MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 plasmid pPAES01

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011061	GGCC	2	8	269	276	0 %	0 %	50 %	50 %	194335118
2	NC_011061	GGGA	2	8	322	329	25 %	0 %	75 %	0 %	194335118
3	NC_011061	CAGA	3	12	962	973	50 %	0 %	25 %	25 %	194335119
4	NC_011061	AATG	2	8	2650	2657	50 %	25 %	25 %	0 %	194335122
5	NC_011061	AGGC	2	8	3427	3434	25 %	0 %	50 %	25 %	194335122
6	NC_011061	GCAG	2	8	3521	3528	25 %	0 %	50 %	25 %	194335122
7	NC_011061	CTGG	2	8	3934	3941	0 %	25 %	50 %	25 %	194335122
8	NC_011061	AGCG	2	8	4232	4239	25 %	0 %	50 %	25 %	194335122
9	NC_011061	CACG	2	8	4311	4318	25 %	0 %	25 %	50 %	194335122
10	NC_011061	GGCA	2	8	4687	4694	25 %	0 %	50 %	25 %	194335123
11	NC_011061	GTAC	2	8	4696	4703	25 %	25 %	25 %	25 %	194335123
12	NC_011061	TGGA	2	8	6189	6196	25 %	25 %	50 %	0 %	194335123
13	NC_011061	GAAA	2	8	6207	6214	75 %	0 %	25 %	0 %	194335123
14	NC_011061	AAGA	2	8	6565	6572	75 %	0 %	25 %	0 %	194335124
15	NC_011061	ACAT	2	8	6573	6580	50 %	25 %	0 %	25 %	194335124
16	NC_011061	TTTC	2	8	7440	7447	0 %	75 %	0 %	25 %	194335125
17	NC_011061	CCTC	2	8	7530	7537	0 %	25 %	0 %	75 %	194335125
18	NC_011061	GCAG	2	8	7607	7614	25 %	0 %	50 %	25 %	194335125
19	NC_011061	TCAA	2	8	8354	8361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011061	CGCT	2	8	8702	8709	0 %	25 %	25 %	50 %	194335127
21	NC_011061	GACC	2	8	10295	10302	25 %	0 %	25 %	50 %	194335128
22	NC_011061	GAAA	2	8	10551	10558	75 %	0 %	25 %	0 %	194335128
23	NC_011061	ATCT	2	8	11044	11051	25 %	50 %	0 %	25 %	194335128
24	NC_011061	GCTG	2	8	11983	11990	0 %	25 %	50 %	25 %	194335129
25	NC_011061	ATCA	2	8	12168	12175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011061	CCTT	2	8	12373	12380	0 %	50 %	0 %	50 %	194335130
27	NC_011061	TTTG	2	8	12644	12651	0 %	75 %	25 %	0 %	194335131
28	NC_011061	ATCT	2	8	13803	13810	25 %	50 %	0 %	25 %	194335132
29	NC_011061	GGCA	2	8	14261	14268	25 %	0 %	50 %	25 %	194335132
30	NC_011061	GCCC	2	8	14441	14448	0 %	0 %	25 %	75 %	194335133
31	NC_011061	GATC	2	8	15338	15345	25 %	25 %	25 %	25 %	194335134
32	NC_011061	GAAG	2	8	15491	15498	50 %	0 %	50 %	0 %	194335134
33	NC_011061	GGAA	2	8	15630	15637	50 %	0 %	50 %	0 %	194335134
34	NC_011061	GGCA	2	8	15770	15777	25 %	0 %	50 %	25 %	194335134
35	NC_011061	ATGC	2	8	16250	16257	25 %	25 %	25 %	25 %	194335134
36	NC_011061	TGGA	2	8	17134	17141	25 %	25 %	50 %	0 %	194335136
37	NC_011061	TCCC	2	8	17891	17898	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011061	TTCC	2	8	17912	17919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011061	GATG	2	8	18203	18210	25 %	25 %	50 %	0 %	194335137
40	NC_011061	CGTG	2	8	18413	18420	0 %	25 %	50 %	25 %	194335137
41	NC_011061	GATG	2	8	18620	18627	25 %	25 %	50 %	0 %	194335137
42	NC_011061	CGTG	2	8	18808	18815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011061	GATG	2	8	19015	19022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011061	CGTG	2	8	19203	19210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011061	AGTC	2	8	19246	19253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011061	GAAA	2	8	19382	19389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011061	AACA	2	8	19753	19760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011061	ATGG	2	8	20067	20074	25 %	25 %	50 %	0 %	194335139
