MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	TCTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011081	AACG	2	8	780	787	50 %	0 %	25 %	25 %	194447276
3	NC_011081	TCCG	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	194447276
4	NC_011081	CTGC	2	8	1328	1335	0 %	25 %	25 %	50 %	194447276
5	NC_011081	GCTG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	50 %	25 %	194447276
6	NC_011081	CAAA	2	8	1670	1677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011081	ATCA	2	8	2236	2243	50 %	25 %	0 %	25 %	194447201
8	NC_011081	GCCA	2	8	2688	2695	25 %	0 %	25 %	50 %	194447236
9	NC_011081	CAGC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	194447236
10	NC_011081	GCTG	2	8	3200	3207	0 %	25 %	50 %	25 %	194447291
11	NC_011081	GGCA	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	194447291
12	NC_011081	GACC	2	8	3513	3520	25 %	0 %	25 %	50 %	194447291
13	NC_011081	CTGG	2	8	3596	3603	0 %	25 %	50 %	25 %	194447291
14	NC_011081	GCTG	2	8	3632	3639	0 %	25 %	50 %	25 %	194447291
15	NC_011081	GGCA	2	8	3721	3728	25 %	0 %	50 %	25 %	194447291
16	NC_011081	ATGT	2	8	3911	3918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011081	GTTG	2	8	4608	4615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011081	ATTT	2	8	4695	4702	25 %	75 %	0 %	0 %	194447263
19	NC_011081	CCCG	2	8	5306	5313	0 %	0 %	25 %	75 %	194447261
20	NC_011081	GAAA	2	8	5449	5456	75 %	0 %	25 %	0 %	194447261
21	NC_011081	GGGA	2	8	6084	6091	25 %	0 %	75 %	0 %	194447192
22	NC_011081	CTGG	2	8	6125	6132	0 %	25 %	50 %	25 %	194447192
23	NC_011081	GGCT	2	8	6325	6332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011081	ATAA	2	8	6531	6538	75 %	25 %	0 %	0 %	194447194
25	NC_011081	TACT	2	8	6629	6636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011081	AAAG	2	8	7702	7709	75 %	0 %	25 %	0 %	194447237
27	NC_011081	GCAG	2	8	8704	8711	25 %	0 %	50 %	25 %	194447260
28	NC_011081	TGCT	2	8	8901	8908	0 %	50 %	25 %	25 %	194447260
29	NC_011081	ATCA	2	8	9587	9594	50 %	25 %	0 %	25 %	194447260
30	NC_011081	AAAT	2	8	9627	9634	75 %	25 %	0 %	0 %	194447260
31	NC_011081	CGTC	2	8	11376	11383	0 %	25 %	25 %	50 %	194447229
32	NC_011081	CAGC	2	8	11425	11432	25 %	0 %	25 %	50 %	194447229
33	NC_011081	CAGC	2	8	11559	11566	25 %	0 %	25 %	50 %	194447229
34	NC_011081	CATT	2	8	11693	11700	25 %	50 %	0 %	25 %	194447255
35	NC_011081	ATCC	2	8	11868	11875	25 %	25 %	0 %	50 %	194447223
36	NC_011081	TACT	2	8	13398	13405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011081	CAGA	2	8	14406	14413	50 %	0 %	25 %	25 %	194447178
38	NC_011081	GCAG	2	8	14892	14899	25 %	0 %	50 %	25 %	194447298
39	NC_011081	CGGC	2	8	15009	15016	0 %	0 %	50 %	50 %	194447298
40	NC_011081	CGGT	2	8	15384	15391	0 %	25 %	50 %	25 %	194447298
41	NC_011081	CTGT	2	8	15581	15588	0 %	50 %	25 %	25 %	194447221
42	NC_011081	TGAG	2	8	16260	16267	25 %	25 %	50 %	0 %	194447206
43	NC_011081	AGGA	2	8	16745	16752	50 %	0 %	50 %	0 %	194447254
44	NC_011081	CAGC	2	8	16808	16815	25 %	0 %	25 %	50 %	194447254
45	NC_011081	CAGG	2	8	16870	16877	25 %	0 %	50 %	25 %	194447254
46	NC_011081	CTGA	2	8	17693	17700	25 %	25 %	25 %	25 %	194447182
