MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 2764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011080	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	194446390
2	NC_011080	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	194444692
3	NC_011080	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	194444103
4	NC_011080	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	194442782
5	NC_011080	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	194445604
6	NC_011080	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	194443702
7	NC_011080	AATCA	2	10	15512	15521	60 %	20 %	0 %	20 %	194445243
8	NC_011080	GGCTG	2	10	18845	18854	0 %	20 %	60 %	20 %	194443256
9	NC_011080	AGAGC	2	10	19366	19375	40 %	0 %	40 %	20 %	194443256
10	NC_011080	TACCG	2	10	21044	21053	20 %	20 %	20 %	40 %	194445060
11	NC_011080	GGCCG	2	10	21668	21677	0 %	0 %	60 %	40 %	194445060
12	NC_011080	CTTTT	2	10	23387	23396	0 %	80 %	0 %	20 %	194444266
13	NC_011080	CGGTA	2	10	24554	24563	20 %	20 %	40 %	20 %	194443119
14	NC_011080	CTGTT	2	10	24593	24602	0 %	60 %	20 %	20 %	194443119
15	NC_011080	TATTT	2	10	25427	25436	20 %	80 %	0 %	0 %	194443678
16	NC_011080	GCGTC	2	10	28350	28359	0 %	20 %	40 %	40 %	194446095
17	NC_011080	ATCTG	2	10	30958	30967	20 %	40 %	20 %	20 %	194444078
18	NC_011080	TTACG	2	10	31013	31022	20 %	40 %	20 %	20 %	194444078
19	NC_011080	GGGCG	2	10	31782	31791	0 %	0 %	80 %	20 %	194444351
20	NC_011080	TGCGT	2	10	32161	32170	0 %	40 %	40 %	20 %	194442512
21	NC_011080	AAAAG	2	10	32555	32564	80 %	0 %	20 %	0 %	194443097
22	NC_011080	TATAA	2	10	34158	34167	60 %	40 %	0 %	0 %	194446304
23	NC_011080	AGCGA	2	10	35584	35593	40 %	0 %	40 %	20 %	194446355
24	NC_011080	TCCTG	2	10	35794	35803	0 %	40 %	20 %	40 %	194446355
25	NC_011080	GGTCA	2	10	38029	38038	20 %	20 %	40 %	20 %	194444661
26	NC_011080	TTCAT	2	10	39301	39310	20 %	60 %	0 %	20 %	194445358
27	NC_011080	TGAAA	2	10	40118	40127	60 %	20 %	20 %	0 %	194443287
28	NC_011080	ACGGC	2	10	44478	44487	20 %	0 %	40 %	40 %	194446358
29	NC_011080	TTTTA	2	10	44804	44813	20 %	80 %	0 %	0 %	194446358
30	NC_011080	GGGCT	2	10	46552	46561	0 %	20 %	60 %	20 %	194446207
31	NC_011080	GCGTA	2	10	48428	48437	20 %	20 %	40 %	20 %	194443677
32	NC_011080	GACCA	2	10	49033	49042	40 %	0 %	20 %	40 %	194443677
33	NC_011080	CCGGC	2	10	49175	49184	0 %	0 %	40 %	60 %	194443677
34	NC_011080	CAGAC	2	10	50365	50374	40 %	0 %	20 %	40 %	194443677
35	NC_011080	TGTGC	2	10	53126	53135	0 %	40 %	40 %	20 %	194442807
36	NC_011080	GTTTG	2	10	55448	55457	0 %	60 %	40 %	0 %	194442276
37	NC_011080	CACTA	2	10	56579	56588	40 %	20 %	0 %	40 %	194442276
38	NC_011080	CGGCG	2	10	57117	57126	0 %	0 %	60 %	40 %	194446803
39	NC_011080	TTCAC	2	10	57372	57381	20 %	40 %	0 %	40 %	194446160
40	NC_011080	AAAAT	2	10	58943	58952	80 %	20 %	0 %	0 %	194444262
41	NC_011080	GGAAA	2	10	59730	59739	60 %	0 %	40 %	0 %	194445334
42	NC_011080	CGCTG	2	10	60220	60229	0 %	20 %	40 %	40 %	194445788
43	NC_011080	CGGCG	2	10	63986	63995	0 %	0 %	60 %	40 %	194443227
44	NC_011080	GCCTG	2	10	64779	64788	0 %	20 %	40 %	40 %	194443227
45	NC_011080	GCGCG	2	10	64933	64942	0 %	0 %	60 %	40 %	194443760
