MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 1399

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011035	CCGTC	2	10	1360	1369	0 %	20 %	20 %	60 %	194097590
2	NC_011035	GCGCG	2	10	3107	3116	0 %	0 %	60 %	40 %	194097593
3	NC_011035	TGACG	2	10	5195	5204	20 %	20 %	40 %	20 %	194097593
4	NC_011035	GAAAA	2	10	5430	5439	80 %	0 %	20 %	0 %	194097594
5	NC_011035	GGCGG	2	10	5702	5711	0 %	0 %	80 %	20 %	194097594
6	NC_011035	CGGCT	2	10	5775	5784	0 %	20 %	40 %	40 %	194097595
7	NC_011035	CGGTT	2	10	7391	7400	0 %	40 %	40 %	20 %	194097598
8	NC_011035	TGTTT	2	10	16794	16803	0 %	80 %	20 %	0 %	194097616
9	NC_011035	CGGGT	2	10	18961	18970	0 %	20 %	60 %	20 %	194097618
10	NC_011035	TGCGG	2	10	25908	25917	0 %	20 %	60 %	20 %	194097625
11	NC_011035	TTCCG	2	10	28188	28197	0 %	40 %	20 %	40 %	194097629
12	NC_011035	CGACC	2	10	31544	31553	20 %	0 %	20 %	60 %	194097632
13	NC_011035	TGGTT	2	10	34598	34607	0 %	60 %	40 %	0 %	194097636
14	NC_011035	GCCGC	2	10	35290	35299	0 %	0 %	40 %	60 %	194097636
15	NC_011035	GTTTC	2	10	37704	37713	0 %	60 %	20 %	20 %	194097639
16	NC_011035	GATGC	2	10	41079	41088	20 %	20 %	40 %	20 %	194097643
17	NC_011035	CGGGC	2	10	42322	42331	0 %	0 %	60 %	40 %	194097644
18	NC_011035	CCGTG	2	10	43294	43303	0 %	20 %	40 %	40 %	194097646
19	NC_011035	TTTGG	2	10	44992	45001	0 %	60 %	40 %	0 %	194097648
20	NC_011035	ATAAA	2	10	47654	47663	80 %	20 %	0 %	0 %	194097650
21	NC_011035	TTTTC	2	10	53884	53893	0 %	80 %	0 %	20 %	194097660
22	NC_011035	TCAAA	2	10	54544	54553	60 %	20 %	0 %	20 %	194097660
23	NC_011035	CCGGG	2	10	56436	56445	0 %	0 %	60 %	40 %	194097660
24	NC_011035	TTGTT	2	10	56604	56613	0 %	80 %	20 %	0 %	194097660
25	NC_011035	GCCGG	2	10	59987	59996	0 %	0 %	60 %	40 %	194097664
26	NC_011035	CGGCT	2	10	62742	62751	0 %	20 %	40 %	40 %	194097669
27	NC_011035	CGTTG	2	10	65450	65459	0 %	40 %	40 %	20 %	194097671
28	NC_011035	AAAAT	2	10	66862	66871	80 %	20 %	0 %	0 %	194097673
29	NC_011035	CCTGC	2	10	66921	66930	0 %	20 %	20 %	60 %	194097673
30	NC_011035	TTTGG	2	10	70251	70260	0 %	60 %	40 %	0 %	194097676
31	NC_011035	AACCG	2	10	70831	70840	40 %	0 %	20 %	40 %	194097679
32	NC_011035	CCCAA	2	10	72289	72298	40 %	0 %	0 %	60 %	194097683
33	NC_011035	TTTCG	2	10	72510	72519	0 %	60 %	20 %	20 %	194097683
34	NC_011035	CGCGG	2	10	72826	72835	0 %	0 %	60 %	40 %	194097683
35	NC_011035	GCCCC	2	10	77296	77305	0 %	0 %	20 %	80 %	194100152
36	NC_011035	AACCG	2	10	78083	78092	40 %	0 %	20 %	40 %	194097688
37	NC_011035	CGGTG	2	10	78722	78731	0 %	20 %	60 %	20 %	194097689
38	NC_011035	AAACC	2	10	79752	79761	60 %	0 %	0 %	40 %	194097690
39	NC_011035	CGATG	2	10	81898	81907	20 %	20 %	40 %	20 %	194097694
40	NC_011035	CGGTT	2	10	82198	82207	0 %	40 %	40 %	20 %	194097695
41	NC_011035	AAATC	2	10	82308	82317	60 %	20 %	0 %	20 %	194097695
42	NC_011035	GGCAG	2	10	82910	82919	20 %	0 %	60 %	20 %	194097696
43	NC_011035	GGCGC	2	10	85035	85044	0 %	0 %	60 %	40 %	194097697
44	NC_011035	ATGTG	2	10	86321	86330	20 %	40 %	40 %	0 %	194097697
45	NC_011035	GGCGG	2	10	91287	91296	0 %	0 %	80 %	20 %	194097705
46	NC_011035	TTTGG	2	10	103665	103674	0 %	60 %	40 %	0 %	194097721