47	NC_011081	ATCA	2	8	17987	17994	50 %	25 %	0 %	25 %	194447182
48	NC_011081	AACA	2	8	18008	18015	75 %	0 %	0 %	25 %	194447182
49	NC_011081	AACA	2	8	18084	18091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011081	TGTT	2	8	18786	18793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011081	GAAA	3	12	19185	19196	75 %	0 %	25 %	0 %	194447181
52	NC_011081	AAAT	2	8	19812	19819	75 %	25 %	0 %	0 %	194447289
53	NC_011081	GTTA	2	8	19932	19939	25 %	50 %	25 %	0 %	194447289
54	NC_011081	CAGC	2	8	20446	20453	25 %	0 %	25 %	50 %	194447224
55	NC_011081	GTGA	2	8	21523	21530	25 %	25 %	50 %	0 %	194447279
56	NC_011081	AGAA	2	8	21758	21765	75 %	0 %	25 %	0 %	194447279
57	NC_011081	CAGC	2	8	21939	21946	25 %	0 %	25 %	50 %	194447243
58	NC_011081	TGTA	2	8	22200	22207	25 %	50 %	25 %	0 %	194447204
59	NC_011081	GTAT	2	8	22591	22598	25 %	50 %	25 %	0 %	194447245
60	NC_011081	GCTG	2	8	22816	22823	0 %	25 %	50 %	25 %	194447245
61	NC_011081	TGGC	2	8	23351	23358	0 %	25 %	50 %	25 %	194447245
62	NC_011081	CGGG	2	8	23509	23516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011081	ACTG	2	8	23951	23958	25 %	25 %	25 %	25 %	194447177
64	NC_011081	GCAG	2	8	24393	24400	25 %	0 %	50 %	25 %	194447177
65	NC_011081	ATGA	2	8	24642	24649	50 %	25 %	25 %	0 %	194447251
66	NC_011081	GCGG	2	8	25251	25258	0 %	0 %	75 %	25 %	194447257
67	NC_011081	CAGT	2	8	25533	25540	25 %	25 %	25 %	25 %	194447257
68	NC_011081	ACGG	2	8	26899	26906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011081	GGCA	2	8	27232	27239	25 %	0 %	50 %	25 %	194447295
70	NC_011081	TCAG	2	8	28305	28312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011081	TAAG	2	8	29134	29141	50 %	25 %	25 %	0 %	194447238
72	NC_011081	AAGC	2	8	29236	29243	50 %	0 %	25 %	25 %	194447190
73	NC_011081	CTGG	2	8	29385	29392	0 %	25 %	50 %	25 %	194447190
74	NC_011081	CCTG	2	8	29438	29445	0 %	25 %	25 %	50 %	194447190
75	NC_011081	GAAC	2	8	30209	30216	50 %	0 %	25 %	25 %	194447190
76	NC_011081	ACGC	2	8	30506	30513	25 %	0 %	25 %	50 %	194447190
77	NC_011081	GAAG	2	8	30674	30681	50 %	0 %	50 %	0 %	194447190
78	NC_011081	TCAG	2	8	30775	30782	25 %	25 %	25 %	25 %	194447190
79	NC_011081	TCAC	2	8	31306	31313	25 %	25 %	0 %	50 %	194447252
80	NC_011081	CTTT	2	8	31770	31777	0 %	75 %	0 %	25 %	194447290
81	NC_011081	TGGC	2	8	31874	31881	0 %	25 %	50 %	25 %	194447290
82	NC_011081	CCGT	2	8	31961	31968	0 %	25 %	25 %	50 %	194447290
83	NC_011081	GCCT	2	8	33983	33990	0 %	25 %	25 %	50 %	194447205
84	NC_011081	CTGG	2	8	35917	35924	0 %	25 %	50 %	25 %	194447227
85	NC_011081	TCAC	2	8	36435	36442	25 %	25 %	0 %	50 %	194447227
86	NC_011081	TACA	2	8	37291	37298	50 %	25 %	0 %	25 %	194447196
87	NC_011081	CAGC	2	8	37886	37893	25 %	0 %	25 %	50 %	194447248
88	NC_011081	TGAT	2	8	37990	37997	25 %	50 %	25 %	0 %	194447248
89	NC_011081	AGTG	2	8	39040	39047	25 %	25 %	50 %	0 %	194447197
90	NC_011081	AAGA	2	8	39058	39065	75 %	0 %	25 %	0 %	194447197
91	NC_011081	TGTT	2	8	39270	39277	0 %	75 %	25 %	0 %	194447197
92	NC_011081	TTCG	2	8	39425	39432	0 %	50 %	25 %	25 %	194447209
93	NC_011081	GGCA	2	8	39697	39704	25 %	0 %	50 %	25 %	194447209