46	NC_011080	CGTGC	2	10	71355	71364	0 %	20 %	40 %	40 %	194442210
47	NC_011080	TTGAT	2	10	71525	71534	20 %	60 %	20 %	0 %	194442210
48	NC_011080	ACCGC	2	10	72085	72094	20 %	0 %	20 %	60 %	194442210
49	NC_011080	CGATG	2	10	77567	77576	20 %	20 %	40 %	20 %	194446768
50	NC_011080	GCGAA	2	10	78508	78517	40 %	0 %	40 %	20 %	194446768
51	NC_011080	CGTAC	2	10	79398	79407	20 %	20 %	20 %	40 %	194446768
52	NC_011080	TTGCC	2	10	81035	81044	0 %	40 %	20 %	40 %	194445217
53	NC_011080	CGTCC	2	10	81145	81154	0 %	20 %	20 %	60 %	194445217
54	NC_011080	TCAGC	2	10	84264	84273	20 %	20 %	20 %	40 %	194442451
55	NC_011080	GGCCA	2	10	84412	84421	20 %	0 %	40 %	40 %	194442451
56	NC_011080	GTACG	2	10	86983	86992	20 %	20 %	40 %	20 %	194445728
57	NC_011080	CAGAA	2	10	87696	87705	60 %	0 %	20 %	20 %	194445728
58	NC_011080	CCGCA	2	10	89815	89824	20 %	0 %	20 %	60 %	194443704
59	NC_011080	CGGTT	2	10	90320	90329	0 %	40 %	40 %	20 %	194444813
60	NC_011080	TGGCG	2	10	92100	92109	0 %	20 %	60 %	20 %	194445455
61	NC_011080	TTTCC	2	10	96020	96029	0 %	60 %	0 %	40 %	194442740
62	NC_011080	GTGGC	2	10	96589	96598	0 %	20 %	60 %	20 %	194442740
63	NC_011080	TGCAC	2	10	98653	98662	20 %	20 %	20 %	40 %	194446537
64	NC_011080	TGGCA	2	10	98722	98731	20 %	20 %	40 %	20 %	194446537
65	NC_011080	TCTGT	2	10	99048	99057	0 %	60 %	20 %	20 %	194446332
66	NC_011080	GCGCT	2	10	99358	99367	0 %	20 %	40 %	40 %	194446332
67	NC_011080	GGCGC	2	10	99772	99781	0 %	0 %	60 %	40 %	194446332
68	NC_011080	GCGAC	2	10	100085	100094	20 %	0 %	40 %	40 %	194446332
69	NC_011080	AACGT	2	10	102542	102551	40 %	20 %	20 %	20 %	194443063
70	NC_011080	CCCAA	2	10	104692	104701	40 %	0 %	0 %	60 %	194444526
71	NC_011080	TTGTT	2	10	105399	105408	0 %	80 %	20 %	0 %	194444526
72	NC_011080	GCTTC	2	10	106779	106788	0 %	40 %	20 %	40 %	194445274
73	NC_011080	TGCGT	2	10	107066	107075	0 %	40 %	40 %	20 %	194445274
74	NC_011080	TGATC	2	10	108766	108775	20 %	40 %	20 %	20 %	194442223
75	NC_011080	GCTGA	2	10	110277	110286	20 %	20 %	40 %	20 %	194446131
76	NC_011080	TGGCG	2	10	111927	111936	0 %	20 %	60 %	20 %	194446131
77	NC_011080	AGCGC	2	10	112487	112496	20 %	0 %	40 %	40 %	194446131
78	NC_011080	ACGTT	2	10	113304	113313	20 %	40 %	20 %	20 %	194446652
79	NC_011080	CCGCG	2	10	113572	113581	0 %	0 %	40 %	60 %	194446652
80	NC_011080	GGGGT	2	10	114968	114977	0 %	20 %	80 %	0 %	194446652
81	NC_011080	ATTTT	2	10	116716	116725	20 %	80 %	0 %	0 %	194444922
82	NC_011080	ACAGA	2	10	116899	116908	60 %	0 %	20 %	20 %	194444922
83	NC_011080	CAGCG	2	10	119892	119901	20 %	0 %	40 %	40 %	194446528
84	NC_011080	GCCGG	2	10	120192	120201	0 %	0 %	60 %	40 %	194446528
85	NC_011080	CGAGC	2	10	120317	120326	20 %	0 %	40 %	40 %	194446528
86	NC_011080	ATTTG	2	10	120760	120769	20 %	60 %	20 %	0 %	194446528
87	NC_011080	TTGCC	2	10	125264	125273	0 %	40 %	20 %	40 %	194444261
88	NC_011080	AGCAG	2	10	125941	125950	40 %	0 %	40 %	20 %	194442730
89	NC_011080	AGTTT	2	10	128171	128180	20 %	60 %	20 %	0 %	194444243
90	NC_011080	TCGAT	2	10	130019	130028	20 %	40 %	20 %	20 %	194442990
91	NC_011080	CGGCG	2	10	132329	132338	0 %	0 %	60 %	40 %	194443917
92	NC_011080	CGTTT	2	10	132791	132800	0 %	60 %	20 %	20 %	194443917
