MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 7916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011083	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011083	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011083	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011083	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011083	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011083	GTG	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011083	CGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011083	TGA	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011083	ATG	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011083	CGG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011083	CGT	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011083	ATC	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011083	AAT	2	6	8721	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011083	TAG	2	6	9333	9338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011083	TCC	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011083	GGA	2	6	9358	9363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011083	ATC	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011083	ATA	2	6	10016	10021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011083	TAA	2	6	10050	10055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011083	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011083	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011083	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011083	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011083	TTC	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011083	TTG	2	6	14835	14840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011083	TAT	2	6	14971	14976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011083	ATG	2	6	16002	16007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011083	ATT	2	6	16056	16061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011083	ATT	2	6	17613	17618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011083	GTT	2	6	17705	17710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011083	GTT	2	6	17729	17734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011083	ATC	2	6	17758	17763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011083	GAT	2	6	17770	17775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011083	CCA	2	6	20032	20037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011083	TTA	2	6	23167	23172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011083	TAA	2	6	24096	24101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011083	GTT	2	6	24117	24122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011083	GAT	2	6	24233	24238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011083	TAA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011083	TAA	2	6	24267	24272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011083	ACG	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011083	AAG	2	6	24354	24359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011083	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011083	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011083	ATC	2	6	24518	24523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011083	GAA	2	6	25564	25569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011083	GAA	2	6	25626	25631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011083	GAA	2	6	25654	25659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011083	GTT	2	6	33457	33462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011083	ATA	2	6	33509	33514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011083	TAT	2	6	33534	33539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011083	ATT	2	6	33593	33598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011083	ATT	2	6	34356	34361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011083	CGT	2	6	34439	34444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011083	ATT	2	6	34493	34498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011083	TGA	2	6	34510	34515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011083	TGT	2	6	34524	34529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011083	ATA	2	6	34577	34582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011083	CTG	2	6	34588	34593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011083	TTA	2	6	34607	34612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011083	GAT	2	6	34754	34759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011083	CTC	2	6	35056	35061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011083	TTA	2	6	35099	35104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011083	AGC	2	6	35161	35166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011083	ATA	2	6	35225	35230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011083	GCC	2	6	35238	35243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011083	GTT	2	6	35266	35271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011083	GTC	2	6	35284	35289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011083	TGT	2	6	35519	35524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011083	GCA	2	6	35555	35560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011083	TTC	2	6	35566	35571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011083	CAT	2	6	35589	35594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011083	CGT	2	6	35633	35638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011083	ACA	2	6	35881	35886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011083	TAA	3	9	35927	35935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011083	ATT	2	6	35975	35980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011083	TGA	2	6	36075	36080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011083	AGG	2	6	39695	39700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011083	GTT	2	6	41037	41042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011083	CTT	2	6	41108	41113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011083	ATT	2	6	41237	41242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011083	GCT	2	6	41328	41333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011083	TAC	2	6	41398	41403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011083	ATC	2	6	41491	41496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011083	TCA	2	6	41561	41566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011083	TAG	2	6	41607	41612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011083	GAA	2	6	41617	41622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011083	AAC	2	6	47319	47324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011083	ATT	2	6	47351	47356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011083	AGT	2	6	47416	47421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011083	ATT	2	6	47442	47447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011083	TTA	2	6	47470	47475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011083	GGT	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011083	TAT	2	6	47574	47579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011083	GCT	2	6	47611	47616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011083	CTT	2	6	48064	48069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011083	GCA	2	6	48108	48113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011083	GCG	2	6	48194	48199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011083	TCT	2	6	48239	48244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011083	TGA	2	6	54228	54233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011083	GTC	2	6	54301	54306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011083	ACG	2	6	62375	62380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011083	GAC	2	6	62389	62394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011083	CCG	2	6	62494	62499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011083	TAA	2	6	63894	63899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011083	ATT	2	6	63960	63965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011083	TTA	2	6	63967	63972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011083	AAT	2	6	64049	64054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011083	GCG	2	6	64074	64079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011083	TCT	2	6	69300	69305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011083	GGC	2	6	69408	69413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011083	TCT	2	6	70437	70442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011083	TTA	2	6	70671	70676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011083	AAC	2	6	70741	70746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011083	ATT	2	6	70758	70763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011083	GCC	2	6	71052	71057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011083	TAA	2	6	72314	72319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011083	TAA	2	6	75688	75693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011083	TTA	2	6	75772	75777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011083	GGC	2	6	76922	76927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011083	TGT	2	6	76950	76955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011083	CGG	2	6	77805	77810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011083	TAA	2	6	81945	81950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011083	TAT	2	6	83535	83540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011083	TTG	2	6	83548	83553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011083	ATG	2	6	83593	83598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011083	CCG	2	6	83909	83914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011083	AAC	2	6	88849	88854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011083	AAT	2	6	89131	89136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011083	TAT	2	6	89982	89987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011083	TGA	2	6	90335	90340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011083	ATT	2	6	90375	90380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011083	GCC	2	6	90457	90462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011083	GCC	2	6	90549	90554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011083	ATT	2	6	90569	90574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011083	TAA	2	6	90580	90585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011083	TGT	3	9	90657	90665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011083	AAT	2	6	90674	90679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011083	ATA	2	6	90716	90721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011083	TAT	2	6	90729	90734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_011083	CCT	2	6	195423	195428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_011083	CAT	2	6	196339	196344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_011083	GGA	2	6	196395	196400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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