MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	CAAACA	2	12	1246	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
2	NC_011047	ATAATT	2	12	4138	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	194246407
3	NC_011047	AAATAA	2	12	8687	8698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246410
4	NC_011047	TAATTC	2	12	12359	12370	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246413
5	NC_011047	ATGAAT	2	12	14669	14680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246415
6	NC_011047	TTAAAT	2	12	16165	16176	50 %	50 %	0 %	0 %	194246416
7	NC_011047	TTTTGG	2	12	16545	16556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246416
8	NC_011047	TGTAAA	2	12	16986	16997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246416
9	NC_011047	ATTAAA	2	12	19293	19304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246418
10	NC_011047	TATTTT	2	12	21356	21367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246420
11	NC_011047	ATTTTG	2	12	22110	22121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194246420
12	NC_011047	TTGCGT	2	12	22682	22693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	194246420
13	NC_011047	TATCAA	2	12	24568	24579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246421
14	NC_011047	TTTTAT	2	12	25962	25973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246422
15	NC_011047	TTGACC	2	12	25990	26001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194246422
16	NC_011047	TTAAAG	2	12	26310	26321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246422
17	NC_011047	TTATTT	2	12	26720	26731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246422
18	NC_011047	TAACTT	2	12	27320	27331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246423
19	NC_011047	AGAAGG	2	12	28964	28975	50 %	0 %	50 %	0 %	194246424
20	NC_011047	TTTTAT	2	12	29426	29437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246425
21	NC_011047	TTCAAT	2	12	30265	30276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246426
22	NC_011047	ATTTTT	2	12	31022	31033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246427
23	NC_011047	TTGATC	2	12	31433	31444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194246428
24	NC_011047	TTTTTC	2	12	32287	32298	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	194246429
25	NC_011047	TATTTA	2	12	32598	32609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246429
26	NC_011047	TATTAA	2	12	34282	34293	50 %	50 %	0 %	0 %	194246429
27	NC_011047	AATTTC	2	12	35642	35653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246431
28	NC_011047	ATCTAA	2	12	35840	35851	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246431
29	NC_011047	TTTATC	2	12	39426	39437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246435
30	NC_011047	AAAAAT	2	12	39597	39608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246435
31	NC_011047	CAAAAA	2	12	39612	39623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	194246435
32	NC_011047	AAATAA	2	12	39746	39757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246435
33	NC_011047	CCTACA	2	12	43257	43268	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	194246437
34	NC_011047	TATTTT	2	12	44532	44543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246438
35	NC_011047	TAAATT	2	12	44556	44567	50 %	50 %	0 %	0 %	194246438
36	NC_011047	CTATTT	2	12	44791	44802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246438
37	NC_011047	ACTTTT	2	12	45357	45368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246438
38	NC_011047	TGTCTC	2	12	49769	49780	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194246441
39	NC_011047	ATGTTT	2	12	49824	49835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194246441
40	NC_011047	TACCAG	2	12	51832	51843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194246442
41	NC_011047	TAAAAA	2	12	53149	53160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246443
42	NC_011047	TTGTAA	2	12	53858	53869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246444
43	NC_011047	TTTCAA	2	12	55388	55399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246445
44	NC_011047	GTTTGA	2	12	56425	56436	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	194246445
45	NC_011047	TTATTT	2	12	57477	57488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246446
46	NC_011047	ATTTTA	2	12	57860	57871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246446
47	NC_011047	TAAAAT	2	12	60808	60819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246450
48	NC_011047	AGATTT	2	12	62028	62039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246452
49	NC_011047	AGACAT	2	12	63193	63204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194246452
50	NC_011047	TTTAAT	2	12	64707	64718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246454
51	NC_011047	CTAAAT	2	12	65075	65086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246455
52	NC_011047	ATTTTT	2	12	65139	65150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246455
53	NC_011047	TTTTCT	2	12	65260	65271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	194246455
54	NC_011047	TAATTT	2	12	67844	67855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246457
55	NC_011047	GTAAAT	2	12	67870	67881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246457
56	NC_011047	GAAAAT	2	12	69229	69240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194246458
57	NC_011047	AATTTG	2	12	71958	71969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246459
58	NC_011047	TTGTTT	2	12	73588	73599	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	194246460
59	NC_011047	CTTTAT	2	12	73800	73811	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194246461
60	NC_011047	ATAAAA	2	12	75220	75231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246462
61	NC_011047	TCATTA	2	12	77053	77064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246464
