MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011035	ATGCTG	2	12	11912	11923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011035	GAAACA	2	12	19416	19427	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011035	TCTTGT	2	12	47812	47823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011035	AATCAA	2	12	49697	49708	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011035	TTTTGT	2	12	61135	61146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011035	GAATTT	2	12	133545	133556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011035	AACTTC	2	12	133659	133670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011035	ATTTAA	2	12	138006	138017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011035	ATTTGC	2	12	138026	138037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011035	GTTCGG	2	12	161166	161177	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011035	AAAATC	2	12	170886	170897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011035	TTCAAA	2	12	171961	171972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011035	TTGAGG	2	12	177694	177705	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011035	GAATTG	2	12	177903	177914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011035	CTGAAT	2	12	196037	196048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011035	GTTTTT	2	12	197028	197039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011035	ATTTAA	2	12	234125	234136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011035	CGGACA	2	12	269672	269683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011035	AGGATT	2	12	279716	279727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011035	TTATGT	2	12	299872	299883	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011035	TGTCGA	2	12	359942	359953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011035	AAAATA	2	12	395250	395261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011035	TTCGGA	2	12	404930	404941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011035	TGCCGT	2	12	449296	449307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011035	ATTTAA	2	12	513202	513213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011035	AAGGAA	2	12	515075	515086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011035	ATTTAT	2	12	515869	515880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011035	TTCAAT	2	12	515881	515892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011035	GCAGGA	2	12	523619	523630	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011035	TTATTT	2	12	526500	526511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011035	CCGTTG	2	12	533098	533109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011035	CCGTCG	2	12	533110	533121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011035	CCGTTG	2	12	533146	533157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011035	CCGTCG	2	12	533158	533169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011035	GCCGTC	2	12	533181	533192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011035	TTGCCG	2	12	533197	533208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011035	GCCGCT	2	12	533211	533222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011035	CCGTTG	2	12	533302	533313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011035	CCGACC	2	12	541234	541245	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011035	TTGGGT	2	12	548067	548078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011035	TAATCA	2	12	563069	563080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011035	TGCAGT	2	12	572657	572668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011035	GCTGTT	2	12	576585	576596	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011035	AATTCC	2	12	577081	577092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011035	GCTGTT	2	12	582109	582120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011035	ATTTAA	2	12	625653	625664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011035	TCGTTT	2	12	657814	657825	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011035	TTTTAT	2	12	684591	684602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011035	TATTTT	2	12	735108	735119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011035	AATTTG	2	12	773256	773267	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011035	ATTTAA	2	12	773360	773371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011035	ATTTAA	2	12	782516	782527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011035	AAATAT	2	12	870976	870987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011035	CAATGC	2	12	885856	885867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011035	AATCGT	2	12	893293	893304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011035	ATCCGA	2	12	898938	898949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011035	TGGGAA	2	12	911010	911021	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011035	GCACCG	2	12	916406	916417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011035	ATTTAA	2	12	925580	925591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011035	CAAACA	2	12	932257	932268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011035	CAAAGG	2	12	940310	940321	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011035	TTAAAT	2	12	958343	958354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011035	ATTTAA	2	12	961681	961692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011035	TAAATA	2	12	962974	962985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011035	CGCGGT	2	12	973231	973242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011035	GTGCCG	2	12	1000881	1000892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011035	TGCCTT	2	12	1050602	1050613	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011035	CTTTTC	2	12	1069873	1069884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011035	TTTCAG	2	12	1072382	1072393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011035	ATTTAA	2	12	1073254	1073265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011035	CCTGTT	2	12	1086533	1086544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011035	GCTGCC	2	12	1106680	1106691	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011035	CGAAGC	2	12	1182846	1182857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011035	TTATAT	2	12	1208315	1208326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011035	TCAAAT	2	12	1212617	1212628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011035	ACGGCA	2	12	1213473	1213484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011035	AGCGGC	2	12	1213568	1213579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011035	ACGGCA	2	12	1213581	1213592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011035	GCGACG	2	12	1213596	1213607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011035	ACGGCG	2	12	1213617	1213628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011035	ACGGCA	2	12	1213629	1213640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011035	ACGGCG	2	12	1213665	1213676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011035	ACGGCA	2	12	1213677	1213688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011035	CATTTC	2	12	1301692	1301703	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011035	TTAAAT	2	12	1321078	1321089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011035	CCCAAG	2	12	1401564	1401575	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011035	AAAACA	2	12	1419701	1419712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011035	ATTTAA	2	12	1440294	1440305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011035	GAAACC	2	12	1466635	1466646	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011035	GAAACC	2	12	1467615	1467626	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011035	AAATCA	2	12	1527924	1527935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011035	TTTAGC	2	12	1559716	1559727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011035	ATTTAA	2	12	1577352	1577363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011035	AAAATA	2	12	1579504	1579515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011035	CGTTTC	2	12	1585909	1585920	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011035	CCGTTG	2	12	1599049	1599060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011035	CCGTCG	2	12	1599061	1599072	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011035	CCGTTG	2	12	1599097	1599108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011035	CCGTCG	2	12	1599109	1599120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011035	GCCGTC	2	12	1599132	1599143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011035	TTGCCG	2	12	1599148	1599159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011035	GCCGCT	2	12	1599162	1599173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011035	CCGTTG	2	12	1599253	1599264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011035	TCCGCC	2	12	1618635	1618646	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011035	TTTATC	2	12	1619625	1619636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011035	CGGCTT	2	12	1639423	1639434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011035	GTCGAT	2	12	1664814	1664825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011035	TTTTCA	2	12	1668986	1668997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011035	TCACGC	2	12	1669947	1669958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011035	AAAAAT	2	12	1717526	1717537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011035	AAAGAA	2	12	1722323	1722334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011035	TTAAAT	2	12	1760755	1760766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011035	GGCTGC	2	12	1809186	1809197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011035	GTTATT	2	12	1890049	1890060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011035	TTCGGT	2	12	1946117	1946128	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011035	TTAAAT	2	12	1974286	1974297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011035	AAATTT	2	12	1982278	1982289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011035	TTAAAT	2	12	1988470	1988481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011035	CTTATG	2	12	1991659	1991670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011035	GGAAAA	2	12	2009907	2009918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011035	TTAAAT	2	12	2056083	2056094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011035	TAAACC	2	12	2060931	2060942	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011035	CAAAAA	2	12	2076128	2076139	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011035	AAGATA	2	12	2088056	2088067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011035	ATGGTA	2	12	2104110	2104121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011035	CAAAAA	2	12	2106424	2106435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011035	CCGCGC	2	12	2108902	2108913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011035	AAATCA	2	12	2120195	2120206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011035	TTAAAT	2	12	2146967	2146978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011035	ATTTAA	2	12	2161917	2161928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011035	CTTTTG	2	12	2165642	2165653	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011035	GCTTCC	2	12	2166528	2166539	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011035	GGTTTT	2	12	2168341	2168352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011035	TTAAAT	2	12	2189563	2189574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011035	TTGCCA	2	12	2209409	2209420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.