MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	GA	3	6	236	241	50 %	0 %	50 %	0 %	194447188
2	NC_011081	CA	3	6	877	882	50 %	0 %	0 %	50 %	194447276
3	NC_011081	GC	3	6	1306	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	194447276
4	NC_011081	CG	3	6	1871	1876	0 %	0 %	50 %	50 %	194447211
5	NC_011081	CA	3	6	1934	1939	50 %	0 %	0 %	50 %	194447211
6	NC_011081	TA	3	6	2356	2361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011081	TA	3	6	2367	2372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011081	CT	3	6	3454	3459	0 %	50 %	0 %	50 %	194447291
9	NC_011081	GA	3	6	3949	3954	50 %	0 %	50 %	0 %	194447275
10	NC_011081	GA	3	6	4744	4749	50 %	0 %	50 %	0 %	194447263
11	NC_011081	TC	4	8	4842	4849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011081	TA	3	6	5576	5581	50 %	50 %	0 %	0 %	194447261
13	NC_011081	CA	3	6	5651	5656	50 %	0 %	0 %	50 %	194447261
14	NC_011081	AT	3	6	6500	6505	50 %	50 %	0 %	0 %	194447194
15	NC_011081	TC	3	6	6506	6511	0 %	50 %	0 %	50 %	194447194
16	NC_011081	GC	3	6	8547	8552	0 %	0 %	50 %	50 %	194447260
17	NC_011081	AC	3	6	8634	8639	50 %	0 %	0 %	50 %	194447260
18	NC_011081	GA	3	6	8716	8721	50 %	0 %	50 %	0 %	194447260
19	NC_011081	AG	3	6	8773	8778	50 %	0 %	50 %	0 %	194447260
20	NC_011081	AT	3	6	9680	9685	50 %	50 %	0 %	0 %	194447260
21	NC_011081	AT	3	6	10524	10529	50 %	50 %	0 %	0 %	194447200
22	NC_011081	GC	3	6	11411	11416	0 %	0 %	50 %	50 %	194447229
23	NC_011081	TG	3	6	11930	11935	0 %	50 %	50 %	0 %	194447223
24	NC_011081	GC	3	6	12355	12360	0 %	0 %	50 %	50 %	194447262
25	NC_011081	GC	3	6	12565	12570	0 %	0 %	50 %	50 %	194447262
26	NC_011081	TC	3	6	13158	13163	0 %	50 %	0 %	50 %	194447262
27	NC_011081	GA	3	6	13169	13174	50 %	0 %	50 %	0 %	194447262
28	NC_011081	CA	3	6	13839	13844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011081	TG	3	6	14266	14271	0 %	50 %	50 %	0 %	194447178
30	NC_011081	CT	3	6	14458	14463	0 %	50 %	0 %	50 %	194447178
31	NC_011081	CA	3	6	14647	14652	50 %	0 %	0 %	50 %	194447298
32	NC_011081	CG	3	6	15052	15057	0 %	0 %	50 %	50 %	194447298
33	NC_011081	CT	3	6	15426	15431	0 %	50 %	0 %	50 %	194447298
34	NC_011081	AT	3	6	17234	17239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011081	GT	3	6	18021	18026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011081	AT	3	6	18357	18362	50 %	50 %	0 %	0 %	194447247
37	NC_011081	AG	3	6	18376	18381	50 %	0 %	50 %	0 %	194447247
38	NC_011081	TG	3	6	18442	18447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011081	TG	3	6	18680	18685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011081	TG	3	6	19660	19665	0 %	50 %	50 %	0 %	194447181
41	NC_011081	GC	3	6	19923	19928	0 %	0 %	50 %	50 %	194447289
42	NC_011081	TG	3	6	20541	20546	0 %	50 %	50 %	0 %	194447224
43	NC_011081	GA	3	6	21148	21153	50 %	0 %	50 %	0 %	194447224
44	NC_011081	GC	3	6	21374	21379	0 %	0 %	50 %	50 %	194447224
45	NC_011081	CA	3	6	21383	21388	50 %	0 %	0 %	50 %	194447224
46	NC_011081	GC	3	6	21752	21757	0 %	0 %	50 %	50 %	194447279
47	NC_011081	TA	3	6	22206	22211	50 %	50 %	0 %	0 %	194447204
48	NC_011081	CA	3	6	22235	22240	50 %	0 %	0 %	50 %	194447204
49	NC_011081	GT	3	6	22284	22289	0 %	50 %	50 %	0 %	194447204
