MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 1331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	GCA	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733785
2	NC_011092	CGC	2	6	338	343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733785
3	NC_011092	GTG	2	6	418	423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733785
4	NC_011092	GTC	2	6	537	542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733880
5	NC_011092	AAC	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733880
6	NC_011092	CTG	2	6	717	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733880
7	NC_011092	GGA	2	6	806	811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733880
8	NC_011092	GAA	2	6	1005	1010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733880
9	NC_011092	CAC	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733880
10	NC_011092	GGA	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733880
11	NC_011092	GCC	3	9	1181	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733880
12	NC_011092	CAG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733880
13	NC_011092	CAC	2	6	1232	1237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733880
14	NC_011092	TCA	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733880
15	NC_011092	TGA	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733880
16	NC_011092	CGG	2	6	1889	1894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733858
17	NC_011092	CCT	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194733822
18	NC_011092	TGA	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733822
19	NC_011092	GCG	2	6	2397	2402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733822
20	NC_011092	GAT	2	6	2597	2602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733889
21	NC_011092	CCG	2	6	2641	2646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733889
22	NC_011092	TGA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733850
23	NC_011092	TCT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733850
24	NC_011092	CTG	2	6	3754	3759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733850
25	NC_011092	TTC	2	6	3769	3774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733850
26	NC_011092	CAA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733850
27	NC_011092	TCG	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733850
28	NC_011092	CGG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733850
29	NC_011092	CTG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733850
30	NC_011092	ATC	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733850
31	NC_011092	AGT	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733850
32	NC_011092	CCA	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733850
33	NC_011092	TGA	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733850
34	NC_011092	GAA	2	6	4561	4566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733786
35	NC_011092	TTC	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733786
36	NC_011092	ATT	3	9	4710	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733786
37	NC_011092	CAG	2	6	4862	4867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733786
38	NC_011092	ACA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733786
39	NC_011092	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733786
40	NC_011092	GAT	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733786
41	NC_011092	CAA	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733786
42	NC_011092	ACC	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733786
43	NC_011092	CGG	2	6	5313	5318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733786
44	NC_011092	TCC	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194733786
45	NC_011092	TCA	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733786
46	NC_011092	ATA	2	6	6387	6392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733894
47	NC_011092	GTT	2	6	6437	6442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733894
48	NC_011092	GAG	2	6	6569	6574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733894
49	NC_011092	CGT	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733894
50	NC_011092	ACC	2	6	6860	6865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733894
51	NC_011092	TAT	2	6	6884	6889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733894
52	NC_011092	CTG	2	6	6965	6970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733894
53	NC_011092	AGC	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733894
54	NC_011092	TCA	2	6	7233	7238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733894
55	NC_011092	GAA	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733894
56	NC_011092	GCT	2	6	7322	7327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733894
57	NC_011092	AAG	2	6	8193	8198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733831
58	NC_011092	TTC	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733831
59	NC_011092	GCC	2	6	8306	8311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733831
60	NC_011092	CCA	2	6	8682	8687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733809
61	NC_011092	GCG	2	6	8704	8709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733809
62	NC_011092	GGC	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733809
63	NC_011092	CAG	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733809
64	NC_011092	GCT	2	6	8836	8841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733809
65	NC_011092	CAA	2	6	8866	8871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733809
66	NC_011092	GCA	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733809
67	NC_011092	GAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733809
68	NC_011092	ACG	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733809
69	NC_011092	TGC	2	6	8991	8996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733809
70	NC_011092	CGC	3	9	9028	9036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733809
71	NC_011092	CAT	3	9	9064	9072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733809
72	NC_011092	ACA	2	6	9120	9125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733809
73	NC_011092	CGC	2	6	9222	9227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733809
74	NC_011092	CCG	2	6	9294	9299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733809
75	NC_011092	GCA	3	9	9325	9333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733809
76	NC_011092	ACC	2	6	9491	9496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733884
77	NC_011092	GCC	2	6	9512	9517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733884
78	NC_011092	GCC	2	6	9574	9579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733884
79	NC_011092	CAG	3	9	9608	9616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733884
80	NC_011092	GGA	2	6	9682	9687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733884
81	NC_011092	GAA	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733884
82	NC_011092	CTT	2	6	9763	9768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733884
