MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 9562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011080	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	194446390
2	NC_011080	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	194446390
3	NC_011080	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	194444692
4	NC_011080	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	194444103
5	NC_011080	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	194444103
6	NC_011080	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	194444103
7	NC_011080	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	194444103
8	NC_011080	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	194444103
9	NC_011080	TGAG	2	8	6624	6631	25 %	25 %	50 %	0 %	194442782
10	NC_011080	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	194442782
11	NC_011080	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	194442782
12	NC_011080	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	194442782
13	NC_011080	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	194442295
14	NC_011080	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	194442295
15	NC_011080	TGGC	2	8	8819	8826	0 %	25 %	50 %	25 %	194446748
16	NC_011080	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	194446224
17	NC_011080	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	194445369
18	NC_011080	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	194444858
19	NC_011080	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	194444858
20	NC_011080	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	194444858
21	NC_011080	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	194445604
22	NC_011080	TCTG	2	8	11390	11397	0 %	50 %	25 %	25 %	194445604
23	NC_011080	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	194444220
24	NC_011080	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	194444220
25	NC_011080	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	194444220
26	NC_011080	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	194444220
27	NC_011080	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	194444220
28	NC_011080	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	194444220
29	NC_011080	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	194443702
30	NC_011080	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	194445243
31	NC_011080	TTTG	2	8	15539	15546	0 %	75 %	25 %	0 %	194445243
32	NC_011080	CGAA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	25 %	25 %	194445243
33	NC_011080	ATTG	2	8	15766	15773	25 %	50 %	25 %	0 %	194445243
34	NC_011080	ATTA	2	8	16434	16441	50 %	50 %	0 %	0 %	194442240
35	NC_011080	ATAA	2	8	16526	16533	75 %	25 %	0 %	0 %	194446320
36	NC_011080	AATA	2	8	17990	17997	75 %	25 %	0 %	0 %	194443256
37	NC_011080	CGTG	2	8	19276	19283	0 %	25 %	50 %	25 %	194443256
38	NC_011080	CCAA	2	8	21277	21284	50 %	0 %	0 %	50 %	194445060
39	NC_011080	GACG	2	8	21623	21630	25 %	0 %	50 %	25 %	194445060
40	NC_011080	TGGC	2	8	22276	22283	0 %	25 %	50 %	25 %	194445060
41	NC_011080	TCGT	2	8	22351	22358	0 %	50 %	25 %	25 %	194445060
42	NC_011080	TGGC	2	8	22382	22389	0 %	25 %	50 %	25 %	194445060
