MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011081	GAG	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011081	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011081	ACG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011081	ATC	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011081	TCA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011081	GTT	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011081	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011081	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011081	CGC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011081	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011081	AAC	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011081	TGT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011081	TCT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011081	TCG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011081	GTA	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011081	CCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011081	TTG	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011081	GAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011081	TTG	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011081	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011081	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011081	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011081	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011081	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011081	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011081	TAA	2	6	6345	6350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011081	TAA	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011081	TAA	2	6	8212	8217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011081	ATG	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011081	CTC	2	6	10734	10739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011081	GGC	2	6	10755	10760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011081	TGG	2	6	10884	10889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011081	ATT	2	6	10901	10906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011081	TGG	2	6	10959	10964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011081	CCA	2	6	10986	10991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011081	GAT	2	6	10995	11000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011081	CGG	2	6	13260	13265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011081	TGT	2	6	13273	13278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011081	ACC	2	6	13332	13337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011081	AGT	2	6	13459	13464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011081	ACC	2	6	13549	13554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011081	GCA	2	6	13555	13560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011081	AAG	2	6	13581	13586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011081	ATG	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011081	TCC	2	6	13912	13917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011081	TTG	2	6	14025	14030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011081	CGT	2	6	14162	14167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011081	CTG	2	6	14169	14174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011081	TCC	2	6	14503	14508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011081	TGA	2	6	14509	14514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011081	TGC	2	6	15499	15504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011081	GCT	2	6	15696	15701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011081	TGT	2	6	15714	15719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011081	ATT	2	6	15772	15777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011081	TGA	3	9	15890	15898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011081	ATG	2	6	15906	15911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011081	TGA	2	6	15940	15945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011081	TTC	2	6	18470	18475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011081	ATG	2	6	18589	18594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011081	GAG	2	6	22556	22561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011081	CTC	2	6	23556	23561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011081	GCG	2	6	23582	23587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011081	CGG	2	6	23624	23629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011081	CAC	2	6	23830	23835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011081	AAG	2	6	23864	23869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011081	GTT	2	6	23874	23879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011081	CGC	2	6	26117	26122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011081	CGC	2	6	26251	26256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011081	CCT	2	6	26272	26277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011081	AAC	2	6	26451	26456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011081	GGA	2	6	26457	26462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011081	GGC	2	6	26907	26912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011081	GCC	2	6	26916	26921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011081	GCC	2	6	27572	27577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011081	GCG	2	6	27641	27646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011081	AGA	2	6	27669	27674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011081	GGC	2	6	27774	27779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011081	GTC	2	6	27785	27790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011081	GCT	2	6	27811	27816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011081	CCG	2	6	27834	27839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011081	CGC	2	6	27917	27922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011081	GCA	2	6	27990	27995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011081	GCC	2	6	28008	28013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011081	AGG	2	6	28233	28238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011081	CTC	2	6	28247	28252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011081	GAT	2	6	29192	29197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011081	GCA	2	6	31192	31197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011081	GGT	2	6	33012	33017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011081	GCG	2	6	33029	33034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011081	CGG	2	6	33068	33073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011081	GGA	2	6	33405	33410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011081	TGT	2	6	34070	34075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011081	GGC	2	6	34119	34124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011081	GTC	2	6	34130	34135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011081	GCT	2	6	34156	34161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011081	CCG	2	6	34179	34184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011081	CGC	2	6	34262	34267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011081	CCG	2	6	34348	34353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011081	CAG	2	6	34417	34422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011081	GTG	2	6	34511	34516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011081	GAA	2	6	34559	34564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011081	CCG	2	6	35114	35119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011081	TCA	2	6	35147	35152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011081	ACA	2	6	35153	35158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011081	GGC	2	6	35465	35470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011081	AGG	2	6	35494	35499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011081	CAG	2	6	36485	36490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011081	GTG	2	6	37408	37413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011081	CTC	2	6	37482	37487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011081	GAG	2	6	37525	37530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011081	ATC	2	6	38434	38439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011081	ATA	2	6	38440	38445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011081	ATG	2	6	38453	38458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011081	TTG	2	6	46804	46809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011081	CAG	2	6	46882	46887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011081	ACA	2	6	46943	46948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011081	TAG	2	6	46952	46957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011081	CCG	2	6	46966	46971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011081	CGG	2	6	47155	47160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011081	GCC	2	6	47171	47176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011081	TTG	2	6	47180	47185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011081	TCT	2	6	47211	47216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011081	GAT	2	6	47543	47548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011081	ACA	2	6	47611	47616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011081	GGA	2	6	47685	47690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011081	GGT	2	6	47845	47850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011081	AGG	2	6	47871	47876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011081	TCC	2	6	47945	47950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011081	GAT	2	6	47966	47971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011081	ATC	2	6	47982	47987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011081	AGT	2	6	47999	48004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011081	CAT	2	6	48555	48560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011081	TGT	2	6	48919	48924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011081	AGG	2	6	57438	57443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011081	GAA	2	6	57495	57500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011081	CCT	2	6	58482	58487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011081	CCG	2	6	67369	67374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011081	GAT	2	6	70752	70757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011081	ATT	2	6	70839	70844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011081	GTC	2	6	70867	70872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011081	AAC	2	6	72966	72971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011081	TCC	2	6	73849	73854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_011081	AAT	2	6	73918	73923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011081	GTT	2	6	73955	73960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011081	ATG	2	6	73989	73994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011081	ATC	3	9	75223	75231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011081	TTA	2	6	86854	86859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011081	AGT	2	6	88387	88392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011081	AGA	2	6	89185	89190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011081	GAG	2	6	89521	89526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011081	CAA	2	6	89631	89636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011081	TTA	2	6	89820	89825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011081	ACG	2	6	89840	89845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011081	TAT	2	6	89895	89900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011081	CAG	2	6	90080	90085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_011081	TTA	2	6	90281	90286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011081	GAC	2	6	90816	90821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011081	GAA	2	6	90872	90877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011081	CGA	2	6	90892	90897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011081	ATG	2	6	91043	91048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011081	TGT	2	6	91165	91170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011081	ATC	2	6	91205	91210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_011081	ATT	2	6	91216	91221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011081	ATT	2	6	91297	91302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.