62	NC_011047	GTTTAA	2	12	77498	77509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194246464
63	NC_011047	ATAACA	2	12	77817	77828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246465
64	NC_011047	TTTTAA	2	12	78169	78180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246465
65	NC_011047	ATCATT	2	12	78565	78576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246466
66	NC_011047	TCTTTG	2	12	78952	78963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	194246466
67	NC_011047	TAAATT	2	12	79489	79500	50 %	50 %	0 %	0 %	194246466
68	NC_011047	ATACTA	2	12	80031	80042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246467
69	NC_011047	ATTAAA	2	12	80559	80570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246467
70	NC_011047	CTAAAA	2	12	83261	83272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246469
71	NC_011047	ATTATA	2	12	83287	83298	50 %	50 %	0 %	0 %	194246469
72	NC_011047	ATAAAA	2	12	86035	86046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246472
73	NC_011047	TTAAAG	2	12	87248	87259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246473
74	NC_011047	TAAATT	2	12	87825	87836	50 %	50 %	0 %	0 %	194246474
75	NC_011047	ATTAAT	2	12	88443	88454	50 %	50 %	0 %	0 %	194246474
76	NC_011047	CACCAA	2	12	89035	89046	50 %	0 %	0 %	50 %	194246475
77	NC_011047	AATTTA	2	12	89824	89835	50 %	50 %	0 %	0 %	194246475
78	NC_011047	ATCTAA	2	12	91869	91880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194246477
79	NC_011047	TTAAAT	2	12	92027	92038	50 %	50 %	0 %	0 %	194246477
80	NC_011047	CTAAAG	2	12	92135	92146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194246477
81	NC_011047	TTAATT	2	12	93279	93290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246478
82	NC_011047	ACCTAA	2	12	94153	94164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194246479
83	NC_011047	TATTTT	2	12	94299	94310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246479
84	NC_011047	TTTGTT	2	12	95605	95616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	194246480
85	NC_011047	TAATTT	2	12	96163	96174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246480
86	NC_011047	AATTAA	2	12	96448	96459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246480
87	NC_011047	TCTAAT	2	12	97869	97880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246481
88	NC_011047	TACCAC	2	12	99911	99922	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	194246482
89	NC_011047	AATTTC	2	12	102141	102152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246482
90	NC_011047	TTTAAT	2	12	102309	102320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246482
91	NC_011047	TTTTAA	2	12	102453	102464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246482
92	NC_011047	TTAATT	2	12	102832	102843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246482
93	NC_011047	TATGAA	2	12	105723	105734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246484
94	NC_011047	ATAAAG	2	12	109864	109875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194246487
95	NC_011047	ATTTAA	2	12	110231	110242	50 %	50 %	0 %	0 %	194246487
96	NC_011047	AAATAA	2	12	112457	112468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246487
97	NC_011047	TTTTGG	2	12	118610	118621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246489
98	NC_011047	CCTAAT	2	12	121461	121472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246493
99	NC_011047	ATTTTT	2	12	122745	122756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246494
100	NC_011047	TTTACA	2	12	125913	125924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246497
101	NC_011047	TAAAAC	2	12	126042	126053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246497
102	NC_011047	TATAAA	2	12	127383	127394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246498
103	NC_011047	TAAAAA	2	12	127855	127866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246498
104	NC_011047	ACAATA	2	12	128800	128811	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246498
105	NC_011047	CTTTAA	2	12	128896	128907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194246498
106	NC_011047	TTTAAA	2	12	129782	129793	50 %	50 %	0 %	0 %	194246498
107	NC_011047	TCTCAA	2	12	130035	130046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246499
108	NC_011047	TTTAAT	2	12	130939	130950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246500
109	NC_011047	TAAAAT	2	12	131248	131259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246500
110	NC_011047	TAAAAA	2	12	131347	131358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194246500
111	NC_011047	TAGTTT	2	12	133347	133358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194246501
112	NC_011047	TTTTGG	2	12	135076	135087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246502
113	NC_011047	TGTAAA	2	12	135517	135528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	194246502
114	NC_011047	CATAAC	2	12	136412	136423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194246503
115	NC_011047	ATTTAT	2	12	137241	137252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246504
116	NC_011047	TAAATT	2	12	137399	137410	50 %	50 %	0 %	0 %	194246504
117	NC_011047	TTTTTA	2	12	137438	137449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194246504
118	NC_011047	GAAACA	2	12	137520	137531	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194246504
119	NC_011047	CAAAAA	2	12	137760	137771	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	194246504
120	NC_011047	AAATTA	2	12	138241	138252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246504
121	NC_011047	AACTAA	2	12	140083	140094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194246505
122	NC_011047	ATTACC	2	12	140299	140310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246505
123	NC_011047	TTTGAT	2	12	142146	142157	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194246506
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