MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011027	TGTTTT	2	12	54012	54023	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011027	GCGACC	2	12	58136	58147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011027	TGTAAT	2	12	86928	86939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011027	GAAAAA	2	12	152618	152629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011027	TGGGCT	2	12	210379	210390	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011027	ATGTTA	2	12	263396	263407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011027	GATGCG	2	12	305912	305923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011027	GGTTGC	2	12	307775	307786	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011027	GCCGAT	2	12	330920	330931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011027	GACAAA	2	12	382961	382972	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011027	CGGTTC	2	12	415159	415170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011027	TGGAAT	2	12	425873	425884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011027	AGGGGT	2	12	449581	449592	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011027	GAGCTG	2	12	454223	454234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011027	TGGCGA	2	12	454281	454292	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011027	GAATTT	2	12	474970	474981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011027	ATAAAC	2	12	479048	479059	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011027	TCGATT	2	12	537060	537071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011027	CGGTCG	2	12	580782	580793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011027	ATTGAA	2	12	674981	674992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011027	TTTATG	2	12	698577	698588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011027	GATTCT	2	12	711960	711971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011027	GTTTGA	2	12	721736	721747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011027	GGTCAA	2	12	732117	732128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011027	GGTCAT	2	12	755616	755627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011027	AGGAAG	2	12	788225	788236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011027	TCGAAG	2	12	791326	791337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011027	GTGTTT	2	12	837723	837734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011027	AATATT	2	12	838057	838068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011027	AACCAA	2	12	838654	838665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011027	TAATTC	2	12	879045	879056	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011027	TGTTAT	2	12	893297	893308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011027	TTTTTC	2	12	909970	909981	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011027	TTCTTG	2	12	923358	923369	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011027	ATTCCC	2	12	955459	955470	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011027	ATATGT	2	12	992252	992263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011027	CGAAGT	2	12	1002302	1002313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011027	CGACGG	2	12	1022452	1022463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011027	TCCTTT	2	12	1028117	1028128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011027	TTGGTT	2	12	1042802	1042813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011027	ATCGGA	2	12	1076221	1076232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011027	AAAAGC	2	12	1094403	1094414	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011027	TGGAAT	2	12	1103367	1103378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011027	ATCGGG	2	12	1157525	1157536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011027	TGCAGC	2	12	1193518	1193529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011027	CAACAC	2	12	1194682	1194693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011027	CTTTAT	2	12	1226527	1226538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011027	CAGAGA	2	12	1259340	1259351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011027	TGCAAA	2	12	1260306	1260317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011027	AGGCTC	2	12	1270520	1270531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011027	AAATAA	2	12	1272387	1272398	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011027	CAAAAT	2	12	1302459	1302470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011027	TGAAAA	2	12	1365978	1365989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011027	GCTAAA	2	12	1395178	1395189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011027	CAAACT	2	12	1436283	1436294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011027	GCATCA	2	12	1436494	1436505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011027	AAAAGA	2	12	1475667	1475678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011027	TTATTT	2	12	1562535	1562546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011027	GTTGAG	2	12	1567374	1567385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011027	CACCGA	2	12	1569029	1569040	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011027	AGCGGC	2	12	1624055	1624066	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011027	ATCAAT	2	12	1638613	1638624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011027	ATCACA	2	12	1640800	1640811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011027	CGGCAA	2	12	1651570	1651581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011027	GCAAAA	2	12	1697601	1697612	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011027	TGAACT	2	12	1724652	1724663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011027	GGCAGC	2	12	1732643	1732654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011027	CGATCT	2	12	1748977	1748988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011027	GCTTTG	2	12	1793235	1793246	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011027	TAACCA	2	12	1796106	1796117	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011027	TGTGAT	2	12	1797605	1797616	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011027	ATCCAG	2	12	1818411	1818422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011027	GCAACA	2	12	1818584	1818595	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011027	TCGGCA	2	12	1836988	1836999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011027	GTTTTT	2	12	1841164	1841175	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011027	TTACAT	2	12	1851554	1851565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011027	AAAAAG	2	12	1900821	1900832	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011027	ATGAGG	2	12	1994835	1994846	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011027	CCTACC	2	12	2033384	2033395	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011027	ACCCGA	2	12	2034760	2034771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011027	TTGAAA	2	12	2086636	2086647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011027	AATCAA	2	12	2126613	2126624	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011027	GGACGC	2	12	2126663	2126674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011027	TCAACC	2	12	2151973	2151984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011027	CGCGGG	2	12	2168136	2168147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011027	CTTACG	2	12	2168294	2168305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011027	AAAAGC	2	12	2182656	2182667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011027	AATCGA	2	12	2195308	2195319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011027	TTTGAT	2	12	2245682	2245693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011027	CCCGAA	2	12	2257718	2257729	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011027	TGCCGA	2	12	2285462	2285473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.