MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011072	TCGTG	2	10	16421	16430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011072	GTTAA	2	10	17142	17151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011072	GGGAG	2	10	17660	17669	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011072	AGGGA	2	10	19871	19880	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011072	CTTTT	2	10	23313	23322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011072	AGAGG	2	10	41779	41788	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011072	TTTAT	2	10	62098	62107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011072	ATTCA	2	10	68019	68028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011072	TAATA	2	10	70541	70550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011072	TGATA	2	10	79079	79088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011072	TATCA	2	10	80785	80794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011072	GAAAG	2	10	82644	82653	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011072	ATAAA	2	10	90120	90129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011072	TAACC	2	10	90218	90227	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011072	GGCTT	2	10	106181	106190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011072	GGAAT	2	10	108013	108022	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011072	AAATT	2	10	114843	114852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011072	AGGAT	2	10	114874	114883	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011072	GCTTT	2	10	115908	115917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011072	TATTG	2	10	115945	115954	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011072	TAAAA	2	10	121862	121871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011072	ATTAA	2	10	125497	125506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011072	GAAGT	2	10	131862	131871	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011072	GTTTG	2	10	132102	132111	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011072	ATGAC	2	10	132249	132258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011072	GAAAA	2	10	132839	132848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011072	TGCTC	2	10	136844	136853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011072	TTTTC	2	10	147057	147066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011072	TGAAA	2	10	162277	162286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011072	ATTTC	2	10	163803	163812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011072	CCCTG	2	10	171053	171062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_011072	AAGGA	2	10	198680	198689	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011072	GTTCA	2	10	200314	200323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011072	AAAAT	2	10	204121	204130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011072	ATCGA	2	10	204869	204878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011072	TTTTA	2	10	209494	209503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011072	ATTCT	2	10	214254	214263	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011072	CTATC	2	10	215476	215485	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011072	CTTTT	2	10	228437	228446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011072	CTTAA	2	10	230794	230803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011072	AAGCC	2	10	244439	244448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011072	AATAG	2	10	245985	245994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011072	TGATA	2	10	255207	255216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011072	AACAA	2	10	269588	269597	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011072	CTTTT	2	10	274769	274778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011072	TAATT	2	10	274889	274898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011072	TAGAA	2	10	278339	278348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011072	AAATA	2	10	289762	289771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011072	ATAAA	2	10	334640	334649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011072	TTTTC	2	10	347570	347579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011072	TTTTA	2	10	362028	362037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011072	GACTG	2	10	400854	400863	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011072	CTTTT	2	10	403769	403778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011072	AAATA	2	10	412074	412083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011072	AGAAA	2	10	412095	412104	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011072	TTTGC	2	10	415219	415228	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011072	TTTAT	2	10	418566	418575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011072	ATTTA	2	10	418680	418689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011072	TAGGA	2	10	430344	430353	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011072	CAGGG	2	10	433704	433713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011072	TGAAA	2	10	439037	439046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011072	CTATT	2	10	441107	441116	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011072	AATAA	2	10	446403	446412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011072	CTTTT	2	10	447671	447680	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011072	TAAAA	2	10	447684	447693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011072	CTAAG	2	10	449389	449398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011072	TGTTT	2	10	452290	452299	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011072	TAGTT	2	10	454007	454016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011072	CTTTC	2	10	456891	456900	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_011072	ATAAA	2	10	459271	459280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011072	AGCGA	2	10	462406	462415	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011072	TTGCC	2	10	466204	466213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011072	ATTCA	2	10	466483	466492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011072	TACTG	2	10	467256	467265	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011072	ATATA	2	10	467273	467282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011072	TTCTT	2	10	469838	469847	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011072	GATAA	2	10	472514	472523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011072	GTATA	2	10	477967	477976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011072	CAATA	2	10	480233	480242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011072	CTTAG	2	10	490511	490520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011072	TTTCA	2	10	492213	492222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011072	TATAA	2	10	493511	493520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011072	TTTTA	2	10	496234	496243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011072	CTTTT	2	10	496325	496334	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011072	TTTTA	2	10	496406	496415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011072	GCAGA	2	10	496518	496527	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011072	