MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 1738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011035	ATATT	2	10	106	115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011035	CCGTC	2	10	1360	1369	0 %	20 %	20 %	60 %	194097590
3	NC_011035	GCGCG	2	10	3107	3116	0 %	0 %	60 %	40 %	194097593
4	NC_011035	TGACG	2	10	5195	5204	20 %	20 %	40 %	20 %	194097593
5	NC_011035	GAAAA	2	10	5430	5439	80 %	0 %	20 %	0 %	194097594
6	NC_011035	GGCGG	2	10	5702	5711	0 %	0 %	80 %	20 %	194097594
7	NC_011035	CGGCT	2	10	5775	5784	0 %	20 %	40 %	40 %	194097595
8	NC_011035	CGGTT	2	10	7391	7400	0 %	40 %	40 %	20 %	194097598
9	NC_011035	ATTAT	2	10	11556	11565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011035	AAGGG	2	10	12032	12041	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011035	CGTGT	2	10	15222	15231	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011035	TGTTT	2	10	16794	16803	0 %	80 %	20 %	0 %	194097616
13	NC_011035	CGGGT	2	10	18961	18970	0 %	20 %	60 %	20 %	194097618
14	NC_011035	TTTGA	2	10	22292	22301	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011035	TGCGG	2	10	25908	25917	0 %	20 %	60 %	20 %	194097625
16	NC_011035	TTCCG	2	10	28188	28197	0 %	40 %	20 %	40 %	194097629
17	NC_011035	CGACC	2	10	31544	31553	20 %	0 %	20 %	60 %	194097632
18	NC_011035	TGGTT	2	10	34598	34607	0 %	60 %	40 %	0 %	194097636
19	NC_011035	GCCGC	2	10	35290	35299	0 %	0 %	40 %	60 %	194097636
20	NC_011035	GTTTC	2	10	37704	37713	0 %	60 %	20 %	20 %	194097639
21	NC_011035	GCCCC	2	10	38852	38861	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_011035	TTTCC	2	10	39663	39672	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011035	GATGC	2	10	41079	41088	20 %	20 %	40 %	20 %	194097643
24	NC_011035	CGGGC	2	10	42322	42331	0 %	0 %	60 %	40 %	194097644
25	NC_011035	CCGTG	2	10	43294	43303	0 %	20 %	40 %	40 %	194097646
26	NC_011035	TTTGG	2	10	44992	45001	0 %	60 %	40 %	0 %	194097648
27	NC_011035	ATAAA	2	10	47654	47663	80 %	20 %	0 %	0 %	194097650
28	NC_011035	AGAAA	2	10	47949	47958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011035	TTTTC	2	10	53884	53893	0 %	80 %	0 %	20 %	194097660
30	NC_011035	TCAAA	2	10	54544	54553	60 %	20 %	0 %	20 %	194097660
31	NC_011035	CCGGG	2	10	56436	56445	0 %	0 %	60 %	40 %	194097660
32	NC_011035	TTGTT	2	10	56604	56613	0 %	80 %	20 %	0 %	194097660
33	NC_011035	GCCGG	2	10	59987	59996	0 %	0 %	60 %	40 %	194097664
34	NC_011035	CGGCT	2	10	62742	62751	0 %	20 %	40 %	40 %	194097669
35	NC_011035	CGTTG	2	10	65450	65459	0 %	40 %	40 %	20 %	194097671
36	NC_011035	AAAAT	2	10	66862	66871	80 %	20 %	0 %	0 %	194097673
37	NC_011035	CCTGC	2	10	66921	66930	0 %	20 %	20 %	60 %	194097673
38	NC_011035	TGCCT	2	10	68099	68108	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011035	TTTGG	2	10	70251	70260	0 %	60 %	40 %	0 %	194097676
40	NC_011035	AACCG	2	10	70831	70840	40 %	0 %	20 %	40 %	194097679
41	NC_011035	GAAGA	8	40	71800	71839	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011035	CCCAA	2	10	72289	72298	40 %	0 %	0 %	60 %	194097683
43	NC_011035	TTTCG	2	10	72510	72519	0 %	60 %	20 %	20 %	194097683
44	NC_011035	CGCGG	2	10	72826	72835	0 %	0 %	60 %	40 %	194097683
45	NC_011035	GAAGA	7	35	77107	77141	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011035	GCCCC	2	10	77296	77305	0 %	0 %	20 %	80 %	194100152
47	NC_011035	CGGTT	2	10	77542	77551	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011035	AACCG	2	10	78083	78092	40 %	0 %	20 %	40 %	194097688
49	NC_011035	CGGTG	2	10	78722	78731	0 %	20 %	60 %	20 %	194097689
