MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194398133
2	NC_011072	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
3	NC_011072	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194397105
4	NC_011072	TGCTTA	2	12	7714	7725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194397105
5	NC_011072	GCTAAC	2	12	7955	7966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194397105
6	NC_011072	TTGATT	2	12	8889	8900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194398092
7	NC_011072	CATCTC	2	12	20898	20909	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194397264
8	NC_011072	AGTTGA	2	12	21017	21028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397472
9	NC_011072	AGGTTG	2	12	25157	25168	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194397801
10	NC_011072	TTGTTT	2	12	27371	27382	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	194396909
11	NC_011072	AAAATT	2	12	27402	27413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194396909
12	NC_011072	CGATTG	2	12	31244	31255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397391
13	NC_011072	TTCCTT	2	12	34389	34400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398373
14	NC_011072	AGGATA	2	12	39930	39941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194397308
15	NC_011072	TCAATC	2	12	41259	41270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397308
16	NC_011072	TTCGGA	2	12	48297	48308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397123
17	NC_011072	TTACTG	2	12	51497	51508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194396879
18	NC_011072	GTTTCT	2	12	61798	61809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	194398622
19	NC_011072	TTCCTT	2	12	62878	62889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397376
20	NC_011072	TTGCAG	2	12	67031	67042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397103
21	NC_011072	TCTTGC	2	12	68610	68621	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194396654
22	NC_011072	GACTTG	2	12	69014	69025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194396654
23	NC_011072	AAAATG	2	12	70692	70703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194397832
24	NC_011072	AATGGT	2	12	71749	71760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398738
25	NC_011072	ATTCTG	2	12	76746	76757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194396933
26	NC_011072	ACATCA	2	12	85308	85319	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194397775
27	NC_011072	GCTTGC	2	12	86044	86055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397775
28	NC_011072	TACAGG	2	12	88269	88280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194398306
29	NC_011072	AAAAAC	2	12	88370	88381	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	194398306
30	NC_011072	TGGTTG	2	12	92090	92101	0 %	50 %	50 %	0 %	194398505
31	NC_011072	TTTTGA	2	12	95581	95592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194398179
32	NC_011072	AAGCAG	2	12	96109	96120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194398179
33	NC_011072	AAGGAA	2	12	100971	100982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397410
34	NC_011072	AGTGGC	2	12	110304	110315	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194397690
35	NC_011072	TTATCT	2	12	118253	118264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194398289
36	NC_011072	TTTTAT	2	12	119616	119627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194396967
37	NC_011072	TAACAA	2	12	120111	120122	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194396967
38	NC_011072	AAGCAA	2	12	123508	123519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194396737
39	NC_011072	CCAGCT	2	12	124578	124589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194396737
40	NC_011072	TCAGGG	2	12	133893	133904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194397720
41	NC_011072	GAAGCA	2	12	145153	145164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194397525
42	NC_011072	TCAGGT	2	12	158638	158649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397651
43	NC_011072	ATTGAG	2	12	165268	165279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398020
44	NC_011072	TTCGGA	2	12	165398	165409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194398020
45	NC_011072	AACAAG	2	12	169021	169032	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194396788
46	NC_011072	GGATTG	2	12	170750	170761	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194397666
47	NC_011072	TGCACT	2	12	174515	174526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194397278
48	NC_011072	CAATAT	2	12	175995	176006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194396860
49	NC_011072	TGTTCG	2	12	176786	176797	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	194398387
50	NC_011072	TTCCAT	2	12	177324	177335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194398387
51	NC_011072	ACTTGG	2	12	177583	177594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194398387
52	NC_011072	ACCACG	2	12	182120	182131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194397768
53	NC_011072	TAAAAA	2	12	182543	182554	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194398301
54	NC_011072	GCAGAC	2	12	183133	183144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397996
55	NC_011072	ACAAGA	2	12	190595	190606	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194397517
56	NC_011072	CAGGAA	2	12	190799	190810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194396949
57	NC_011072	TAAAGG	2	12	193486	193497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194397396
58	NC_011072	GCAATC	2	12	196074	196085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194398165
59	NC_011072	ACATCA	2	12	196621	196632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194398748
60	NC_011072	TAAAGG	2	12	200872	200883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194396863
61	NC_011072	AAATTA	2	12	201911	201922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397819
62	NC_011072	ACTTGG	2	12	201978	201989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397819
63	NC_011072	TTGAAG	2	12	204919	204930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396958
64	NC_011072	GTAAAG	2	12	205603	205614	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408843741
