MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	TTCA	2	8	430	437	25 %	50 %	0 %	25 %	194733785
2	NC_011092	GGCA	2	8	816	823	25 %	0 %	50 %	25 %	194733880
3	NC_011092	GGCC	2	8	2654	2661	0 %	0 %	50 %	50 %	194733889
4	NC_011092	ACCA	2	8	4054	4061	50 %	0 %	0 %	50 %	194733850
5	NC_011092	CGGC	2	8	4389	4396	0 %	0 %	50 %	50 %	194733850
6	NC_011092	TGAT	2	8	5368	5375	25 %	50 %	25 %	0 %	194733786
7	NC_011092	CTGG	2	8	6664	6671	0 %	25 %	50 %	25 %	194733894
8	NC_011092	TCGT	2	8	6725	6732	0 %	50 %	25 %	25 %	194733894
9	NC_011092	CAAA	2	8	6771	6778	75 %	0 %	0 %	25 %	194733894
10	NC_011092	GCGA	2	8	8375	8382	25 %	0 %	50 %	25 %	194733831
11	NC_011092	CGTT	2	8	10596	10603	0 %	50 %	25 %	25 %	194733838
12	NC_011092	GGCA	2	8	11279	11286	25 %	0 %	50 %	25 %	194733781
13	NC_011092	GGCG	2	8	12509	12516	0 %	0 %	75 %	25 %	194733891
14	NC_011092	CAGC	2	8	12826	12833	25 %	0 %	25 %	50 %	194733891
15	NC_011092	GAAA	2	8	13902	13909	75 %	0 %	25 %	0 %	194733836
16	NC_011092	ACTA	2	8	14140	14147	50 %	25 %	0 %	25 %	194733836
17	NC_011092	GCTG	2	8	14344	14351	0 %	25 %	50 %	25 %	194733816
18	NC_011092	GCCC	2	8	16026	16033	0 %	0 %	25 %	75 %	194733857
19	NC_011092	CAGC	2	8	16622	16629	25 %	0 %	25 %	50 %	194733790
20	NC_011092	CATC	2	8	18550	18557	25 %	25 %	0 %	50 %	194733834
21	NC_011092	TTAT	2	8	18703	18710	25 %	75 %	0 %	0 %	194733834
22	NC_011092	TGAC	2	8	18796	18803	25 %	25 %	25 %	25 %	194733834
23	NC_011092	TCAA	2	8	18879	18886	50 %	25 %	0 %	25 %	194733834
24	NC_011092	AAAC	2	8	19303	19310	75 %	0 %	0 %	25 %	194733834
25	NC_011092	CTTT	2	8	19541	19548	0 %	75 %	0 %	25 %	194733834
26	NC_011092	TGAA	2	8	20071	20078	50 %	25 %	25 %	0 %	194733834
27	NC_011092	TTTA	2	8	20177	20184	25 %	75 %	0 %	0 %	194733834
28	NC_011092	GAAA	2	8	21052	21059	75 %	0 %	25 %	0 %	194733826
29	NC_011092	AATA	2	8	21434	21441	75 %	25 %	0 %	0 %	194733826
30	NC_011092	ATTG	2	8	22231	22238	25 %	50 %	25 %	0 %	194733826
31	NC_011092	ATTA	2	8	22936	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	194733826
32	NC_011092	CTGC	2	8	23257	23264	0 %	25 %	25 %	50 %	194733878
33	NC_011092	GCGG	2	8	23542	23549	0 %	0 %	75 %	25 %	194733821
34	NC_011092	CGGG	2	8	24500	24507	0 %	0 %	75 %	25 %	194733828
35	NC_011092	CCGG	2	8	25339	25346	0 %	0 %	50 %	50 %	194733830
36	NC_011092	CTTC	2	8	25649	25656	0 %	50 %	0 %	50 %	194733830
37	NC_011092	CCGG	2	8	25704	25711	0 %	0 %	50 %	50 %	194733830
38	NC_011092	GCAC	2	8	27583	27590	25 %	0 %	25 %	50 %	194733886
39	NC_011092	GCCG	2	8	27747	27754	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
40	NC_011092	CTGG	2	8	28302	28309	0 %	25 %	50 %	25 %	194733886
41	NC_011092	CGGC	2	8	28538	28545	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
42	NC_011092	CGGC	2	8	28721	28728	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
43	NC_011092	CGGC	2	8	28793	28800	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
44	NC_011092	ACGC	2	8	29341	29348	25 %	0 %	25 %	50 %	194733776
45	NC_011092	CGGG	2	8	29595	29602	0 %	0 %	75 %	25 %	194733776
46	NC_011092	CTGG	2	8	30154	30161	0 %	25 %	50 %	25 %	194733776
