MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	GCCGC	2	10	1832	1841	0 %	0 %	40 %	60 %	194447211
2	NC_011081	CTGAA	2	10	2429	2438	40 %	20 %	20 %	20 %	194447273
3	NC_011081	TCTTT	2	10	6106	6115	0 %	80 %	0 %	20 %	194447192
4	NC_011081	AGAAA	2	10	9609	9618	80 %	0 %	20 %	0 %	194447260
5	NC_011081	CGGCC	2	10	11364	11373	0 %	0 %	40 %	60 %	194447229
6	NC_011081	TATCA	2	10	12020	12029	40 %	40 %	0 %	20 %	194447223
7	NC_011081	TGTCA	2	10	15443	15452	20 %	40 %	20 %	20 %	194447298
8	NC_011081	GAAAA	2	10	15979	15988	80 %	0 %	20 %	0 %	194447206
9	NC_011081	TGGGA	2	10	17911	17920	20 %	20 %	60 %	0 %	194447182
10	NC_011081	CAGAG	2	10	20141	20150	40 %	0 %	40 %	20 %	194447289
11	NC_011081	AGACC	2	10	20172	20181	40 %	0 %	20 %	40 %	194447289
12	NC_011081	GTTCA	2	10	20348	20357	20 %	40 %	20 %	20 %	194447224
13	NC_011081	CGTAC	2	10	20811	20820	20 %	20 %	20 %	40 %	194447224
14	NC_011081	CTTTT	2	10	22188	22197	0 %	80 %	0 %	20 %	194447204
15	NC_011081	GCTGG	2	10	24278	24287	0 %	20 %	60 %	20 %	194447177
16	NC_011081	TCCTG	2	10	25901	25910	0 %	40 %	20 %	40 %	194447257
17	NC_011081	CCGCC	2	10	25948	25957	0 %	0 %	20 %	80 %	194447257
18	NC_011081	ACCGT	2	10	26708	26717	20 %	20 %	20 %	40 %	194447256
19	NC_011081	TGTAC	2	10	26943	26952	20 %	40 %	20 %	20 %	194447295
20	NC_011081	AAGTG	2	10	29906	29915	40 %	20 %	40 %	0 %	194447190
21	NC_011081	ACTGA	2	10	31218	31227	40 %	20 %	20 %	20 %	194447252
22	NC_011081	CTGGT	2	10	32146	32155	0 %	40 %	40 %	20 %	194447290
23	NC_011081	ATGGG	2	10	32756	32765	20 %	20 %	60 %	0 %	194447226
24	NC_011081	CTGAA	2	10	36420	36429	40 %	20 %	20 %	20 %	194447227
25	NC_011081	TTTAT	2	10	36992	37001	20 %	80 %	0 %	0 %	194447240
26	NC_011081	ATGAC	2	10	39463	39472	40 %	20 %	20 %	20 %	194447209
27	NC_011081	ATCGT	2	10	40030	40039	20 %	40 %	20 %	20 %	194447209
28	NC_011081	CAGGG	2	10	45663	45672	20 %	0 %	60 %	20 %	194447244
29	NC_011081	CAGAA	2	10	49532	49541	60 %	0 %	20 %	20 %	194447288
30	NC_011081	CATAA	2	10	51474	51483	60 %	20 %	0 %	20 %	194447277
31	NC_011081	TGAGC	2	10	51484	51493	20 %	20 %	40 %	20 %	194447277
32	NC_011081	GTCTG	2	10	52527	52536	0 %	40 %	40 %	20 %	194447228
33	NC_011081	TCTTT	2	10	55748	55757	0 %	80 %	0 %	20 %	194447253
34	NC_011081	ACCGG	2	10	59377	59386	20 %	0 %	40 %	40 %	194447213
35	NC_011081	CCAGT	2	10	67999	68008	20 %	20 %	20 %	40 %	194447220
36	NC_011081	GACAG	2	10	68541	68550	40 %	0 %	40 %	20 %	194447287
37	NC_011081	AAAGG	2	10	70470	70479	60 %	0 %	40 %	0 %	194447274
38	NC_011081	ACGCA	2	10	78469	78478	40 %	0 %	20 %	40 %	194447198
39	NC_011081	GTTGT	2	10	81693	81702	0 %	60 %	40 %	0 %	194447193
40	NC_011081	ACTGA	2	10	81890	81899	40 %	20 %	20 %	20 %	194447268
41	NC_011081	TCCAG	2	10	83720	83729	20 %	20 %	20 %	40 %	194447207
42	NC_011081	TCCAG	2	10	85718	85727	20 %	20 %	20 %	40 %	194447233
43	NC_011081	GCTGT	2	10	86012	86021	0 %	40 %	40 %	20 %	194447233
44	NC_011081	TTGAA	2	10	89371	89380	40 %	40 %	20 %	0 %	194447239
45	NC_011081	GCCCG	2	10	89385	89394	0 %	0 %	40 %	60 %	194447239
46	NC_011081	CAGCA	2	10	90445	90454	40 %	0 %	20 %	40 %	194447216
47	NC_011081	GCTTC	2	10	90496	90505	0 %	40 %	20 %	40 %	194447216

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.