MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 8529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	CCAG	2	8	24	31	25 %	0 %	25 %	50 %	193213721
2	NC_011026	ATGT	2	8	673	680	25 %	50 %	25 %	0 %	193213721
3	NC_011026	CTTT	2	8	1520	1527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011026	CATT	2	8	1701	1708	25 %	50 %	0 %	25 %	193213722
5	NC_011026	CATC	2	8	1894	1901	25 %	25 %	0 %	50 %	193213722
6	NC_011026	CGGA	2	8	2955	2962	25 %	0 %	50 %	25 %	193213723
7	NC_011026	AATG	2	8	3040	3047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011026	CAAA	2	8	3120	3127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011026	GTAA	2	8	3591	3598	50 %	25 %	25 %	0 %	193213725
10	NC_011026	TCGT	2	8	4834	4841	0 %	50 %	25 %	25 %	193213726
11	NC_011026	GGAC	2	8	4877	4884	25 %	0 %	50 %	25 %	193213726
12	NC_011026	CGAT	2	8	4993	5000	25 %	25 %	25 %	25 %	193213726
13	NC_011026	GAAA	2	8	5609	5616	75 %	0 %	25 %	0 %	193213726
14	NC_011026	TGGT	2	8	6511	6518	0 %	50 %	50 %	0 %	193213726
15	NC_011026	CGTT	2	8	6932	6939	0 %	50 %	25 %	25 %	193213726
16	NC_011026	TACC	2	8	7111	7118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011026	CCGC	2	8	7177	7184	0 %	0 %	25 %	75 %	193213727
18	NC_011026	AAAT	2	8	7411	7418	75 %	25 %	0 %	0 %	193213727
19	NC_011026	AGCG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	50 %	25 %	193213727
20	NC_011026	CGTC	2	8	8543	8550	0 %	25 %	25 %	50 %	193213727
21	NC_011026	CTTC	2	8	8726	8733	0 %	50 %	0 %	50 %	193213727
22	NC_011026	TCGG	2	8	9070	9077	0 %	25 %	50 %	25 %	193213727
23	NC_011026	GGCG	2	8	9269	9276	0 %	0 %	75 %	25 %	193213727
24	NC_011026	CGAA	2	8	9327	9334	50 %	0 %	25 %	25 %	193213727
25	NC_011026	CAAG	2	8	9404	9411	50 %	0 %	25 %	25 %	193213727
26	NC_011026	ACAA	2	8	10351	10358	75 %	0 %	0 %	25 %	193213727
27	NC_011026	CATC	2	8	10913	10920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011026	CGAT	2	8	11352	11359	25 %	25 %	25 %	25 %	193213728
29	NC_011026	CAAC	2	8	11474	11481	50 %	0 %	0 %	50 %	193213728
30	NC_011026	CAAG	2	8	11698	11705	50 %	0 %	25 %	25 %	193213728
31	NC_011026	GCAC	2	8	11760	11767	25 %	0 %	25 %	50 %	193213728
32	NC_011026	TTCA	2	8	11792	11799	25 %	50 %	0 %	25 %	193213728
33	NC_011026	GATC	2	8	12472	12479	25 %	25 %	25 %	25 %	193213728
34	NC_011026	AAAC	2	8	12850	12857	75 %	0 %	0 %	25 %	193213728
35	NC_011026	GGAA	2	8	13481	13488	50 %	0 %	50 %	0 %	193213728
36	NC_011026	CCTG	2	8	13707	13714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011026	TGGC	2	8	14347	14354	0 %	25 %	50 %	25 %	193213729
38	NC_011026	CTAT	2	8	14483	14490	25 %	50 %	0 %	25 %	193213729
39	NC_011026	TGCT	2	8	14508	14515	0 %	50 %	25 %	25 %	193213729
40	NC_011026	TTCA	2	8	14729	14736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011026	GTTA	2	8	15503	15510	25 %	50 %	25 %	0 %	193213730
42	NC_011026	GCCA	2	8	15977	15984	25 %	0 %	25 %	50 %	193213731
43	NC_011026	GAAA	2	8	16258	16265	75 %	0 %	25 %	0 %	193213732
44	NC_011026	TTGC	2	8	17359	17366	0 %	50 %	25 %	25 %	193213733
45	NC_011026	GCTG	2	8	18384	18391	0 %	25 %	50 %	25 %	193213734
46	NC_011026	ATTT	2	8	18503	18510	25 %	75 %	0 %	0 %	193213734