94	NC_011081	TGCC	2	8	39959	39966	0 %	25 %	25 %	50 %	194447209
95	NC_011081	GATG	2	8	40232	40239	25 %	25 %	50 %	0 %	194447209
96	NC_011081	AAAG	2	8	40833	40840	75 %	0 %	25 %	0 %	194447209
97	NC_011081	TTTG	2	8	41096	41103	0 %	75 %	25 %	0 %	194447209
98	NC_011081	GCTG	2	8	41138	41145	0 %	25 %	50 %	25 %	194447209
99	NC_011081	ACAA	2	8	41863	41870	75 %	0 %	0 %	25 %	194447209
100	NC_011081	GAAG	2	8	41973	41980	50 %	0 %	50 %	0 %	194447209
101	NC_011081	GGTT	2	8	42146	42153	0 %	50 %	50 %	0 %	194447258
102	NC_011081	TCAA	2	8	42739	42746	50 %	25 %	0 %	25 %	194447258
103	NC_011081	CGGT	2	8	44708	44715	0 %	25 %	50 %	25 %	194447208
104	NC_011081	CAGG	2	8	44813	44820	25 %	0 %	50 %	25 %	194447208
105	NC_011081	GTTC	2	8	44840	44847	0 %	50 %	25 %	25 %	194447208
106	NC_011081	GCAG	2	8	45228	45235	25 %	0 %	50 %	25 %	194447208
107	NC_011081	ATCA	2	8	45280	45287	50 %	25 %	0 %	25 %	194447208
108	NC_011081	ATTT	2	8	46749	46756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011081	ATCA	2	8	46909	46916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011081	GTGG	2	8	47669	47676	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011081	AACA	2	8	47837	47844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011081	TAAT	2	8	48329	48336	50 %	50 %	0 %	0 %	194447278
113	NC_011081	AATG	2	8	48356	48363	50 %	25 %	25 %	0 %	194447278
114	NC_011081	GCTG	2	8	48365	48372	0 %	25 %	50 %	25 %	194447278
115	NC_011081	TGTC	2	8	48486	48493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011081	AGTG	2	8	48657	48664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011081	GATT	2	8	48687	48694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011081	GGAG	2	8	48962	48969	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011081	TTGT	2	8	49365	49372	0 %	75 %	25 %	0 %	194447288
120	NC_011081	AAGA	2	8	49555	49562	75 %	0 %	25 %	0 %	194447288
121	NC_011081	TCTG	2	8	49609	49616	0 %	50 %	25 %	25 %	194447288
122	NC_011081	CTAT	2	8	49657	49664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011081	AATA	2	8	49808	49815	75 %	25 %	0 %	0 %	194447277
124	NC_011081	AGGT	2	8	49892	49899	25 %	25 %	50 %	0 %	194447277
125	NC_011081	GAAT	2	8	50263	50270	50 %	25 %	25 %	0 %	194447277
126	NC_011081	CAGC	2	8	50788	50795	25 %	0 %	25 %	50 %	194447277
127	NC_011081	ACCC	2	8	50850	50857	25 %	0 %	0 %	75 %	194447277
128	NC_011081	GGCT	2	8	51181	51188	0 %	25 %	50 %	25 %	194447277
129	NC_011081	TTAA	2	8	51924	51931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011081	GCCA	2	8	52015	52022	25 %	0 %	25 %	50 %	194447228
131	NC_011081	TGGC	2	8	52317	52324	0 %	25 %	50 %	25 %	194447228
132	NC_011081	ATGG	2	8	52500	52507	25 %	25 %	50 %	0 %	194447228
133	NC_011081	TGAT	2	8	52603	52610	25 %	50 %	25 %	0 %	194447292
134	NC_011081	TGAT	2	8	53596	53603	25 %	50 %	25 %	0 %	194447292
135	NC_011081	GCCC	2	8	54442	54449	0 %	0 %	25 %	75 %	194447253
136	NC_011081	GCCT	2	8	55101	55108	0 %	25 %	25 %	50 %	194447253
137	NC_011081	CAGA	2	8	56012	56019	50 %	0 %	25 %	25 %	194447253
138	NC_011081	CCGC	2	8	56501	56508	0 %	0 %	25 %	75 %	194447253
