MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	A	6	6	26	31	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011092	T	6	6	664	669	0 %	100 %	0 %	0 %	194733880
3	NC_011092	G	6	6	1799	1804	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011092	T	6	6	1930	1935	0 %	100 %	0 %	0 %	194733858
5	NC_011092	T	8	8	2380	2387	0 %	100 %	0 %	0 %	194733822
6	NC_011092	A	7	7	6776	6782	100 %	0 %	0 %	0 %	194733894
7	NC_011092	T	6	6	7901	7906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011092	A	6	6	8145	8150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011092	A	7	7	8803	8809	100 %	0 %	0 %	0 %	194733809
10	NC_011092	A	6	6	9104	9109	100 %	0 %	0 %	0 %	194733809
11	NC_011092	A	7	7	9464	9470	100 %	0 %	0 %	0 %	194733884
12	NC_011092	A	6	6	9896	9901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011092	T	6	6	11014	11019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011092	T	6	6	14062	14067	0 %	100 %	0 %	0 %	194733836
15	NC_011092	G	6	6	14290	14295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011092	A	6	6	14867	14872	100 %	0 %	0 %	0 %	194733883
17	NC_011092	T	6	6	16517	16522	0 %	100 %	0 %	0 %	194733790
18	NC_011092	A	6	6	17687	17692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011092	A	8	8	18570	18577	100 %	0 %	0 %	0 %	194733834
20	NC_011092	T	6	6	19089	19094	0 %	100 %	0 %	0 %	194733834
21	NC_011092	A	6	6	21483	21488	100 %	0 %	0 %	0 %	194733826
22	NC_011092	A	6	6	26003	26008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011092	A	6	6	27035	27040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011092	G	6	6	30971	30976	0 %	0 %	100 %	0 %	194733848
25	NC_011092	A	6	6	32523	32528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011092	T	6	6	36589	36594	0 %	100 %	0 %	0 %	194733888
27	NC_011092	A	6	6	43604	43609	100 %	0 %	0 %	0 %	194733784
28	NC_011092	A	6	6	44011	44016	100 %	0 %	0 %	0 %	194733784
29	NC_011092	A	6	6	45418	45423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011092	A	6	6	45477	45482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011092	T	6	6	45502	45507	0 %	100 %	0 %	0 %	194733796
32	NC_011092	A	6	6	45623	45628	100 %	0 %	0 %	0 %	194733796
33	NC_011092	T	6	6	45953	45958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011092	A	6	6	46119	46124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011092	A	6	6	46215	46220	100 %	0 %	0 %	0 %	194733852
36	NC_011092	A	6	6	51571	51576	100 %	0 %	0 %	0 %	194733824
37	NC_011092	T	6	6	51922	51927	0 %	100 %	0 %	0 %	194733815
38	NC_011092	T	6	6	52056	52061	0 %	100 %	0 %	0 %	194733815
39	NC_011092	T	6	6	52692	52697	0 %	100 %	0 %	0 %	194733847
40	NC_011092	A	6	6	53154	53159	100 %	0 %	0 %	0 %	194733840
41	NC_011092	A	7	7	53231	53237	100 %	0 %	0 %	0 %	194733840
42	NC_011092	T	6	6	53782	53787	0 %	100 %	0 %	0 %	194733777
43	NC_011092	A	6	6	54043	54048	100 %	0 %	0 %	0 %	194733777
44	NC_011092	T	7	7	54129	54135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011092	A	6	6	54988	54993	100 %	0 %	0 %	0 %	194733845
46	NC_011092	T	6	6	55207	55212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011092	T	6	6	57935	57940	0 %	100 %	0 %	0 %	194733791
48	NC_011092	C	6	6	60292	60297	0 %	0 %	0 %	100 %	194733803
49	NC_011092	A	7	7	60750	60756	100 %	0 %	0 %	0 %	194733803
50	NC_011092	A	6	6	65817	65822	100 %	0 %	0 %	0 %	194733814
51	NC_011092	C	6	6	71946	71951	0 %	0 %	0 %	100 %	194733876
52	NC_011092	A	8	8	73469	73476	100 %	0 %	0 %	0 %	194733775
53	NC_011092	T	6	6	73608	73613	0 %	100 %	0 %	0 %	194733775
54	NC_011092	A	6	6	73763	73768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011092	A	6	6	74128	74133	100 %	0 %	0 %	0 %	194733832
56	NC_011092	T	6	6	74597	74602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011092	T	6	6	75201	75206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011092	T	6	6	76625	76630	0 %	100 %	0 %	0 %	194733893
