MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	TATTT	2	10	6490	6499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011047	ATTTA	2	10	6880	6889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011047	ATTTT	2	10	6945	6954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011047	AATAC	2	10	7226	7235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011047	ATAAA	2	10	7668	7677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011047	ATAAA	2	10	7926	7935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011047	TAAAA	2	10	10015	10024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011047	ATTAT	2	10	11492	11501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011047	TTTAA	2	10	11697	11706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011047	ATTTT	2	10	14351	14360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011047	CAAAT	2	10	15029	15038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011047	TTATT	2	10	15082	15091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011047	AATTT	2	10	15144	15153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011047	AATAA	2	10	17635	17644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011047	AAATT	2	10	19434	19443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011047	AAATT	2	10	20991	21000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011047	TAAAA	2	10	24778	24787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011047	TTATT	2	10	24832	24841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011047	ATAAA	2	10	24911	24920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011047	AAAAT	2	10	27018	27027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011047	ATTTT	2	10	28043	28052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011047	TATTT	3	15	28327	28341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011047	ATTTT	2	10	28484	28493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011047	TAAAA	2	10	29703	29712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011047	TTTAA	2	10	29851	29860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011047	TATTT	2	10	34628	34637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011047	TAAAA	2	10	40256	40265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011047	AATCA	2	10	41951	41960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011047	ATTTT	2	10	45953	45962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011047	ATAAA	2	10	47036	47045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011047	TAAAA	2	10	47120	47129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011047	AAATA	2	10	54869	54878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011047	CTTAA	2	10	56636	56645	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011047	AAATT	2	10	56753	56762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011047	TAAAT	2	10	56918	56927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011047	TTAAT	2	10	64091	64100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011047	ATTAA	2	10	64130	64139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011047	ATTTT	2	10	68505	68514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011047	AAAAC	2	10	68891	68900	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011047	AAATT	2	10	72501	72510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011047	TTAAA	2	10	72581	72590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011047	TTTAA	2	10	72644	72653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011047	AGTTA	2	10	73048	73057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011047	AATTT	2	10	73254	73263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011047	ATAAC	2	10	74633	74642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011047	AAACT	2	10	75010	75019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011047	AATTA	2	10	76361	76370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011047	TTTTA	2	10	76675	76684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011047	ATTTA	2	10	81675	81684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011047	TTAAT	2	10	83485	83494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011047	ATAAA	2	10	83525	83534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011047	ATTAA	2	10	83643	83652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011047	TTTAA	2	10	88943	88952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011047	TAATT	2	10	97258	97267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011047	TATAA	2	10	103032	103041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011047	TATTT	2	10	106068	106077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011047	AAAAT	2	10	106250	106259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011047	TAAAA	2	10	106986	106995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011047	AAAAT	2	10	107814	107823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011047	TAAAT	2	10	108249	108258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011047	AATTA	2	10	108278	108287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011047	TTCAT	2	10	112974	112983	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011047	TGAAA	2	10	113305	113314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011047	TAATT	2	10	113565	113574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011047	ATATA	2	10	113605	113614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011047	TAAAA	2	10	117732	117741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011047	TAAAA	2	10	117770	117779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011047	GAAAT	2	10	118076	118085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011047	ATAAA	2	10	118266	118275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011047	AATTT	2	10	118390	118399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011047	TAAAA	2	10	120490	120499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011047	TTAAA	2	10	121161	121170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011047	ATTAT	2	10	123446	123455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011047	TAAAA	2	10	123482	123491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011047	ATATT	2	10	130494	130503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011047	TAAAA	2	10	131682	131691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011047	TTAAA	2	10	134160	134169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011047	AATAT	2	10	135942	135951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011047	ATTAA	2	10	138777	138786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011047	AATTT	2	10	139188	139197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011047	ATAAA	2	10	141146	141155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011047	ATTTT	2	10	143130	143139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011047	TAAAA	2	10	145288	145297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011047	AAATA	2	10	150018	150027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011047	TAAAA	2	10	153147	153156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011047	ATTTT	2	10	153214	153223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011047	TAAAA	2	10	155012	155021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011047	ATAAA	2	10	155363	155372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011047	TAATT	2	10	155649	155658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011047	ATTTT	2	10	157397	157406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011047	ATTTT	2	10	157476	157485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011047	ATTTT	2	10	157789	157798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011047	TAAAA	2	10	159307	159316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011047	AATAA	2	10	159743	159752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011047	TTAAT	3	15	168272	168286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011047	ATTAA	2	10	169556	169565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011047	TATTT	2	10	172645	172654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011047	AAAAT	2	10	174700	174709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011047	TATAA	2	10	174749	174758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011047	TTTTA	2	10	174822	174831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011047	AAAAT	2	10	176511	176520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011047	ATTAA	2	10	180950	180959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011047	TATTT	2	10	182355	182364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011047	AAATT	2	10	183435	183444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011047	ATTTT	2	10	183564	183573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011047	ATATT	2	10	184665	184674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011047	TAATT	2	10	186172	186181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011047	ATTAA	2	10	191039	191048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011047	TAATT	2	10	192120	192129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011047	AATTT	2	10	195017	195026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011047	ATTTT	2	10	195162	195171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011047	TAAAA	2	10	196626	196635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011047	TTTTA	2	10	197901	197910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011047	TAAAA	2	10	200219	200228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011047	AATAA	2	10	200360	200369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011047	ATTTT	2	10	200539	200548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011047	AAAAT	2	10	200646	200655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011047	CAAAA	2	10	200697	200706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011047	ACATT	2	10	200735	200744	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011047	TTTAA	2	10	200785	200794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011047	AAATG	2	10	200817	200826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011047	TAAAA	2	10	201848	201857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011047	CACAA	2	10	202050	202059	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011047	TTTTA	2	10	202195	202204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011047	ATTTT	2	10	202210	202219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011047	TTAAT	2	10	208360	208369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011047	ATTTG	2	10	208498	208507	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011047	TAATA	2	10	208582	208591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011047	CAAAA	3	15	208894	208908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011047	AAAAC	2	10	211441	211450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011047	AATTT	2	10	220764	220773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011047	AATTA	2	10	221201	221210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011047	AACAA	2	10	221535	221544	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011047	TATAT	2	10	222527	222536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011047	TATTT	2	10	230089	230098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011047	ATAAA	2	10	230845	230854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011047	ATATA	2	10	230962	230971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011047	TAAAA	2	10	237017	237026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011047	TAAAT	2	10	237050	237059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011047	TAAAT	2	10	237087	237096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011047	TAATT	2	10	238815	238824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011047	AAATT	2	10	238886	238895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011047	AAATT	2	10	238968	238977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011047	ATTTT	2	10	239408	239417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011047	TTAAA	2	10	243895	243904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011047	TTTAA	2	10	243924	243933	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011047	ACTAT	2	10	245026	245035	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011047	TAAAT	2	10	245151	245160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011047	TAAAT	2	10	245504	245513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011047	ATTAA	2	10	247274	247283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011047	TTTAT	2	10	247423	247432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.