22238	25 %	50 %	25 %	0 %	194733826
43	NC_011092	ATTA	2	8	22936	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	194733826
44	NC_011092	CTGC	2	8	23257	23264	0 %	25 %	25 %	50 %	194733878
45	NC_011092	GCGG	2	8	23542	23549	0 %	0 %	75 %	25 %	194733821
46	NC_011092	CGGG	2	8	24500	24507	0 %	0 %	75 %	25 %	194733828
47	NC_011092	ACCG	2	8	24663	24670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011092	TTGT	2	8	24979	24986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011092	CCGG	2	8	25339	25346	0 %	0 %	50 %	50 %	194733830
50	NC_011092	CTTC	2	8	25649	25656	0 %	50 %	0 %	50 %	194733830
51	NC_011092	CCGG	2	8	25704	25711	0 %	0 %	50 %	50 %	194733830
52	NC_011092	TCCG	2	8	25984	25991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011092	GCCG	2	8	26785	26792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011092	GCAC	2	8	27583	27590	25 %	0 %	25 %	50 %	194733886
55	NC_011092	GCCG	2	8	27747	27754	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
56	NC_011092	CTGG	2	8	28302	28309	0 %	25 %	50 %	25 %	194733886
57	NC_011092	CGGC	2	8	28538	28545	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
58	NC_011092	CGGC	2	8	28721	28728	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
59	NC_011092	CGGC	2	8	28793	28800	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
60	NC_011092	ACGC	2	8	29341	29348	25 %	0 %	25 %	50 %	194733776
61	NC_011092	CGGG	2	8	29595	29602	0 %	0 %	75 %	25 %	194733776
62	NC_011092	CTGG	2	8	30154	30161	0 %	25 %	50 %	25 %	194733776
63	NC_011092	GGCA	2	8	30301	30308	25 %	0 %	50 %	25 %	194733848
64	NC_011092	CCTG	2	8	30467	30474	0 %	25 %	25 %	50 %	194733848
65	NC_011092	TTGC	2	8	30482	30489	0 %	50 %	25 %	25 %	194733848
66	NC_011092	AAGC	2	8	30515	30522	50 %	0 %	25 %	25 %	194733848
67	NC_011092	CCAT	2	8	30542	30549	25 %	25 %	0 %	50 %	194733848
68	NC_011092	CGGC	2	8	30758	30765	0 %	0 %	50 %	50 %	194733848
69	NC_011092	AGCG	2	8	30846	30853	25 %	0 %	50 %	25 %	194733848
70	NC_011092	CGGC	2	8	30876	30883	0 %	0 %	50 %	50 %	194733848
71	NC_011092	CAGG	2	8	31811	31818	25 %	0 %	50 %	25 %	194733819
72	NC_011092	CACT	2	8	32230	32237	25 %	25 %	0 %	50 %	194733882
73	NC_011092	GCAC	2	8	33071	33078	25 %	0 %	25 %	50 %	194733801
74	NC_011092	GCCG	2	8	33235	33242	0 %	0 %	50 %	50 %	194733801
75	NC_011092	CTTG	2	8	34040	34047	0 %	50 %	25 %	25 %	194733856
76	NC_011092	GTCC	2	8	34399	34406	0 %	25 %	25 %	50 %	194733856
77	NC_011092	TCAA	2	8	35506	35513	50 %	25 %	0 %	25 %	194733856
78	NC_011092	GCCA	2	8	35896	35903	25 %	0 %	25 %	50 %	194733856
79	NC_011092	TTTC	2	8	36650	36657	0 %	75 %	0 %	25 %	194733888
80	NC_011092	TCAA	2	8	37138	37145	50 %	25 %	0 %	25 %	194733888
81	NC_011092	GGCG	2	8	38202	38209	0 %	0 %	75 %	25 %	194733797
82	NC_011092	CAGC	2	8	38519	38526	25 %	0 %	25 %	50 %	194733797
83	NC_011092	GCTG	2	8	40023	40030	0 %	25 %	50 %	25 %	194733823
84	NC_011092	CCGC	2	8	40115	40122	0 %	0 %	25 %	75 %	194733823
85	NC_011092	GCAG	2	8	40214	40221	25 %	0 %	50 %	25 %	194733823
86	NC_011092	CTGG	2	8	40407	40414	0 %	25 %	50 %	25 %	194733823
87	NC_011092	GAAC	2	8	40765	40772	50 %	0 %	25 %	25 %	194733806
88	NC_011092	AAGG	2	8	40814	40821	50 %	0 %	50 %	0 %	194733806
89	NC_011092	CTGC	2	8	41510	41517	0 %	25 %	25 %	50 %	194733879
90	NC_011092	CGGC	2	8	41702	41709	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
91	NC_011092	GCCG	2	8	41766	41773	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
92	NC_011092	CTGG	2	8	42027	42034	0 %	25 %	50 %	25 %	194733879
93	NC_011092	GCGG	2	8	42396	42403	0 %	0 %	75 %	25 %	194733879
