MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 4285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011071	ACCCC	2	10	12	21	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_011071	ACCAC	2	10	1440	1449	40 %	0 %	0 %	60 %	194363779
3	NC_011071	CCTTG	2	10	3935	3944	0 %	40 %	20 %	40 %	194363781
4	NC_011071	TGGTC	2	10	4094	4103	0 %	40 %	40 %	20 %	194363781
5	NC_011071	GGCCA	2	10	4752	4761	20 %	0 %	40 %	40 %	194363781
6	NC_011071	CGCTG	2	10	6864	6873	0 %	20 %	40 %	40 %	194363782
7	NC_011071	CCGCC	2	10	7677	7686	0 %	0 %	20 %	80 %	194363783
8	NC_011071	CCGCG	2	10	7707	7716	0 %	0 %	40 %	60 %	194363783
9	NC_011071	AAGAC	2	10	9974	9983	60 %	0 %	20 %	20 %	194363785
10	NC_011071	ACTGA	2	10	11501	11510	40 %	20 %	20 %	20 %	194363786
11	NC_011071	TAGCT	2	10	11559	11568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011071	GCCCA	2	10	17905	17914	20 %	0 %	20 %	60 %	194363794
13	NC_011071	CGAAA	2	10	17956	17965	60 %	0 %	20 %	20 %	194363794
14	NC_011071	CTGCC	2	10	18702	18711	0 %	20 %	20 %	60 %	194363794
15	NC_011071	GGCCG	2	10	20364	20373	0 %	0 %	60 %	40 %	194363794
16	NC_011071	ATCAA	2	10	20979	20988	60 %	20 %	0 %	20 %	194363795
17	NC_011071	ATGAA	2	10	22986	22995	60 %	20 %	20 %	0 %	194363796
18	NC_011071	CACCG	2	10	23822	23831	20 %	0 %	20 %	60 %	194363797
19	NC_011071	GTCAT	2	10	24006	24015	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011071	GATGC	2	10	24310	24319	20 %	20 %	40 %	20 %	194363798
21	NC_011071	GCAGC	2	10	24661	24670	20 %	0 %	40 %	40 %	194363798
22	NC_011071	GGTCG	2	10	26136	26145	0 %	20 %	60 %	20 %	194363799
23	NC_011071	GCCAG	2	10	27262	27271	20 %	0 %	40 %	40 %	194363800
24	NC_011071	CACCG	2	10	27864	27873	20 %	0 %	20 %	60 %	194363800
25	NC_011071	GGTCG	2	10	29127	29136	0 %	20 %	60 %	20 %	194363801
26	NC_011071	GCACG	2	10	30067	30076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011071	GCTCC	2	10	31842	31851	0 %	20 %	20 %	60 %	194363804
28	NC_011071	GCCAG	2	10	32582	32591	20 %	0 %	40 %	40 %	194363804
29	NC_011071	CGCTG	2	10	33380	33389	0 %	20 %	40 %	40 %	194363804
30	NC_011071	GCAGC	2	10	35959	35968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011071	TGCCC	2	10	36007	36016	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011071	TGCCC	2	10	36349	36358	0 %	20 %	20 %	60 %	194363808
33	NC_011071	CTGCC	2	10	37912	37921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011071	AGGGC	2	10	38936	38945	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011071	GCGCC	2	10	40092	40101	0 %	0 %	40 %	60 %	194363812
36	NC_011071	CGGGC	2	10	41503	41512	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011071	GGTGG	2	10	41963	41972	0 %	20 %	80 %	0 %	194363814
38	NC_011071	CCAGG	2	10	42638	42647	20 %	0 %	40 %	40 %	194363814
39	NC_011071	TCGGT	2	10	43848	43857	0 %	40 %	40 %	20 %	194363815
40	NC_011071	CGACC	2	10	44791	44800	20 %	0 %	20 %	60 %	194363815
41	NC_011071	GCGCA	2	10	46276	46285	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011071	GCCGC	2	10	46300	46309	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_011071	GCCGC	2	10	47405	47414	0 %	0 %	40 %	60 %	194363818
44	NC_011071	TGGGC	2	10	47956	47965	0 %	20 %	60 %	20 %	194363818
45	NC_011071	TGCGC	2	10	48034	48043	0 %	20 %	40 %	40 %	194363818
46	NC_011071	GCGCC	2	10	52299	52308	0 %	0 %	40 %	60 %	194363823
47	NC_011071	CTGCC	2	10	52942	52951	0 %	20 %	20 %	60 %	194363823
48	NC_011071	GGGCA	2	10	53054	53063	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011071	CGGCG	2	10	53523	53532	0 %	0 %	60 %	40 %	194363824
50	NC_011071	CATGG	2	10	53976	53985	20 %	20 %	40 %	20 %	194363824
