MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	TAAGGA	2	12	16894	16905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011072	GAAGTG	2	12	19982	19993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011072	ACTAAT	2	12	20012	20023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011072	TAAAAA	2	12	38653	38664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011072	AAAAAT	2	12	54657	54668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011072	TTCTAT	2	12	62237	62248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011072	TCCCAT	2	12	68090	68101	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011072	TAAAAA	2	12	92368	92379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011072	GCTTAT	2	12	113035	113046	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011072	ATAAAA	2	12	122938	122949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011072	TTTGCT	2	12	131934	131945	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011072	ATAAAA	2	12	132325	132336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011072	ATAAAT	2	12	137164	137175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011072	TTTTAC	2	12	184698	184709	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011072	TCTTAA	2	12	228802	228813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011072	GGTTGC	2	12	245655	245666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011072	TCTTTT	2	12	265145	265156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011072	GAAAAA	2	12	296357	296368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011072	ACAAGA	2	12	303037	303048	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011072	GCAGTT	2	12	336805	336816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011072	AGAAAT	2	12	390696	390707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011072	ATGAAG	2	12	402637	402648	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011072	GCTTGC	2	12	433662	433673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011072	GTTCCT	2	12	453925	453936	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011072	TAAAAA	2	12	476333	476344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011072	TAAAAA	2	12	479000	479011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011072	TGCTTT	2	12	484570	484581	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011072	AAAATG	2	12	504439	504450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011072	TCTTTT	2	12	515512	515523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011072	AAAGTT	2	12	567044	567055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011072	ACTTCT	2	12	583733	583744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011072	ATTGAA	2	12	634471	634482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011072	AGATTG	2	12	667387	667398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011072	TTTTCA	2	12	709205	709216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011072	GAACAA	2	12	721202	721213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011072	TTTGTT	2	12	721214	721225	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011072	TCTTGT	2	12	722323	722334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011072	AAAAAC	2	12	734754	734765	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011072	TTCGGG	2	12	757988	757999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011072	TTAAAA	2	12	793666	793677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011072	TATAAA	2	12	797193	797204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011072	TATTTT	2	12	818178	818189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011072	TTTTTA	2	12	866043	866054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011072	CTATTT	2	12	877513	877524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011072	AAAAAG	2	12	877562	877573	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011072	TTTTCT	2	12	889542	889553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011072	TAAAAA	2	12	919373	919384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011072	TTAAAA	2	12	924091	924102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011072	TGTCAA	2	12	928885	928896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011072	CATTAT	2	12	938550	938561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011072	AAGTTG	2	12	982489	982500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011072	AATTTT	2	12	1048605	1048616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011072	TTTTTG	2	12	1058239	1058250	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011072	GTTTGT	2	12	1067417	1067428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011072	TGAAAA	2	12	1086411	1086422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011072	GTTGAA	2	12	1091942	1091953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011072	AGAAAA	2	12	1124261	1124272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011072	TAAAAA	2	12	1163516	1163527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011072	AATCTA	2	12	1190749	1190760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011072	TAAAAA	2	12	1219517	1219528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011072	TTTAAT	2	12	1231283	1231294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011072	TAGGTA	2	12	1275339	1275350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011072	TTGAAA	2	12	1286314	1286325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011072	GATGGT	2	12	1315080	1315091	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011072	TTTTAT	2	12	1326589	1326600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011072	TTTCCT	2	12	1330082	1330093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011072	TGCTTC	2	12	1372047	1372058	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011072	ACTAAA	2	12	1373389	1373400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011072	AAATTT	2	12	1388151	1388162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011072	CCGTTT	2	12	1481411	1481422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011072	TTAAAA	2	12	1536123	1536134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011072	AACTTG	2	12	1571373	1571384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011072	TATAAA	2	12	1596459	1596470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011072	AAAGAT	2	12	1596561	1596572	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011072	TAATCA	2	12	1604609	1604620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011072	CACTTC	2	12	1618396	1618407	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011072	AAAAAT	2	12	1629328	1629339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011072	GAACAT	2	12	1648684	1648695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011072	TAGGCT	2	12	1668718	1668729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011072	ATATCA	2	12	1673455	1673466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011072	TCATTA	2	12	1680468	1680479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_011072	TAATCA	2	12	1699225	1699236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011072	TAAAAA	2	12	1725290	1725301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011072	TATTAG	2	12	1727043	1727054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011072	CACTTC	2	12	1727074	1727085	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011072	TCCTTA	2	12	1730162	1730173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011072	AAAAAC	2	12	1754215	1754226	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011072	CCAGAA	2	12	1759315	1759326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011072	AGGACA	2	12	1803658	1803669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011072	CTATTC	2	12	1806171	1806182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011072	AAAAAT	2	12	1807173	1807184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011072	TATTAG	2	12	1819169	1819180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011072	CACTTC	2	12	1819200	1819211	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011072	TCCTTA	2	12	1822288	1822299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011072	ATGATT	2	12	1835292	1835303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011072	CCCGAA	2	12	1885666	1885677	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011072	TATTAG	2	12	1886539	1886550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011072	CACTTC	2	12	1886570	1886581	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011072	TCCTTA	2	12	1889658	1889669	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011072	ATAGAT	2	12	1934332	1934343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011072	TCTTTT	2	12	1946097	1946108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011072	GCATGA	2	12	1964003	1964014	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011072	TAAATT	2	12	1969947	1969958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011072	ACCTTG	2	12	2036400	2036411	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.