MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011027	CTGA	2	8	1719	1726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011027	TAAA	2	8	1907	1914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011027	ATTT	2	8	5831	5838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011027	TTCT	2	8	11477	11484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011027	GCTT	2	8	11605	11612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011027	CGGG	2	8	29009	29016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011027	AACA	2	8	29034	29041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011027	CATT	2	8	30049	30056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011027	GCTG	2	8	30102	30109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011027	GCAG	2	8	30237	30244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011027	GTCC	2	8	30549	30556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011027	TTCA	2	8	32600	32607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011027	TCCA	2	8	43705	43712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011027	CCGC	2	8	45858	45865	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_011027	TCAT	2	8	51337	51344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011027	TTGA	2	8	54145	54152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011027	CGTT	2	8	58357	58364	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011027	GAAT	2	8	58537	58544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011027	CGCC	2	8	60562	60569	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_011027	GGTC	2	8	65129	65136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011027	TCGT	2	8	65217	65224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011027	TTAT	2	8	65372	65379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011027	CTTC	2	8	65417	65424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011027	TGTA	2	8	71729	71736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011027	TCCG	2	8	71754	71761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011027	ACAA	2	8	80622	80629	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011027	TTCC	2	8	80800	80807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011027	TCGC	2	8	80867	80874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011027	ATGA	2	8	86918	86925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011027	TTGC	2	8	87091	87098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011027	GATA	2	8	87652	87659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011027	CAGC	2	8	88524	88531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011027	TTTA	2	8	99417	99424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011027	TAAT	2	8	101040	101047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011027	TCAT	2	8	101313	101320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011027	GAAT	2	8	103723	103730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011027	ATAA	2	8	107376	107383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011027	CGAA	2	8	110517	110524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011027	AAGG	2	8	115077	115084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011027	CGAT	2	8	115230	115237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011027	GGTG	2	8	115499	115506	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011027	GACG	2	8	116410	116417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011027	TTTA	2	8	119044	119051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011027	CTGA	2	8	120472	120479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011027	TCCT	2	8	127166	127173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011027	TGAA	2	8	130129	130136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011027	TGGT	2	8	134594	134601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011027	GCCC	2	8	136907	136914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011027	AAGA	2	8	138417	138424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011027	AGGT	2	8	138435	138442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011027	CATA	2	8	142240	142247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011027	CATG	2	8	145287	145294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011027	CAGG	2	8	147518	147525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011027	CCTG	2	8	147533	147540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011027	CGTT	2	8	147845	147852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011027	GAGC	2	8	150719	150726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011027	CTGC	2	8	150761	150768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011027	TTAT	2	8	151818	151825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011027	CCTG	2	8	154081	154088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011027	GCGT	2	8	154094	154101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011027	TCAA	2	8	156008	156015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011027	TTCA	2	8	158621	158628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011027	AAGA	2	8	160780	160787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011027	CTTC	2	8	161098	161105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011027	CAAA	2	8	162683	162690	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011027	GGCT	2	8	179488	179495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011027	TTTC	2	8	181207	181214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011027	GGTC	2	8	184712	184719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011027	GATA	2	8	191385	191392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011027	TAAC	2	8	192251	192258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011027	GATA	2	8	196502	196509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011027	AACA	2	8	197556	197563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011027	AGAA	2	8	205888	205895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011027	CTTT	2	8	215034	215041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011027	TTTA	2	8	215873	215880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011027	CGAA	2	8	216085	216092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011027	AAGC	2	8	216856	216863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011027	AAGG	2	8	225464	225471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011027	CGAT	2	8	225617	225624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011027	GGTG	2	8	225886	225893	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011027	GACG	2	8	226797	226804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011027	TATT	2	8	228640	228647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011027	CGGG	2	8	230601	230608	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011027	GCAC	2	8	230641	230648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011027	GCCG	2	8	232161	232168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011027	CCGG	2	8	232181	232188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011027	TAGA	2	8	234652	234659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011027	CTCC	2	8	250375	250382	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_011027	TCCC	2	8	250842	250849	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_011027	GGCA	2	8	254573	254580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011027	TCAA	2	8	257244	257251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011027	CAGG	2	8	260627	260634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011027	GTTC	2	8	260658	260665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011027	AGCA	2	8	264960	264967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011027	TTCG	2	8	266778	266785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011027	GTTG	2	8	270474	270481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011027	CCGT	2	8	283502	283509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011027	GGTC	2	8	285779	285786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011027	CGTT	2	8	287295	287302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011027	TTGT	2	8	287348	287355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011027	CCGG	2	8	289208	289215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011027	TGCC	2	8	289667	289674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011027	ATTT	2	8	289750	289757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011027	ATTG	2	8	294338	294345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011027	CGAG	2	8	303174	303181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011027	ATTG	2	8	310881	310888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011027	TAAA	2	8	315079	315086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011027	CGTC	2	8	318058	318065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011027	CCTG	2	8	318066	318073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011027	CCGC	2	8	320426	320433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_011027	TCCG	2	8	324118	324125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011027	ATTG	2	8	324238	324245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011027	TCAT	2	8	324332	324339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011027	TCAT	2	8	325912	325919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011027	GCAG	2	8	330844	330851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011027	AGAA	2	8	334525	334532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011027	TCGG	2	8	334759	334766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011027	GATC	2	8	334771	334778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011027	GTGG	2	8	341826	341833	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011027	TTCA	2	8	343013	343020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011027	TTTC	2	8	356911	356918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011027	TGGT	2	8	360579	360586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011027	GGTT	2	8	360674	360681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011027	AGTG	2	8	366362	366369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011027	CCGC	2	8	367477	367484	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_011027	GCGG	2	8	367500	367507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011027	TTGG	2	8	371231	371238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011027	ATGA	2	8	372003	372010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011027	GGTT	2	8	373168	373175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011027	GGCC	2	8	376295	376302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011027	GAAA	2	8	378595	378602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011027	AGTG	2	8	383531	383538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011027	CAGG	2	8	395488	395495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011027	CGGT	2	8	395619	395626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011027	CGTC	2	8	400311	400318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011027	TGAG	2	8	406360	406367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011027	CAAA	2	8	406451	406458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011027	GTGG	2	8	412492	412499	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011027	AAAG	2	8	416503	416510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011027	AGCC	2	8	421056	421063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011027	TACT	2	8	421064	421071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011027	GGCG	2	8	421179	421186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011027	ATGA	2	8	425863	425870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011027	GACA	2	8	437808	437815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011027	CAAA	2	8	442933	442940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011027	TAAT	2	8	447461	447468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011027	ATCA	2	8	449739	449746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011027	CGTG	2	8	453651	453658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011027	TCGA	2	8	454069	454076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011027	GTCG	2	8	454399	454406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011027	GATC	2	8	454606	454613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_011027	GATC	2	8	457165	457172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_011027	GATC	2	8	585472	585479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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