139	NC_011081	GCTG	2	8	56609	56616	0 %	25 %	50 %	25 %	194447253
140	NC_011081	CAGG	2	8	56625	56632	25 %	0 %	50 %	25 %	194447253
141	NC_011081	TCTG	2	8	56666	56673	0 %	50 %	25 %	25 %	194447253
142	NC_011081	GCCA	2	8	56921	56928	25 %	0 %	25 %	50 %	194447253
143	NC_011081	CTGT	2	8	57292	57299	0 %	50 %	25 %	25 %	194447253
144	NC_011081	ATCA	2	8	57503	57510	50 %	25 %	0 %	25 %	194447222
145	NC_011081	ATGA	2	8	57526	57533	50 %	25 %	25 %	0 %	194447222
146	NC_011081	TGGA	2	8	57770	57777	25 %	25 %	50 %	0 %	194447222
147	NC_011081	CAGA	2	8	57968	57975	50 %	0 %	25 %	25 %	194447222
148	NC_011081	GATA	2	8	58627	58634	50 %	25 %	25 %	0 %	194447186
149	NC_011081	CCAG	2	8	58643	58650	25 %	0 %	25 %	50 %	194447186
150	NC_011081	CGAT	2	8	59038	59045	25 %	25 %	25 %	25 %	194447213
151	NC_011081	TGGT	2	8	61047	61054	0 %	50 %	50 %	0 %	194447176
152	NC_011081	TTTC	2	8	61477	61484	0 %	75 %	0 %	25 %	194447176
153	NC_011081	GAAC	2	8	61657	61664	50 %	0 %	25 %	25 %	194447265
154	NC_011081	TGGT	2	8	61826	61833	0 %	50 %	50 %	0 %	194447265
155	NC_011081	GCAG	2	8	62317	62324	25 %	0 %	50 %	25 %	194447265
156	NC_011081	GTGC	2	8	62413	62420	0 %	25 %	50 %	25 %	194447265
157	NC_011081	GCTG	2	8	62936	62943	0 %	25 %	50 %	25 %	194447285
158	NC_011081	TTCA	2	8	63246	63253	25 %	50 %	0 %	25 %	194447246
159	NC_011081	GACA	2	8	63355	63362	50 %	0 %	25 %	25 %	194447246
160	NC_011081	GCTC	2	8	63424	63431	0 %	25 %	25 %	50 %	194447246
161	NC_011081	CCTG	2	8	63610	63617	0 %	25 %	25 %	50 %	194447299
162	NC_011081	ACTG	2	8	63859	63866	25 %	25 %	25 %	25 %	194447299
163	NC_011081	TCTG	2	8	65006	65013	0 %	50 %	25 %	25 %	194447299
164	NC_011081	AGGA	2	8	65456	65463	50 %	0 %	50 %	0 %	194447299
165	NC_011081	TTTG	2	8	65545	65552	0 %	75 %	25 %	0 %	194447299
166	NC_011081	ATTC	2	8	65620	65627	25 %	50 %	0 %	25 %	194447299
167	NC_011081	TCCA	2	8	66464	66471	25 %	25 %	0 %	50 %	194447299
168	NC_011081	TCTG	2	8	66894	66901	0 %	50 %	25 %	25 %	194447299
169	NC_011081	CAGC	2	8	67160	67167	25 %	0 %	25 %	50 %	194447299
170	NC_011081	CGGG	2	8	67193	67200	0 %	0 %	75 %	25 %	194447299
171	NC_011081	GATG	2	8	67605	67612	25 %	25 %	50 %	0 %	194447187
172	NC_011081	GCAT	2	8	67751	67758	25 %	25 %	25 %	25 %	194447187
173	NC_011081	CTTC	2	8	67844	67851	0 %	50 %	0 %	50 %	194447187
174	NC_011081	TGCC	2	8	68659	68666	0 %	25 %	25 %	50 %	194447287
175	NC_011081	TGCC	2	8	69175	69182	0 %	25 %	25 %	50 %	194447287
176	NC_011081	CCGA	2	8	69203	69210	25 %	0 %	25 %	50 %	194447287
177	NC_011081	TGGT	2	8	69241	69248	0 %	50 %	50 %	0 %	194447287
178	NC_011081	CTTC	2	8	69680	69687	0 %	50 %	0 %	50 %	194447210
179	NC_011081	AGCC	2	8	69929	69936	25 %	0 %	25 %	50 %	194447210
180	NC_011081	GTTC	2	8	70433	70440	0 %	50 %	25 %	25 %	194447274
181	NC_011081	CAGC	2	8	70642	70649	25 %	0 %	25 %	50 %	194447274
182	NC_011081	ACAG	2	8	70744	70751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_011081	GTTT	2	8	70758	70765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011081	AAAT	2	8	70788	70795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011081	CTGG	2	8	70852	70859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_011081	GATT	2	8	71263	71270	25 %	50 %	25 %	0 %	194447296