47	NC_011035	GTTTT	2	10	104388	104397	0 %	80 %	20 %	0 %	194097721
48	NC_011035	GTATT	2	10	104926	104935	20 %	60 %	20 %	0 %	194097721
49	NC_011035	TCGCG	2	10	105730	105739	0 %	20 %	40 %	40 %	194097722
50	NC_011035	CGGTT	2	10	109846	109855	0 %	40 %	40 %	20 %	194097726
51	NC_011035	GAAAG	2	10	110479	110488	60 %	0 %	40 %	0 %	194097726
52	NC_011035	GGCAG	2	10	113776	113785	20 %	0 %	60 %	20 %	194097729
53	NC_011035	GAATC	2	10	115877	115886	40 %	20 %	20 %	20 %	194097731
54	NC_011035	AAGGT	2	10	117969	117978	40 %	20 %	40 %	0 %	194097733
55	NC_011035	TACCG	2	10	120592	120601	20 %	20 %	20 %	40 %	194097735
56	NC_011035	GAATG	2	10	121877	121886	40 %	20 %	40 %	0 %	194097738
57	NC_011035	AAAAT	2	10	121942	121951	80 %	20 %	0 %	0 %	194097738
58	NC_011035	GGTGT	2	10	122516	122525	0 %	40 %	60 %	0 %	194097739
59	NC_011035	CGGCA	2	10	124602	124611	20 %	0 %	40 %	40 %	194097741
60	NC_011035	CCGCC	2	10	127077	127086	0 %	0 %	20 %	80 %	194097743
61	NC_011035	CAGCG	2	10	127403	127412	20 %	0 %	40 %	40 %	194097744
62	NC_011035	GCGTG	2	10	127823	127832	0 %	20 %	60 %	20 %	194097745
63	NC_011035	CGGTA	2	10	127872	127881	20 %	20 %	40 %	20 %	194097745
64	NC_011035	GGCGT	2	10	129188	129197	0 %	20 %	60 %	20 %	194097746
65	NC_011035	GCGCG	2	10	129778	129787	0 %	0 %	60 %	40 %	194097746
66	NC_011035	GGCGC	2	10	131472	131481	0 %	0 %	60 %	40 %	194097748
67	NC_011035	ACCGC	2	10	132419	132428	20 %	0 %	20 %	60 %	194097751
68	NC_011035	GACGG	2	10	136418	136427	20 %	0 %	60 %	20 %	194097755
69	NC_011035	CTGGG	2	10	136693	136702	0 %	20 %	60 %	20 %	194097755
70	NC_011035	CGTAT	2	10	138207	138216	20 %	40 %	20 %	20 %	194097756
71	NC_011035	CTCAA	2	10	138573	138582	40 %	20 %	0 %	40 %	194097757
72	NC_011035	CCGCC	2	10	138847	138856	0 %	0 %	20 %	80 %	194097757
73	NC_011035	ACGGC	2	10	138898	138907	20 %	0 %	40 %	40 %	194097757
74	NC_011035	CCGAC	2	10	139156	139165	20 %	0 %	20 %	60 %	194097757
75	NC_011035	TGGTT	2	10	139414	139423	0 %	60 %	40 %	0 %	194097757
76	NC_011035	CCTGC	2	10	141714	141723	0 %	20 %	20 %	60 %	194097761
77	NC_011035	CAATA	2	10	144959	144968	60 %	20 %	0 %	20 %	194097766
78	NC_011035	CGCGC	2	10	146090	146099	0 %	0 %	40 %	60 %	194097766
79	NC_011035	CAAGC	2	10	146238	146247	40 %	0 %	20 %	40 %	194097766
80	NC_011035	CCGAA	2	10	147752	147761	40 %	0 %	20 %	40 %	194097768
81	NC_011035	GCGGG	2	10	147902	147911	0 %	0 %	80 %	20 %	194097768
82	NC_011035	GGCAG	2	10	153896	153905	20 %	0 %	60 %	20 %	194097776
83	NC_011035	CGGAA	2	10	157560	157569	40 %	0 %	40 %	20 %	194097780
84	NC_011035	AGGCG	2	10	160674	160683	20 %	0 %	60 %	20 %	194097785
85	NC_011035	GCGCG	2	10	160812	160821	0 %	0 %	60 %	40 %	194097785
86	NC_011035	GAAAA	2	10	162142	162151	80 %	0 %	20 %	0 %	194097788
87	NC_011035	CGGCG	2	10	165143	165152	0 %	0 %	60 %	40 %	194097793
88	NC_011035	GATGT	2	10	165348	165357	20 %	40 %	40 %	0 %	194097793
89	NC_011035	CCGCA	2	10	167457	167466	20 %	0 %	20 %	60 %	194097793
90	NC_011035	GCCGG	2	10	167818	167827	0 %	0 %	60 %	40 %	194097794
91	NC_011035	CGCGG	2	10	167869	167878	0 %	0 %	60 %	40 %	194097794
92	NC_011035	CAAAC	2	10	168427	168436	60 %	0 %	0 %	40 %	194097795
