MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	TAAAA	3	15	1723	1737	80 %	20 %	0 %	0 %	194246405
2	NC_011047	AATTT	2	10	1834	1843	40 %	60 %	0 %	0 %	194246405
3	NC_011047	TACCT	2	10	4254	4263	20 %	40 %	0 %	40 %	194246407
4	NC_011047	AAAGT	2	10	4283	4292	60 %	20 %	20 %	0 %	194246407
5	NC_011047	TTCAT	2	10	4582	4591	20 %	60 %	0 %	20 %	194246407
6	NC_011047	TATTT	2	10	5734	5743	20 %	80 %	0 %	0 %	194246409
7	NC_011047	ATTTA	2	10	6268	6277	40 %	60 %	0 %	0 %	194246409
8	NC_011047	TATTT	2	10	6490	6499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011047	ATTTA	2	10	6880	6889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011047	ATTTT	2	10	6945	6954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011047	AATAC	2	10	7226	7235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011047	ATAAA	2	10	7668	7677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011047	ATAAA	2	10	7926	7935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011047	AGTAA	2	10	8755	8764	60 %	20 %	20 %	0 %	194246410
15	NC_011047	TAAAA	2	10	10015	10024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011047	ATTAT	2	10	11492	11501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011047	TTTAA	2	10	11697	11706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011047	TAAAT	2	10	12144	12153	60 %	40 %	0 %	0 %	194246413
19	NC_011047	GATTT	2	10	13078	13087	20 %	60 %	20 %	0 %	194246414
20	NC_011047	TAATT	2	10	13565	13574	40 %	60 %	0 %	0 %	194246414
21	NC_011047	ATTTT	2	10	14351	14360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011047	CAAAT	2	10	15029	15038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011047	TTATT	2	10	15082	15091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011047	AATTT	2	10	15144	15153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011047	AATGC	2	10	15777	15786	40 %	20 %	20 %	20 %	194246416
26	NC_011047	AATTA	2	10	17033	17042	60 %	40 %	0 %	0 %	194246416
27	NC_011047	AAAAC	2	10	17052	17061	80 %	0 %	0 %	20 %	194246416
28	NC_011047	AATAA	2	10	17635	17644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011047	TTTTG	2	10	17809	17818	0 %	80 %	20 %	0 %	194246417
30	NC_011047	ATATT	2	10	17920	17929	40 %	60 %	0 %	0 %	194246417
31	NC_011047	ATTTT	2	10	18165	18174	20 %	80 %	0 %	0 %	194246417
32	NC_011047	TGTAC	2	10	18324	18333	20 %	40 %	20 %	20 %	194246417
33	NC_011047	TAAAA	2	10	18735	18744	80 %	20 %	0 %	0 %	194246418
34	NC_011047	AAATT	2	10	19434	19443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011047	TAAAT	2	10	20007	20016	60 %	40 %	0 %	0 %	194246419
36	NC_011047	AAATT	2	10	20991	21000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011047	ATATT	2	10	21340	21349	40 %	60 %	0 %	0 %	194246420
38	NC_011047	TTGTT	2	10	21612	21621	0 %	80 %	20 %	0 %	194246420
39	NC_011047	TTTAA	2	10	21868	21877	40 %	60 %	0 %	0 %	194246420
40	NC_011047	TTTTA	2	10	22530	22539	20 %	80 %	0 %	0 %	194246420
41	NC_011047	ATTTA	2	10	22947	22956	40 %	60 %	0 %	0 %	194246420
42	NC_011047	CTTTT	2	10	23018	23027	0 %	80 %	0 %	20 %	194246420
43	NC_011047	AAATT	2	10	23985	23994	60 %	40 %	0 %	0 %	194246421
44	NC_011047	TAAAA	2	10	24778	24787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011047	TTATT	2	10	24832	24841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011047	ATAAA	2	10	24911	24920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011047	ATTAA	2	10	25781	25790	60 %	40 %	0 %	0 %	194246422
