MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	ATTG	2	8	2871	2878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011092	CTAA	2	8	2890	2897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011092	CAGA	2	8	2975	2982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011092	ACGT	2	8	5883	5890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011092	GTCT	2	8	6222	6229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011092	GTAT	2	8	6307	6314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011092	CTGT	2	8	7746	7753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011092	TGAT	2	8	8004	8011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011092	CTTC	2	8	14729	14736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011092	CTAA	2	8	17642	17649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011092	AGTG	2	8	17796	17803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011092	TTTA	2	8	18212	18219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011092	ACCG	2	8	24663	24670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011092	TTGT	2	8	24979	24986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011092	TCCG	2	8	25984	25991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011092	GCCG	2	8	26785	26792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011092	AATC	2	8	43152	43159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011092	ATTT	2	8	45461	45468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011092	TTTG	2	8	52874	52881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011092	TGAA	2	8	55276	55283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011092	CCGA	2	8	56619	56626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011092	GCCA	2	8	74954	74961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011092	CAGC	2	8	75087	75094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011092	GCGG	2	8	75245	75252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011092	TACA	2	8	78991	78998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011092	TGCC	2	8	79040	79047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011092	GCCA	2	8	79061	79068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011092	CGAG	2	8	80473	80480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011092	TAAT	2	8	82843	82850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011092	CTGA	2	8	94630	94637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011092	GAAC	2	8	103063	103070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011092	GTCA	2	8	103311	103318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011092	CTGA	2	8	103343	103350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011092	GGCC	2	8	107414	107421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011092	TCCC	2	8	107459	107466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_011092	GTTT	2	8	108832	108839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011092	ACGA	2	8	109832	109839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.