187	NC_011081	GAAT	2	8	71631	71638	50 %	25 %	25 %	0 %	194447296
188	NC_011081	ACCT	2	8	72543	72550	25 %	25 %	0 %	50 %	194447249
189	NC_011081	CAAA	2	8	72644	72651	75 %	0 %	0 %	25 %	194447249
190	NC_011081	ATTT	2	8	73225	73232	25 %	75 %	0 %	0 %	194447234
191	NC_011081	GTGA	2	8	74598	74605	25 %	25 %	50 %	0 %	194447281
192	NC_011081	AACG	2	8	74958	74965	50 %	0 %	25 %	25 %	194447281
193	NC_011081	TGTA	2	8	74970	74977	25 %	50 %	25 %	0 %	194447281
194	NC_011081	CTTG	2	8	75447	75454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_011081	CGCA	2	8	75515	75522	25 %	0 %	25 %	50 %	194447179
196	NC_011081	AGCC	2	8	75952	75959	25 %	0 %	25 %	50 %	194447179
197	NC_011081	AACC	2	8	75979	75986	50 %	0 %	0 %	50 %	194447179
198	NC_011081	TTTG	2	8	76684	76691	0 %	75 %	25 %	0 %	194447179
199	NC_011081	TGCC	2	8	77453	77460	0 %	25 %	25 %	50 %	194447269
200	NC_011081	TGTC	2	8	77540	77547	0 %	50 %	25 %	25 %	194447269
201	NC_011081	TTAT	2	8	77774	77781	25 %	75 %	0 %	0 %	194447269
202	NC_011081	CGGG	2	8	77927	77934	0 %	0 %	75 %	25 %	194447269
203	NC_011081	GTTT	2	8	78030	78037	0 %	75 %	25 %	0 %	194447198
204	NC_011081	GTTA	2	8	78133	78140	25 %	50 %	25 %	0 %	194447198
205	NC_011081	TTGT	2	8	78426	78433	0 %	75 %	25 %	0 %	194447198
206	NC_011081	CCAG	2	8	79880	79887	25 %	0 %	25 %	50 %	194447225
207	NC_011081	GCTG	2	8	80198	80205	0 %	25 %	50 %	25 %	194447225
208	NC_011081	TGTA	2	8	80295	80302	25 %	50 %	25 %	0 %	194447225
209	NC_011081	GTTT	2	8	81225	81232	0 %	75 %	25 %	0 %	194447225
210	NC_011081	GCTG	2	8	81393	81400	0 %	25 %	50 %	25 %	194447193
211	NC_011081	ATGG	2	8	81731	81738	25 %	25 %	50 %	0 %	194447193
212	NC_011081	TCGT	2	8	82187	82194	0 %	50 %	25 %	25 %	194447268
213	NC_011081	GGCA	2	8	82472	82479	25 %	0 %	50 %	25 %	194447268
214	NC_011081	TCAG	2	8	84115	84122	25 %	25 %	25 %	25 %	194447207
215	NC_011081	TGTT	2	8	84471	84478	0 %	75 %	25 %	0 %	194447207
216	NC_011081	TGCC	2	8	84768	84775	0 %	25 %	25 %	50 %	194447270
217	NC_011081	TGCC	2	8	85430	85437	0 %	25 %	25 %	50 %	194447233
218	NC_011081	GTTT	2	8	85583	85590	0 %	75 %	25 %	0 %	194447233
219	NC_011081	ACTG	2	8	85880	85887	25 %	25 %	25 %	25 %	194447233
220	NC_011081	TCCG	2	8	86319	86326	0 %	25 %	25 %	50 %	194447199
221	NC_011081	TTTA	2	8	86460	86467	25 %	75 %	0 %	0 %	194447199
222	NC_011081	AGAA	2	8	87141	87148	75 %	0 %	25 %	0 %	194447241
223	NC_011081	AGAA	2	8	87682	87689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
224	NC_011081	AAAG	2	8	88328	88335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
225	NC_011081	AGAA	2	8	88396	88403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
226	NC_011081	GGCC	2	8	89227	89234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
227	NC_011081	TTTC	2	8	89275	89282	0 %	75 %	0 %	25 %	194447239
228	NC_011081	TCTT	2	8	89811	89818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
229	NC_011081	AGGT	2	8	90506	90513	25 %	25 %	50 %	0 %	194447216
230	NC_011081	TGCC	2	8	90788	90795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.