51	NC_011071	AGCAC	2	10	55539	55548	40 %	0 %	20 %	40 %	194363825
52	NC_011071	CCGGC	2	10	57621	57630	0 %	0 %	40 %	60 %	194363828
53	NC_011071	CTGGC	2	10	58635	58644	0 %	20 %	40 %	40 %	194363828
54	NC_011071	AGCCG	2	10	59326	59335	20 %	0 %	40 %	40 %	194363828
55	NC_011071	TTGGG	2	10	60151	60160	0 %	40 %	60 %	0 %	194363829
56	NC_011071	TGGCG	2	10	60583	60592	0 %	20 %	60 %	20 %	194363830
57	NC_011071	CGCGG	2	10	62693	62702	0 %	0 %	60 %	40 %	194363832
58	NC_011071	CGGAC	2	10	62925	62934	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011071	CAGGC	2	10	63498	63507	20 %	0 %	40 %	40 %	194363833
60	NC_011071	CGGCG	2	10	63694	63703	0 %	0 %	60 %	40 %	194363833
61	NC_011071	GACCA	2	10	66244	66253	40 %	0 %	20 %	40 %	194363834
62	NC_011071	GGCCA	2	10	67225	67234	20 %	0 %	40 %	40 %	194363836
63	NC_011071	CGCGC	2	10	68553	68562	0 %	0 %	40 %	60 %	194363837
64	NC_011071	CTGCG	2	10	68683	68692	0 %	20 %	40 %	40 %	194363837
65	NC_011071	CGCTG	2	10	69340	69349	0 %	20 %	40 %	40 %	194363838
66	NC_011071	CATCG	2	10	70462	70471	20 %	20 %	20 %	40 %	194363839
67	NC_011071	GCCGT	2	10	70801	70810	0 %	20 %	40 %	40 %	194363839
68	NC_011071	GCTGG	2	10	71387	71396	0 %	20 %	60 %	20 %	194363840
69	NC_011071	GCGCC	2	10	71465	71474	0 %	0 %	40 %	60 %	194363840
70	NC_011071	CTGCA	2	10	72712	72721	20 %	20 %	20 %	40 %	194363840
71	NC_011071	CAGGC	2	10	74476	74485	20 %	0 %	40 %	40 %	194363841
72	NC_011071	GGCCG	2	10	74487	74496	0 %	0 %	60 %	40 %	194363841
73	NC_011071	AGGCC	2	10	75306	75315	20 %	0 %	40 %	40 %	194363842
74	NC_011071	CACCG	2	10	75733	75742	20 %	0 %	20 %	60 %	194363842
75	NC_011071	AGTGA	2	10	76090	76099	40 %	20 %	40 %	0 %	194363842
76	NC_011071	GCGCC	2	10	80263	80272	0 %	0 %	40 %	60 %	194363844
77	NC_011071	GCGAA	2	10	84121	84130	40 %	0 %	40 %	20 %	194363847
78	NC_011071	AGGGC	2	10	86228	86237	20 %	0 %	60 %	20 %	194363849
79	NC_011071	GCTGC	2	10	86342	86351	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011071	CCCGG	2	10	87054	87063	0 %	0 %	40 %	60 %	194363850
81	NC_011071	GCCGT	2	10	87778	87787	0 %	20 %	40 %	40 %	194363851
82	NC_011071	GCGCT	2	10	88811	88820	0 %	20 %	40 %	40 %	194363852
83	NC_011071	TCAGT	2	10	89679	89688	20 %	40 %	20 %	20 %	194363853
84	NC_011071	GCTGG	2	10	90735	90744	0 %	20 %	60 %	20 %	194363853
85	NC_011071	TGGCC	2	10	91559	91568	0 %	20 %	40 %	40 %	194363854
86	NC_011071	GGCTG	2	10	91876	91885	0 %	20 %	60 %	20 %	194363855
87	NC_011071	CTGGC	2	10	92034	92043	0 %	20 %	40 %	40 %	194363855
88	NC_011071	GCTGT	2	10	92196	92205	0 %	40 %	40 %	20 %	194363855
89	NC_011071	GCGCC	2	10	92713	92722	0 %	0 %	40 %	60 %	194363855
90	NC_011071	CAGCG	3	15	99618	99632	20 %	0 %	40 %	40 %	194363861
91	NC_011071	CATCG	2	10	101208	101217	20 %	20 %	20 %	40 %	194363862
92	NC_011071	ATCGC	2	10	102043	102052	20 %	20 %	20 %	40 %	194363862
93	NC_011071	AGCGC	2	10	102476	102485	20 %	0 %	40 %	40 %	194363862
94	NC_011071	GACTG	2	10	102842	102851	20 %	20 %	40 %	20 %	194363862
95	NC_011071	CAGCA	2	10	102970	102979	40 %	0 %	20 %	40 %	194363862
96	NC_011071	GGCGC	2	10	103480	103489	0 %	0 %	60 %	40 %	194363863
97	NC_011071	GGGCA	2	10	103799	103808	20 %	0 %	60 %	20 %	194363863
98	NC_011071	CAGCG	3	15	104358	104372	20 %	0 %	40 %	40 %	194363863
99	NC_011071	ACGGC	2	10	105385	105394	20 %	0 %	40 %	40 %	194363865
100	NC_011071	AGCGC	2	10	106299	106308	20 %	0 %	40 %	40 %	194363865
101	NC_011071	CACGG	2	10	108004	108013	20 %	0 %	40 %	40 %	194363867
102	NC_011071	CGGCG	2	10	108160	108169	0 %	0 %	60 %	40 %	194363867
103	NC_011071	CACCG	2	10	108986	108995	20 %	0 %	20 %	60 %	194363868