47	NC_011092	GGCA	2	8	30301	30308	25 %	0 %	50 %	25 %	194733848
48	NC_011092	CCTG	2	8	30467	30474	0 %	25 %	25 %	50 %	194733848
49	NC_011092	TTGC	2	8	30482	30489	0 %	50 %	25 %	25 %	194733848
50	NC_011092	AAGC	2	8	30515	30522	50 %	0 %	25 %	25 %	194733848
51	NC_011092	CCAT	2	8	30542	30549	25 %	25 %	0 %	50 %	194733848
52	NC_011092	CGGC	2	8	30758	30765	0 %	0 %	50 %	50 %	194733848
53	NC_011092	AGCG	2	8	30846	30853	25 %	0 %	50 %	25 %	194733848
54	NC_011092	CGGC	2	8	30876	30883	0 %	0 %	50 %	50 %	194733848
55	NC_011092	CAGG	2	8	31811	31818	25 %	0 %	50 %	25 %	194733819
56	NC_011092	CACT	2	8	32230	32237	25 %	25 %	0 %	50 %	194733882
57	NC_011092	GCAC	2	8	33071	33078	25 %	0 %	25 %	50 %	194733801
58	NC_011092	GCCG	2	8	33235	33242	0 %	0 %	50 %	50 %	194733801
59	NC_011092	CTTG	2	8	34040	34047	0 %	50 %	25 %	25 %	194733856
60	NC_011092	GTCC	2	8	34399	34406	0 %	25 %	25 %	50 %	194733856
61	NC_011092	TCAA	2	8	35506	35513	50 %	25 %	0 %	25 %	194733856
62	NC_011092	GCCA	2	8	35896	35903	25 %	0 %	25 %	50 %	194733856
63	NC_011092	TTTC	2	8	36650	36657	0 %	75 %	0 %	25 %	194733888
64	NC_011092	TCAA	2	8	37138	37145	50 %	25 %	0 %	25 %	194733888
65	NC_011092	GGCG	2	8	38202	38209	0 %	0 %	75 %	25 %	194733797
66	NC_011092	CAGC	2	8	38519	38526	25 %	0 %	25 %	50 %	194733797
67	NC_011092	GCTG	2	8	40023	40030	0 %	25 %	50 %	25 %	194733823
68	NC_011092	CCGC	2	8	40115	40122	0 %	0 %	25 %	75 %	194733823
69	NC_011092	GCAG	2	8	40214	40221	25 %	0 %	50 %	25 %	194733823
70	NC_011092	CTGG	2	8	40407	40414	0 %	25 %	50 %	25 %	194733823
71	NC_011092	GAAC	2	8	40765	40772	50 %	0 %	25 %	25 %	194733806
72	NC_011092	AAGG	2	8	40814	40821	50 %	0 %	50 %	0 %	194733806
73	NC_011092	CTGC	2	8	41510	41517	0 %	25 %	25 %	50 %	194733879
74	NC_011092	CGGC	2	8	41702	41709	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
75	NC_011092	GCCG	2	8	41766	41773	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
76	NC_011092	CTGG	2	8	42027	42034	0 %	25 %	50 %	25 %	194733879
77	NC_011092	GCGG	2	8	42396	42403	0 %	0 %	75 %	25 %	194733879
78	NC_011092	CCAG	2	8	43372	43379	25 %	0 %	25 %	50 %	194733784
79	NC_011092	TCCA	2	8	43424	43431	25 %	25 %	0 %	50 %	194733784
80	NC_011092	AGTA	2	8	43459	43466	50 %	25 %	25 %	0 %	194733784
81	NC_011092	TTCA	2	8	43546	43553	25 %	50 %	0 %	25 %	194733784
82	NC_011092	AAGT	2	8	43645	43652	50 %	25 %	25 %	0 %	194733784
83	NC_011092	GCTG	2	8	44547	44554	0 %	25 %	50 %	25 %	194733817
84	NC_011092	CAAT	2	8	45313	45320	50 %	25 %	0 %	25 %	194733872
85	NC_011092	GCAG	2	8	45826	45833	25 %	0 %	50 %	25 %	194733796
86	NC_011092	TAAT	2	8	45871	45878	50 %	50 %	0 %	0 %	194733796
87	NC_011092	GTCC	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
88	NC_011092	GTCC	2	8	47638	47645	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
89	NC_011092	CGGT	2	8	48376	48383	0 %	25 %	50 %	25 %	194733874
90	NC_011092	TGCC	2	8	48977	48984	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
91	NC_011092	GGGC	2	8	49207	49214	0 %	0 %	75 %	25 %	194733874
92	NC_011092	GCTC	2	8	49363	49370	0 %	25 %	25 %	50 %	194733874