50	NC_011081	GT	3	6	22415	22420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011081	AC	3	6	22824	22829	50 %	0 %	0 %	50 %	194447245
52	NC_011081	TG	3	6	23029	23034	0 %	50 %	50 %	0 %	194447245
53	NC_011081	CA	3	6	24359	24364	50 %	0 %	0 %	50 %	194447177
54	NC_011081	GA	3	6	24789	24794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011081	GC	3	6	24953	24958	0 %	0 %	50 %	50 %	194447297
56	NC_011081	GA	3	6	25036	25041	50 %	0 %	50 %	0 %	194447297
57	NC_011081	CA	3	6	25213	25218	50 %	0 %	0 %	50 %	194447297
58	NC_011081	CG	3	6	27586	27591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011081	GT	3	6	27963	27968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011081	GC	3	6	28545	28550	0 %	0 %	50 %	50 %	194447180
61	NC_011081	AG	3	6	29140	29145	50 %	0 %	50 %	0 %	194447238
62	NC_011081	CG	3	6	29154	29159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011081	CG	3	6	29816	29821	0 %	0 %	50 %	50 %	194447190
64	NC_011081	TG	4	8	30371	30378	0 %	50 %	50 %	0 %	194447190
65	NC_011081	TG	3	6	31093	31098	0 %	50 %	50 %	0 %	194447190
66	NC_011081	TC	3	6	31459	31464	0 %	50 %	0 %	50 %	194447252
67	NC_011081	CT	3	6	33543	33548	0 %	50 %	0 %	50 %	194447230
68	NC_011081	GT	3	6	34308	34313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011081	CT	3	6	35108	35113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011081	CG	3	6	35407	35412	0 %	0 %	50 %	50 %	194447189
71	NC_011081	CA	3	6	36709	36714	50 %	0 %	0 %	50 %	194447272
72	NC_011081	GT	3	6	37199	37204	0 %	50 %	50 %	0 %	194447196
73	NC_011081	GA	3	6	37328	37333	50 %	0 %	50 %	0 %	194447196
74	NC_011081	GC	3	6	37680	37685	0 %	0 %	50 %	50 %	194447248
75	NC_011081	TC	3	6	38597	38602	0 %	50 %	0 %	50 %	194447202
76	NC_011081	TC	3	6	38816	38821	0 %	50 %	0 %	50 %	194447286
77	NC_011081	TC	3	6	39108	39113	0 %	50 %	0 %	50 %	194447197
78	NC_011081	CA	3	6	40892	40897	50 %	0 %	0 %	50 %	194447209
79	NC_011081	CA	3	6	41335	41340	50 %	0 %	0 %	50 %	194447209
80	NC_011081	GA	3	6	43378	43383	50 %	0 %	50 %	0 %	194447258
81	NC_011081	CA	3	6	43596	43601	50 %	0 %	0 %	50 %	194447258
82	NC_011081	CA	3	6	44688	44693	50 %	0 %	0 %	50 %	194447208
83	NC_011081	AG	3	6	45125	45130	50 %	0 %	50 %	0 %	194447208
84	NC_011081	CT	3	6	45912	45917	0 %	50 %	0 %	50 %	194447244
85	NC_011081	TG	3	6	46311	46316	0 %	50 %	50 %	0 %	194447244
86	NC_011081	TG	3	6	47032	47037	0 %	50 %	50 %	0 %	194447283
87	NC_011081	TC	3	6	47476	47481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011081	GA	3	6	48607	48612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011081	TA	4	8	50124	50131	50 %	50 %	0 %	0 %	194447277
90	NC_011081	TA	4	8	50446	50453	50 %	50 %	0 %	0 %	194447277
91	NC_011081	CA	3	6	51914	51919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011081	AT	3	6	52858	52863	50 %	50 %	0 %	0 %	194447292
93	NC_011081	GT	3	6	53171	53176	0 %	50 %	50 %	0 %	194447292
94	NC_011081	AG	3	6	54783	54788	50 %	0 %	50 %	0 %	194447253
95	NC_011081	AG	3	6	55620	55625	50 %	0 %	50 %	0 %	194447253
96	NC_011081	CA	3	6	55626	55631	50 %	0 %	0 %	50 %	194447253
97	NC_011081	TG	3	6	56525	56530	0 %	50 %	50 %	0 %	194447253