43	NC_011080	CGCC	2	8	22648	22655	0 %	0 %	25 %	75 %	194445060
44	NC_011080	CTGG	2	8	22994	23001	0 %	25 %	50 %	25 %	194445060
45	NC_011080	TTTA	2	8	23492	23499	25 %	75 %	0 %	0 %	194444266
46	NC_011080	TCTG	2	8	23949	23956	0 %	50 %	25 %	25 %	194444266
47	NC_011080	TGAA	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	194443119
48	NC_011080	CCAG	2	8	24730	24737	25 %	0 %	25 %	50 %	194443119
49	NC_011080	ACCG	2	8	25407	25414	25 %	0 %	25 %	50 %	194443678
50	NC_011080	AAAT	2	8	25467	25474	75 %	25 %	0 %	0 %	194443678
51	NC_011080	TATT	2	8	25520	25527	25 %	75 %	0 %	0 %	194443678
52	NC_011080	TCTG	2	8	25924	25931	0 %	50 %	25 %	25 %	194446095
53	NC_011080	GCCT	2	8	26105	26112	0 %	25 %	25 %	50 %	194446095
54	NC_011080	CCTT	2	8	26611	26618	0 %	50 %	0 %	50 %	194446095
55	NC_011080	TCAG	2	8	26970	26977	25 %	25 %	25 %	25 %	194446095
56	NC_011080	AGCC	2	8	27917	27924	25 %	0 %	25 %	50 %	194446095
57	NC_011080	CCGA	2	8	28124	28131	25 %	0 %	25 %	50 %	194446095
58	NC_011080	ATTA	2	8	28517	28524	50 %	50 %	0 %	0 %	194446333
59	NC_011080	GGCG	2	8	28759	28766	0 %	0 %	75 %	25 %	194446333
60	NC_011080	ATGA	2	8	29964	29971	50 %	25 %	25 %	0 %	194444519
61	NC_011080	TGCT	2	8	30534	30541	0 %	50 %	25 %	25 %	194444078
62	NC_011080	TATC	2	8	30590	30597	25 %	50 %	0 %	25 %	194444078
63	NC_011080	GTAA	2	8	30627	30634	50 %	25 %	25 %	0 %	194444078
64	NC_011080	TTCG	2	8	30889	30896	0 %	50 %	25 %	25 %	194444078
65	NC_011080	GTCA	2	8	31399	31406	25 %	25 %	25 %	25 %	194444351
66	NC_011080	ACCG	2	8	32219	32226	25 %	0 %	25 %	50 %	194442512
67	NC_011080	AGGC	2	8	32257	32264	25 %	0 %	50 %	25 %	194442512
68	NC_011080	CCTG	2	8	32693	32700	0 %	25 %	25 %	50 %	194443097
69	NC_011080	CGCA	2	8	32883	32890	25 %	0 %	25 %	50 %	194443097
70	NC_011080	TAAA	2	8	32953	32960	75 %	25 %	0 %	0 %	194443097
71	NC_011080	TTAT	2	8	33522	33529	25 %	75 %	0 %	0 %	194446304
72	NC_011080	TTGG	2	8	33906	33913	0 %	50 %	50 %	0 %	194446304
73	NC_011080	CTTT	2	8	34286	34293	0 %	75 %	0 %	25 %	194446304
74	NC_011080	GAAG	2	8	34326	34333	50 %	0 %	50 %	0 %	194446304
75	NC_011080	TAAA	2	8	34378	34385	75 %	25 %	0 %	0 %	513538136
76	NC_011080	ATAA	2	8	34657	34664	75 %	25 %	0 %	0 %	513538136
77	NC_011080	GTGC	2	8	34780	34787	0 %	25 %	50 %	25 %	513538136
78	NC_011080	TTAA	2	8	34790	34797	50 %	50 %	0 %	0 %	513538136
79	NC_011080	TGGA	2	8	35542	35549	25 %	25 %	50 %	0 %	194446355
80	NC_011080	GGGA	2	8	36486	36493	25 %	0 %	75 %	0 %	194446355
81	NC_011080	ATAC	2	8	37471	37478	50 %	25 %	0 %	25 %	194444661
82	NC_011080	GAAG	2	8	37543	37550	50 %	0 %	50 %	0 %	194444661
83	NC_011080	CACG	2	8	38106	38113	25 %	0 %	25 %	50 %	194444661
84	NC_011080	TAAT	2	8	38208	38215	50 %	50 %	0 %	0 %	194444661
85	NC_011080	GCGG	2	8	40530	40537	0 %	0 %	75 %	25 %	194443287
86	NC_011080	CTGG	2	8	40748	40755	0 %	25 %	50 %	25 %	194443287
87	NC_011080	CCGA	2	8	41265	41272	25 %	0 %	25 %	50 %	194443287
88	NC_011080	ATCG	2	8	41421	41428	25 %	25 %	25 %	25 %	194443287
89	NC_011080	TCAA	2	8	41482	41489	50 %	25 %	0 %	25 %	194443287
90	NC_011080	ACCG	2	8	41749	41756	25 %	0 %	25 %	50 %	194443637
91	NC_011080	GAAA	2	8	41800	41807	75 %	0 %	25 %	0 %	194443637
