MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	TAAAA	3	15	1723	1737	80 %	20 %	0 %	0 %	194246405
2	NC_011047	AATTT	2	10	1834	1843	40 %	60 %	0 %	0 %	194246405
3	NC_011047	TACCT	2	10	4254	4263	20 %	40 %	0 %	40 %	194246407
4	NC_011047	AAAGT	2	10	4283	4292	60 %	20 %	20 %	0 %	194246407
5	NC_011047	TTCAT	2	10	4582	4591	20 %	60 %	0 %	20 %	194246407
6	NC_011047	TATTT	2	10	5734	5743	20 %	80 %	0 %	0 %	194246409
7	NC_011047	ATTTA	2	10	6268	6277	40 %	60 %	0 %	0 %	194246409
8	NC_011047	AGTAA	2	10	8755	8764	60 %	20 %	20 %	0 %	194246410
9	NC_011047	TAAAT	2	10	12144	12153	60 %	40 %	0 %	0 %	194246413
10	NC_011047	GATTT	2	10	13078	13087	20 %	60 %	20 %	0 %	194246414
11	NC_011047	TAATT	2	10	13565	13574	40 %	60 %	0 %	0 %	194246414
12	NC_011047	AATGC	2	10	15777	15786	40 %	20 %	20 %	20 %	194246416
13	NC_011047	AATTA	2	10	17033	17042	60 %	40 %	0 %	0 %	194246416
14	NC_011047	AAAAC	2	10	17052	17061	80 %	0 %	0 %	20 %	194246416
15	NC_011047	TTTTG	2	10	17809	17818	0 %	80 %	20 %	0 %	194246417
16	NC_011047	ATATT	2	10	17920	17929	40 %	60 %	0 %	0 %	194246417
17	NC_011047	ATTTT	2	10	18165	18174	20 %	80 %	0 %	0 %	194246417
18	NC_011047	TGTAC	2	10	18324	18333	20 %	40 %	20 %	20 %	194246417
19	NC_011047	TAAAA	2	10	18735	18744	80 %	20 %	0 %	0 %	194246418
20	NC_011047	TAAAT	2	10	20007	20016	60 %	40 %	0 %	0 %	194246419
21	NC_011047	ATATT	2	10	21340	21349	40 %	60 %	0 %	0 %	194246420
22	NC_011047	TTGTT	2	10	21612	21621	0 %	80 %	20 %	0 %	194246420
23	NC_011047	TTTAA	2	10	21868	21877	40 %	60 %	0 %	0 %	194246420
24	NC_011047	TTTTA	2	10	22530	22539	20 %	80 %	0 %	0 %	194246420
25	NC_011047	ATTTA	2	10	22947	22956	40 %	60 %	0 %	0 %	194246420
26	NC_011047	CTTTT	2	10	23018	23027	0 %	80 %	0 %	20 %	194246420
27	NC_011047	AAATT	2	10	23985	23994	60 %	40 %	0 %	0 %	194246421
28	NC_011047	ATTAA	2	10	25781	25790	60 %	40 %	0 %	0 %	194246422
29	NC_011047	GATTT	2	10	27380	27389	20 %	60 %	20 %	0 %	194246423
30	NC_011047	CTAAA	2	10	29393	29402	60 %	20 %	0 %	20 %	194246425
31	NC_011047	ATTTT	2	10	30188	30197	20 %	80 %	0 %	0 %	194246426
32	NC_011047	TAAAG	2	10	30478	30487	60 %	20 %	20 %	0 %	194246426
33	NC_011047	ATAAA	2	10	33007	33016	80 %	20 %	0 %	0 %	194246429
34	NC_011047	ATTTA	2	10	33370	33379	40 %	60 %	0 %	0 %	194246429
35	NC_011047	TTTGT	2	10	33892	33901	0 %	80 %	20 %	0 %	194246429
36	NC_011047	TTTTC	2	10	34125	34134	0 %	80 %	0 %	20 %	194246429
37	NC_011047	ATGAT	2	10	34314	34323	40 %	40 %	20 %	0 %	194246429
38	NC_011047	AAACA	2	10	35511	35520	80 %	0 %	0 %	20 %	194246430
39	NC_011047	ATTTT	2	10	35574	35583	20 %	80 %	0 %	0 %	194246431
40	NC_011047	AATTT	2	10	36685	36694	40 %	60 %	0 %	0 %	194246431
41	NC_011047	TAATT	2	10	37652	37661	40 %	60 %	0 %	0 %	194246433
42	NC_011047	AAAGA	2	10	38753	38762	80 %	0 %	20 %	0 %	194246434
43	NC_011047	AATTT	2	10	38908	38917	40 %	60 %	0 %	0 %	194246434
44	NC_011047	TTAGT	2	10	41060	41069	20 %	60 %	20 %	0 %	194246436
45	NC_011047	ATATT	2	10	41541	41550	40 %	60 %	0 %	0 %	194246436
46	NC_011047	AAACC	2	10	41681	41690	60 %	0 %	0 %	40 %	194246436
