MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	TAATTA	2	12	240	251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011047	CAAACA	2	12	1246	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
3	NC_011047	TATAAA	2	12	1623	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011047	ATAATT	2	12	4138	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	194246407
5	NC_011047	ATTTTT	2	12	6537	6548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011047	TTTTAA	2	12	6555	6566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011047	AAATAA	2	12	8687	8698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246410
8	NC_011047	TTAAAA	2	12	8780	8791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011047	TAATTC	2	12	12359	12370	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246413
10	NC_011047	AATAAA	2	12	14019	14030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011047	TTAAAT	2	12	14414	14425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011047	ATGAAT	2	12	14669	14680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246415
13	NC_011047	TTAAAT	2	12	16165	16176	50 %	50 %	0 %	0 %	194246416
14	NC_011047	TTTTGG	2	12	16545	16556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246416
15	NC_011047	TGTAAA	2	12	16986	16997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246416
16	NC_011047	CATTAT	2	12	18647	18658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011047	ATTAAA	2	12	19293	19304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246418
18	NC_011047	TATTTT	2	12	21356	21367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246420
19	NC_011047	ATTTTG	2	12	22110	22121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194246420
20	NC_011047	TTGCGT	2	12	22682	22693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	194246420
21	NC_011047	TATCAA	2	12	24568	24579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246421
22	NC_011047	ATATTT	2	12	24811	24822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011047	TTTTAT	2	12	25962	25973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246422
24	NC_011047	TTGACC	2	12	25990	26001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194246422
25	NC_011047	TTAAAG	2	12	26310	26321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246422
26	NC_011047	TTATTT	2	12	26720	26731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246422
27	NC_011047	ATCATT	2	12	27113	27124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011047	TAACTT	2	12	27320	27331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246423
29	NC_011047	ATATTT	2	12	27976	27987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011047	AAACTT	2	12	28085	28096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011047	ATATTT	2	12	28417	28428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011047	AGAAGG	2	12	28964	28975	50 %	0 %	50 %	0 %	194246424
33	NC_011047	TTTTAT	2	12	29426	29437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246425
34	NC_011047	TTTTCT	2	12	29653	29664	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011047	TTCAAT	2	12	30265	30276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246426
36	NC_011047	ATTTTT	2	12	31022	31033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246427
37	NC_011047	TTGATC	2	12	31433	31444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194246428
38	NC_011047	TTAATT	2	12	31615	31626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011047	TTTTTC	2	12	32287	32298	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	194246429
40	NC_011047	TATTTA	2	12	32598	32609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246429
41	NC_011047	TATTAA	2	12	34282	34293	50 %	50 %	0 %	0 %	194246429
42	NC_011047	AATTTC	2	12	35642	35653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246431
43	NC_011047	ATCTAA	2	12	35840	35851	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246431
44	NC_011047	AAAATT	2	12	37962	37973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011047	TTTATC	2	12	39426	39437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246435
46	NC_011047	AAAAAT	2	12	39597	39608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246435
47	NC_011047	CAAAAA	2	12	39612	39623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	194246435
48	NC_011047	AAATAA	2	12	39746	39757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246435
49	NC_011047	CCTACA	2	12	43257	43268	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	194246437
50	NC_011047	TATTTT	2	12	44532	44543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246438
51	NC_011047	TAAATT	2	12	44556	44567	50 %	50 %	0 %	0 %	194246438
52	NC_011047	CTATTT	2	12	44791	44802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246438
53	NC_011047	ACTTTT	2	12	45357	45368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246438
54	NC_011047	TAAAAA	2	12	46888	46899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011047	TGTCTC	2	12	49769	49780	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194246441
56	NC_011047	ATGTTT	2	12	49824	49835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194246441
57	NC_011047	TACCAG	2	12	51832	51843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194246442
58	NC_011047	TAAAAA	2	12	53149	53160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246443
59	NC_011047	TTGTAA	2	12	53858	53869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246444
60	NC_011047	ATTTAA	2	12	55276	55287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011047	TAAAAA	2	12	55345	55356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011047	TTTCAA	2	12	55388	55399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246445
63	NC_011047	GTTTGA	2	12	56425	56436	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	194246445