94	NC_011092	AATC	2	8	43152	43159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011092	CCAG	2	8	43372	43379	25 %	0 %	25 %	50 %	194733784
96	NC_011092	TCCA	2	8	43424	43431	25 %	25 %	0 %	50 %	194733784
97	NC_011092	AGTA	2	8	43459	43466	50 %	25 %	25 %	0 %	194733784
98	NC_011092	TTCA	2	8	43546	43553	25 %	50 %	0 %	25 %	194733784
99	NC_011092	AAGT	2	8	43645	43652	50 %	25 %	25 %	0 %	194733784
100	NC_011092	GCTG	2	8	44547	44554	0 %	25 %	50 %	25 %	194733817
101	NC_011092	CAAT	2	8	45313	45320	50 %	25 %	0 %	25 %	194733872
102	NC_011092	ATTT	2	8	45461	45468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011092	GCAG	2	8	45826	45833	25 %	0 %	50 %	25 %	194733796
104	NC_011092	TAAT	2	8	45871	45878	50 %	50 %	0 %	0 %	194733796
105	NC_011092	GTCC	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
106	NC_011092	GTCC	2	8	47638	47645	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
107	NC_011092	CGGT	2	8	48376	48383	0 %	25 %	50 %	25 %	194733874
108	NC_011092	TGCC	2	8	48977	48984	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
109	NC_011092	GGGC	2	8	49207	49214	0 %	0 %	75 %	25 %	194733874
110	NC_011092	GCTC	2	8	49363	49370	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
111	NC_011092	TGGC	2	8	49543	49550	0 %	25 %	50 %	25 %	194733874
112	NC_011092	GCTG	2	8	50656	50663	0 %	25 %	50 %	25 %	194733843
113	NC_011092	AGCA	2	8	51761	51768	50 %	0 %	25 %	25 %	194733815
114	NC_011092	GGAA	2	8	52199	52206	50 %	0 %	50 %	0 %	194733815
115	NC_011092	TCCT	2	8	52385	52392	0 %	50 %	0 %	50 %	194733815
116	NC_011092	TTTG	2	8	52874	52881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011092	TTTA	2	8	53390	53397	25 %	75 %	0 %	0 %	194733777
118	NC_011092	TGAT	2	8	53453	53460	25 %	50 %	25 %	0 %	194733777
119	NC_011092	AAAG	2	8	53788	53795	75 %	0 %	25 %	0 %	194733777
120	NC_011092	TGTT	2	8	54367	54374	0 %	75 %	25 %	0 %	194733845
121	NC_011092	ATGT	2	8	54520	54527	25 %	50 %	25 %	0 %	194733845
122	NC_011092	AGTA	2	8	54534	54541	50 %	25 %	25 %	0 %	194733845
123	NC_011092	TGAA	2	8	55276	55283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011092	AACG	2	8	55369	55376	50 %	0 %	25 %	25 %	194733807
125	NC_011092	AGCC	2	8	55518	55525	25 %	0 %	25 %	50 %	194733807
126	NC_011092	AACT	2	8	55543	55550	50 %	25 %	0 %	25 %	194733807
127	NC_011092	TGGC	2	8	56221	56228	0 %	25 %	50 %	25 %	194733859
128	NC_011092	CCGA	2	8	56619	56626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011092	AGAC	2	8	56782	56789	50 %	0 %	25 %	25 %	194733791
130	NC_011092	GCAA	2	8	57059	57066	50 %	0 %	25 %	25 %	194733791
131	NC_011092	TGCC	2	8	57218	57225	0 %	25 %	25 %	50 %	194733791
132	NC_011092	GCTT	2	8	58313	58320	0 %	50 %	25 %	25 %	194733865
133	NC_011092	TGGC	2	8	58626	58633	0 %	25 %	50 %	25 %	194733865
134	NC_011092	TCCG	2	8	59254	59261	0 %	25 %	25 %	50 %	194733892
135	NC_011092	GAAA	2	8	60283	60290	75 %	0 %	25 %	0 %	194733803
136	NC_011092	TTTC	2	8	60596	60603	0 %	75 %	0 %	25 %	194733803
137	NC_011092	CTGG	2	8	60969	60976	0 %	25 %	50 %	25 %	194733854
138	NC_011092	GGCG	2	8	62556	62563	0 %	0 %	75 %	25 %	194733805
139	NC_011092	CAGC	2	8	62873	62880	25 %	0 %	25 %	50 %	194733805
140	NC_011092	CGTC	2	8	63220	63227	0 %	25 %	25 %	50 %	194733851
141	NC_011092	TGCC	2	8	63603	63610	0 %	25 %	25 %	50 %	194733851
142	NC_011092	GCTC	2	8	63670	63677	0 %	25 %	25 %	50 %	194733792
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192	NC_011092	TTAT	2	8	88776	88783	25 %	75 %	0 %	0 %	194733799
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.