MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 62568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011083	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
2	NC_011083	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450909
3	NC_011083	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450909
4	NC_011083	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
5	NC_011083	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
6	NC_011083	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
7	NC_011083	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
8	NC_011083	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
9	NC_011083	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
10	NC_011083	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450909
11	NC_011083	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450909
12	NC_011083	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
13	NC_011083	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
14	NC_011083	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
15	NC_011083	CTG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
16	NC_011083	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450909
17	NC_011083	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450909
18	NC_011083	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450909
19	NC_011083	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
20	NC_011083	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
21	NC_011083	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450909
22	NC_011083	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450909
23	NC_011083	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
24	NC_011083	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
25	NC_011083	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450909
26	NC_011083	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450909
27	NC_011083	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450909
28	NC_011083	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450909
29	NC_011083	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450909
30	NC_011083	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450909
31	NC_011083	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
32	NC_011083	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
33	NC_011083	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450909
34	NC_011083	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
35	NC_011083	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450909
36	NC_011083	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450909
37	NC_011083	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
38	NC_011083	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450909
39	NC_011083	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
40	NC_011083	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
41	NC_011083	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450909
42	NC_011083	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450909
43	NC_011083	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450909
44	NC_011083	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450909
45	NC_011083	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450909
46	NC_011083	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450909
47	NC_011083	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450909
48	NC_011083	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450909
49	NC_011083	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451411
50	NC_011083	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451411
51	NC_011083	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451411
52	NC_011083	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451411
53	NC_011083	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451411
54	NC_011083	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451411
55	NC_011083	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451411
56	NC_011083	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451411
57	NC_011083	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451411
58	NC_011083	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451411
59	NC_011083	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451411
60	NC_011083	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451411
61	NC_011083	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451411
62	NC_011083	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450589
63	NC_011083	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450589
64	NC_011083	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450589
65	NC_011083	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450589
66	NC_011083	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450589
67	NC_011083	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450589
68	NC_011083	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450589
69	NC_011083	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450589
70	NC_011083	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450589
71	NC_011083	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450589
72	NC_011083	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450589
73	NC_011083	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450589
74	NC_011083	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450589
75	NC_011083	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194450589
76	NC_011083	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450589
77	NC_011083	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450589
78	NC_011083	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450589
79	NC_011083	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450589
80	NC_011083	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450589
81	NC_011083	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450589
82	NC_011083	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450589
83	NC_011083	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450589
84	NC_011083	TCA	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449329
85	NC_011083	AAT	2	6	5227	5232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449329
86	NC_011083	TCA	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449329
87	NC_011083	ACC	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449329
88	NC_011083	TCA	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449329
89	NC_011083	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449329
90	NC_011083	CAC	3	9	5383	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449329
91	NC_011083	TGT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449329
92	NC_011083	CGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449329
93	NC_011083	GCG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449329
94	NC_011083	GCT	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449329
95	NC_011083	ACC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447372
96	NC_011083	CAA	2	6	6109	6114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447372
97	NC_011083	CGA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447372
98	NC_011083	CAG	2	6	6436	6441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447372
99	NC_011083	ATC	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447372
100	NC_011083	GAT	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447372
101	NC_011083	ACG	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447372
102	NC_011083	GAT	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447372
103	NC_011083	GCG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447372
104	NC_011083	CGA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447372
105	NC_011083	GCC	2	6	7012	7017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447372
106	NC_011083	AGG	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194447372
107	NC_011083	ATG	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447372
108	NC_011083	GCG	2	6	7139	7144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447372
109	NC_011083	GCC	2	6	7225	7230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447372
110	NC_011083	AGC	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447372
111	NC_011083	TAA	2	6	7371	7376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447372
112	NC_011083	TTG	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447372
113	NC_011083	CAC	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447995
114	NC_011083	AGC	2	6	7842	7847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447995
115	NC_011083	AGC	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447995
116	NC_011083	CAG	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447995
117	NC_011083	GTT	2	6	7871	7876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447995
118	NC_011083	ATG	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447995
119	NC_011083	AAG	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447995
120	NC_011083	GCT	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447995
121	NC_011083	TAC	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447995
122	NC_011083	CGT	2	6	8323	8328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447995
123	NC_011083	GCA	2	6	8512	8517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447995
124	NC_011083	CTG	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447995
125	NC_011083	GCG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448501
126	NC_011083	GAG	2	6	8812	8817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194448501
127	NC_011083	GCG	2	6	8856	8861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448501
128	NC_011083	TGA	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448501
129	NC_011083	TGA	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448501
130	NC_011083	GAT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448501
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132	NC_011083	GTC	2	6	9309	9314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448501
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252	NC_011083	CAT	2	6	17280	17285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450738
253	NC_011083	GAT	2	6	17362	17367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450738
254	NC_011083	TAA	2	6	17403	17408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450738
255	NC_011083	ACT	2	6	17910	17915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450498
256	NC_011083	CAA	2	6	17941	17946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450498
257	NC_011083	GAT	2	6	17949	17954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450498
258	NC_011083	TTA	2	6	18038	18043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450498
259	NC_011083	TTG	2	6	18157	18162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450498
260	NC_011083	AGA	2	6	18191	18196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450498
261	NC_011083	CTG	2	6	18360	18365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450498
262	NC_011083	CGG	2	6	18434	18439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450498
263	NC_011083	CCG	2	6	18469	18474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450498
264	NC_011083	GTG	2	6	18510	18515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450498
265	NC_011083	GCT	2	6	18626	18631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450498
266	NC_011083	CTG	2	6	18700	18705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450498
267	NC_011083	ACT	2	6	18708	18713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450498
268	NC_011083	TGA	2	6	18772	18777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450498
269	NC_011083	CTT	2	6	18785	18790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450498
270	NC_011083	CCA	2	6	18818	18823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450498
271	NC_011083	CTG	2	6	18882	18887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450498
272	NC_011083	CGC	2	6	18973	18978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450498
273	NC_011083	CTA	2	6	19009	19014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450498
274	NC_011083	CGC	2	6	19180	19185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450498
275	NC_011083	CGA	2	6	19388	19393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450498
276	NC_011083	GCG	2	6	19422	19427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450498
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278	NC_011083	TGA	2	6	19484	19489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450498
279	NC_011083	GAA	2	6	19713	19718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450498
280	NC_011083	GAA	2	6	19746	19751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450498
281	NC_011083	GAT	2	6	19770	19775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450498
282	NC_011083	CAG	2	6	19780	19785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450498
283	NC_011083	TGG	2	6	19893	19898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450498
284	NC_011083	CGG	2	6	19934	19939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450498
285	NC_011083	TCA	2	6	20126	20131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449860
286	NC_011083	GCG	2	6	20213	20218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449860
287	NC_011083	AAC	2	6	20281	20286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449860
288	NC_011083	ATC	2	6	20287	20292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449860
289	NC_011083	TAA	2	6	20295	20300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449860
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291	NC_011083	CGC	2	6	20469	20474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449860
292	NC_011083	AAC	2	6	20480	20485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449860
293	NC_011083	CCG	2	6	20486	20491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449860
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319	NC_011083	CGA	2	6	22320	22325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449860
320	NC_011083	CGG	2	6	22421	22426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449860
321	NC_011083	TGC	2	6	22433	22438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449860
322	NC_011083	GCT	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449860
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371	NC_011083	CGC	2	6	26544	26549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967568
372	NC_011083	TAT	2	6	26590	26595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
373	NC_011083	TAC	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967568
374	NC_011083	CCG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967568
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