104	NC_011071	CTCAC	2	10	109632	109641	20 %	20 %	0 %	60 %	194363868
105	NC_011071	CCGAT	2	10	111768	111777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011071	CAGCG	2	10	111801	111810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011071	GGCGG	2	10	111935	111944	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011071	GGATG	2	10	113336	113345	20 %	20 %	60 %	0 %	194363871
109	NC_011071	TGCGC	2	10	114043	114052	0 %	20 %	40 %	40 %	194363871
110	NC_011071	CAGTG	2	10	115294	115303	20 %	20 %	40 %	20 %	194363873
111	NC_011071	ATCGC	2	10	115808	115817	20 %	20 %	20 %	40 %	194363873
112	NC_011071	CAGGG	2	10	118982	118991	20 %	0 %	60 %	20 %	194363874
113	NC_011071	CAGTG	2	10	119106	119115	20 %	20 %	40 %	20 %	194363874
114	NC_011071	GGCGG	2	10	119358	119367	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011071	CTTTT	2	10	119637	119646	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011071	GTGGC	2	10	122525	122534	0 %	20 %	60 %	20 %	194363877
117	NC_011071	GGCGC	2	10	122620	122629	0 %	0 %	60 %	40 %	194363878
118	NC_011071	CCGGC	2	10	122661	122670	0 %	0 %	40 %	60 %	194363878
119	NC_011071	GTGCT	2	10	123760	123769	0 %	40 %	40 %	20 %	194363879
120	NC_011071	GCCGG	2	10	123913	123922	0 %	0 %	60 %	40 %	194363879
121	NC_011071	CCCGA	2	10	124516	124525	20 %	0 %	20 %	60 %	194363879
122	NC_011071	GCCCG	2	10	125118	125127	0 %	0 %	40 %	60 %	194363879
123	NC_011071	CCTGG	2	10	129910	129919	0 %	20 %	40 %	40 %	194363884
124	NC_011071	ACTTC	2	10	130756	130765	20 %	40 %	0 %	40 %	194363885
125	NC_011071	GATCC	2	10	133562	133571	20 %	20 %	20 %	40 %	194363887
126	NC_011071	TGCGC	2	10	139235	139244	0 %	20 %	40 %	40 %	194363891
127	NC_011071	CCGCG	2	10	141785	141794	0 %	0 %	40 %	60 %	194363891
128	NC_011071	GCGCA	2	10	142080	142089	20 %	0 %	40 %	40 %	194363891
129	NC_011071	GGCAC	2	10	146931	146940	20 %	0 %	40 %	40 %	194363891
130	NC_011071	TGACC	2	10	148856	148865	20 %	20 %	20 %	40 %	194363891
131	NC_011071	ACCGC	2	10	149299	149308	20 %	0 %	20 %	60 %	194363891
132	NC_011071	TGGCG	2	10	151661	151670	0 %	20 %	60 %	20 %	194363891
133	NC_011071	TGCCA	2	10	155355	155364	20 %	20 %	20 %	40 %	194363895
134	NC_011071	GCCAT	2	10	156003	156012	20 %	20 %	20 %	40 %	194363895
135	NC_011071	CATCG	2	10	156237	156246	20 %	20 %	20 %	40 %	194363895
136	NC_011071	TGCGT	2	10	157378	157387	0 %	40 %	40 %	20 %	194363896
137	NC_011071	GCGCG	2	10	158375	158384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011071	CTGGC	2	10	159018	159027	0 %	20 %	40 %	40 %	194363897
139	NC_011071	CCGAT	2	10	159031	159040	20 %	20 %	20 %	40 %	194363897
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151	NC_011071	CCAGC	2	10	172782	172791	20 %	0 %	20 %	60 %	194363909
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159	NC_011071	CACGC	2	10	183217	183226	20 %	0 %	20 %	60 %	194363923
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162	NC_011071	GCCAC	2	10	185912	185921	20 %	0 %	20 %	60 %	194363927
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268	NC_011071	GTCGG	2	10	303202	303211	0 %	20 %	60 %	20 %	194364031
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386	NC_011071	TGACC	2	10	420399	420408	20 %	20 %	20 %	40 %	194364129
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398	NC_011071	GCGCG	2	10	431859	431868	0 %	0 %	60 %	40 %	194364141
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401	NC_011071	CCGTA	2	10	437002	437011	20 %	20 %	20 %	40 %	194364144
402	NC_011071	CGATG	2	10	438390	438399	20 %	20 %	40 %	20 %	194364144
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