49	NC_011061	GCCA	2	8	20837	20844	25 %	0 %	25 %	50 %	194335140
50	NC_011061	TTCC	2	8	21227	21234	0 %	50 %	0 %	50 %	194335141
51	NC_011061	ATTG	2	8	21663	21670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011061	GGCA	2	8	21964	21971	25 %	0 %	50 %	25 %	194335142
53	NC_011061	CGGA	2	8	22085	22092	25 %	0 %	50 %	25 %	194335142
54	NC_011061	TCCA	2	8	22744	22751	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011061	TCAT	2	8	22995	23002	25 %	50 %	0 %	25 %	194335143
56	NC_011061	GCAG	2	8	23383	23390	25 %	0 %	50 %	25 %	194335144
57	NC_011061	AGAC	2	8	23735	23742	50 %	0 %	25 %	25 %	194335145
58	NC_011061	CTGG	2	8	24074	24081	0 %	25 %	50 %	25 %	194335145
59	NC_011061	TGCT	2	8	24164	24171	0 %	50 %	25 %	25 %	194335145
60	NC_011061	CGAC	2	8	24473	24480	25 %	0 %	25 %	50 %	194335145
61	NC_011061	ATGG	2	8	24536	24543	25 %	25 %	50 %	0 %	194335145
62	NC_011061	GCTG	2	8	25071	25078	0 %	25 %	50 %	25 %	194335145
63	NC_011061	CAGG	2	8	25145	25152	25 %	0 %	50 %	25 %	194335145
64	NC_011061	GACA	2	8	25667	25674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011061	GGCC	2	8	25891	25898	0 %	0 %	50 %	50 %	194335146
66	NC_011061	CCGG	2	8	26047	26054	0 %	0 %	50 %	50 %	194335146
67	NC_011061	GAGC	2	8	26277	26284	25 %	0 %	50 %	25 %	194335146
68	NC_011061	AGTG	2	8	26982	26989	25 %	25 %	50 %	0 %	194335146
69	NC_011061	AGTG	2	8	26994	27001	25 %	25 %	50 %	0 %	194335146
70	NC_011061	AGTG	2	8	27006	27013	25 %	25 %	50 %	0 %	194335146
71	NC_011061	AGGA	2	8	27216	27223	50 %	0 %	50 %	0 %	194335146
72	NC_011061	AAAT	2	8	27330	27337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011061	AGCC	2	8	27550	27557	25 %	0 %	25 %	50 %	194335147
74	NC_011061	AAAC	2	8	28450	28457	75 %	0 %	0 %	25 %	194335148
75	NC_011061	CAGT	2	8	28674	28681	25 %	25 %	25 %	25 %	194335148
76	NC_011061	AACA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	194335149
77	NC_011061	GATC	2	8	30221	30228	25 %	25 %	25 %	25 %	194335149
78	NC_011061	TTGT	2	8	31046	31053	0 %	75 %	25 %	0 %	194335151
79	NC_011061	CAGT	2	8	31738	31745	25 %	25 %	25 %	25 %	194335151
80	NC_011061	TCCC	2	8	32145	32152	0 %	25 %	0 %	75 %	194335151
81	NC_011061	ATCC	2	8	33208	33215	25 %	25 %	0 %	50 %	194335153
82	NC_011061	GAAA	2	8	33824	33831	75 %	0 %	25 %	0 %	194335154
83	NC_011061	AGGA	2	8	34095	34102	50 %	0 %	50 %	0 %	194335154
84	NC_011061	CAAA	2	8	34298	34305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011061	TCGA	2	8	34472	34479	25 %	25 %	25 %	25 %	194335155
86	NC_011061	CCTT	2	8	35481	35488	0 %	50 %	0 %	50 %	194335157
87	NC_011061	AGGC	2	8	35618	35625	25 %	0 %	50 %	25 %	194335157
88	NC_011061	CTGT	2	8	35788	35795	0 %	50 %	25 %	25 %	194335157
89	NC_011061	AGGA	2	8	36006	36013	50 %	0 %	50 %	0 %	194335157
90	NC_011061	CCGG	2	8	36241	36248	0 %	0 %	50 %	50 %	194335157
91	NC_011061	TGAA	2	8	36426	36433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011061	TGGC	2	8	37252	37259	0 %	25 %	50 %	25 %	194335158
93	NC_011061	AAAC	2	8	37332	37339	75 %	0 %	0 %	25 %	194335158
94	NC_011061	AGTC	2	8	37635	37642	25 %	25 %	25 %	25 %	194335158
95	NC_011061	GATG	2	8	38984	38991	25 %	25 %	50 %	0 %	194335159
96	NC_011061	ATCG	2	8	39066	39073	25 %	25 %	25 %	25 %	194335159
97	NC_011061	AGCC	2	8	39607	39614	25 %	0 %	25 %	50 %	194335159