93	NC_011035	TTTTC	2	10	170247	170256	0 %	80 %	0 %	20 %	194097799
94	NC_011035	CGGCT	2	10	172218	172227	0 %	20 %	40 %	40 %	194097802
95	NC_011035	GCAGT	2	10	178534	178543	20 %	20 %	40 %	20 %	194097811
96	NC_011035	TGGTG	2	10	179139	179148	0 %	40 %	60 %	0 %	194097811
97	NC_011035	TTGCC	2	10	181886	181895	0 %	40 %	20 %	40 %	194097814
98	NC_011035	GTCCA	2	10	182147	182156	20 %	20 %	20 %	40 %	194097814
99	NC_011035	GAAGG	2	10	182803	182812	40 %	0 %	60 %	0 %	194097814
100	NC_011035	GCAGG	2	10	183451	183460	20 %	0 %	60 %	20 %	194097814
101	NC_011035	TGCCG	2	10	184778	184787	0 %	20 %	40 %	40 %	194097817
102	NC_011035	ATGCC	2	10	184912	184921	20 %	20 %	20 %	40 %	194097817
103	NC_011035	ACCGC	2	10	186093	186102	20 %	0 %	20 %	60 %	194097819
104	NC_011035	AGCGG	2	10	186460	186469	20 %	0 %	60 %	20 %	194097820
105	NC_011035	GTCGC	2	10	192526	192535	0 %	20 %	40 %	40 %	194097826
106	NC_011035	GAAAA	2	10	193435	193444	80 %	0 %	20 %	0 %	194097826
107	NC_011035	GCGCC	3	15	193767	193781	0 %	0 %	40 %	60 %	194097827
108	NC_011035	GCCGC	2	10	198169	198178	0 %	0 %	40 %	60 %	194097830
109	NC_011035	GCCCG	2	10	198219	198228	0 %	0 %	40 %	60 %	194097830
110	NC_011035	CGGCG	2	10	200906	200915	0 %	0 %	60 %	40 %	194097831
111	NC_011035	TCGCG	2	10	201539	201548	0 %	20 %	40 %	40 %	194097831
112	NC_011035	GGTCG	2	10	201753	201762	0 %	20 %	60 %	20 %	194097831
113	NC_011035	GAAAA	2	10	202223	202232	80 %	0 %	20 %	0 %	194097833
114	NC_011035	GCCGT	2	10	202463	202472	0 %	20 %	40 %	40 %	194097833
115	NC_011035	TCGCC	2	10	204413	204422	0 %	20 %	20 %	60 %	194097834
116	NC_011035	GAAAA	2	10	205854	205863	80 %	0 %	20 %	0 %	194097837
117	NC_011035	GAAAA	2	10	208441	208450	80 %	0 %	20 %	0 %	194097841
118	NC_011035	TCGGT	2	10	208817	208826	0 %	40 %	40 %	20 %	194097841
119	NC_011035	GAAGC	2	10	209175	209184	40 %	0 %	40 %	20 %	194097841
120	NC_011035	GATGT	2	10	209260	209269	20 %	40 %	40 %	0 %	194097841
121	NC_011035	GTTCC	2	10	209340	209349	0 %	40 %	20 %	40 %	194097842
122	NC_011035	AAAGC	2	10	209503	209512	60 %	0 %	20 %	20 %	194097842
123	NC_011035	CCTGT	2	10	210373	210382	0 %	40 %	20 %	40 %	194097843
124	NC_011035	TCGCT	2	10	211155	211164	0 %	40 %	20 %	40 %	194097844
125	NC_011035	CAGGG	2	10	213332	213341	20 %	0 %	60 %	20 %	194097846
126	NC_011035	CATCG	2	10	213707	213716	20 %	20 %	20 %	40 %	194097846
127	NC_011035	CGCGG	2	10	214255	214264	0 %	0 %	60 %	40 %	194097847
128	NC_011035	ATTTT	2	10	215678	215687	20 %	80 %	0 %	0 %	194097848
129	NC_011035	ATCGC	2	10	216300	216309	20 %	20 %	20 %	40 %	194097849
130	NC_011035	GATTC	2	10	218837	218846	20 %	40 %	20 %	20 %	194097853
131	NC_011035	GTTTT	2	10	221014	221023	0 %	80 %	20 %	0 %	194097855
132	NC_011035	GTGGC	2	10	221831	221840	0 %	20 %	60 %	20 %	194097856
133	NC_011035	GCCGA	2	10	223668	223677	20 %	0 %	40 %	40 %	194097858
134	NC_011035	TTCAA	2	10	225105	225114	40 %	40 %	0 %	20 %	194097858
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259	NC_011035	ATCAA	2	10	398572	398581	60 %	20 %	0 %	20 %	194098060
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