48	NC_011047	AAAAT	2	10	27018	27027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011047	GATTT	2	10	27380	27389	20 %	60 %	20 %	0 %	194246423
50	NC_011047	ATTTT	2	10	28043	28052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011047	TATTT	3	15	28327	28341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011047	ATTTT	2	10	28484	28493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011047	CTAAA	2	10	29393	29402	60 %	20 %	0 %	20 %	194246425
54	NC_011047	TAAAA	2	10	29703	29712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011047	TTTAA	2	10	29851	29860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011047	ATTTT	2	10	30188	30197	20 %	80 %	0 %	0 %	194246426
57	NC_011047	TAAAG	2	10	30478	30487	60 %	20 %	20 %	0 %	194246426
58	NC_011047	ATAAA	2	10	33007	33016	80 %	20 %	0 %	0 %	194246429
59	NC_011047	ATTTA	2	10	33370	33379	40 %	60 %	0 %	0 %	194246429
60	NC_011047	TTTGT	2	10	33892	33901	0 %	80 %	20 %	0 %	194246429
61	NC_011047	TTTTC	2	10	34125	34134	0 %	80 %	0 %	20 %	194246429
62	NC_011047	ATGAT	2	10	34314	34323	40 %	40 %	20 %	0 %	194246429
63	NC_011047	TATTT	2	10	34628	34637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011047	AAACA	2	10	35511	35520	80 %	0 %	0 %	20 %	194246430
65	NC_011047	ATTTT	2	10	35574	35583	20 %	80 %	0 %	0 %	194246431
66	NC_011047	AATTT	2	10	36685	36694	40 %	60 %	0 %	0 %	194246431
67	NC_011047	TAATT	2	10	37652	37661	40 %	60 %	0 %	0 %	194246433
68	NC_011047	AAAGA	2	10	38753	38762	80 %	0 %	20 %	0 %	194246434
69	NC_011047	AATTT	2	10	38908	38917	40 %	60 %	0 %	0 %	194246434
70	NC_011047	TAAAA	2	10	40256	40265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011047	TTAGT	2	10	41060	41069	20 %	60 %	20 %	0 %	194246436
72	NC_011047	ATATT	2	10	41541	41550	40 %	60 %	0 %	0 %	194246436
73	NC_011047	AAACC	2	10	41681	41690	60 %	0 %	0 %	40 %	194246436
74	NC_011047	AAATT	2	10	41805	41814	60 %	40 %	0 %	0 %	194246436
75	NC_011047	AATCA	2	10	41951	41960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011047	GGATT	2	10	42539	42548	20 %	40 %	40 %	0 %	194246437
77	NC_011047	TTTAA	2	10	42666	42675	40 %	60 %	0 %	0 %	194246437
78	NC_011047	AAAAT	2	10	43942	43951	80 %	20 %	0 %	0 %	194246437
79	NC_011047	TAAAT	2	10	43976	43985	60 %	40 %	0 %	0 %	194246437
80	NC_011047	TAAAT	2	10	44325	44334	60 %	40 %	0 %	0 %	194246438
81	NC_011047	ATTTT	2	10	45953	45962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011047	TTGAT	2	10	46463	46472	20 %	60 %	20 %	0 %	194246439
83	NC_011047	TTGAT	2	10	46499	46508	20 %	60 %	20 %	0 %	194246439
84	NC_011047	ATAAA	2	10	47036	47045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011047	TAAAA	2	10	47120	47129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011047	TTTTA	2	10	47210	47219	20 %	80 %	0 %	0 %	194246440
87	NC_011047	GTTTT	2	10	48426	48435	0 %	80 %	20 %	0 %	194246441
88	NC_011047	ATCAT	2	10	48858	48867	40 %	40 %	0 %	20 %	194246441
89	NC_011047	TGATT	2	10	49007	49016	20 %	60 %	20 %	0 %	194246441
90	NC_011047	TTTTC	2	10	49032	49041	0 %	80 %	0 %	20 %	194246441
91	NC_011047	ATTGA	2	10	49129	49138	40 %	40 %	20 %	0 %	194246441
92	NC_011047	ATTAT	2	10	49191	49200	40 %	60 %	0 %	0 %	194246441
93	NC_011047	AATAA	2	10	51566	51575	80 %	20 %	0 %	0 %	194246442
94	NC_011047	AATTT	2	10	53181	53190	40 %	60 %	0 %	0 %	194246443
95	NC_011047	TAAAA	2	10	53423	53432	80 %	20 %	0 %	0 %	194246444
96	NC_011047	TTTTA	2	10	54455	54464	20 %	80 %	0 %	0 %	194246444