83	NC_011092	CTG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733884
84	NC_011092	ACA	2	6	9977	9982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733838
85	NC_011092	CGG	2	6	10036	10041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733838
86	NC_011092	GCG	2	6	10167	10172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733838
87	NC_011092	GCC	2	6	10195	10200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733838
88	NC_011092	ATG	2	6	10203	10208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733838
89	NC_011092	CGG	2	6	10236	10241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733838
90	NC_011092	ATG	2	6	10326	10331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733838
91	NC_011092	AGG	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733838
92	NC_011092	CCG	2	6	10374	10379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733838
93	NC_011092	GGA	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733838
94	NC_011092	TGC	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733838
95	NC_011092	GCT	2	6	10522	10527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733838
96	NC_011092	TTC	2	6	10637	10642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733838
97	NC_011092	TGA	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733838
98	NC_011092	GCC	2	6	10752	10757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733838
99	NC_011092	GCT	2	6	10801	10806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733838
100	NC_011092	TGA	2	6	10869	10874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733838
101	NC_011092	ACT	2	6	10881	10886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733838
102	NC_011092	TGA	2	6	10900	10905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733838
103	NC_011092	CAC	2	6	11084	11089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733781
104	NC_011092	GCG	2	6	11306	11311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733781
105	NC_011092	AGA	2	6	11417	11422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733781
106	NC_011092	CCG	2	6	11447	11452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733781
107	NC_011092	CGT	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733781
108	NC_011092	TGA	2	6	11467	11472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733781
109	NC_011092	AAC	2	6	11499	11504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733781
110	NC_011092	GGC	3	9	11726	11734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733781
111	NC_011092	CGA	2	6	11759	11764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733781
112	NC_011092	GCT	3	9	11765	11773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733781
113	NC_011092	ACA	2	6	11821	11826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733781
114	NC_011092	CGG	2	6	11828	11833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733781
115	NC_011092	GAT	3	9	11843	11851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733781
116	NC_011092	CGG	2	6	11884	11889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733781
117	NC_011092	TGC	2	6	12001	12006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733781
118	NC_011092	TGG	2	6	12130	12135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733781
119	NC_011092	ATA	2	6	12281	12286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733891
120	NC_011092	TGG	2	6	12340	12345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733891
121	NC_011092	GTT	2	6	12425	12430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733891
122	NC_011092	TGA	2	6	12529	12534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733891
123	NC_011092	CTT	2	6	12551	12556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733891
124	NC_011092	GTT	2	6	12560	12565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733891
125	NC_011092	ACG	2	6	12605	12610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733891
126	NC_011092	GGA	2	6	12611	12616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733891
127	NC_011092	ATG	2	6	12894	12899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733891
128	NC_011092	CAT	2	6	13396	13401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733836
129	NC_011092	TCA	2	6	13427	13432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733836
130	NC_011092	TCT	3	9	13490	13498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733836
131	NC_011092	TTC	2	6	13604	13609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733836
132	NC_011092	ATG	2	6	13628	13633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733836
133	NC_011092	GCT	2	6	13634	13639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733836
134	NC_011092	GTT	2	6	13689	13694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733836
135	NC_011092	CAT	2	6	14007	14012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733836
136	NC_011092	GCC	2	6	14222	14227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733836
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139	NC_011092	CGC	2	6	14856	14861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733883
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143	NC_011092	ATC	2	6	15817	15822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733857
144	NC_011092	TCT	2	6	15827	15832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733857
145	NC_011092	GAA	2	6	15855	15860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733857
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149	NC_011092	AGC	2	6	15988	15993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733857
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153	NC_011092	CCG	2	6	16205	16210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733857
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157	NC_011092	TCA	2	6	16483	16488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733790
158	NC_011092	TCA	2	6	16494	16499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733790
159	NC_011092	TCC	2	6	16554	16559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194733790
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162	NC_011092	CCG	2	6	16908	16913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733790
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247	NC_011092	GTT	2	6	26454	26459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733780
248	NC_011092	TCT	2	6	26501	26506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733780
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497	NC_011092	GCA	2	6	43655	43660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733784
498	NC_011092	GCA	2	6	43682	43687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733784
499	NC_011092	GCG	2	6	43777	43782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733784
500	NC_011092	ATA	2	6	43815	43820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733784

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