47	NC_011047	AAATT	2	10	41805	41814	60 %	40 %	0 %	0 %	194246436
48	NC_011047	GGATT	2	10	42539	42548	20 %	40 %	40 %	0 %	194246437
49	NC_011047	TTTAA	2	10	42666	42675	40 %	60 %	0 %	0 %	194246437
50	NC_011047	AAAAT	2	10	43942	43951	80 %	20 %	0 %	0 %	194246437
51	NC_011047	TAAAT	2	10	43976	43985	60 %	40 %	0 %	0 %	194246437
52	NC_011047	TAAAT	2	10	44325	44334	60 %	40 %	0 %	0 %	194246438
53	NC_011047	TTGAT	2	10	46463	46472	20 %	60 %	20 %	0 %	194246439
54	NC_011047	TTGAT	2	10	46499	46508	20 %	60 %	20 %	0 %	194246439
55	NC_011047	TTTTA	2	10	47210	47219	20 %	80 %	0 %	0 %	194246440
56	NC_011047	GTTTT	2	10	48426	48435	0 %	80 %	20 %	0 %	194246441
57	NC_011047	ATCAT	2	10	48858	48867	40 %	40 %	0 %	20 %	194246441
58	NC_011047	TGATT	2	10	49007	49016	20 %	60 %	20 %	0 %	194246441
59	NC_011047	TTTTC	2	10	49032	49041	0 %	80 %	0 %	20 %	194246441
60	NC_011047	ATTGA	2	10	49129	49138	40 %	40 %	20 %	0 %	194246441
61	NC_011047	ATTAT	2	10	49191	49200	40 %	60 %	0 %	0 %	194246441
62	NC_011047	AATAA	2	10	51566	51575	80 %	20 %	0 %	0 %	194246442
63	NC_011047	AATTT	2	10	53181	53190	40 %	60 %	0 %	0 %	194246443
64	NC_011047	TAAAA	2	10	53423	53432	80 %	20 %	0 %	0 %	194246444
65	NC_011047	TTTTA	2	10	54455	54464	20 %	80 %	0 %	0 %	194246444
66	NC_011047	AATAA	2	10	56558	56567	80 %	20 %	0 %	0 %	194246445
67	NC_011047	AAAAT	2	10	58497	58506	80 %	20 %	0 %	0 %	194246446
68	NC_011047	TACTT	2	10	59121	59130	20 %	60 %	0 %	20 %	194246448
69	NC_011047	AAAAT	2	10	59192	59201	80 %	20 %	0 %	0 %	194246448
70	NC_011047	GAAAA	2	10	60030	60039	80 %	0 %	20 %	0 %	194246449
71	NC_011047	TATTT	2	10	60511	60520	20 %	80 %	0 %	0 %	194246450
72	NC_011047	AAAAT	2	10	61134	61143	80 %	20 %	0 %	0 %	194246451
73	NC_011047	TTAGA	2	10	61389	61398	40 %	40 %	20 %	0 %	194246451
74	NC_011047	TAAAA	2	10	61459	61468	80 %	20 %	0 %	0 %	194246451
75	NC_011047	ACACA	2	10	62398	62407	60 %	0 %	0 %	40 %	194246452
76	NC_011047	ATTTT	2	10	62600	62609	20 %	80 %	0 %	0 %	194246452
77	NC_011047	TAAAA	2	10	63427	63436	80 %	20 %	0 %	0 %	194246452
78	NC_011047	ATTTA	2	10	65455	65464	40 %	60 %	0 %	0 %	194246455
79	NC_011047	CATTT	2	10	67178	67187	20 %	60 %	0 %	20 %	194246457
80	NC_011047	ATATT	2	10	67743	67752	40 %	60 %	0 %	0 %	194246457
81	NC_011047	ATCAA	2	10	68349	68358	60 %	20 %	0 %	20 %	194246457
82	NC_011047	TAAAA	2	10	68396	68405	80 %	20 %	0 %	0 %	194246457
83	NC_011047	ATTAT	2	10	69685	69694	40 %	60 %	0 %	0 %	194246458
84	NC_011047	AAAAT	2	10	69767	69776	80 %	20 %	0 %	0 %	194246458
85	NC_011047	TCAAA	2	10	70867	70876	60 %	20 %	0 %	20 %	194246459
86	NC_011047	AAAAT	2	10	70959	70968	80 %	20 %	0 %	0 %	194246459
87	NC_011047	AAATT	2	10	71252	71261	60 %	40 %	0 %	0 %	194246459
88	NC_011047	TAAAA	2	10	71275	71284	80 %	20 %	0 %	0 %	194246459
89	NC_011047	AAATA	2	10	72282	72291	80 %	20 %	0 %	0 %	194246459
90	NC_011047	AAATA	2	10	73904	73913	80 %	20 %	0 %	0 %	194246461
91	NC_011047	TAAAA	2	10	75116	75125	80 %	20 %	0 %	0 %	194246462
92	NC_011047	ATATT	2	10	75341	75350	40 %	60 %	0 %	0 %	194246462
