MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 3276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011072	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011072	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011072	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011072	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011072	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011072	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011072	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011072	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011072	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011072	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011072	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011072	AGT	2	6	14965	14970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011072	AAC	2	6	15014	15019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011072	CGG	2	6	15060	15065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011072	TGA	2	6	15118	15123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011072	GTA	2	6	15282	15287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011072	GGC	2	6	15384	15389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011072	AGG	2	6	15419	15424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011072	TGG	2	6	15603	15608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011072	CGA	2	6	15627	15632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011072	GCA	2	6	15701	15706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011072	CGC	2	6	15748	15753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011072	TGT	2	6	15787	15792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011072	AGA	2	6	15796	15801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011072	CAG	2	6	15870	15875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011072	TAG	2	6	15977	15982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011072	GGA	2	6	16060	16065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011072	GAA	2	6	16324	16329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011072	GGT	2	6	16398	16403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011072	GTC	2	6	16412	16417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011072	CAT	2	6	16480	16485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011072	TAA	2	6	16515	16520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011072	GGA	2	6	16524	16529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011072	ATC	2	6	16548	16553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011072	CGC	2	6	16714	16719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011072	CAC	2	6	16759	16764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011072	GAT	2	6	16829	16834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011072	CCT	2	6	16885	16890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011072	AGG	2	6	16984	16989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011072	GTA	2	6	17099	17104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011072	TAA	2	6	17106	17111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011072	CGA	2	6	17187	17192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011072	ACG	2	6	17205	17210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011072	GAT	2	6	17238	17243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011072	GAG	2	6	17308	17313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011072	TAG	2	6	17376	17381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011072	AGA	2	6	17463	17468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011072	CGG	2	6	17547	17552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011072	GGA	2	6	17579	17584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011072	ACA	2	6	17697	17702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011072	ATG	2	6	17764	17769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011072	GGA	2	6	17897	17902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011072	ACC	2	6	18163	18168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011072	AAT	2	6	18183	18188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011072	AGC	2	6	18243	18248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011072	GAG	2	6	18393	18398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011072	ACA	2	6	18549	18554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011072	TAG	2	6	18706	18711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011072	GAT	2	6	18953	18958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011072	CGG	2	6	19044	19049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011072	TAC	2	6	19314	19319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011072	CCT	2	6	19402	19407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011072	GGT	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011072	TCG	2	6	19653	19658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011072	CGT	2	6	19733	19738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011072	AGT	2	6	20191	20196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011072	GTA	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011072	ATG	2	6	20281	20286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011072	TAA	3	9	20352	20360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011072	AAG	2	6	21191	21196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011072	ATA	2	6	21236	21241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011072	TTG	2	6	21372	21377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011072	ATA	2	6	21753	21758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011072	TCT	2	6	21825	21830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011072	TAA	2	6	21855	21860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011072	AAG	2	6	23275	23280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011072	CCT	2	6	23282	23287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011072	TTG	2	6	23291	23296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011072	ATA	2	6	23325	23330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011072	CTT	2	6	23361	23366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011072	ATA	3	9	23386	23394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011072	ATA	2	6	23922	23927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011072	GGA	2	6	23965	23970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011072	CAG	2	6	23974	23979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011072	AAT	2	6	24039	24044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011072	ATA	2	6	24057	24062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011072	TCT	2	6	25141	25146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011072	AGG	2	6	26474	26479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011072	ATG	2	6	27678	27683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011072	CTT	2	6	27705	27710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011072	GGA	2	6	27796	27801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011072	GAT	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011072	TAG	2	6	28830	28835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011072	ATA	2	6	28872	28877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011072	AGA	2	6	28883	28888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011072	TCA	2	6	28903	28908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011072	CAT	2	6	28923	28928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011072	TAG	2	6	28976	28981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011072	TTC	2	6	29035	29040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011072	CGT	2	6	29072	29077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011072	GAT	2	6	29091	29096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011072	TGA	2	6	29117	29122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011072	GTT	2	6	29207	29212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011072	ATA	2	6	29268	29273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011072	TTG	2	6	29741	29746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011072	TGT	2	6	29767	29772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011072	AAT	2	6	29817	29822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011072	TCC	2	6	30222	30227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011072	TCC	2	6	30231	30236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011072	TAT	2	6	30324	30329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011072	TAT	2	6	30345	30350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011072	TCC	2	6	33124	33129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011072	GTA	2	6	33136	33141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011072	TGA	2	6	33175	33180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011072	AGG	2	6	33184	33189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011072	GCT	2	6	33711	33716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011072	GTA	2	6	34935	34940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011072	AGG	2	6	34964	34969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011072	GAT	2	6	38534	38539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011072	ATG	2	6	39049	39054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011072	ATT	2	6	39068	39073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011072	TAA	2	6	39219	39224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011072	GTT	2	6	39434	39439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011072	TTC	2	6	39456	39461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011072	AGC	2	6	39554	39559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011072	AAT	2	6	43159	43164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011072	TTC	2	6	43184	43189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011072	TGA	2	6	47858	47863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011072	TGA	2	6	50939	50944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011072	TTG	2	6	50983	50988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011072	GAA	2	6	53111	53116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011072	ATA	2	6	53183	53188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011072	AAT	2	6	53195	53200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011072	GTC	2	6	54525	54530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011072	GTG	2	6	54531	54536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011072	CCG	2	6	54731	54736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011072	GAT	2	6	54754	54759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011072	TGG	2	6	54821	54826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011072	CTG	2	6	54827	54832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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