59	NC_011092	A	8	8	80484	80491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011092	A	6	6	81582	81587	100 %	0 %	0 %	0 %	194733812
61	NC_011092	T	8	8	82889	82896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011092	T	6	6	84695	84700	0 %	100 %	0 %	0 %	194733789
63	NC_011092	T	7	7	84719	84725	0 %	100 %	0 %	0 %	194733789
64	NC_011092	T	6	6	84788	84793	0 %	100 %	0 %	0 %	194733789
65	NC_011092	T	7	7	85236	85242	0 %	100 %	0 %	0 %	194733789
66	NC_011092	T	8	8	85613	85620	0 %	100 %	0 %	0 %	194733789
67	NC_011092	A	6	6	85717	85722	100 %	0 %	0 %	0 %	194733849
68	NC_011092	T	6	6	85911	85916	0 %	100 %	0 %	0 %	194733849
69	NC_011092	T	6	6	86172	86177	0 %	100 %	0 %	0 %	194733833
70	NC_011092	T	8	8	86834	86841	0 %	100 %	0 %	0 %	194733833
71	NC_011092	T	6	6	86960	86965	0 %	100 %	0 %	0 %	194733833
72	NC_011092	T	6	6	87355	87360	0 %	100 %	0 %	0 %	194733861
73	NC_011092	T	6	6	87862	87867	0 %	100 %	0 %	0 %	194733861
74	NC_011092	T	8	8	87970	87977	0 %	100 %	0 %	0 %	194733861
75	NC_011092	T	6	6	87981	87986	0 %	100 %	0 %	0 %	194733861
76	NC_011092	A	6	6	88532	88537	100 %	0 %	0 %	0 %	194733787
77	NC_011092	G	6	6	89860	89865	0 %	0 %	100 %	0 %	194733818
78	NC_011092	A	6	6	90204	90209	100 %	0 %	0 %	0 %	194733818
79	NC_011092	G	6	6	91318	91323	0 %	0 %	100 %	0 %	194733818
80	NC_011092	A	6	6	92828	92833	100 %	0 %	0 %	0 %	194733862
81	NC_011092	A	6	6	93055	93060	100 %	0 %	0 %	0 %	194733862
82	NC_011092	G	7	7	93696	93702	0 %	0 %	100 %	0 %	194733870
83	NC_011092	C	6	6	94827	94832	0 %	0 %	0 %	100 %	194733810
84	NC_011092	C	7	7	96816	96822	0 %	0 %	0 %	100 %	194733887
85	NC_011092	A	8	8	99316	99323	100 %	0 %	0 %	0 %	194733866
86	NC_011092	A	6	6	99364	99369	100 %	0 %	0 %	0 %	194733866
87	NC_011092	A	6	6	100507	100512	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
88	NC_011092	G	6	6	100853	100858	0 %	0 %	100 %	0 %	194733844
89	NC_011092	A	6	6	101168	101173	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
90	NC_011092	A	6	6	101191	101196	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
91	NC_011092	A	7	7	101530	101536	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
92	NC_011092	A	6	6	101620	101625	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
93	NC_011092	A	6	6	101650	101655	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
94	NC_011092	A	6	6	102585	102590	100 %	0 %	0 %	0 %	194733774
95	NC_011092	A	6	6	102753	102758	100 %	0 %	0 %	0 %	194733842
96	NC_011092	A	6	6	102880	102885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011092	G	8	8	102889	102896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011092	G	6	6	102955	102960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011092	C	6	6	102965	102970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_011092	A	7	7	103782	103788	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
101	NC_011092	A	6	6	104094	104099	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
102	NC_011092	A	6	6	105036	105041	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
103	NC_011092	A	6	6	105183	105188	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
104	NC_011092	A	6	6	105354	105359	100 %	0 %	0 %	0 %	194733839
105	NC_011092	A	6	6	105866	105871	100 %	0 %	0 %	0 %	194733839
106	NC_011092	T	9	9	106602	106610	0 %	100 %	0 %	0 %	194733820
107	NC_011092	T	6	6	107278	107283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011092	T	8	8	107348	107355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011092	A	6	6	107437	107442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011092	T	6	6	108029	108034	0 %	100 %	0 %	0 %	194733871
111	NC_011092	A	7	7	108739	108745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011092	C	6	6	108863	108868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_011092	T	6	6	109663	109668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011092	T	6	6	109712	109717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.