47	NC_011026	ACGC	2	8	18997	19004	25 %	0 %	25 %	50 %	193213735
48	NC_011026	CGCT	2	8	19055	19062	0 %	25 %	25 %	50 %	193213735
49	NC_011026	CAAC	2	8	19339	19346	50 %	0 %	0 %	50 %	193213735
50	NC_011026	GTTC	2	8	20022	20029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011026	TAAC	2	8	20047	20054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011026	GCGA	2	8	20779	20786	25 %	0 %	50 %	25 %	193213736
53	NC_011026	AATG	2	8	21441	21448	50 %	25 %	25 %	0 %	193213736
54	NC_011026	TATC	2	8	21462	21469	25 %	50 %	0 %	25 %	193213736
55	NC_011026	TCGG	2	8	21574	21581	0 %	25 %	50 %	25 %	193213736
56	NC_011026	GCGG	2	8	21889	21896	0 %	0 %	75 %	25 %	193213736
57	NC_011026	ACAT	2	8	22453	22460	50 %	25 %	0 %	25 %	193213736
58	NC_011026	GACG	2	8	22957	22964	25 %	0 %	50 %	25 %	193213737
59	NC_011026	CTGG	2	8	23678	23685	0 %	25 %	50 %	25 %	193213737
60	NC_011026	AAAC	2	8	23921	23928	75 %	0 %	0 %	25 %	193213737
61	NC_011026	GAAA	2	8	25233	25240	75 %	0 %	25 %	0 %	193213738
62	NC_011026	CTGA	2	8	25485	25492	25 %	25 %	25 %	25 %	193213739
63	NC_011026	CTTG	2	8	25599	25606	0 %	50 %	25 %	25 %	193213739
64	NC_011026	CCGT	2	8	26158	26165	0 %	25 %	25 %	50 %	193213739
65	NC_011026	TTGA	2	8	26653	26660	25 %	50 %	25 %	0 %	193213739
66	NC_011026	AATT	2	8	27184	27191	50 %	50 %	0 %	0 %	193213739
67	NC_011026	CAAA	2	8	27264	27271	75 %	0 %	0 %	25 %	193213739
68	NC_011026	ATTT	2	8	27837	27844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011026	CATT	2	8	28278	28285	25 %	50 %	0 %	25 %	193213740
70	NC_011026	AGCA	2	8	29199	29206	50 %	0 %	25 %	25 %	193213741
71	NC_011026	CCAA	2	8	29278	29285	50 %	0 %	0 %	50 %	193213741
72	NC_011026	TCGA	2	8	29500	29507	25 %	25 %	25 %	25 %	193213741
73	NC_011026	TTCG	2	8	30176	30183	0 %	50 %	25 %	25 %	193213741
74	NC_011026	CTTC	2	8	30236	30243	0 %	50 %	0 %	50 %	193213741
75	NC_011026	CTTT	2	8	31507	31514	0 %	75 %	0 %	25 %	193213741
76	NC_011026	ATCG	2	8	31654	31661	25 %	25 %	25 %	25 %	193213741
77	NC_011026	CAAG	2	8	32234	32241	50 %	0 %	25 %	25 %	193213741
78	NC_011026	AGCA	2	8	32262	32269	50 %	0 %	25 %	25 %	193213741
79	NC_011026	ACTT	2	8	32761	32768	25 %	50 %	0 %	25 %	193213742
80	NC_011026	TTGT	2	8	33376	33383	0 %	75 %	25 %	0 %	193213743
81	NC_011026	AGCA	2	8	35427	35434	50 %	0 %	25 %	25 %	193213745
82	NC_011026	TTTC	2	8	35766	35773	0 %	75 %	0 %	25 %	193213745
83	NC_011026	GGAA	2	8	36295	36302	50 %	0 %	50 %	0 %	193213745
84	NC_011026	CTTT	2	8	36573	36580	0 %	75 %	0 %	25 %	193213745
85	NC_011026	ATTT	2	8	37821	37828	25 %	75 %	0 %	0 %	193213747
86	NC_011026	GAGC	2	8	38046	38053	25 %	0 %	50 %	25 %	193213747
87	NC_011026	TGAA	2	8	38275	38282	50 %	25 %	25 %	0 %	193213747
88	NC_011026	TTTG	2	8	38378	38385	0 %	75 %	25 %	0 %	193213747
89	NC_011026	ATTG	2	8	38822	38829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011026	TGTA	2	8	38869	38876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011026	TTGC	2	8	39432	39439	0 %	50 %	25 %	25 %	193213748
92	NC_011026	ATTT	2	8	39841	39848	25 %	75 %	0 %	0 %	193213748
93	NC_011026	GCAG	2	8	40087	40094	25 %	0 %	50 %	25 %	193213749
94	NC_011026	TTCG	2	8	40165	40172	0 %	50 %	25 %	25 %	193213749
