MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 1057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447188
2	NC_011081	GCG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447188
3	NC_011081	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447276
4	NC_011081	CGT	3	9	596	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447276
5	NC_011081	CCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447276
6	NC_011081	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447276
7	NC_011081	CAG	3	9	1139	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447276
8	NC_011081	CAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447276
9	NC_011081	CGT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447276
10	NC_011081	AGC	3	9	1291	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447276
11	NC_011081	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447276
12	NC_011081	CAG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447276
13	NC_011081	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447211
14	NC_011081	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447211
15	NC_011081	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447201
16	NC_011081	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447201
17	NC_011081	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447273
18	NC_011081	GCG	2	6	2579	2584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447273
19	NC_011081	GCT	2	6	2617	2622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447273
20	NC_011081	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447273
21	NC_011081	GCC	2	6	2742	2747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447236
22	NC_011081	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447291
23	NC_011081	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447291
24	NC_011081	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447291
25	NC_011081	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447291
26	NC_011081	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447291
27	NC_011081	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447291
28	NC_011081	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447291
29	NC_011081	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447291
30	NC_011081	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447291
31	NC_011081	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447291
32	NC_011081	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447291
33	NC_011081	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447291
34	NC_011081	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447291
35	NC_011081	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447291
36	NC_011081	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447291
37	NC_011081	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447291
38	NC_011081	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447275
39	NC_011081	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447275
40	NC_011081	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447275
41	NC_011081	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447275
42	NC_011081	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447275
43	NC_011081	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447215
44	NC_011081	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447215
45	NC_011081	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447263
46	NC_011081	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447191
47	NC_011081	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447191
48	NC_011081	CAT	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447191
49	NC_011081	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447261
50	NC_011081	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447261
51	NC_011081	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447261
52	NC_011081	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447261
53	NC_011081	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447261
54	NC_011081	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447261
55	NC_011081	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447261
56	NC_011081	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447192
57	NC_011081	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447192
58	NC_011081	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447192
59	NC_011081	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447192
60	NC_011081	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447192
61	NC_011081	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447192
62	NC_011081	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447192
63	NC_011081	CAC	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447192
64	NC_011081	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447192
65	NC_011081	TGT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447194
66	NC_011081	AGA	3	9	6563	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447194
67	NC_011081	AGA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447237
68	NC_011081	TCT	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447237
69	NC_011081	ATG	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447237
70	NC_011081	TGC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447237
71	NC_011081	ACC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447237
72	NC_011081	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447237
73	NC_011081	CTC	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447237
74	NC_011081	CAG	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447237
75	NC_011081	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447237
76	NC_011081	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447237
77	NC_011081	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447237
78	NC_011081	ATC	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447237
79	NC_011081	GCA	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447237
80	NC_011081	ATC	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447237
81	NC_011081	TGT	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447219
82	NC_011081	TGC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447219
83	NC_011081	CAG	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447219
84	NC_011081	GAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447260
85	NC_011081	TGC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447260
86	NC_011081	ATG	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447260
87	NC_011081	AAG	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447260
88	NC_011081	GCA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447260
89	NC_011081	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447260
90	NC_011081	TCA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447260
91	NC_011081	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447260
92	NC_011081	GTG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447260
93	NC_011081	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447260
94	NC_011081	GGT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447260
95	NC_011081	CTG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447260
96	NC_011081	GAT	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447260
97	NC_011081	TAA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447260
98	NC_011081	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447260
99	NC_011081	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447260
100	NC_011081	GCT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447260
101	NC_011081	CAG	2	6	10035	10040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447260
102	NC_011081	ATT	2	6	10100	10105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447260
103	NC_011081	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447260
104	NC_011081	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447200
105	NC_011081	AAG	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447200
106	NC_011081	TTA	2	6	10350	10355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447200
107	NC_011081	TAT	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447200
108	NC_011081	AAT	2	6	10480	10485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447200
109	NC_011081	ATA	3	9	10597	10605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447264
110	NC_011081	CAT	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447264
111	NC_011081	ACC	2	6	11129	11134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447229
112	NC_011081	CTT	2	6	11139	11144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447229
113	NC_011081	TGC	2	6	11166	11171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447229
114	NC_011081	CAC	2	6	11182	11187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447229
115	NC_011081	CTG	2	6	11271	11276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447229
116	NC_011081	ACG	2	6	11294	11299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447229
117	NC_011081	CAG	3	9	11344	11352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447229
118	NC_011081	TCC	2	6	11438	11443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447229
119	NC_011081	GAC	2	6	11445	11450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447229
120	NC_011081	AGG	2	6	11454	11459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194447229
121	NC_011081	TCA	2	6	11549	11554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447229
122	NC_011081	CGG	2	6	11600	11605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447229
123	NC_011081	TCC	2	6	11626	11631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447255
124	NC_011081	AGA	2	6	11732	11737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447255
125	NC_011081	GTT	2	6	11834	11839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447255
126	NC_011081	ATA	2	6	11891	11896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447223
127	NC_011081	TAA	2	6	11907	11912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447223
128	NC_011081	ATA	2	6	11949	11954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447223
129	NC_011081	ATC	2	6	11969	11974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447223
130	NC_011081	ATG	2	6	11976	11981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447223
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132	NC_011081	TAT	2	6	12117	12122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447284
133	NC_011081	GCA	2	6	12262	12267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447262
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162	NC_011081	GCT	2	6	16111	16116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447206
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243	NC_011081	CTG	2	6	23070	23075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447245
244	NC_011081	TGG	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447245
245	NC_011081	AGT	2	6	23211	23216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447245
246	NC_011081	GTG	2	6	23255	23260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447245
247	NC_011081	GTT	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447245
248	NC_011081	GCA	2	6	23283	23288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447245
249	NC_011081	GCC	2	6	23293	23298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447245
250	NC_011081	TGA	2	6	23701	23706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447183
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252	NC_011081	TCG	2	6	23971	23976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447177
253	NC_011081	GCC	2	6	24123	24128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447177
254	NC_011081	TCA	2	6	24305	24310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447177
255	NC_011081	GCT	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447177
256	NC_011081	GCA	2	6	24515	24520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447177
257	NC_011081	ATG	2	6	24532	24537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447177
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260	NC_011081	CCT	2	6	24728	24733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447251
261	NC_011081	GCA	2	6	24833	24838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447297
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265	NC_011081	CTG	2	6	25070	25075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447297
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275	NC_011081	GCC	2	6	25467	25472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447257
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282	NC_011081	GTG	2	6	25819	25824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447257
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285	NC_011081	GTG	2	6	25970	25975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447257
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377	NC_011081	CCG	2	6	32791	32796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447226
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500	NC_011081	CTT	2	6	42857	42862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447258

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