93	NC_011080	ATTCC	2	10	137892	137901	20 %	40 %	0 %	40 %	194444736
94	NC_011080	AAAGC	2	10	140189	140198	60 %	0 %	20 %	20 %	194444269
95	NC_011080	CCGCA	2	10	140722	140731	20 %	0 %	20 %	60 %	194444269
96	NC_011080	AGTTC	2	10	143092	143101	20 %	40 %	20 %	20 %	194443193
97	NC_011080	TGCCT	2	10	143192	143201	0 %	40 %	20 %	40 %	194446206
98	NC_011080	TATCG	2	10	144972	144981	20 %	40 %	20 %	20 %	194446375
99	NC_011080	AAGCG	2	10	147845	147854	40 %	0 %	40 %	20 %	194444164
100	NC_011080	GTTTG	2	10	149748	149757	0 %	60 %	40 %	0 %	194442341
101	NC_011080	CGTAT	2	10	151219	151228	20 %	40 %	20 %	20 %	194446027
102	NC_011080	ATCAG	2	10	153055	153064	40 %	20 %	20 %	20 %	194445444
103	NC_011080	CTGCC	2	10	155064	155073	0 %	20 %	20 %	60 %	194444863
104	NC_011080	CGGCG	2	10	157794	157803	0 %	0 %	60 %	40 %	194444484
105	NC_011080	CCGGC	2	10	161147	161156	0 %	0 %	40 %	60 %	194443083
106	NC_011080	GATCA	2	10	164464	164473	40 %	20 %	20 %	20 %	194443863
107	NC_011080	CGTCA	2	10	165210	165219	20 %	20 %	20 %	40 %	194443064
108	NC_011080	ATCCC	2	10	166910	166919	20 %	20 %	0 %	60 %	194444325
109	NC_011080	AGCGC	2	10	167618	167627	20 %	0 %	40 %	40 %	194444325
110	NC_011080	TGAGC	2	10	169467	169476	20 %	20 %	40 %	20 %	194443188
111	NC_011080	CGCAT	2	10	169729	169738	20 %	20 %	20 %	40 %	194442571
112	NC_011080	CGAAC	2	10	170458	170467	40 %	0 %	20 %	40 %	194444228
113	NC_011080	GTTCA	2	10	170724	170733	20 %	40 %	20 %	20 %	194444228
114	NC_011080	ATGAC	2	10	171690	171699	40 %	20 %	20 %	20 %	194443693
115	NC_011080	CTGGA	2	10	172280	172289	20 %	20 %	40 %	20 %	194445301
116	NC_011080	CAGAA	2	10	174399	174408	60 %	0 %	20 %	20 %	194446380
117	NC_011080	CGAAG	2	10	177270	177279	40 %	0 %	40 %	20 %	194442509
118	NC_011080	AGCAA	2	10	179483	179492	60 %	0 %	20 %	20 %	194442514
119	NC_011080	GGCAT	2	10	184551	184560	20 %	20 %	40 %	20 %	194444072
120	NC_011080	GGCCA	2	10	184973	184982	20 %	0 %	40 %	40 %	194443781
121	NC_011080	GCGCC	2	10	184986	184995	0 %	0 %	40 %	60 %	194443781
122	NC_011080	CGTTT	2	10	185488	185497	0 %	60 %	20 %	20 %	194443781
123	NC_011080	GGGGA	2	10	185540	185549	20 %	0 %	80 %	0 %	194443781
124	NC_011080	CTGGT	2	10	189177	189186	0 %	40 %	40 %	20 %	194445093
125	NC_011080	CGGCG	2	10	192486	192495	0 %	0 %	60 %	40 %	448967493
126	NC_011080	CCGCT	2	10	193193	193202	0 %	20 %	20 %	60 %	448967493
127	NC_011080	GCCCA	2	10	195745	195754	20 %	0 %	20 %	60 %	194445050
128	NC_011080	GCGCA	2	10	196150	196159	20 %	0 %	40 %	40 %	194445050
129	NC_011080	ATCGG	2	10	197541	197550	20 %	20 %	40 %	20 %	194446066
130	NC_011080	GCCGC	2	10	198751	198760	0 %	0 %	40 %	60 %	194443616
131	NC_011080	ATCCA	2	10	204101	204110	40 %	20 %	0 %	40 %	194445260
132	NC_011080	CGGCG	2	10	206218	206227	0 %	0 %	60 %	40 %	194445694
133	NC_011080	TGGTC	2	10	207084	207093	0 %	40 %	40 %	20 %	194445694
134	NC_011080	CGTCA	2	10	208782	208791	20 %	20 %	20 %	40 %	194446310
135	NC_011080	AGCGC	2	10	209733	209742	20 %	0 %	40 %	40 %	194446310
136	NC_011080	CGGCG	2	10	211647	211656	0 %	0 %	60 %	40 %	194443994
137	NC_011080	TTCGG	2	10	212527	212536	0 %	40 %	40 %	20 %	194443969