98	NC_011061	GTCA	2	8	39867	39874	25 %	25 %	25 %	25 %	194335159
99	NC_011061	TACA	2	8	40622	40629	50 %	25 %	0 %	25 %	194335160
100	NC_011061	ATCG	2	8	40716	40723	25 %	25 %	25 %	25 %	194335160
101	NC_011061	CACT	2	8	41346	41353	25 %	25 %	0 %	50 %	194335161
102	NC_011061	GAAT	2	8	42272	42279	50 %	25 %	25 %	0 %	194335161
103	NC_011061	TTCT	2	8	42633	42640	0 %	75 %	0 %	25 %	194335161
104	NC_011061	ACCG	2	8	42772	42779	25 %	0 %	25 %	50 %	194335161
105	NC_011061	ATAC	2	8	43881	43888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011061	ACGC	2	8	44095	44102	25 %	0 %	25 %	50 %	194335162
107	NC_011061	TGGC	2	8	44116	44123	0 %	25 %	50 %	25 %	194335162
108	NC_011061	TCAT	2	8	44325	44332	25 %	50 %	0 %	25 %	194335163
109	NC_011061	CCAC	2	8	44695	44702	25 %	0 %	0 %	75 %	194335163
110	NC_011061	ATAC	2	8	44748	44755	50 %	25 %	0 %	25 %	194335163
111	NC_011061	CTGC	2	8	44872	44879	0 %	25 %	25 %	50 %	194335163
112	NC_011061	TGAG	2	8	44886	44893	25 %	25 %	50 %	0 %	194335163
113	NC_011061	CTGG	2	8	44900	44907	0 %	25 %	50 %	25 %	194335163
114	NC_011061	ATTT	2	8	45050	45057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011061	TTTG	2	8	45108	45115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011061	TCTT	2	8	45505	45512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011061	CATC	2	8	45835	45842	25 %	25 %	0 %	50 %	194335165
118	NC_011061	ATGC	2	8	46828	46835	25 %	25 %	25 %	25 %	194335166
119	NC_011061	TCAA	2	8	46925	46932	50 %	25 %	0 %	25 %	194335166
120	NC_011061	TTGA	2	8	46957	46964	25 %	50 %	25 %	0 %	194335166
121	NC_011061	CCTT	2	8	47250	47257	0 %	50 %	0 %	50 %	194335167
122	NC_011061	ACGC	2	8	47728	47735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011061	TGGC	2	8	47749	47756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011061	TCAT	2	8	47952	47959	25 %	50 %	0 %	25 %	194335168
125	NC_011061	CTGC	2	8	48969	48976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011061	GTAA	2	8	49318	49325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011061	CTGC	2	8	49784	49791	0 %	25 %	25 %	50 %	194335169
128	NC_011061	TGCA	2	8	49798	49805	25 %	25 %	25 %	25 %	194335169
129	NC_011061	CGCT	2	8	49838	49845	0 %	25 %	25 %	50 %	194335169
130	NC_011061	TGAT	2	8	50445	50452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011061	TCTG	2	8	51032	51039	0 %	50 %	25 %	25 %	194335171
132	NC_011061	TTCC	2	8	51270	51277	0 %	50 %	0 %	50 %	194335171
133	NC_011061	CTTC	2	8	51825	51832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011061	AGGC	2	8	52005	52012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011061	GCCT	2	8	52617	52624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011061	GGAT	2	8	52930	52937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011061	CCTG	2	8	53419	53426	0 %	25 %	25 %	50 %	194335172
138	NC_011061	GGTA	2	8	53500	53507	25 %	25 %	50 %	0 %	194335172
139	NC_011061	CAAA	2	8	54259	54266	75 %	0 %	0 %	25 %	194335172
140	NC_011061	GAGG	2	8	54454	54461	25 %	0 %	75 %	0 %	194335173
141	NC_011061	TTGT	2	8	54526	54533	0 %	75 %	25 %	0 %	194335173
142	NC_011061	CTGT	2	8	54593	54600	0 %	50 %	25 %	25 %	194335173
143	NC_011061	TGTC	2	8	54771	54778	0 %	50 %	25 %	25 %	194335173
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.