98	NC_011081	AG	3	6	57223	57228	50 %	0 %	50 %	0 %	194447253
99	NC_011081	AG	3	6	57684	57689	50 %	0 %	50 %	0 %	194447222
100	NC_011081	GT	3	6	58106	58111	0 %	50 %	50 %	0 %	194447222
101	NC_011081	AT	3	6	58962	58967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011081	TG	3	6	59997	60002	0 %	50 %	50 %	0 %	194447271
103	NC_011081	AT	3	6	60896	60901	50 %	50 %	0 %	0 %	194447176
104	NC_011081	AG	3	6	62164	62169	50 %	0 %	50 %	0 %	194447265
105	NC_011081	AG	3	6	62840	62845	50 %	0 %	50 %	0 %	194447285
106	NC_011081	GA	3	6	63585	63590	50 %	0 %	50 %	0 %	194447299
107	NC_011081	CT	3	6	64437	64442	0 %	50 %	0 %	50 %	194447299
108	NC_011081	CT	3	6	64497	64502	0 %	50 %	0 %	50 %	194447299
109	NC_011081	TG	3	6	64632	64637	0 %	50 %	50 %	0 %	194447299
110	NC_011081	GA	3	6	67545	67550	50 %	0 %	50 %	0 %	194447187
111	NC_011081	AT	3	6	67655	67660	50 %	50 %	0 %	0 %	194447187
112	NC_011081	AT	3	6	68466	68471	50 %	50 %	0 %	0 %	194447287
113	NC_011081	AT	3	6	68826	68831	50 %	50 %	0 %	0 %	194447287
114	NC_011081	GA	3	6	70219	70224	50 %	0 %	50 %	0 %	194447210
115	NC_011081	AC	3	6	70538	70543	50 %	0 %	0 %	50 %	194447274
116	NC_011081	GA	3	6	71822	71827	50 %	0 %	50 %	0 %	194447249
117	NC_011081	AT	3	6	73210	73215	50 %	50 %	0 %	0 %	194447234
118	NC_011081	TG	3	6	74477	74482	0 %	50 %	50 %	0 %	194447281
119	NC_011081	AC	3	6	75279	75284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011081	AC	3	6	75414	75419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011081	AT	3	6	76354	76359	50 %	50 %	0 %	0 %	194447179
122	NC_011081	TA	3	6	76623	76628	50 %	50 %	0 %	0 %	194447179
123	NC_011081	AC	4	8	76939	76946	50 %	0 %	0 %	50 %	194447294
124	NC_011081	TA	3	6	76957	76962	50 %	50 %	0 %	0 %	194447294
125	NC_011081	AT	3	6	77098	77103	50 %	50 %	0 %	0 %	194447294
126	NC_011081	GT	3	6	77312	77317	0 %	50 %	50 %	0 %	194447294
127	NC_011081	TA	3	6	77411	77416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011081	CT	3	6	77527	77532	0 %	50 %	0 %	50 %	194447269
129	NC_011081	GC	4	8	77854	77861	0 %	0 %	50 %	50 %	194447269
130	NC_011081	GA	3	6	78705	78710	50 %	0 %	50 %	0 %	194447184
131	NC_011081	AG	3	6	79492	79497	50 %	0 %	50 %	0 %	194447184
132	NC_011081	GC	3	6	80817	80822	0 %	0 %	50 %	50 %	194447225
133	NC_011081	AG	3	6	82884	82889	50 %	0 %	50 %	0 %	194447268
134	NC_011081	TC	3	6	84431	84436	0 %	50 %	0 %	50 %	194447207
135	NC_011081	CT	3	6	84483	84488	0 %	50 %	0 %	50 %	194447207
136	NC_011081	AT	3	6	84725	84730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011081	TC	3	6	85415	85420	0 %	50 %	0 %	50 %	194447233
138	NC_011081	TA	3	6	86260	86265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011081	AT	3	6	86361	86366	50 %	50 %	0 %	0 %	194447199
140	NC_011081	GT	3	6	86582	86587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011081	GA	3	6	87183	87188	50 %	0 %	50 %	0 %	194447241
142	NC_011081	GA	3	6	87842	87847	50 %	0 %	50 %	0 %	194447300
143	NC_011081	GA	3	6	87958	87963	50 %	0 %	50 %	0 %	194447300
144	NC_011081	TC	3	6	89202	89207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011081	AT	3	6	90224	90229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.