64	NC_011047	CAATAA	2	12	56711	56722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011047	TTATTT	2	12	57477	57488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246446
66	NC_011047	ATTTTA	2	12	57860	57871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246446
67	NC_011047	TTTTAT	2	12	60120	60131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011047	TAAAAT	2	12	60808	60819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246450
69	NC_011047	AGATTT	2	12	62028	62039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246452
70	NC_011047	AGACAT	2	12	63193	63204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194246452
71	NC_011047	ATATTA	2	12	63507	63518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011047	TTTAAT	2	12	64707	64718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246454
73	NC_011047	CTAAAT	2	12	65075	65086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246455
74	NC_011047	ATTTTT	2	12	65139	65150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246455
75	NC_011047	TTTTCT	2	12	65260	65271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	194246455
76	NC_011047	TAATTT	2	12	67844	67855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246457
77	NC_011047	GTAAAT	2	12	67870	67881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246457
78	NC_011047	ATTTTA	2	12	68958	68969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011047	CATAAA	2	12	69022	69033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011047	GAAAAT	2	12	69229	69240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194246458
81	NC_011047	TAAAAA	2	12	69836	69847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011047	ATTAAA	2	12	70074	70085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011047	AATTTG	2	12	71958	71969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246459
84	NC_011047	TTGTTT	2	12	73588	73599	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	194246460
85	NC_011047	CTTTAT	2	12	73800	73811	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246461
86	NC_011047	TCTTTT	2	12	74806	74817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011047	ATAAAA	2	12	75220	75231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246462
88	NC_011047	AAAATT	2	12	76801	76812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011047	TCATTA	2	12	77053	77064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246464
90	NC_011047	GTTTAA	2	12	77498	77509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246464
91	NC_011047	ATAACA	2	12	77817	77828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246465
92	NC_011047	TTTTAA	2	12	78169	78180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246465
93	NC_011047	ATCATT	2	12	78565	78576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246466
94	NC_011047	TCTTTG	2	12	78952	78963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	194246466
95	NC_011047	TAAATT	2	12	79489	79500	50 %	50 %	0 %	0 %	194246466
96	NC_011047	ATACTA	2	12	80031	80042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246467
97	NC_011047	ATTAAA	2	12	80559	80570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246467
98	NC_011047	TAATCT	2	12	80653	80664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011047	CTAAAA	2	12	83261	83272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246469
100	NC_011047	ATTATA	2	12	83287	83298	50 %	50 %	0 %	0 %	194246469
101	NC_011047	ATAAAA	2	12	86035	86046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246472
102	NC_011047	TTAAAG	2	12	87248	87259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246473
103	NC_011047	TAAATT	2	12	87825	87836	50 %	50 %	0 %	0 %	194246474
104	NC_011047	ATTAAT	2	12	88443	88454	50 %	50 %	0 %	0 %	194246474
105	NC_011047	CACCAA	2	12	89035	89046	50 %	0 %	0 %	50 %	194246475
106	NC_011047	AATTTA	2	12	89824	89835	50 %	50 %	0 %	0 %	194246475
107	NC_011047	ATCTAA	2	12	91869	91880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246477
108	NC_011047	TTAAAT	2	12	92027	92038	50 %	50 %	0 %	0 %	194246477
109	NC_011047	CTAAAG	2	12	92135	92146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194246477
110	NC_011047	TTAATT	2	12	93279	93290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246478
111	NC_011047	TAAAAA	2	12	93793	93804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011047	ACCTAA	2	12	94153	94164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194246479
113	NC_011047	TATTTT	2	12	94299	94310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246479
114	NC_011047	TTTGTT	2	12	95605	95616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	194246480
115	NC_011047	TAATTT	2	12	96163	96174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246480
116	NC_011047	AATTAA	2	12	96448	96459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246480
117	NC_011047	TCTAAT	2	12	97869	97880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246481
118	NC_011047	TACCAC	2	12	99911	99922	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	194246482
119	NC_011047	AATTTC	2	12	102141	102152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246482
120	NC_011047	TTTAAT	2	12	102309	102320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246482
121	NC_011047	TTTTAA	2	12	102453	102464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246482
122	NC_011047	TTAATT	2	12	102832	102843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246482
123	NC_011047	ATAAAT	2	12	104168	104179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011047	TATGAA	2	12	105723	105734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246484
125	NC_011047	TAAAAA	2	12	108265	108276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011047	ATAAAG	2	12	109864	109875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194246487
127	NC_011047	ATTTAA	2	12	110231	110242	50 %	50 %	0 %	0 %	194246487
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