65	NC_011072	AAACTC	2	12	206978	206989	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194396717
66	NC_011072	AGATAA	2	12	211070	211081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194397290
67	NC_011072	CATAAT	2	12	213137	213148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194397480
68	NC_011072	TATCTG	2	12	218515	218526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194397799
69	NC_011072	ACAATT	2	12	220635	220646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194398478
70	NC_011072	CGAAAT	2	12	226646	226657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194396969
71	NC_011072	AGATGT	2	12	230351	230362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396918
72	NC_011072	TGTCAA	2	12	235419	235430	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194397930
73	NC_011072	GATGGT	2	12	236178	236189	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194397000
74	NC_011072	TGCCTT	2	12	237830	237841	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194398402
75	NC_011072	GTTGCT	2	12	242296	242307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	194397797
76	NC_011072	GCAAGA	2	12	246187	246198	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194398605
77	NC_011072	ATTCGA	2	12	247585	247596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194398605
78	NC_011072	GTCAGT	2	12	250990	251001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397447
79	NC_011072	CGATAC	2	12	261372	261383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194397984
80	NC_011072	TTTTGG	2	12	265667	265678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398507
81	NC_011072	TAGATA	2	12	271279	271290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194396842
82	NC_011072	CATTAT	2	12	272881	272892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194397634
83	NC_011072	GATAAA	2	12	276627	276638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194396877
84	NC_011072	AAAATG	2	12	280545	280556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194396885
85	NC_011072	ATGGAG	2	12	283545	283556	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	194398671
86	NC_011072	GGACAA	2	12	284412	284423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194397865
87	NC_011072	CCATAG	2	12	287875	287886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194397856
88	NC_011072	TTGATT	2	12	288318	288329	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194397856
89	NC_011072	AGGAGT	2	12	290064	290075	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	194396928
90	NC_011072	CGAGCT	2	12	291135	291146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194396813
91	NC_011072	AGCGTG	2	12	291698	291709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194398555
92	NC_011072	ATGGTT	2	12	294180	294191	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	194397924
93	NC_011072	CAACCT	2	12	300736	300747	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	194398668
94	NC_011072	GACCGT	2	12	304885	304896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194398206
95	NC_011072	TGGAAT	2	12	313265	313276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398523
96	NC_011072	GCCAAA	2	12	318513	318524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	194398504
97	NC_011072	GCTAAA	2	12	321309	321320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194398132
98	NC_011072	GAAAAA	2	12	322620	322631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	194397693
99	NC_011072	AGCTAT	2	12	324489	324500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194397693
100	NC_011072	AGACAA	2	12	327284	327295	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194397693
101	NC_011072	TGAGCT	2	12	332793	332804	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194398094
102	NC_011072	TTTGAT	2	12	333256	333267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194396726
103	NC_011072	GCCAAA	2	12	334054	334065	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	194396726
104	NC_011072	TCAAGT	2	12	334171	334182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194396726
105	NC_011072	TCAAGT	2	12	334195	334206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194396726
106	NC_011072	TTCACG	2	12	334419	334430	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194396726
107	NC_011072	GTGCCA	2	12	335932	335943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194397196
108	NC_011072	GATTTT	2	12	339016	339027	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194396915
109	NC_011072	TGGAGG	2	12	341367	341378	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	194398279
110	NC_011072	CATTTA	2	12	341933	341944	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194398279
111	NC_011072	AAGTAG	2	12	343827	343838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194398461
112	NC_011072	ATGTCA	2	12	344482	344493	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194397821
113	NC_011072	TGTCAT	2	12	346993	347004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194398711
114	NC_011072	ACTTTT	2	12	352979	352990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194397429
115	NC_011072	AGTATG	2	12	355001	355012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396953
116	NC_011072	TGCTAA	2	12	355691	355702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194396953
117	NC_011072	TGAAAT	2	12	356510	356521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194397233
118	NC_011072	CGAACG	2	12	358720	358731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398157
119	NC_011072	ACTTGG	2	12	358855	358866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194398157
120	NC_011072	GTCTGT	2	12	359647	359658	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	194396884
121	NC_011072	TACCAG	2	12	360915	360926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194396884
122	NC_011072	GTGTGA	2	12	363746	363757	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194398393
123	NC_011072	AAGTGA	2	12	366532	366543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194397995
124	NC_011072	GCCAAG	2	12	366602	366613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397995
125	NC_011072	TGGATG	2	12	367759	367770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194397921