93	NC_011047	TTTTG	2	10	78602	78611	0 %	80 %	20 %	0 %	194246466
94	NC_011047	GGAAT	2	10	78662	78671	40 %	20 %	40 %	0 %	194246466
95	NC_011047	TTTTG	2	10	79324	79333	0 %	80 %	20 %	0 %	194246466
96	NC_011047	ATTAA	2	10	79854	79863	60 %	40 %	0 %	0 %	194246467
97	NC_011047	AAATT	2	10	80715	80724	60 %	40 %	0 %	0 %	194246468
98	NC_011047	AATTT	2	10	82204	82213	40 %	60 %	0 %	0 %	194246469
99	NC_011047	ATTTA	2	10	82890	82899	40 %	60 %	0 %	0 %	194246469
100	NC_011047	AAAAT	2	10	83893	83902	80 %	20 %	0 %	0 %	194246470
101	NC_011047	TAATT	2	10	83976	83985	40 %	60 %	0 %	0 %	194246470
102	NC_011047	TAATT	2	10	84511	84520	40 %	60 %	0 %	0 %	194246470
103	NC_011047	TCCAC	2	10	85117	85126	20 %	20 %	0 %	60 %	194246471
104	NC_011047	TAATT	2	10	85805	85814	40 %	60 %	0 %	0 %	194246472
105	NC_011047	TAAAA	2	10	87579	87588	80 %	20 %	0 %	0 %	194246474
106	NC_011047	ATTTT	2	10	87610	87619	20 %	80 %	0 %	0 %	194246474
107	NC_011047	AAATT	2	10	87671	87680	60 %	40 %	0 %	0 %	194246474
108	NC_011047	TTTTA	2	10	88869	88878	20 %	80 %	0 %	0 %	194246474
109	NC_011047	ATTTA	2	10	89282	89291	40 %	60 %	0 %	0 %	194246475
110	NC_011047	ATTCA	2	10	91005	91014	40 %	40 %	0 %	20 %	194246476
111	NC_011047	TAATT	2	10	93860	93869	40 %	60 %	0 %	0 %	194246479
112	NC_011047	TTTTA	2	10	94897	94906	20 %	80 %	0 %	0 %	194246480
113	NC_011047	ATTTT	2	10	95711	95720	20 %	80 %	0 %	0 %	194246480
114	NC_011047	ATTTT	2	10	96024	96033	20 %	80 %	0 %	0 %	194246480
115	NC_011047	AATTA	2	10	97000	97009	60 %	40 %	0 %	0 %	194246480
116	NC_011047	TAAAA	2	10	98583	98592	80 %	20 %	0 %	0 %	194246482
117	NC_011047	TTTTC	2	10	98638	98647	0 %	80 %	0 %	20 %	194246482
118	NC_011047	ATTTT	2	10	98734	98743	20 %	80 %	0 %	0 %	194246482
119	NC_011047	GAAAT	2	10	101396	101405	60 %	20 %	20 %	0 %	194246482
120	NC_011047	AAAAT	2	10	101725	101734	80 %	20 %	0 %	0 %	194246482
121	NC_011047	AATTC	2	10	101980	101989	40 %	40 %	0 %	20 %	194246482
122	NC_011047	TAAAA	2	10	102208	102217	80 %	20 %	0 %	0 %	194246482
123	NC_011047	AAATA	2	10	102294	102303	80 %	20 %	0 %	0 %	194246482
124	NC_011047	TAAAA	2	10	105283	105292	80 %	20 %	0 %	0 %	194246484
125	NC_011047	TTCAG	2	10	105746	105755	20 %	40 %	20 %	20 %	194246484
126	NC_011047	TAAAA	2	10	105784	105793	80 %	20 %	0 %	0 %	194246484
127	NC_011047	TATAA	2	10	105889	105898	60 %	40 %	0 %	0 %	194246484
128	NC_011047	TTTTA	2	10	106548	106557	20 %	80 %	0 %	0 %	194246485
129	NC_011047	TAATT	2	10	106566	106575	40 %	60 %	0 %	0 %	194246485
130	NC_011047	TTTAT	3	15	106651	106665	20 %	80 %	0 %	0 %	194246485
131	NC_011047	AAATT	2	10	108441	108450	60 %	40 %	0 %	0 %	194246487
132	NC_011047	ATTTT	2	10	108903	108912	20 %	80 %	0 %	0 %	194246487
133	NC_011047	TCTAT	2	10	109593	109602	20 %	60 %	0 %	20 %	194246487
134	NC_011047	TTAAA	2	10	109807	109816	60 %	40 %	0 %	0 %	194246487
135	NC_011047	TATTT	2	10	110270	110279	20 %	80 %	0 %	0 %	194246487
136	NC_011047	ATTTT	2	10	110442	110451	20 %	80 %	0 %	0 %	194246487
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