95	NC_011026	TTTA	2	8	40206	40213	25 %	75 %	0 %	0 %	193213749
96	NC_011026	CAAG	2	8	41014	41021	50 %	0 %	25 %	25 %	193213749
97	NC_011026	TTTC	2	8	41282	41289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011026	AGAA	2	8	41437	41444	75 %	0 %	25 %	0 %	193213750
99	NC_011026	TATT	2	8	41803	41810	25 %	75 %	0 %	0 %	193213750
100	NC_011026	TCAA	2	8	43356	43363	50 %	25 %	0 %	25 %	193213751
101	NC_011026	ATCG	2	8	43367	43374	25 %	25 %	25 %	25 %	193213751
102	NC_011026	TTTC	2	8	43808	43815	0 %	75 %	0 %	25 %	193213751
103	NC_011026	TTTC	2	8	43933	43940	0 %	75 %	0 %	25 %	193213751
104	NC_011026	AACG	2	8	44630	44637	50 %	0 %	25 %	25 %	193213752
105	NC_011026	GCAA	2	8	45742	45749	50 %	0 %	25 %	25 %	193213753
106	NC_011026	ACGC	2	8	46433	46440	25 %	0 %	25 %	50 %	193213754
107	NC_011026	TTGC	2	8	46607	46614	0 %	50 %	25 %	25 %	193213754
108	NC_011026	TTGT	2	8	46626	46633	0 %	75 %	25 %	0 %	193213754
109	NC_011026	ATTT	2	8	46894	46901	25 %	75 %	0 %	0 %	193213754
110	NC_011026	TCTT	2	8	47227	47234	0 %	75 %	0 %	25 %	193213755
111	NC_011026	ATCA	2	8	48287	48294	50 %	25 %	0 %	25 %	193213758
112	NC_011026	GAAA	2	8	48450	48457	75 %	0 %	25 %	0 %	193213758
113	NC_011026	CCAA	2	8	49029	49036	50 %	0 %	0 %	50 %	193213758
114	NC_011026	GTCT	2	8	49070	49077	0 %	50 %	25 %	25 %	193213758
115	NC_011026	GCTC	2	8	49547	49554	0 %	25 %	25 %	50 %	193213758
116	NC_011026	CAAC	2	8	49868	49875	50 %	0 %	0 %	50 %	193213758
117	NC_011026	GCAA	2	8	50001	50008	50 %	0 %	25 %	25 %	193213758
118	NC_011026	GCAA	2	8	50343	50350	50 %	0 %	25 %	25 %	193213758
119	NC_011026	AAGA	2	8	50468	50475	75 %	0 %	25 %	0 %	193213758
120	NC_011026	GCCA	2	8	51050	51057	25 %	0 %	25 %	50 %	193213759
121	NC_011026	TGCC	2	8	51433	51440	0 %	25 %	25 %	50 %	193213759
122	NC_011026	TGCG	2	8	51615	51622	0 %	25 %	50 %	25 %	193213759
123	NC_011026	GAAA	2	8	51726	51733	75 %	0 %	25 %	0 %	193213759
124	NC_011026	TCGC	2	8	53075	53082	0 %	25 %	25 %	50 %	193213761
125	NC_011026	CTTG	2	8	53177	53184	0 %	50 %	25 %	25 %	193213761
126	NC_011026	TTCG	2	8	53328	53335	0 %	50 %	25 %	25 %	193213761
127	NC_011026	CGAT	2	8	53344	53351	25 %	25 %	25 %	25 %	193213761
128	NC_011026	TGGT	2	8	53449	53456	0 %	50 %	50 %	0 %	193213761
129	NC_011026	TTGA	2	8	53475	53482	25 %	50 %	25 %	0 %	193213761
130	NC_011026	TGGC	2	8	53632	53639	0 %	25 %	50 %	25 %	193213761
131	NC_011026	AAAG	2	8	54171	54178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011026	TCTA	2	8	54260	54267	25 %	50 %	0 %	25 %	193213762
133	NC_011026	ATCG	2	8	54581	54588	25 %	25 %	25 %	25 %	193213762
134	NC_011026	GCTT	2	8	55076	55083	0 %	50 %	25 %	25 %	193213762
135	NC_011026	AAGT	2	8	55547	55554	50 %	25 %	25 %	0 %	193213762
136	NC_011026	AGGT	2	8	55740	55747	25 %	25 %	50 %	0 %	193213762
137	NC_011026	ATTC	2	8	57323	57330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011026	ACCA	2	8	57621	57628	50 %	0 %	0 %	50 %	193213764
139	NC_011026	TTTG	2	8	57773	57780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011026	TGTT	2	8	57899	57906	0 %	75 %	25 %	0 %	193213765
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