92	NC_011080	GGTC	2	8	42372	42379	0 %	25 %	50 %	25 %	194443637
93	NC_011080	TTTG	2	8	42896	42903	0 %	75 %	25 %	0 %	194443637
94	NC_011080	GTAT	2	8	43191	43198	25 %	50 %	25 %	0 %	194445725
95	NC_011080	TCCG	2	8	43585	43592	0 %	25 %	25 %	50 %	194445725
96	NC_011080	ATGA	2	8	45647	45654	50 %	25 %	25 %	0 %	194446358
97	NC_011080	AACG	2	8	45949	45956	50 %	0 %	25 %	25 %	194446358
98	NC_011080	GAAA	2	8	46897	46904	75 %	0 %	25 %	0 %	194446207
99	NC_011080	TCGC	2	8	46912	46919	0 %	25 %	25 %	50 %	194446207
100	NC_011080	GCTG	2	8	47103	47110	0 %	25 %	50 %	25 %	194446207
101	NC_011080	CACG	2	8	47801	47808	25 %	0 %	25 %	50 %	194443115
102	NC_011080	CAGC	2	8	47828	47835	25 %	0 %	25 %	50 %	194443115
103	NC_011080	CTGC	2	8	47965	47972	0 %	25 %	25 %	50 %	194443115
104	NC_011080	CATG	2	8	48533	48540	25 %	25 %	25 %	25 %	194443677
105	NC_011080	AAGT	2	8	49327	49334	50 %	25 %	25 %	0 %	194443677
106	NC_011080	CCAG	2	8	49385	49392	25 %	0 %	25 %	50 %	194443677
107	NC_011080	TTGA	2	8	50166	50173	25 %	50 %	25 %	0 %	194443677
108	NC_011080	GAAA	2	8	50501	50508	75 %	0 %	25 %	0 %	194445592
109	NC_011080	GCCA	2	8	50842	50849	25 %	0 %	25 %	50 %	194445592
110	NC_011080	TAAA	2	8	51235	51242	75 %	25 %	0 %	0 %	194445592
111	NC_011080	CATA	2	8	52880	52887	50 %	25 %	0 %	25 %	194442807
112	NC_011080	TCAG	2	8	52891	52898	25 %	25 %	25 %	25 %	194442807
113	NC_011080	TGGC	2	8	53605	53612	0 %	25 %	50 %	25 %	194442807
114	NC_011080	AGCC	2	8	57432	57439	25 %	0 %	25 %	50 %	194446160
115	NC_011080	AAAG	2	8	57511	57518	75 %	0 %	25 %	0 %	194446160
116	NC_011080	ATGG	2	8	57644	57651	25 %	25 %	50 %	0 %	194446160
117	NC_011080	TGAT	2	8	58316	58323	25 %	50 %	25 %	0 %	194443769
118	NC_011080	TGGA	2	8	58985	58992	25 %	25 %	50 %	0 %	194444262
119	NC_011080	CCTG	2	8	59021	59028	0 %	25 %	25 %	50 %	194445334
120	NC_011080	GATT	2	8	59383	59390	25 %	50 %	25 %	0 %	194445334
121	NC_011080	CTGC	2	8	60770	60777	0 %	25 %	25 %	50 %	194445788
122	NC_011080	CTGG	2	8	60877	60884	0 %	25 %	50 %	25 %	194445788
123	NC_011080	GTGG	2	8	61042	61049	0 %	25 %	75 %	0 %	194445788
124	NC_011080	ACCA	2	8	61888	61895	50 %	0 %	0 %	50 %	194442739
125	NC_011080	GTGG	2	8	61923	61930	0 %	25 %	75 %	0 %	194442739
126	NC_011080	CATT	2	8	62113	62120	25 %	50 %	0 %	25 %	194442739
127	NC_011080	TCAA	2	8	63154	63161	50 %	25 %	0 %	25 %	194442739
128	NC_011080	GCCA	2	8	64740	64747	25 %	0 %	25 %	50 %	194443227
129	NC_011080	GCTG	2	8	65128	65135	0 %	25 %	50 %	25 %	194443760
130	NC_011080	CGCC	2	8	65965	65972	0 %	0 %	25 %	75 %	194443760
131	NC_011080	CCAG	2	8	66160	66167	25 %	0 %	25 %	50 %	194443760
132	NC_011080	CCGC	2	8	66316	66323	0 %	0 %	25 %	75 %	194443760
133	NC_011080	GAAG	2	8	67627	67634	50 %	0 %	50 %	0 %	194445261
134	NC_011080	CAGA	2	8	67800	67807	50 %	0 %	25 %	25 %	194445261
135	NC_011080	TTTC	2	8	68073	68080	0 %	75 %	0 %	25 %	194445261
136	NC_011080	AGTC	2	8	68232	68239	25 %	25 %	25 %	25 %	194445261
137	NC_011080	TAAT	2	8	68274	68281	50 %	50 %	0 %	0 %	194445261
138	NC_011080	ATTT	2	8	68660	68667	25 %	75 %	0 %	0 %	194444878
139	NC_011080	GTCG	2	8	68692	68699	0 %	25 %	50 %	25 %	194444878
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