126	NC_011072	TGCAGC	2	12	368328	368339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194397921
127	NC_011072	TCTATC	2	12	370168	370179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194397536
128	NC_011072	GGATGA	2	12	374415	374426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	194397371
129	NC_011072	TGTTGG	2	12	374604	374615	0 %	50 %	50 %	0 %	194397371
130	NC_011072	TTTTGG	2	12	380743	380754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398564
131	NC_011072	TCCAGC	2	12	381021	381032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194397305
132	NC_011072	AGGCCA	2	12	382278	382289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397759
133	NC_011072	GGCTCT	2	12	384435	384446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398167
134	NC_011072	CTTTTT	2	12	385877	385888	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	194396779
135	NC_011072	TTTGAA	2	12	391947	391958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194398202
136	NC_011072	TTCCAG	2	12	393895	393906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194398012
137	NC_011072	AGTTGA	2	12	396367	396378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398621
138	NC_011072	GCATGC	2	12	399413	399424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194397070
139	NC_011072	TTGAAA	2	12	400258	400269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194397070
140	NC_011072	CGATAG	2	12	405510	405521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194397297
141	NC_011072	AGTTGA	2	12	406685	406696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398470
142	NC_011072	GGAAGT	2	12	408159	408170	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	194398470
143	NC_011072	CAAAAT	2	12	409925	409936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194397317
144	NC_011072	CTTTAC	2	12	410094	410105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194397317
145	NC_011072	TTGAAT	2	12	413623	413634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194396817
146	NC_011072	AATTTC	2	12	417431	417442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194397128
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151	NC_011072	GTATCA	2	12	444681	444692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194398611
152	NC_011072	CCTTGA	2	12	446305	446316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194398422
153	NC_011072	TACTAA	2	12	451836	451847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194396896
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219	NC_011072	GGAAAG	2	12	613722	613733	50 %	0 %	50 %	0 %	194397655
220	NC_011072	GTATCG	2	12	615663	615674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397528
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222	NC_011072	TGAGTT	2	12	618623	618634	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	194396764
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228	NC_011072	GGCCTT	2	12	645222	645233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396707
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230	NC_011072	GGTTCA	2	12	650066	650077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397524
231	NC_011072	ATGCAG	2	12	662050	662061	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194397675
232	NC_011072	AGCTAA	2	12	663453	663464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194398588
233	NC_011072	TAAAAT	2	12	665475	665486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397412
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452	NC_011072	AAGAAA	2	12	1257331	1257342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	194396841
453	NC_011072	TTTCAT	2	12	1258133	1258144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194397418
454	NC_011072	AAGACC	2	12	1259045	1259056	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	194398613
455	NC_011072	TGCAAG	2	12	1259483	1259494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194397058
456	NC_011072	CATGGA	2	12	1260730	1260741	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194397682
457	NC_011072	ACAATG	2	12	1264730	1264741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194398299
458	NC_011072	GAACGA	2	12	1265453	1265464	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194398406
459	NC_011072	TCCTGC	2	12	1265897	1265908	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194398406
460	NC_011072	AGCTAC	2	12	1267925	1267936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194397726
461	NC_011072	TGCTCT	2	12	1269114	1269125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194397416
462	NC_011072	TTTCAT	2	12	1269521	1269532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194397416
463	NC_011072	TAGACA	2	12	1273495	1273506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194396746
464	NC_011072	ATTCTC	2	12	1274094	1274105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194396746
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468	NC_011072	CCTTGA	2	12	1278300	1278311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194397424
469	NC_011072	CTTGGG	2	12	1278342	1278353	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	194397424
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472	NC_011072	CACTGG	2	12	1289497	1289508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194396694
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476	NC_011072	AGGCTG	2	12	1304955	1304966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194397671
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479	NC_011072	GCCTTA	2	12	1311483	1311494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194397210
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482	NC_011072	ATTTTC	2	12	1313842	1313853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194396832
483	NC_011072	CACATC	2	12	1315740	1315751	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	194398462
484	NC_011072	GAATAC	2	12	1316808	1316819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194397109
485	NC_011072	TTTACG	2	12	1317760	1317771	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194397316
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488	NC_011072	GGCATG	2	12	1325017	1325028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194396973
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