AGATG	2	10	504242	504251	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011072	TTTTA	2	10	504588	504597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011072	TTTAT	2	10	508829	508838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011072	AGGAA	2	10	510896	510905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011072	ATAAA	2	10	518896	518905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011072	ATATA	2	10	530861	530870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011072	TAGTA	2	10	534091	534100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011072	CATTT	2	10	535545	535554	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011072	TAAAA	2	10	543965	543974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011072	AAACA	2	10	574042	574051	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011072	ATATA	2	10	576825	576834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011072	GAAAA	2	10	614877	614886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011072	GTTAT	2	10	614916	614925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011072	AGTGT	2	10	634461	634470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011072	TAGTA	2	10	653170	653179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011072	AGGGG	2	10	656133	656142	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011072	ATGGA	2	10	677810	677819	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011072	TTATT	2	10	680105	680114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011072	ATAAA	2	10	687712	687721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011072	GGAAA	2	10	696653	696662	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011072	TAAAA	2	10	706698	706707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011072	TAAAA	2	10	719587	719596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011072	ATTTT	2	10	720839	720848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011072	CAAGA	2	10	726890	726899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011072	CAAAT	2	10	729019	729028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011072	AAAAT	2	10	729064	729073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011072	CTGAT	2	10	732593	732602	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011072	CTGAA	2	10	734790	734799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011072	ATAAA	2	10	734960	734969	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011072	TTTGA	2	10	734988	734997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011072	AAATA	2	10	742615	742624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011072	TATTT	2	10	758145	758154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011072	TTTTG	2	10	784758	784767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011072	TATAT	2	10	797157	797166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011072	ATCTA	2	10	803661	803670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011072	TATGA	2	10	805727	805736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011072	AAATC	2	10	813239	813248	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011072	AGGTT	2	10	813318	813327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011072	CATTT	2	10	813475	813484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011072	AGAAC	2	10	818090	818099	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011072	CTTTT	2	10	826995	827004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011072	TAATA	2	10	828007	828016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011072	ATAGA	2	10	836870	836879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011072	TAAAA	2	10	842063	842072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011072	ATTAG	2	10	847472	847481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011072	AGTTT	2	10	853183	853192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011072	TCTTT	2	10	855314	855323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011072	AATAA	2	10	857173	857182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011072	CAAAA	2	10	874186	874195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011072	AGGCT	2	10	875541	875550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011072	ATAGT	2	10	882116	882125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011072	AGAGG	2	10	882145	882154	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011072	CTTAG	2	10	884694	884703	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011072	AGCTC	2	10	887227	887236	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011072	AAAAG	2	10	888012	888021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011072	TCCTT	2	10	898379	898388	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011072	GCGAA	2	10	899646	899655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011072	ATAAA	2	10	901809	901818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011072	AAATT	2	10	924023	924032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011072	TGAAA	2	10	924652	924661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011072	AATAA	2	10	926800	926809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011072	AACTC	2	10	1857675	1857684	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_011072	CTCTT	2	10	1867614	1867623	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_011072	TATAA	2	10	1873304	1873313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011072	TGAAA	2	10	1873321	1873330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011072	ACTAT	2	10	1879862	1879871	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_011072	AACTA	2	10	1884022	1884031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_011072	TCCCT	2	10	1886683	1886692	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
295	NC_011072	CTCCC	2	10	1888894	1888903	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
296	NC_011072	CACGA	2	10	1890133	1890142	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
297	NC_011072	TATAT	2	10	1893610	1893619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_011072	TATCA	2	10	1895936	1895945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_011072	TTATA	2	10	1897819	1897828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011072	ATTAT	2	10	1929922	1929931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_011072	ATCAA	2	10	1934466	1934475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_011072	AAATC	2	10	1935903	1935912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
303	NC_011072	ACTTT	2	10	1959630	1959639	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_011072	TATGT	2	10	1975869	1975878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
305	NC_011072	TCAAG	2	10	2002679	2002688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
306	NC_011072	TATAT	2	10	2007010	2007019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_011072	AGCAT	2	10	2022802	2022811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
308	NC_011072	TATTT	2	10	2030220	2030229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_011072	AATGG	2	10	2032928	2032937	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
310	NC_011072	CTTTT	2	10	2038242	2038251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
311	NC_011072	TCTCA	2	10	2071529	2071538	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.