138	NC_011080	CTTGC	2	10	213536	213545	0 %	40 %	20 %	40 %	194443433
139	NC_011080	GCGAT	2	10	213877	213886	20 %	20 %	40 %	20 %	194442904
140	NC_011080	TGAGC	2	10	213948	213957	20 %	20 %	40 %	20 %	194442904
141	NC_011080	GCACG	2	10	215212	215221	20 %	0 %	40 %	40 %	194442278
142	NC_011080	AGATC	2	10	215617	215626	40 %	20 %	20 %	20 %	194446701
143	NC_011080	CGCGG	2	10	216039	216048	0 %	0 %	60 %	40 %	448967495
144	NC_011080	CGCGG	2	10	216223	216232	0 %	0 %	60 %	40 %	448967495
145	NC_011080	AGGCC	2	10	216402	216411	20 %	0 %	40 %	40 %	448967495
146	NC_011080	GCCAG	2	10	218207	218216	20 %	0 %	40 %	40 %	194445400
147	NC_011080	GCGCG	2	10	218773	218782	0 %	0 %	60 %	40 %	194444954
148	NC_011080	CGGGG	2	10	220591	220600	0 %	0 %	80 %	20 %	194442804
149	NC_011080	GCGAA	2	10	222711	222720	40 %	0 %	40 %	20 %	194442804
150	NC_011080	CAGCG	2	10	222774	222783	20 %	0 %	40 %	40 %	194442804
151	NC_011080	GGCGG	2	10	224524	224533	0 %	0 %	80 %	20 %	194442340
152	NC_011080	GTTGA	2	10	226373	226382	20 %	40 %	40 %	0 %	448967496
153	NC_011080	TTCAA	2	10	226479	226488	40 %	40 %	0 %	20 %	448967496
154	NC_011080	GGAAT	2	10	227233	227242	40 %	20 %	40 %	0 %	448967496
155	NC_011080	GCAGC	2	10	227892	227901	20 %	0 %	40 %	40 %	448967496
156	NC_011080	TGGCG	2	10	229095	229104	0 %	20 %	60 %	20 %	194445264
157	NC_011080	TGGTC	2	10	229223	229232	0 %	40 %	40 %	20 %	194445264
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167	NC_011080	TGGTG	2	10	258587	258596	0 %	40 %	60 %	0 %	194444852
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176	NC_011080	GCCGG	2	10	277661	277670	0 %	0 %	60 %	40 %	194443133
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248	NC_011080	TGTCG	2	10	404474	404483	0 %	40 %	40 %	20 %	194442931
249	NC_011080	CCGAT	2	10	404719	404728	20 %	20 %	20 %	40 %	194442931
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251	NC_011080	ACGGT	2	10	408739	408748	20 %	20 %	40 %	20 %	194443439
252	NC_011080	TAAAG	2	10	410135	410144	60 %	20 %	20 %	0 %	194442308
253	NC_011080	AAGCC	2	10	411927	411936	40 %	0 %	20 %	40 %	194442308
254	NC_011080	CACGG	2	10	412271	412280	20 %	0 %	40 %	40 %	194442308
255	NC_011080	GCTAC	2	10	414256	414265	20 %	20 %	20 %	40 %	194445894
256	NC_011080	CGCAA	2	10	416604	416613	40 %	0 %	20 %	40 %	194445438
257	NC_011080	ATTAC	2	10	418335	418344	40 %	40 %	0 %	20 %	194444217
258	NC_011080	GCCAG	2	10	420834	420843	20 %	0 %	40 %	40 %	194442843
259	NC_011080	CGCGC	2	10	422465	422474	0 %	0 %	40 %	60 %	194446369
260	NC_011080	GCGCA	2	10	423109	423118	20 %	0 %	40 %	40 %	194446369
261	NC_011080	GTGGC	2	10	426821	426830	0 %	20 %	60 %	20 %	194444712
262	NC_011080	GGCAT	2	10	428959	428968	20 %	20 %	40 %	20 %	194442596
263	NC_011080	TATAT	2	10	429382	429391	40 %	60 %	0 %	0 %	194445610
264	NC_011080	ACGTT	2	10	430479	430488	20 %	40 %	20 %	20 %	448967504
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393	NC_011080	CAGAC	2	10	640202	640211	40 %	0 %	20 %	40 %	194442496
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499	NC_011080	AGGGC	2	10	808524	808533	20 %	0 %	60 %	20 %	194444060
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