50	NC_011035	AAACC	2	10	79752	79761	60 %	0 %	0 %	40 %	194097690
51	NC_011035	CGATG	2	10	81898	81907	20 %	20 %	40 %	20 %	194097694
52	NC_011035	CGGTT	2	10	82198	82207	0 %	40 %	40 %	20 %	194097695
53	NC_011035	AAATC	2	10	82308	82317	60 %	20 %	0 %	20 %	194097695
54	NC_011035	GGCAG	2	10	82910	82919	20 %	0 %	60 %	20 %	194097696
55	NC_011035	GGCGC	2	10	85035	85044	0 %	0 %	60 %	40 %	194097697
56	NC_011035	ATGTG	2	10	86321	86330	20 %	40 %	40 %	0 %	194097697
57	NC_011035	GGCGG	2	10	91287	91296	0 %	0 %	80 %	20 %	194097705
58	NC_011035	GCCCC	2	10	99815	99824	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
59	NC_011035	GGTTT	2	10	101254	101263	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011035	TTTGG	2	10	103665	103674	0 %	60 %	40 %	0 %	194097721
61	NC_011035	GTTTT	2	10	104388	104397	0 %	80 %	20 %	0 %	194097721
62	NC_011035	GTATT	2	10	104926	104935	20 %	60 %	20 %	0 %	194097721
63	NC_011035	TCGCG	2	10	105730	105739	0 %	20 %	40 %	40 %	194097722
64	NC_011035	CGGTT	2	10	109846	109855	0 %	40 %	40 %	20 %	194097726
65	NC_011035	GAAAG	2	10	110479	110488	60 %	0 %	40 %	0 %	194097726
66	NC_011035	GGCAG	2	10	113776	113785	20 %	0 %	60 %	20 %	194097729
67	NC_011035	GAATC	2	10	115877	115886	40 %	20 %	20 %	20 %	194097731
68	NC_011035	AAGGT	2	10	117969	117978	40 %	20 %	40 %	0 %	194097733
69	NC_011035	TACCG	2	10	120592	120601	20 %	20 %	20 %	40 %	194097735
70	NC_011035	GAATG	2	10	121877	121886	40 %	20 %	40 %	0 %	194097738
71	NC_011035	AAAAT	2	10	121942	121951	80 %	20 %	0 %	0 %	194097738
72	NC_011035	GGTGT	2	10	122516	122525	0 %	40 %	60 %	0 %	194097739
73	NC_011035	CGGCA	2	10	124602	124611	20 %	0 %	40 %	40 %	194097741
74	NC_011035	CCGCC	2	10	127077	127086	0 %	0 %	20 %	80 %	194097743
75	NC_011035	CAGCG	2	10	127403	127412	20 %	0 %	40 %	40 %	194097744
76	NC_011035	GCGTG	2	10	127823	127832	0 %	20 %	60 %	20 %	194097745
77	NC_011035	CGGTA	2	10	127872	127881	20 %	20 %	40 %	20 %	194097745
78	NC_011035	GGCGT	2	10	129188	129197	0 %	20 %	60 %	20 %	194097746
79	NC_011035	GCGCG	2	10	129778	129787	0 %	0 %	60 %	40 %	194097746
80	NC_011035	GGCGC	2	10	131472	131481	0 %	0 %	60 %	40 %	194097748
81	NC_011035	ACCGC	2	10	132419	132428	20 %	0 %	20 %	60 %	194097751
82	NC_011035	GACGG	2	10	136418	136427	20 %	0 %	60 %	20 %	194097755
83	NC_011035	CTGGG	2	10	136693	136702	0 %	20 %	60 %	20 %	194097755
84	NC_011035	CGTAT	2	10	138207	138216	20 %	40 %	20 %	20 %	194097756
85	NC_011035	CTCAA	2	10	138573	138582	40 %	20 %	0 %	40 %	194097757
86	NC_011035	CCGCC	2	10	138847	138856	0 %	0 %	20 %	80 %	194097757
87	NC_011035	ACGGC	2	10	138898	138907	20 %	0 %	40 %	40 %	194097757
88	NC_011035	CCGAC	2	10	139156	139165	20 %	0 %	20 %	60 %	194097757
89	NC_011035	TGGTT	2	10	139414	139423	0 %	60 %	40 %	0 %	194097757
90	NC_011035	CCTGC	2	10	141714	141723	0 %	20 %	20 %	60 %	194097761
91	NC_011035	GCCTC	2	10	141921	141930	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_011035	CAATA	2	10	144959	144968	60 %	20 %	0 %	20 %	194097766
93	NC_011035	CGCGC	2	10	146090	146099	0 %	0 %	40 %	60 %	194097766
94	NC_011035	CAAGC	2	10	146238	146247	40 %	0 %	20 %	40 %	194097766
95	NC_011035	CCGAA	2	10	147752	147761	40 %	0 %	20 %	40 %	194097768
96	NC_011035	GCGGG	2	10	147902	147911	0 %	0 %	80 %	20 %	194097768
97	NC_011035	ACCGT	2	10	152779	152788	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011035	GGCAG	2	10	153896	153905	20 %	0 %	60 %	20 %	194097776
99	NC_011035	CGGGG	2	10	156210	156219	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011035	CGGAA	2	10	157560	157569	40 %	0 %	40 %	20 %	194097780