97	NC_011047	AAATA	2	10	54869	54878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011047	AATAA	2	10	56558	56567	80 %	20 %	0 %	0 %	194246445
99	NC_011047	CTTAA	2	10	56636	56645	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011047	AAATT	2	10	56753	56762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011047	TAAAT	2	10	56918	56927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011047	AAAAT	2	10	58497	58506	80 %	20 %	0 %	0 %	194246446
103	NC_011047	TACTT	2	10	59121	59130	20 %	60 %	0 %	20 %	194246448
104	NC_011047	AAAAT	2	10	59192	59201	80 %	20 %	0 %	0 %	194246448
105	NC_011047	GAAAA	2	10	60030	60039	80 %	0 %	20 %	0 %	194246449
106	NC_011047	TATTT	2	10	60511	60520	20 %	80 %	0 %	0 %	194246450
107	NC_011047	AAAAT	2	10	61134	61143	80 %	20 %	0 %	0 %	194246451
108	NC_011047	TTAGA	2	10	61389	61398	40 %	40 %	20 %	0 %	194246451
109	NC_011047	TAAAA	2	10	61459	61468	80 %	20 %	0 %	0 %	194246451
110	NC_011047	ACACA	2	10	62398	62407	60 %	0 %	0 %	40 %	194246452
111	NC_011047	ATTTT	2	10	62600	62609	20 %	80 %	0 %	0 %	194246452
112	NC_011047	TAAAA	2	10	63427	63436	80 %	20 %	0 %	0 %	194246452
113	NC_011047	TTAAT	2	10	64091	64100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011047	ATTAA	2	10	64130	64139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011047	ATTTA	2	10	65455	65464	40 %	60 %	0 %	0 %	194246455
116	NC_011047	CATTT	2	10	67178	67187	20 %	60 %	0 %	20 %	194246457
117	NC_011047	ATATT	2	10	67743	67752	40 %	60 %	0 %	0 %	194246457
118	NC_011047	ATCAA	2	10	68349	68358	60 %	20 %	0 %	20 %	194246457
119	NC_011047	TAAAA	2	10	68396	68405	80 %	20 %	0 %	0 %	194246457
120	NC_011047	ATTTT	2	10	68505	68514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011047	AAAAC	2	10	68891	68900	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011047	ATTAT	2	10	69685	69694	40 %	60 %	0 %	0 %	194246458
123	NC_011047	AAAAT	2	10	69767	69776	80 %	20 %	0 %	0 %	194246458
124	NC_011047	TCAAA	2	10	70867	70876	60 %	20 %	0 %	20 %	194246459
125	NC_011047	AAAAT	2	10	70959	70968	80 %	20 %	0 %	0 %	194246459
126	NC_011047	AAATT	2	10	71252	71261	60 %	40 %	0 %	0 %	194246459
127	NC_011047	TAAAA	2	10	71275	71284	80 %	20 %	0 %	0 %	194246459
128	NC_011047	AAATA	2	10	72282	72291	80 %	20 %	0 %	0 %	194246459
129	NC_011047	AAATT	2	10	72501	72510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011047	TTAAA	2	10	72581	72590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011047	TTTAA	2	10	72644	72653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011047	AGTTA	2	10	73048	73057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011047	AATTT	2	10	73254	73263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011047	AAATA	2	10	73904	73913	80 %	20 %	0 %	0 %	194246461
135	NC_011047	ATAAC	2	10	74633	74642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011047	AAACT	2	10	75010	75019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011047	TAAAA	2	10	75116	75125	80 %	20 %	0 %	0 %	194246462
138	NC_011047	ATATT	2	10	75341	75350	40 %	60 %	0 %	0 %	194246462
139	NC_011047	AATTA	2	10	76361	76370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011047	TTTTA	2	10	76675	76684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011047	TTTTG	2	10	78602	78611	0 %	80 %	20 %	0 %	194246466
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143	NC_011047	TTTTG	2	10	79324	79333	0 %	80 %	20 %	0 %	194246466
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