93	NC_011092	TGGC	2	8	49543	49550	0 %	25 %	50 %	25 %	194733874
94	NC_011092	GCTG	2	8	50656	50663	0 %	25 %	50 %	25 %	194733843
95	NC_011092	AGCA	2	8	51761	51768	50 %	0 %	25 %	25 %	194733815
96	NC_011092	GGAA	2	8	52199	52206	50 %	0 %	50 %	0 %	194733815
97	NC_011092	TCCT	2	8	52385	52392	0 %	50 %	0 %	50 %	194733815
98	NC_011092	TTTA	2	8	53390	53397	25 %	75 %	0 %	0 %	194733777
99	NC_011092	TGAT	2	8	53453	53460	25 %	50 %	25 %	0 %	194733777
100	NC_011092	AAAG	2	8	53788	53795	75 %	0 %	25 %	0 %	194733777
101	NC_011092	TGTT	2	8	54367	54374	0 %	75 %	25 %	0 %	194733845
102	NC_011092	ATGT	2	8	54520	54527	25 %	50 %	25 %	0 %	194733845
103	NC_011092	AGTA	2	8	54534	54541	50 %	25 %	25 %	0 %	194733845
104	NC_011092	AACG	2	8	55369	55376	50 %	0 %	25 %	25 %	194733807
105	NC_011092	AGCC	2	8	55518	55525	25 %	0 %	25 %	50 %	194733807
106	NC_011092	AACT	2	8	55543	55550	50 %	25 %	0 %	25 %	194733807
107	NC_011092	TGGC	2	8	56221	56228	0 %	25 %	50 %	25 %	194733859
108	NC_011092	AGAC	2	8	56782	56789	50 %	0 %	25 %	25 %	194733791
109	NC_011092	GCAA	2	8	57059	57066	50 %	0 %	25 %	25 %	194733791
110	NC_011092	TGCC	2	8	57218	57225	0 %	25 %	25 %	50 %	194733791
111	NC_011092	GCTT	2	8	58313	58320	0 %	50 %	25 %	25 %	194733865
112	NC_011092	TGGC	2	8	58626	58633	0 %	25 %	50 %	25 %	194733865
113	NC_011092	TCCG	2	8	59254	59261	0 %	25 %	25 %	50 %	194733892
114	NC_011092	GAAA	2	8	60283	60290	75 %	0 %	25 %	0 %	194733803
115	NC_011092	TTTC	2	8	60596	60603	0 %	75 %	0 %	25 %	194733803
116	NC_011092	CTGG	2	8	60969	60976	0 %	25 %	50 %	25 %	194733854
117	NC_011092	GGCG	2	8	62556	62563	0 %	0 %	75 %	25 %	194733805
118	NC_011092	CAGC	2	8	62873	62880	25 %	0 %	25 %	50 %	194733805
119	NC_011092	CGTC	2	8	63220	63227	0 %	25 %	25 %	50 %	194733851
120	NC_011092	TGCC	2	8	63603	63610	0 %	25 %	25 %	50 %	194733851
121	NC_011092	GCTC	2	8	63670	63677	0 %	25 %	25 %	50 %	194733792
122	NC_011092	TGGC	2	8	63879	63886	0 %	25 %	50 %	25 %	194733792
123	NC_011092	CGGG	2	8	63955	63962	0 %	0 %	75 %	25 %	194733792
124	NC_011092	GTCG	2	8	64893	64900	0 %	25 %	50 %	25 %	194733792
125	NC_011092	CGGA	2	8	65946	65953	25 %	0 %	50 %	25 %	194733873
126	NC_011092	CCAA	2	8	66301	66308	50 %	0 %	0 %	50 %	194733873
127	NC_011092	GGCG	2	8	66853	66860	0 %	0 %	75 %	25 %	194733860
128	NC_011092	CAGC	2	8	67170	67177	25 %	0 %	25 %	50 %	194733860
129	NC_011092	CCTG	2	8	67546	67553	0 %	25 %	25 %	50 %	194733802
130	NC_011092	GGCG	2	8	68449	68456	0 %	0 %	75 %	25 %	194733779
131	NC_011092	CAGC	2	8	68766	68773	25 %	0 %	25 %	50 %	194733779
132	NC_011092	CTCC	2	8	68969	68976	0 %	25 %	0 %	75 %	194733825
133	NC_011092	CAAT	2	8	69330	69337	50 %	25 %	0 %	25 %	194733825
134	NC_011092	GACT	2	8	69795	69802	25 %	25 %	25 %	25 %	194733825
135	NC_011092	GCAG	2	8	70051	70058	25 %	0 %	50 %	25 %	194733825
136	NC_011092	AACC	2	8	70528	70535	50 %	0 %	0 %	50 %	194733782
137	NC_011092	CCAG	2	8	72131	72138	25 %	0 %	25 %	50 %	194733876
138	NC_011092	CAGA	2	8	73210	73217	50 %	0 %	25 %	25 %	194733775
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.