MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 9569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011080	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011080	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
3	NC_011080	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	194446390
4	NC_011080	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	194446390
5	NC_011080	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
6	NC_011080	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	194446390
7	NC_011080	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	194446390
8	NC_011080	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
9	NC_011080	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
10	NC_011080	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	194444692
11	NC_011080	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	194444692
12	NC_011080	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	194444103
13	NC_011080	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	194444103
14	NC_011080	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	194444103
15	NC_011080	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	194443561
16	NC_011080	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	194443561
17	NC_011080	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	194443561
18	NC_011080	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	194443561
19	NC_011080	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	194442782
20	NC_011080	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	194442782
21	NC_011080	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	194442295
22	NC_011080	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	194442295
23	NC_011080	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	194442295
24	NC_011080	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	194442295
25	NC_011080	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	194442295
26	NC_011080	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	194446224
27	NC_011080	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	194445369
28	NC_011080	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	194444220
29	NC_011080	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	194443702
30	NC_011080	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	194443702
31	NC_011080	AT	3	6	15378	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	194445243
32	NC_011080	AT	3	6	15653	15658	50 %	50 %	0 %	0 %	194445243
33	NC_011080	AT	3	6	15906	15911	50 %	50 %	0 %	0 %	194445243
34	NC_011080	GA	3	6	17058	17063	50 %	0 %	50 %	0 %	194443995
35	NC_011080	GC	3	6	18360	18365	0 %	0 %	50 %	50 %	194443256
36	NC_011080	CT	3	6	20334	20339	0 %	50 %	0 %	50 %	194445060
37	NC_011080	GC	3	6	20650	20655	0 %	0 %	50 %	50 %	194445060
38	NC_011080	GC	3	6	20770	20775	0 %	0 %	50 %	50 %	194445060
39	NC_011080	GC	3	6	21175	21180	0 %	0 %	50 %	50 %	194445060
40	NC_011080	GC	3	6	22033	22038	0 %	0 %	50 %	50 %	194445060
41	NC_011080	CT	3	6	22788	22793	0 %	50 %	0 %	50 %	194445060
42	NC_011080	AT	3	6	23576	23581	50 %	50 %	0 %	0 %	194444266
43	NC_011080	CG	3	6	23646	23651	0 %	0 %	50 %	50 %	194444266
44	NC_011080	GC	4	8	23789	23796	0 %	0 %	50 %	50 %	194444266
45	NC_011080	AT	3	6	24050	24055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011080	CG	3	6	25057	25062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011080	CT	3	6	25343	25348	0 %	50 %	0 %	50 %	194443678
48	NC_011080	AT	3	6	25373	25378	50 %	50 %	0 %	0 %	194443678
49	NC_011080	GC	3	6	26076	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
50	NC_011080	CG	3	6	28006	28011	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
51	NC_011080	GC	3	6	28134	28139	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
52	NC_011080	GC	3	6	28170	28175	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
53	NC_011080	TC	3	6	28366	28371	0 %	50 %	0 %	50 %	194446095
54	NC_011080	GT	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	194446333
55	NC_011080	GT	3	6	28613	28618	0 %	50 %	50 %	0 %	194446333
56	NC_011080	CT	3	6	30098	30103	0 %	50 %	0 %	50 %	194445269
57	NC_011080	AG	3	6	30367	30372	50 %	0 %	50 %	0 %	194445269
58	NC_011080	CG	3	6	30424	30429	0 %	0 %	50 %	50 %	194445269
59	NC_011080	AT	3	6	30525	30530	50 %	50 %	0 %	0 %	194444078
60	NC_011080	GC	3	6	30756	30761	0 %	0 %	50 %	50 %	194444078
61	NC_011080	GC	3	6	31046	31051	0 %	0 %	50 %	50 %	194444078
62	NC_011080	GT	3	6	33034	33039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011080	TC	3	6	33478	33483	0 %	50 %	0 %	50 %	194446304
64	NC_011080	AT	3	6	33728	33733	50 %	50 %	0 %	0 %	194446304
65	NC_011080	TA	3	6	33931	33936	50 %	50 %	0 %	0 %	194446304
66	NC_011080	AT	3	6	34427	34432	50 %	50 %	0 %	0 %	513538136
67	NC_011080	AT	3	6	34688	34693	50 %	50 %	0 %	0 %	513538136
68	NC_011080	AT	3	6	35434	35439	50 %	50 %	0 %	0 %	194446355
69	NC_011080	TG	4	8	35649	35656	0 %	50 %	50 %	0 %	194446355
70	NC_011080	GC	3	6	36242	36247	0 %	0 %	50 %	50 %	194446355
