MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	T	7	7	41	47	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011081	A	7	7	1909	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	194447211
3	NC_011081	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	194447275
4	NC_011081	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	194447275
5	NC_011081	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	194447275
6	NC_011081	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011081	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	194447261
8	NC_011081	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	194447261
9	NC_011081	T	6	6	5673	5678	0 %	100 %	0 %	0 %	194447261
10	NC_011081	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
11	NC_011081	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
12	NC_011081	T	6	6	6265	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
13	NC_011081	T	6	6	6305	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
14	NC_011081	G	6	6	6609	6614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011081	A	6	6	8505	8510	100 %	0 %	0 %	0 %	194447260
16	NC_011081	A	7	7	8958	8964	100 %	0 %	0 %	0 %	194447260
17	NC_011081	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	194447260
18	NC_011081	A	6	6	10467	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	194447200
19	NC_011081	A	6	6	10673	10678	100 %	0 %	0 %	0 %	194447264
20	NC_011081	G	6	6	10819	10824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011081	G	9	9	10918	10926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011081	T	6	6	12012	12017	0 %	100 %	0 %	0 %	194447223
23	NC_011081	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	194447262
24	NC_011081	A	7	7	13961	13967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011081	A	7	7	13971	13977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011081	T	7	7	14224	14230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011081	T	6	6	14900	14905	0 %	100 %	0 %	0 %	194447298
28	NC_011081	T	8	8	14945	14952	0 %	100 %	0 %	0 %	194447298
29	NC_011081	A	6	6	15985	15990	100 %	0 %	0 %	0 %	194447206
30	NC_011081	T	6	6	16004	16009	0 %	100 %	0 %	0 %	194447206
31	NC_011081	G	6	6	16155	16160	0 %	0 %	100 %	0 %	194447206
32	NC_011081	G	6	6	16660	16665	0 %	0 %	100 %	0 %	194447254
33	NC_011081	T	6	6	17204	17209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011081	A	7	7	17285	17291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011081	T	6	6	18745	18750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011081	T	6	6	18792	18797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011081	A	8	8	19194	19201	100 %	0 %	0 %	0 %	194447181
38	NC_011081	A	6	6	21137	21142	100 %	0 %	0 %	0 %	194447224
39	NC_011081	T	6	6	22132	22137	0 %	100 %	0 %	0 %	194447243
40	NC_011081	A	6	6	22263	22268	100 %	0 %	0 %	0 %	194447204
41	NC_011081	A	6	6	23050	23055	100 %	0 %	0 %	0 %	194447245
42	NC_011081	G	6	6	23395	23400	0 %	0 %	100 %	0 %	194447245
43	NC_011081	A	6	6	24066	24071	100 %	0 %	0 %	0 %	194447177
44	NC_011081	T	6	6	26521	26526	0 %	100 %	0 %	0 %	194447256
45	NC_011081	A	7	7	26587	26593	100 %	0 %	0 %	0 %	194447256
46	NC_011081	G	6	6	28048	28053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011081	A	6	6	28130	28135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011081	A	6	6	28736	28741	100 %	0 %	0 %	0 %	194447180
49	NC_011081	T	6	6	31823	31828	0 %	100 %	0 %	0 %	194447290
50	NC_011081	A	6	6	34471	34476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54	NC_011081	A	6	6	36980	36985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56	NC_011081	T	7	7	38422	38428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61	NC_011081	A	6	6	40414	40419	100 %	0 %	0 %	0 %	194447209
62	NC_011081	A	8	8	42082	42089	100 %	0 %	0 %	0 %	194447209
63	NC_011081	T	7	7	42152	42158	0 %	100 %	0 %	0 %	194447258
64	NC_011081	T	6	6	43119	43124	0 %	100 %	0 %	0 %	194447258
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70	NC_011081	A	7	7	47622	47628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011081	T	7	7	47646	47652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_011081	A	7	7	67359	67365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_011081	T	6	6	72995	73000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_011081	T	6	6	73789	73794	0 %	100 %	0 %	0 %	194447234
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145	NC_011081	T	6	6	91252	91257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.