101	NC_011035	CGGCG	2	10	158057	158066	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011035	AGGCG	2	10	160674	160683	20 %	0 %	60 %	20 %	194097785
103	NC_011035	GCGCG	2	10	160812	160821	0 %	0 %	60 %	40 %	194097785
104	NC_011035	GAAAA	2	10	162142	162151	80 %	0 %	20 %	0 %	194097788
105	NC_011035	ACAAA	2	10	163045	163054	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011035	AAATT	2	10	163411	163420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011035	ATTTT	2	10	163550	163559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011035	CAAAC	2	10	164928	164937	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011035	CGGCG	2	10	165143	165152	0 %	0 %	60 %	40 %	194097793
110	NC_011035	GATGT	2	10	165348	165357	20 %	40 %	40 %	0 %	194097793
111	NC_011035	CCGCA	2	10	167457	167466	20 %	0 %	20 %	60 %	194097793
112	NC_011035	GCCGG	2	10	167818	167827	0 %	0 %	60 %	40 %	194097794
113	NC_011035	CGCGG	2	10	167869	167878	0 %	0 %	60 %	40 %	194097794
114	NC_011035	CAAAC	2	10	168427	168436	60 %	0 %	0 %	40 %	194097795
115	NC_011035	CCTTA	2	10	169137	169146	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011035	TTTTC	2	10	170247	170256	0 %	80 %	0 %	20 %	194097799
117	NC_011035	CGGCT	2	10	172218	172227	0 %	20 %	40 %	40 %	194097802
118	NC_011035	ATAAC	2	10	172919	172928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011035	TTGCC	2	10	174860	174869	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011035	CGTGT	2	10	177639	177648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011035	GCAGT	2	10	178534	178543	20 %	20 %	40 %	20 %	194097811
122	NC_011035	TGGTG	2	10	179139	179148	0 %	40 %	60 %	0 %	194097811
123	NC_011035	GCGTG	2	10	181558	181567	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011035	TTGCC	2	10	181886	181895	0 %	40 %	20 %	40 %	194097814
125	NC_011035	GTCCA	2	10	182147	182156	20 %	20 %	20 %	40 %	194097814
126	NC_011035	GAAGG	2	10	182803	182812	40 %	0 %	60 %	0 %	194097814
127	NC_011035	GCAGG	2	10	183451	183460	20 %	0 %	60 %	20 %	194097814
128	NC_011035	TGCCG	2	10	184778	184787	0 %	20 %	40 %	40 %	194097817
129	NC_011035	ATGCC	2	10	184912	184921	20 %	20 %	20 %	40 %	194097817
130	NC_011035	ACCGC	2	10	186093	186102	20 %	0 %	20 %	60 %	194097819
131	NC_011035	AGCGG	2	10	186460	186469	20 %	0 %	60 %	20 %	194097820
132	NC_011035	TTCCC	2	10	188312	188321	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_011035	GTCGC	2	10	192526	192535	0 %	20 %	40 %	40 %	194097826
134	NC_011035	GAAAA	2	10	193435	193444	80 %	0 %	20 %	0 %	194097826
135	NC_011035	GCGCC	3	15	193767	193781	0 %	0 %	40 %	60 %	194097827
136	NC_011035	GCCGC	2	10	198169	198178	0 %	0 %	40 %	60 %	194097830
137	NC_011035	GCCCG	2	10	198219	198228	0 %	0 %	40 %	60 %	194097830
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269	NC_011035	GCTTG	2	10	361113	361122	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_011035	TGGAT	2	10	363851	363860	20 %	40 %	40 %	0 %	194098016
271	NC_011035	TTGGA	2	10	364192	364201	20 %	40 %	40 %	0 %	194098016
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286	NC_011035	GAATG	2	10	378720	378729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011035	GGTAT	2	10	378997	379006	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_011035	TGCCG	2	10	445235	445244	0 %	20 %	40 %	40 %	194098115
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387	NC_011035	TGTGT	2	10	496539	496548	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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