71	NC_011080	TA	3	6	37192	37197	50 %	50 %	0 %	0 %	194444661
72	NC_011080	GC	5	10	37959	37968	0 %	0 %	50 %	50 %	194444661
73	NC_011080	AT	3	6	39508	39513	50 %	50 %	0 %	0 %	194445358
74	NC_011080	AT	3	6	39824	39829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011080	AT	3	6	39939	39944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011080	AT	4	8	40026	40033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011080	AT	3	6	40080	40085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011080	CG	3	6	40368	40373	0 %	0 %	50 %	50 %	194443287
79	NC_011080	GT	3	6	41762	41767	0 %	50 %	50 %	0 %	194443637
80	NC_011080	TG	3	6	42792	42797	0 %	50 %	50 %	0 %	194443637
81	NC_011080	CG	3	6	43307	43312	0 %	0 %	50 %	50 %	194445725
82	NC_011080	TA	3	6	43680	43685	50 %	50 %	0 %	0 %	194445725
83	NC_011080	CA	3	6	44701	44706	50 %	0 %	0 %	50 %	194446358
84	NC_011080	CA	3	6	44993	44998	50 %	0 %	0 %	50 %	194446358
85	NC_011080	GC	3	6	45696	45701	0 %	0 %	50 %	50 %	194446358
86	NC_011080	TA	3	6	46101	46106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011080	GA	3	6	46168	46173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011080	TA	3	6	46800	46805	50 %	50 %	0 %	0 %	194446207
89	NC_011080	TG	3	6	47181	47186	0 %	50 %	50 %	0 %	194446207
90	NC_011080	GC	4	8	47320	47327	0 %	0 %	50 %	50 %	194446207
91	NC_011080	GA	3	6	48234	48239	50 %	0 %	50 %	0 %	194443115
92	NC_011080	CG	4	8	49301	49308	0 %	0 %	50 %	50 %	194443677
93	NC_011080	CG	3	6	49514	49519	0 %	0 %	50 %	50 %	194443677
94	NC_011080	TG	3	6	50132	50137	0 %	50 %	50 %	0 %	194443677
95	NC_011080	GC	3	6	51500	51505	0 %	0 %	50 %	50 %	194445592
96	NC_011080	GC	3	6	52503	52508	0 %	0 %	50 %	50 %	194444108
97	NC_011080	GT	3	6	52910	52915	0 %	50 %	50 %	0 %	194442807
98	NC_011080	CG	3	6	53256	53261	0 %	0 %	50 %	50 %	194442807
99	NC_011080	CG	3	6	54344	54349	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
100	NC_011080	GC	3	6	55017	55022	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
101	NC_011080	CG	3	6	55091	55096	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
102	NC_011080	CG	3	6	55825	55830	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
103	NC_011080	CG	3	6	56080	56085	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
104	NC_011080	GC	3	6	56999	57004	0 %	0 %	50 %	50 %	194446803
105	NC_011080	GC	3	6	57875	57880	0 %	0 %	50 %	50 %	194443769
106	NC_011080	GC	4	8	58105	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	194443769
107	NC_011080	CT	3	6	59095	59100	0 %	50 %	0 %	50 %	194445334
108	NC_011080	TG	3	6	60714	60719	0 %	50 %	50 %	0 %	194445788
109	NC_011080	TC	3	6	61118	61123	0 %	50 %	0 %	50 %	194446327
110	NC_011080	GC	3	6	62380	62385	0 %	0 %	50 %	50 %	194442739
111	NC_011080	AT	3	6	63055	63060	50 %	50 %	0 %	0 %	194442739
112	NC_011080	GC	3	6	64576	64581	0 %	0 %	50 %	50 %	194443227
113	NC_011080	GC	3	6	66723	66728	0 %	0 %	50 %	50 %	194444764
114	NC_011080	AT	3	6	68147	68152	50 %	50 %	0 %	0 %	194445261
115	NC_011080	GC	3	6	69026	69031	0 %	0 %	50 %	50 %	194444878
116	NC_011080	GC	3	6	69600	69605	0 %	0 %	50 %	50 %	194444878
117	NC_011080	AC	3	6	69652	69657	50 %	0 %	0 %	50 %	194444878
118	NC_011080	AG	3	6	69798	69803	50 %	0 %	50 %	0 %	194446729
119	NC_011080	CG	3	6	69877	69882	0 %	0 %	50 %	50 %	194446729
120	NC_011080	GC	3	6	69905	69910	0 %	0 %	50 %	50 %	194446729
121	NC_011080	CG	3	6	70534	70539	0 %	0 %	50 %	50 %	194446194
122	NC_011080	CG	3	6	70814	70819	0 %	0 %	50 %	50 %	194446194
123	NC_011080	TG	3	6	71455	71460	0 %	50 %	50 %	0 %	194442210
124	NC_011080	GC	3	6	71966	71971	0 %	0 %	50 %	50 %	194442210
125	NC_011080	TG	3	6	72115	72120	0 %	50 %	50 %	0 %	194442210
126	NC_011080	GC	3	6	72273	72278	0 %	0 %	50 %	50 %	194442210
127	NC_011080	GC	3	6	72450	72455	0 %	0 %	50 %	50 %	194444126
128	NC_011080	CG	3	6	73311	73316	0 %	0 %	50 %	50 %	194443498
129	NC_011080	GC	3	6	73457	73462	0 %	0 %	50 %	50 %	194443498
130	NC_011080	TC	3	6	73844	73849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011080	GC	3	6	73953	73958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011080	CG	3	6	74640	74645	0 %	0 %	50 %	50 %	194445308
133	NC_011080	AT	3	6	74888	74893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011080	CT	3	6	75981	75986	0 %	50 %	0 %	50 %	194444919
135	NC_011080	CG	3	6	77285	77290	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
136	NC_011080	CA	3	6	77302	77307	50 %	0 %	0 %	50 %	194446768
137	NC_011080	TC	3	6	77447	77452	0 %	50 %	0 %	50 %	194446768
138	NC_011080	CG	3	6	77761	77766	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
139	NC_011080	GC	5	10	78807	78816	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
140	NC_011080	CG	3	6	78867	78872	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
141	NC_011080	GC	3	6	79452	79457	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
142	NC_011080	GC	3	6	79951	79956	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
143	NC_011080	TG	3	6	80359	80364	0 %	50 %	50 %	0 %	513538150
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